Снижение экспрессии пренил дифосфат-синтазы субъединицей 2 коррелирует со снижением выживаемости пациентов с раком желудка
Аннотация
Справочная информация
Идентификация новых молекулярных биомаркеров позволит улучшить лечение пациентов с раком желудка (GC). Пренил дифосфат-синтазы субъединица 2 (PDSS2) необходим для биосинтеза кофермента Q10 и действует как подавитель опухоли; Однако роль и регуляторные механизмы PDSS2
в GC не поняты. Цель данного исследования состояла в том, чтобы определить статус экспрессии и регуляторных механизмов PDSS2
в GC.
Методы
Ассоциации между экспрессией и метилирование PDSS2
оценивались с помощью ГХ клеточных линий. Клиническая значимость PDSS2
экспрессии оценивали с помощью 238 пар хирургическим путем резекции желудка тканей с анализом подгруппы на основе GC подвидов.
Результаты
экспрессии PDSS2
мРНК была уменьшена в 73% GC клетки линии по сравнению с контрольной незлокачественный клетки. В PDSS2
промотор гиперметилированы в клетках с пониженной PDSS2
экспрессии и лечения этих клеток с ингибитором метилирования реактивировать PDSS2
выражение. GC ткани выражена значительно более низкие средние уровни PDSS2
мРНК по сравнению с соседними нормальными тканями (P &
л; 0,001). Паттерн экспрессии белка PDSS2 согласуется с этим его мРНК. Уменьшение PDSS2
экспрессии мРНК в тканях GC (менее половины уровня экспрессии, обнаруженной в соответствующих нормальных окружающих тканей) в значительной степени коррелирует с повышенным уровнем антигена 19-9 (P
= 0,015), лимфоузлов метастаз (P = 0,022
), и короче, безрецидивная выживаемость после радикального резекции (P
= 0,022). Кроме того, многомерный анализ выявил PDSS2
экспрессию мРНК как независимый прогностический фактор (отношение рисков 1,95, 95% доверительный интервал 1.22-3.09, P
= 0,005), а также его характер экспрессии и прогностическое значение были схожи между тремя подтипами GC .
Выводы
PDSS2
кодирует предполагаемый подавитель опухоли, и мы покажем здесь, что его экспрессия регулируется гиперметилированием его промотора в GC клетки. Подавление PDSS2
экспрессии мРНК может служить новым биомаркером всех типов GC.
Ключевые слова
Желудочный рак пренил дифосфат синтазы субъединицу 2 Expression метилирование подтип фон
Хотя заболеваемость раком желудка (GC) сокращается в большинстве развитых стран, она остается одной из самых распространенных причин рака, связанных смерти во всем мире [1] - [3]. Соответствующее стратификация пациентов является ключевым аспектом индивидуального подхода, что привело к снижению смертности от этого вида рака [4], [5].
По его эпидемиологии, патологии и локализации в организме, GC признан трех различных злокачественных опухолей возникающие в том же органе [6] - [8]. Шах и др. [9] предложил убедительного классификацию GC согласно гистологических и анатомических критериев следующим образом: (1) проксимальный nondiffuse GC, где опухоль расположена в основном в кардии желудка с признаками предшественника железистой дисплазии или на месте карциномы в присутствии хронического воспаления в , как правило, без атрофии; (2) диффузный ГХ, который может быть расположен в любом месте в желудке без видимой гастрита, который обладает совершенно диффузный характер инфильтрации клеток с низкодифференцированная фенотипа; и (3) дистальный nondiffuse ГХ, который расположен в основном в дистальном отделе желудка с признаками хронического гастрита, который преимущественно дифференцированными или проявляет кишечную фенотип. В этом исследовании они показали, что три подтипа GC отличаются их профилей экспрессии генов. Таким образом, генетическое разнообразие GC подвидов следует рассматривать при изучении генетических и эпигенетических изменений, связанных с желудочной канцерогенеза и прогрессии.
