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La santé et la diversité de nos microbiomes sont connues depuis longtemps pour affecter notre santé. Par conséquent, il y a eu des recherches considérables sur les effets de l'alimentation sur les bactéries qui vivent en nous. Étonnamment, des études transversales ont rapporté peu de différence entre les impacts de différents aliments sur les populations bactériennes.
Les dernières recherches ont porté sur les changements quotidiens de la composition du microbiome intestinal humain par rapport à l'apport alimentaire sur une base individuelle. Chacun des 34 sujets a tenu un registre de tout ce qu'il a mangé pendant 17 jours.
Les types et les quantités de bactéries présentes dans les échantillons de selles prélevés au cours de la même période ont été analysés par métagénomique au fusil de chasse. L'analyse détaillée a permis aux chercheurs d'évaluer comment les microbiomes de différentes personnes, ainsi que les enzymes et les fonctions métaboliques qu'elles influencent, changeaient de jour en jour en fonction de ce qu'ils mangeaient.
La majorité des sujets avaient des relations détectables entre les changements quotidiens dans les aliments qu'ils consommaient et les changements quotidiens dans l'abondance relative des espèces dans leur microbiome. Cependant, les changements dans le microbiome n'étaient pas déterminés par le contenu nutritionnel des régimes alimentaires des sujets.
Par ailleurs, très peu des interactions observées entre les aliments et les microbes étaient cohérentes entre les individus. En effet, les données révèlent que les interactions aliments-microbes sont hautement personnalisées et liées à des aliments spécifiques.
Un petit sous-ensemble de données suggère également qu'un régime alimentaire varié est également important. Deux des participants à l'étude qui n'ont consommé qu'un seul type de boisson de remplacement de repas pendant la durée de l'étude ont montré une variation du microbiome d'un jour à l'autre, suggérant qu'un régime alimentaire stable ne conduit pas nécessairement à un microbiome stable.
Co-auteur Dan Knights, de l'Université du Minnesota :
Le microbiome a été lié à un large éventail de conditions humaines, y compris les troubles métaboliques, maladies auto-immunes, et les infections, il y a donc une forte motivation pour manipuler le microbiome avec l'alimentation comme un moyen d'influencer la santé.
Cette étude suggère que c'est plus compliqué que de simplement regarder les composants alimentaires comme les fibres et le sucre. Beaucoup plus de recherches sont nécessaires avant de pouvoir comprendre comment la gamme complète de nutriments dans les aliments affecte la façon dont le microbiome réagit à ce que nous mangeons. »
Les aliments qui ont des étiquettes nutritionnelles similaires peuvent avoir des effets très différents sur nos microbiomes. Par conséquent, afin de promouvoir ou de supprimer une espèce bactérienne particulière par une intervention alimentaire, le régime peut devoir être adapté à la composition spécifique du microbiome d'un individu.