Barrettin ruokatorvessa (BE), mahalaukun krooninen refluksi vahingoittaa alemman ruokatorven vuoraavia soluja, jolloin niistä tulee enemmän alemman ruoansulatusjärjestelmän soluja. Alemman ruokatorven solut etenevät useiden syöpää edeltävien vaiheiden läpi ennen kuin ne kehittyvät joskus ruokatorven adenokarsinoomaksi, syöpä, jonka viiden vuoden eloonjäämisaste on alle 20 prosenttia. BE on ainoa tunnettu ruokatorven adenokarsinooman esiaste.
Lääkärit voivat havaita nämä progressiiviset tilat BE:ssä etsimällä kromosomimuutoksia, jotka tunnetaan nimellä aneuploidy-yleinen piirre useimmissa syöpäsoluissa-mutta tähän asti prosessissa on ollut useita biopsioita.
Yksi ruokatorven harjaus yhdistettynä sekvensointitekniikkaan nimeltä RealSeqS on riittävän herkkä ja spesifinen tunnistamaan aneuploidian BE:n etenemisen useissa vaiheissa, ja voi jopa sovittaa tiettyjä aneuploidiatyyppejä sairauden tiettyihin vaiheisiin, tutkijat sanovat.
Aneuploidia on jo pitkään ollut mukana kehityksessä, ruokatorven syövän aloittamista tai etenemistä, mutta määrityksiä tai kokeellisia menetelmiä tämän havaitsemiseksi ei ole saavutettu niin helposti tai niin tehokkaasti kuin olisimme halunneet sallia kliinisen toteutuksen. "
Chetan Bettegowda, M.D., Ph.D., Tutkimuksen vanhempi kirjailija ja Jennisonin ja Novakin perheiden neurokirurgian professori, Kimmelin syöpäkeskus
Menetelmä voisi auttaa lääkäreitä tunnistamaan ihmisiä, joilla on suurempi riski saada BE -eteneminen ruokatorven adenokarsinoomaan, "tiukemman seurannan aloittaminen näille potilaille tai hoitojen aloittaminen taudin aikaisemmissa vaiheissa, "Bettegowda sanoo.
Tulokset julkaistiin verkossa 21. tammikuuta lehdessä Gastroenterologia.
Ruokatorven harjauksessa käytetään endoskoopin pehmeää harjan kiinnitystä solujen keräämiseksi ruokatorven vuorauksesta. Menetelmä voi ottaa näytteitä soluista ruokatorven suuremmalta pinta -alalta kuin tavallinen biopsia. Endoskopia, usein harjaamalla, "kuuluu Barrettin tautia sairastavien hoitoon, "Bettegowda sanoo, joten aneuploidian havaitsemismenetelmän sisällyttäminen ei muuttaisi olennaisesti kliinistä käytäntöä.
Vain muutama solu sadoista, jotka on otettu harjaamalla, voi osoittaa aneuploidiaa, kuitenkin, joten harjaamisen yhdistäminen massiivisesti rinnakkaiseen sekvensointiin on avain näiden solujen löytämiseen. Tutkijat käyttivät RealSeqS -tekniikkaa katsomaan yli 350, 000 genomialuetta spesifisten kromosomivarteen muutosten tunnistamiseksi. RealSeqS voi tyypillisesti havaita aneuploidian noin 1 200 solusta, mikä on tarpeen, kun ruokatorven harjauksen suuret osat ovat peräisin normaaleista soluista, sanoo tutkimuksen pääkirjailija Christopher Douville, Kimmel Centerin tutkija, joka suunnitteli RealSeqS:n.
"Menetelmä on nopea ja voi käsitellä satoja näytteitä kustannustehokkaasti, tekee siitä ihanteellisen valinnan BE -tutkimukseen, "sanoo Douville.
Tutkijat saivat ruokatorven harjauksia potilailta, joilla ei ollut BE:tä, BE:llä ja ilman epänormaaleja soluja, joilla on BE ja joko matala tai korkea-asteinen solun poikkeavuus, ja potilaat, joilla on ruokatorven adenokarsinooma. He kouluttivat tunnistamisjärjestelmänsä erottamaan harjaukset BE -potilaista, joilla ei ollut solujen poikkeavuuksia, adenokarsinoomaa sairastavista käyttäen 79 potilaan näytteitä. Tutkimusryhmä tarkasteli sitten 268 potilaan näytteitä testatakseen, voiko menetelmä erottaa BE -etenemisen eri vaiheet.
Bettegowda, Douville ja heidän kollegansa tunnistivat aneuploidian kynnyksen, joka erotti potilaat, joilla oli korkeatasoisia solujen poikkeavuuksia ja adenokarsinooma, BE-potilaista, joilla ei ollut solujen poikkeavuuksia. Tällä kynnyksellä, menetelmä tunnisti suuren riskin potilaita 232 tai 86,7% tapauksista.
Menetelmä tunnisti myös erityisiä kromosomaalisia käsivarsimuutoksia kussakin BE -etenemisen vaiheessa kohti adenokarsinoomaa. Jotkut näistä erityisistä muutoksista on jo yhdistetty sairausvaiheisiin aiemmissa tutkimuksissa, "mutta ne eivät olleet riittävän kattavia, jotta niitä voitaisiin käyttää jollakin diagnostisella tai prognostisella tavalla, "sanoo Douville.
Tutkijat käyttivät näitä muutoksia kehittääkseen arviointityökalun, jota he kutsuivat BAD:ksi (Barrett's Aneuploidy Decision), BE:n etenemisen vaiheiden erottamiseksi. Työkalu voi olla erityisen hyödyllinen riskialttiiden yksilöiden tunnistamisessa, kun solubiopsiat näyttävät hyvänlaatuisilta, koska BAD -työkalu osoittaa molekyylimuutoksia, jotka liittyvät aggressiivisempiin sairauksiin, Bettegowda sanoo.
"Aneuploidy on yhtä yleinen biomarkkeri kuin löydämme tällä hetkellä syöpään, joten odotamme innolla, kuinka voimme käyttää tätä tekniikkaa useisiin syöpiin, "Olemme tyytyväisiä siihen, että RealSeqS -analyysin monipuolisuuden vuoksi voimme tutkia muita taudin prosesseja," hän sanoo. muita syöpätyyppejä ja mahdollisesti löytää muita tapoja puuttua aikaisemmin. "