Пренил дифосфат-синтазы субъединицу 2 (PDSS2
) был идентифицирован в 2005 году [10], а также данные свидетельствуют о что он действует как подавитель опухоли [11], [12]. PDSS2
необходим для синтеза коэнзима Q10 (CoQ10) [13], [14], который синтезируется в внутренней мембране митохондрий и играет жизненно важную роль в митохондриальной дыхательной цепи, пиримидинового нуклеозида биосинтез и модуляцию апоптоза [15]. PDSS2
находится в хромосомный локус 6q16.3-21, сайт частых микросателлитных нестабильности ДНК и потерей гетерозиготности (LOH) в GC [16], [17], поддерживая свою роль в качестве супрессора опухоли в эпителиальных клеток желудка , Кроме того, PDSS2
может подавлять развитие злокачественных меланом и рака легких [11], [12]. Кроме того, Чен и др. Сообщается, что в исполнение избыточную экспрессию PDSS2
приводит к апоптозу в клеточной линии GC, вызывая остановку клеточного цикла в фазе G0 /G1 [18]. Эти отчеты привели нас сделать предположение, что PDSS2
является потенциальным GC-связанных генов и кандидат нового клинически соответствующего прогностического маркера ГК.
В этом исследовании, экспрессии и статуса метилирования PDSS2
в GC были определены для оценки клинической значимости и регуляторных механизмов PDSS2
экспрессии в GC. Наши результаты указывают на то, что PDSS2
выражение обеспечивает потенциальную клиническую биомаркеров прогрессирования и рецидива GC.
Материалы и методы
этики
Данное исследование соответствовало этическим рекомендациям Всемирной медицинской ассоциации Хельсинкской декларации -Ethical принципы медицинских исследований с участием человека и было одобрено Институциональным наблюдательным советом университета Нагоя, Япония. Письменное согласие на использование клинических образцов и данных, в соответствии с требованиями этическими комитетами, было получено от всех пациентов [4].
Сбора образцов
клеточных линий Одиннадцать GC (H111, KATOIII, MKN1, MKN28, MKN45 , MKN74, NUGC2, NUGC3, NUGC4, СК-2-НУ и СК-6-LCK) и CCL-241 (незлокачественный клеточная линия получена из тонкой кишки) были получены из американской коллекции типовых культур (Manassas, VA, США) или университет Тохоку, Япония. Линии GC клеток культивировали при 37 ° С в среде RPMI-1640 (Sigma-Aldrich, St. Louis, MO, USA), дополненной 10% фетальной телячьей сыворотки в атмосфере, содержащей 5% CO <суб> 2. Для CCL-241, 30 нг /мл эпидермального фактора роста (Sigma-Aldrich) добавляли в среду. Первичные ткани GC и соответствующие нормальные окружающие ткани были собраны от 238 пациентов, перенесших резекцию желудка для GC в больнице Университета Нагоя в период между 2001 и 2012 больных, получавших неоадъювантной терапии, были исключены, потому что было трудно получить раковые клетки от травмированных тканей. Образцы были классифицированы гистологически с использованием 7-е издание Союза по международному контролю над раком (UICC) классификации [19]. Соответствующие параметры клинико-патологические были получены из медицинских записей. Для того, чтобы оценить ли уровень экспрессии PDSS2
коррелируют с опухолевым фенотипом, пациенты были разделены на три группы в соответствии с определением GC подвидов в соответствии с критериями Шах и др. [9] следующим образом: проксимальная nondiffuse, диффузной, и дистальный тип nondiffuse. С 2006 года, адъювантной химиотерапии с использованием S-1 (пероральный фторированной пиримидинового) вводят все стадии UICC II-III больных с ГК при отсутствии противопоказаний по состоянию пациента [20]. Пациенты наблюдались по крайней мере, один раз в 3 месяца в течение 2 лет после операции, а затем каждые 6 месяцев в течение 5 лет или до смерти. Физическое обследование, лабораторные анализы, и к улучшенному компьютерная томография (грудной клетки и брюшной полости) проводили при каждом визите. Химиотерапия для больных с отдаленными метастазами или после восстановления определяли по усмотрению врача. Образцы
