В пищеводе Барретта (BE), хронический кислотный рефлюкс из желудка повреждает клетки, выстилающие нижнюю часть пищевода, заставляя их становиться более похожими на клетки нижней пищеварительной системы. Клетки нижнего отдела пищевода проходят несколько предраковых стадий, прежде чем иногда перерастают в аденокарциному пищевода, рак с пятилетней выживаемостью ниже 20 процентов. БЭ - единственный известный предшественник аденокарциномы пищевода.
Клиницисты могут обнаружить эти прогрессирующие состояния при БЭ, ища хромосомные изменения, известные как анеуплоидия - общая черта большинства раковых клеток, - но до сих пор этот процесс включал множественные биопсии.
Однократная чистка пищевода в сочетании с техникой секвенирования, называемой RealSeqS, чувствительна и достаточно специфична для выявления анеуплоидии на нескольких этапах прогрессирования БЭ, и даже может сопоставлять определенные типы анеуплоидии с конкретными стадиями заболевания, говорят исследователи.
<цитата>Анеуплоидия уже давно участвует в развитии, инициирование или прогрессирование рака пищевода, но анализы или экспериментальные методы для его обнаружения не были достигнуты с такой легкостью или с такой высокой пропускной способностью, как мы хотели бы, чтобы их можно было реализовать в клинической практике ».
Четан Беттеговда, Доктор медицины, Кандидат наук., Старший автор исследования и профессор нейрохирургии из семей Дженнисон и Новак, Онкологический центр Киммела
Этот метод может помочь клиницистам выявлять людей с повышенным риском прогрессирования БЭ до аденокарциномы пищевода, "установление более интенсивного наблюдения за этими пациентами или начало лечения на более ранних стадиях болезни, "Беттеговда говорит.
Результаты были опубликованы онлайн 21 января в журнале. Гастроэнтерология.
При чистке пищевода используется насадка с мягкой щеткой для эндоскопа для сбора клеток со слизистой оболочки пищевода. Этот метод позволяет отбирать клетки с большей площади поверхности пищевода, чем при обычной биопсии. Эндоскопия, часто с чисткой, "является частью стандарта лечения людей с болезнью Барретта, "Беттеговда говорит:поэтому включение метода обнаружения анеуплоидии не изменит существенно клиническую практику.
Только несколько клеток из сотен, отобранных при чистке зубов, могут демонстрировать анеуплоидию, тем не мение, поэтому сочетание чистки щеткой с массовым параллельным секвенированием является ключом к обнаружению этих клеток. Исследователи использовали технику под названием RealSeqS, чтобы просмотреть более 350, 000 регионов генома для выявления специфических изменений хромосомного плеча. RealSeqS обычно может обнаруживать анеуплоидию на уровне примерно 1 из 200 клеток, что необходимо, когда большие части пищевода получены из нормальных клеток, говорит ведущий автор исследования Кристофер Дувиль, исследователь Центра Киммела, разработавший RealSeqS.
"Этот метод быстр и позволяет эффективно обрабатывать сотни образцов, что делает его идеальным выбором для исследования БЭ, - говорит Дувиль.
Исследователи получили чистки пищевода от пациентов без БЭ, с БЭ и без аномальных клеток, с БЭ и клеточными аномалиями низкой или высокой степени, и пациенты с аденокарциномой пищевода. Они обучили свою систему идентификации отличать чистки зубов у пациентов с БЭ без клеточных аномалий от пациентов с аденокарциномой, используя образцы от 79 пациентов. Затем исследовательская группа изучила образцы от 268 пациентов, чтобы проверить, может ли метод различать различные стадии прогрессирования БЭ.
Бетеговда, Дувилль и их коллеги определили порог анеуплоидии, который отличал пациентов с клеточными аномалиями высокой степени и аденокарциномой от пациентов с БЭ без клеточных аномалий. На этом пороге Методом выявлено 232 пациентов группы высокого риска или 86,7% случаев.
Метод также идентифицировал специфические изменения хромосомного плеча на каждой стадии прогрессирования БЭ в сторону аденокарциномы. Некоторые из этих конкретных изменений уже были связаны со стадиями заболевания в предыдущих исследованиях, "но они не были достаточно всеобъемлющими, чтобы их можно было использовать в диагностических или прогностических целях, - говорит Дувиль.
Исследователи использовали эти изменения для разработки инструмента оценки, который они назвали BAD (Решение об анеуплоидии Барретта). для различения стадий прогрессирования БЭ. Этот инструмент может быть особенно полезен для выявления лиц из группы высокого риска, когда биопсия клеток выглядит доброкачественной. потому что инструмент BAD указывает на молекулярные изменения, которые связаны с более агрессивным заболеванием, Беттеговда говорит.
"Анеуплоидия - это универсальный биомаркер рака, который мы можем найти в настоящее время, поэтому мы очень рады видеть, как мы можем использовать эту технологию для лечения множества видов рака, - говорит он. - Мы оптимистично настроены в том, что, учитывая универсальность анализа RealSeqS, мы можем изучать другие патологические процессы, другие типы рака и, возможно, найдут другие способы вмешаться раньше ».