ткани были немедленно замораживали в жидком азоте и хранили при -80 ° С. Образцы опухоли без некротических областей (около 5 мм
2) были извлечены при макроскопическом наблюдении и только образцов, подтвержденных на сегодняшний составляют более 80% компонентов опухоли от H &Amp; E окрашивание были включены в данное исследование. Соответствующих нормальных смежные образцы слизистой оболочки желудка &К раствору 5 ° см от края опухоли были получены из того же самого пациента [21]
Количественные в режиме реального времени обратной транскрипции полимеразной цепной реакции (QRT-PCR)
тотальную РНК. (10 мкг на образец), выделяли из линий 11 GC клеток, CCL-241, 238 первичных GC тканей и соответствующие нормальные окружающие ткани были использованы для генерации кДНК, который амплифицировали с использованием специфических праймеров для ПЦР (дополнительный файл 1: Таблица S1). Обнаружение в реальном времени SYBR® интенсивности зеленой флуоресценции проводили с использованием системы ABI StepOnePlus ПЦР в реальном времени (Applied Biosystems, Foster City, CA, USA). Экспрессия мРНК GAPDH
количественно оценивали в каждом образце по стандартизации. Реакции QRT-PCR в каждом образце были проведены в трех экземплярах. Уровень экспрессии каждого образца представлены в виде значения PDSS2
ампликона, деленное на что из GAPDH,
[22]. PDSS2
экспрессия мРНК была определена как снижение в GC тканях, когда ее уровень был меньше, чем вдвое меньше, соответствующей нормальной смежной ткани.
Анализ области промотора PDSS2
нуклеотидной последовательности в PDSS2
область промотора, анализировали, чтобы определить наличие или отсутствие CpG островков определяется следующим образом: по меньшей мере 200 п.н. участок ДНК с высоким содержанием GC (> 50%) и Наблюдаемое отношение CpG /ожидаемая CpG-≥0.6 [23] , Мы использовали программное обеспечение CpG острова Searcher (HTTP:.. //Cpgislands USC Edu /) для определения местоположения CpG островков [24]
метилирования конкретных ПЦР (ССП) и бисульфит анализ последовательности
. PDSS2
обладает остров CpG вблизи его промоторной области, и мы предположили, что аберрантных метилирования отвечает за регулирование транскрипции PDSS2
в GC. Образцы ДНК из линий 11 GC клеток, обработанных бисульфит были подвергнуты и MSP анализа нуклеотидной последовательности [25]. Последовательности праймеров, используемых для MSP и бисульфита последовательности перечислены в дополнительном файле 1: Таблица S1
5-аза-2'-дезоксицитидин (5-аза-О.К.) лечение
Чтобы оценить отношение промотора гиперметилированием к PDSS2.
транскрипции, GC клетки (1,5 × 10 6) обрабатывали 5-аза-ПСТ (Sigma-Aldrich), чтобы ингибировать метилирование ДНК и культивировали в течение 6 дней со средними изменениями в дни 1, 3 и 5. РНК экстрагировали, и оТ-ПЦР проводили, как описано [7].
иммуногистохимии (IHC)
IHC анализ локализации PDSS2 проводили с использованием мышиных моноклональных антител против PDSS2 (ab119768, Abcam, Кембридж, Соединенное Королевство ) разводили 1: 150 в разбавителе антитела (Dako, Glostrup, Дания), чтобы исследовать 30 представительных фиксированных формалином и залитых парафином участки хорошо сохранившегося ГХ ткани, описанной ранее [3]. Окрашивание модели были сопоставлены между ШС и соответствующих нормальных окружающих тканей. Чтобы избежать субъективности, образцы были рандомизированы и кодируются перед проведением анализа двумя независимыми наблюдателями, которые не знали о состоянии образцов. Каждый наблюдатель оценивали все образцы, по крайней мере в два раза, чтобы свести к минимуму изменения внутри наблюдателя [7].
Оценка клинической значимости экспрессии PDSS2
Корреляция между рисунком PDSS2
экспрессии мРНК и клинико-патологическими параметрами были оценены в соответствии с различия между тремя подтипами GC. Подгруппа анализ выживаемости в соответствии с ГК подтипа было проведено с целью определения влияния PDSS2
выражение результатов пациентов.
Статистический анализ
относительных уровней экспрессии мРНК (PDSS2 /GAPDH
) между GC и прилегающих к нему нормальные ткани были проанализированы с помощью теста Манна-Уитни U
. Χ
2 тест использовали для анализа значимости ассоциации между экспрессией и метилирования статус PDSS2
и клинико-патологическими параметрами. Конкретные болезни и показатели выживаемости без признаков заболевания были рассчитаны с использованием метода Каплана-Мейера, а разница в кривых выживаемости анализировали с помощью лог-рангового теста. Мы провели многомерный регрессионный анализ для выявления прогностических факторов с использованием модели пропорциональных рисков Кокса и переменные с P &
ЛТ; 0,05 были введены в окончательной модели. Все статистические анализы были проведены с использованием JMP 10 программного обеспечения (SAS Institute Inc, Кэри, Северная Каролина, США). Значение P &
ЛТ; 0,05 считали статистически значимыми.
Результаты идентификации острова CpG в промоторе PDSS2
остров CpG был идентифицирован в PDSS2
области промотора с использованием CpG острова Searcher. Свойства острова CpG являются следующие: 1655 п.н., 55,9% GC, и 0,70 Наблюдаемые /ожидаемый коэффициент CpG CpG (Рис. 1А) Поэтому мы предположили, что гиперметилирование островов CpG регулирует экспрессию PDSS2
в GC. Рисунок 1 Метилирование анализ PDSS2 в ГХ клеточных линиях. (A) На острове CpG обозначено синей линии с центром на PDSS2
инициации транскрипции сайта, простирающейся вверх по течению в области промотора. (B) Гистограммы показывают PDSS2
уровни экспрессии мРНК в CCL-241 (управление незлокачественный клетки) и линии клеток GC до или после обработки 5-аза-ПСТ. Статус метилирования промотора PDSS2
оценивали с использованием ССП, и результаты заключаются в коробке. M, метилированной; рм, частично метилированный; U, неметилированным. (С) Типичные результаты анализа последовательностей бисульфита. Все сайты CpG в KATOIII клетки были сохранены в качестве CG и тех MKN74 были преобразованы в TG.
Выражение PDSS2 мРНК и статус метилирования в линиях GC клеток
Значительное снижение PDSS2
уровней мРНК были обнаружены в семи (73 %) из 11 линий ГХ клеток по сравнению с уровнем экспрессии клетки CCL-241 (данные для GC тканей описаны ниже). Там не было никакого видимого различия в уровнях экспрессии между линиями клеток, полученных из дифференцированных и недифференцированной ГКС (Фиг.1В). Гиперметилирование PDSS2
промотор был обнаружен в MKN1, SC-2-NU, KATOIII, MKN45 и клеток NUGC3 (рис 1В). Для того, чтобы определить, ингибирует ли гиперметилирование PDSS2
промотор транскрипции, уровни экспрессии мРНК сравнивали до и после обработки клеток с ингибитором метилирования 5-аза-ПСТ. PDSS2
уровни мРНК были восстановлены в клетках с понижающей регуляции PDSS2
выражение сопровождающих гиперметилирование после обработки 5-аза-ПСТ (рис 1B), указывая, что промотор гиперметилирование тормозится PDSS2
транскрипцию в GC. Типичные хроматограммы анализа последовательность PDSS2
промоторной области в MKN28 (полная метилирования) и NUGC4 (отсутствие метилирования) клеток показаны на рисунке 1C.
Характеристики пациентов
популяции пациентов включали 179 мужчин и 59 женщины в возрасте от 20 до 84 лет (65,3 × 11,7 лет, средний × стандартное отклонение). Патологически, 139 и 99 пациентов были диагностированы с недифференцированной и дифференцированной GC соответственно. Пациенты были разделены на три GC фенотипов следующим образом: nondiffuse, 54; диффузный, 48; и дистальный nondiffuse, 136. В соответствии с 7-м издании классификации UICC, 58, 40, 71 и 69 пациентов находились в стадии I, II, III и IV, соответственно. Сто шестьдесят четыре пациентов в стадии I-III прошли R0 резекция. Шестьдесят из 69 пациентов в UICC стадии IV были диагностированы как стадия IV в связи с положительной перитонеального лаважа цитологии, локализованного перитонеального метастазирования или отдаленными метастазами лимфатических узлов. Восемь пациентов в стадии IV была синхронная метастаз печени, один был метастаз легких, и они подверглись гастрэктомия целью контролировать кровотечение или препятствие к прохождению
пищи. Уровней экспрессии мРНК PDSS2 и белка в хирургически удаленных тканях
средний уровень экспрессии мРНК PDSS2
была ниже, в ГЦ тканях по сравнению с нормальных окружающих тканей (Р
&л; 0,001); Тем не менее, не было никаких существенных различий в PDSS2
уровней экспрессии мРНК между пациентами с недифференцированном или дифференцированном GC (Рисунок 2А). Паттерн экспрессии PDSS2 оценивали с использованием IHC. Типичные случаи с пониженным PDSS2 окрашивания тканей GC показаны на рисунке 2B. В целом, окрашивающие образцы PDSS2 согласуются с данными QRT-PCR. Рисунок 2. Экспрессия анализ PDSS2 в клинических образцах. (A) Средний уровень PDSS2
мРНК в GC тканях по сравнению с соответствующими нормальными окружающими тканями и в тканях GC между пациентами с недифференцированной GC и дифференцированной GC. Данные (B) представитель IHC сравнивая экспрессию PDSS2 в опухоли и смежной нормальной смежной ткани (увеличено 100 × и 400 ×). N, нормальная смежной ткани; T, опухолевой ткани
. Прогностическое значение уровня экспрессии мРНК PDSS2
Выражение PDSS2
мРНК в тканях GC была снижена в 76 (32%) из 238 пациентов (менее половины уровня экспрессии, обнаруженных в соответствующие нормальные окружающие ткани). Болезньспецифическая выживаемость больных со сниженной уровни PDSS2
мРНК в ШС была значительно ниже по сравнению с теми, без (ставки 5-летняя выживаемость, 36% и 64% соответственно, P &
ЛТ; 0,001, рис 3A). Снижение уровня PDSS2
мРНК в ШС были связаны с углеводным антигеном (CA) 19-9 > 37 МЕ /мл и метастаз лимфатических узлов (таблица 1). Одномерный анализ выживаемости без признаков заболевания конкретных показали, что GC подтип (проксимального nondiffuse или диффузное), СА 19-9 > 37 МЕ /мл, размер опухоли (≥50 мм), pT4, недифференцированные опухоли, вовлечение лимфатической, инвазия сосудов, инвазивный рост, метастазов в лимфатических узлах, положительный перитонеальный лаваж цитологии и снижение PDSS2
экспрессию мРНК в GC ткани были значительными прогностический факторы неблагоприятных исходов. Многофакторный анализ выявил снизился PDSS2
экспрессии мРНК как независимый прогностический фактор (отношение рисков 1,95, 95% доверительный интервал 1.22-3.09, P
= 0,005, таблица 2). Пропорциональных рисков предположение в модели Кокса оценивали с помощью моделей, включая время-по-регрессоров взаимодействий и без каких-либо существенных нарушений были найдены в модели. Рисунок 3 прогностическое значение экспрессии PDSS2 мРНК у пациентов с GC. (А) Болезнь-специфическая выживаемость больных со сниженной PDSS2
мРНК в GC ткани. (B) (C) Болезни специфических (В) и безрецидивная (C) выживаемости среди 168 пациентов, перенесших резекцию R0.
Таблица 1 Взаимосвязь между уровнем экспрессии мРНК PDSS2 и клинико-патологическими параметрами 238 пациентов
Переменные
DecreasedPDSS2
мРНК в тканях GC (п)
Другие (п)
P значение
Возраст
0,408
&л; 65 год
29
71
≥ 65 год
47
91
Пол
0,551
Мале
59
120
Женский <бр> 17
42
Подтип
0,298
Проксимальный nondiffuse
22
32
Диффузный
14
33
Дистальный nondiffuse
40 <бр> 96
Карциноэмбриональный антиген (нг /мл)
0,490
≤ 5
59
132
> 5
17
30
углеводный антиген 19-9 (МЕ /мл)
0,015 *
≤ 37
55
139
> 37
21
23
Опухоль Размер (мм) 0,104
&л; 50
29
80
≤ 50
47
82
Глубина Опухоль (UICC)
0,419
pT1
14
32
pt2
6
24
pT3
19
33
pT4
37
73
Дифференциация
0,217
Дифференцированный
36 <бр> 63
недифференцированных
40
99
участие лимфатической
0,201
Absent
8
27
Представить
68
135
судно вторжения
0,535
Absent
31
73
Представить
45
89
инфильтративный тип роста
0,443
инвазивный рост
24
59
резкого роста
52
102
лимфатического узла метастаз (UICC)
0,022 *
pn0
19
70
pN1
8
19
PN2
12
24
pN3
37
49
перитонеального лаважа цитологии
0,306
Отрицательная
57
131
Положительный
19
31
Отдаленные метастазы (UICC)
0,228
M0
50
119
M1
26
43 <бр> * Статистически значимое (P &
л; 0,05). GC, рак желудка; UICC, Союз по международному контролю рака.
Таблица 2 прогностическими факторами для выживаемости без признаков заболевания специфичной 238 пациентов
переменных
п (%)
Одномерный
Multivariable
коэффициент опасности
95% ДИ
P
значение
отношение
опасности
95% ДИ
P
значение
Возраст (≥65)
138 (58%)
1,04
0,67 - 1,61
0,843
Пол (женский)
59 (25%)
1,29
0,79 - 2,05
0,301
Подтип (дистальный nondiffuse)
136 (57%)
0,43
0,28 - 0,67
&лт; 0,001
0,64
0.40 - 1.01
0,056
Карциноэмбриональный антиген (> 5 нг /мл)
47 (20%)
1,48
0,86 - 2,42
0,149
углеводный антиген 19-9 (> 37 МЕ /мл)
44 (18%)
1,98
1.17 - 3.20
0,012
1,23
0,71 - 2,06 <бр> 0,445
размер опухоли (≥50 мм)
129 (54%)
2,86
1,78 - 4,80
&л; 0,001
1,40
0,83 - 2,42
0,211
глубина опухоли (pT4, UICC)
110 (46%)
4.17
2,61 - 6,88
&лт; 0,001
1,38
0,78 - 2,50
0,273 <бр> Опухоль дифференциация (недифференцированные)
139 (58%)
2,03
1,28 - 3,32
0,002
1,45
0,83 - 2,60
0,197
лимфатической участие
203 (85%)
6,31
2,36 - 25,8
&лт; 0,001
1,45
0,45 - 6,50
0,559
судно вторжения
134 (56%) <бр> 2,65
1,66 - 4,37
&л; 0,001
1,75
1,07 - 2,97
0,026 *
инвазивный рост
83 (35%)
3.03
1,97 - 4,70
&л; 0,001
1,19
0,70 - 2,05
0,520
лимфоузлов метастаз
149 (63%)
7,02
3,70 - 15,1
&л; 0,001
1,38
0,56 - 3,81
0,503
перитонеального лаважа цитологии (положительный) 50
(21%)
4,33
2,76 - 6,74
&лт; 0,001
1,87
1,14 - 3,06
0,014 *
UICC этап (III-IV)
140 (59%)
9,68
4,97 - 21,8
&л; 0,001 <бр> 2,63
0,94 - 7,83
0,065
Снижение PDSS2
мРНК в GCS
76 (32%)
2.18
1.40 - 3.37
&лт; 0,001
1,91
1,19 - 3,04
0,008 *
* Статистически значимое в многомерном анализе. GC, рак желудка; CI, доверительный интервал; UICC, Союз по международной борьбе против рака.
Из 168 пациентов, перенесших резекцию R0, коэффициент выживаемости конкретных заболеваний была значительно ниже для тех, с уменьшением PDSS2
экспрессию мРНК в ШС (п = 50) по сравнению с теми, без (п = 118) (5-летняя выживаемость, 50% и 77%, соответственно, P
= 0,006, рис 3B). Пациенты со сниженной PDSS2
экспрессия мРНК в ШС испытывали значительно более ранние рецидивы после операции по сравнению с пациентами без (ставки 2-летних безрецидивной выживаемости, 64% и 84%, соответственно, P = 0,022
, Рисунок 3C). Первоначальные рекуррентные участки 43 рецидивирующих пациентов со сниженной PDSS2
экспрессия мРНК в ШС были перитонеальный в 21 (49%), печень у 6 (14%), лимфатический узел в 13 (30%) и другие (например, легкие и кости) у 3 больных. С другой стороны, те из 61 пациентов без рецидивирующей снизилась PDSS2
были перитонеальный в 35 (57%), печень в 10 (16%), лимфатический узел в 8 (13%) и другие у 8 больных. Пациенты со сниженной PDSS2
экспрессия мРНК в ШС, вероятно, рецидив узла, хотя оно не достигало статистической значимости.
Подгруппа анализ экспрессии PDSS2 в соответствии с ГК подтипа
Среднее PDSS2
экспрессии мРНК уровни были эквивалентны в GC и нормальных окружающих тканей (рис 4а). Точно так же, прогностическое значение уменьшилось PDSS2
экспрессии мРНК в ШС была сопоставима между тремя подтипами GC (Рисунок 4B). Рисунок 4 Анализ в подгруппах GC подвидов. Уровни экспрессии (A) PDSS2
мРНК среди трех подтипов GC как в GC и нормальных окружающих тканей. (B) Сравнение выживаемости без признаков заболевания конкретных больных и без снижения PDSS2
экспрессии мРНК в ШС каждого подтипа GC.
Обсуждение
PDSSs являются гетеротетрамерными ферменты, содержащие субъединиц, кодируемых PDSS1
(10p12. 1) и PDSS2
[10], [12]. Активность PDSS требует от обеих субъединиц [10], [14], [15]. Ассоциация PDSS2 с услугой GC был рассмотрен из-за его хромосоме (6q21), а также из-за его инактивации или потери от некоторых злокачественных новообразований [16], [26]. Здесь показано, что PDSS2
мРНК гетерогенно выраженный в ГХ клеточных линий, и его экспрессия ингибируется в 73% и 32% клеточных линий ГХ и опухолевых тканей, соответственно. Мы обнаружили гиперметилирование PDSS2
промотора в течение пяти (45%) линий 11 GC клеток со значительно уменьшенными уровнями PDSS2
выражения. Кроме того, PDSS2
транскрипции была возобновлена после того, как клетки обрабатывали ингибитором метилирования ДНК. Эти данные являются первыми, насколько нам известно, чтобы показать, что промотор гиперметилирование регулирует PDSS2
транскрипции. Тем не менее, PDSS2
выражение было снижено в некоторых клетках GC без гиперметилированием. Поскольку хромосома 6Q является частым местом LOH в GC [17], [26], [27], LOH может регулировать PDSS2
выражение, а также.
Там был доклад, демонстрирующий, что было выражено PDSS2
при пониженных или незаметного экспрессии в небольшом количестве образцов биопсии GC [18]. В настоящем исследовании мы проанализировали 238 хирургических образцов опухолей и соответствующего незатронутой ткани, чтобы получить более глубокое представление о клинической значимости PDSS2
экспрессии в GC. В соответствии с анализом злокачественной меланомы и рака легких [11], [12], большинство пациентов с ГК таил сниженный уровень PDSS2
мРНК в GC тканях, а средний PDSS2
уровень экспрессии был значительно снизился в сравнении GC с нормальными окружающими тканями. IHC было проведено с целью определить, отражает ли уровень мРНК PDSS2
экспрессию белка. Поскольку результаты IHC показали, что данные мРНК в соответствии с уровнем белка, последующие анализы были выполнены в соответствии с данными мРНК, которые более пригодны для количественного анализа [7], [23].
Снижение PDSS2
экспрессия мРНК в ШС была в значительной степени связано с повышенными уровнями предоперационной CA19-9 и метастазов в лимфатических узлах и был идентифицирован как независимый прогностический фактор. Кроме того, пациенты со сниженной PDSS2
экспрессию мРНК в GC ткани испытывали значительно раньше рецидива после резекции R0. В последнее время, Чен и др. исследовали активность подавлять опухоли PDSS2
при раке легкого [28]. Они сообщили, что принудительное сверхэкспрессия PDSS2
вызвало массовую гибель клеток путем апоптоза и образование существенно тормозится колоний и существует обратная зависимость между PDSS2
выражение выражение и gelsolin, которое, как известно, ингибирует апоптоз и увеличить инвазию клеток и метастазирование [29], хотя PDSS2 не влияет на чувствительность раковых клеток к химиотерапевтическим препаратам [28]. Эта опухоль подавляющих механизм PDSS2
может быть применен к GC, а также.
Паттерн экспрессии PDSS2
мРНК и ее прогностическое воздействия были сходны между тремя подтипами GC (проксимальная nondiffuse, диффузные и дистальной nondiffuse) , указывая, что PDSS2
выражение влияет на патогенез всех типов ГХ. Шах и др. сообщили, что одна треть амплифицированных генов, возможно, в том числе PDSS2
, показали эквивалентную схему экспрессии среди трех подтипов GC [9].
ГХ одна из опухолей с высокой частотой аберрантных метилирования, и она часто демонстрирует КПГ остров methylator фенотип [30], [31]. Выражение большого числа генов подавляется CpG острова гиперметилированием в GC клетки, в том числе, кодирующие опухолевых супрессоров, регуляторы клеточного цикла, индукторов и палачей апоптоза, белки, которые способствуют инвазивный фенотип, и ремонт несовпадение ДНК ферментов [32]. Эти эпигенетические изменения могут служить в качестве биомаркеров, которые освещают увеличенный метастатический потенциал и агрессивного фенотипа опухоли [33], а также терапевтические цели [34]. Таким образом, идентификация других генов, которые регулируются с помощью метилирования в GC клетки, вероятно, улучшить управление GC
Функция опухоли подавляющий из PDSS2
поддержаны присутствующими выводы следующим образом:. (1) снижение экспрессии PDSS2
часто обнаруживается в тканях GC, (2) средний уровень PDSS2
экспрессии значительно ниже в GC тканях, и (3) снижение экспрессии PDSS2
было связано с ранним рецидивом и последующим плохим прогнозом. PDSS2
уровни экспрессии в тканях биопсии получены с использованием образцов эндоскопического наблюдения или в хирургических образцах могут быть полезны для прогнозирования раннего рецидива и плохой прогноз, который, скорее всего, усилия по оказанию помощи в разработке более эффективных терапевтических стратегий.
Это исследование было ограничено его отсутствие достаточного функционального анализа PDSS2
, который закаляет вывод о том, что он действует как подавитель опухоли в GC. Дальнейшие исследования, включая анализ пути в желудочном канцерогенезе и функционального анализа, как ожидается, прояснить молекулярные механизмы, лежащие в основе биологической активности PDSS2
в GC.
Заключение
В заключение, наши результаты подтверждают вывод о том, что экспрессия мнимый супрессоров опухолей ген PDSS2
регулируется промотором гиперметилированием в GC клетках и указывают. Наши результаты указывают на то, что дальнейшее снижение экспрессии PDSS2
мРНК может представлять собой новый биомаркер для прогрессии и рецидива всех видов GC. Вклад
Авторского
MK, HO, FS, DS, HT, RH и КМ Проведенные эксперименты и анализ данных. DK, CT, SY, TF, GN, HS, МК, МФ и Ю.К. собраны случаи и клинические данные. MK и SN задуман и разработан исследование и подготовил первоначальную рукопись. YK курировал проект. Все авторы внесли свой вклад в окончательный вариант рукописи.