Les patients atteints de SDRA sont généralement placés sur des ventilateurs pour aider à obtenir suffisamment d'oxygène dans leur corps. Maintenant, une nouvelle recherche présentée lors du congrès international « virtuel » de l'European Respiratory Society a révélé que le fait d'avoir moins de types différents de champignons dans les poumons est lié à une sévérité accrue de la maladie chez les patients atteints du SDRA.
Le microbiome humain est composé de minuscules organismes tels que les bactéries, virus et champignons. Présenter ses recherches à la réunion, Mme Noël Britton, un doctorant à l'Université de Pittsburgh, ETATS-UNIS, a déclaré que jusqu'à présent, les chercheurs avaient eu tendance à se concentrer sur l'étude des effets des bactéries sur la santé humaine, en partie parce que le microbiome est principalement composé de bactéries et qu'il existe des difficultés techniques pour extraire suffisamment de champignons à étudier.
"En termes de nombre de cellules, les champignons sont plus nombreux que les bactéries de plusieurs ordres de grandeur, " elle a dit.
"En outre, alors qu'il est désormais bien établi que les poumons abritent un microbiome distinct et dynamique, ils ne représentent pas un environnement riche pour le développement des microbes, et ils ont généralement beaucoup moins de microbes que l'intestin - le site du corps où les scientifiques ont concentré le plus de recherches sur le microbiome.
Il peut être difficile de capter un signal d'une masse de champignons aussi faible et d'être sûr que les séquences identifiées ne sont pas dues à une contamination en laboratoire.
"Nous voulions mener cette recherche car le syndrome de détresse respiratoire aiguë est caractérisé par une sur-réaction hyper-inflammatoire du système immunitaire et nous savons que les champignons peuvent être impliqués dans l'activation et la régulation du système immunitaire humain."
"Il n'y a pas de thérapies connues pour le traitement réussi du SDRA et on sait très peu de choses sur les raisons pour lesquelles certains patients ont une réponse hyper-inflammatoire. La diversité du microbiome, et en particulier des champignons, peut jouer un rôle important pour comprendre pourquoi certains patients développent un SDRA et d'autres pas."
Mme Britton et ses collègues ont inscrit 202 patients ventilés mécaniquement dans l'étude entre octobre 2011 et septembre 2019. Pour autant qu'ils le sachent, aucun de ces patients n'avait de COVID-19, mais ils continuent d'inscrire des patients pendant la pandémie et une analyse future examinera ceux dont le COVID-19 a été confirmé.
Sur les 202 patients de cette analyse, 21% avaient un diagnostic de MRA, l'âge moyen était de 50 ans et 61 % étaient des femmes.
Les chercheurs ont collecté des sécrétions à base de mucus de la trachée (la principale voie aérienne menant aux poumons) et extrait l'ADN à analyser en laboratoire à l'aide d'une technique appelée séquençage de nouvelle génération.
Mme Britton a déclaré:"Nous avons identifié environ 100 types différents de champignons dans les poumons des appareils à ventilation mécanique, patients gravement malades. La diversité était assez faible dans tous les échantillons, mais dans les échantillons dans lesquels une seule espèce dominait, la diversité était très faible."
"Un grand nombre de patients avaient des échantillons dominés par une seule espèce fongique de type Candida; cela représentait plus de 50% des champignons présents dans ces échantillons et il est connu pour être impliqué dans la maladie chez l'homme."
La diversité fongique était plus faible chez les patients atteints de SDRA que chez ceux sans maladie. Chez les patients atteints de SDRA, choc, la septicémie et la défaillance d'organes étaient associées à une plus faible diversité.
La diminution de la diversité était liée à des lésions plus graves des poumons, un traitement plus intensif et des niveaux élevés d'une protéine appelée pentraxine-3, qui est un indicateur de l'inflammation et de la gravité de la maladie.
L'association d'une plus faible diversité fongique avec des marqueurs cliniques de la gravité de la maladie est une découverte importante car elle fournit des preuves d'une relation entre le microbiome pulmonaire et les résultats cliniques dans les maladies graves. Nous continuerons à étudier cela plus avant car il y a beaucoup de choses qui ne sont pas comprises sur le développement et le traitement du SDRA et cette étude peut nous orienter vers une découverte importante basée sur le diagnostic ou le traitement. »
Noël Britton, Doctorat., Université de Pittsburgh
On ne sait pas comment se développe la diversité fongique (ou autre micro-organisme), mais les champignons sont plus susceptibles d'entrer dans les poumons en inhalant de minuscules quantités de salive dans les poumons.
"En tant que deuxième plus grande surface muqueuse du corps humain, à peu près la même taille qu'un court de tennis, les poumons humains sont constamment exposés aux champignons par inhalation, " a déclaré Mme Britton.
"Les champignons en suspension dans l'air sont particulièrement répandus, comprenant jusqu'à 50, 000 spores par mètre cube d'air, et ainsi les voies respiratoires sont exposées à une grande variété. Les champignons inhalés peuvent être extrêmement divers et inclure des espèces connues pour causer des maladies ainsi que celles considérées comme inoffensives pour l'homme. »
Tobias Welte, qui n'a pas participé à la recherche, est l'ancien président de l'European Respiratory Society, Professeur de médecine pulmonaire et directeur du département des maladies pulmonaires et infectieuses à la faculté de médecine de l'université de Hanovre, Allemagne.
Il a déclaré :« Au cours des dernières années, beaucoup d'attention s'est concentrée sur le microbiome, en particulier dans l'intestin, et sa relation avec divers problèmes de santé. Les champignons sont plus difficiles à étudier que les autres composants du microbiote pulmonaire, comme les bactéries et les virus, mais nous commençons à voir plus de preuves qu'ils ont également un rôle dans les maladies pulmonaires chroniques.
« Le résultat de cette étude, qu'une moindre diversité du mycobiome est liée à de moins bons résultats pour les patients atteints du syndrome de détresse respiratoire aiguë, est fascinant. Il est trop tôt pour savoir ce que cela pourrait signifier pour les patients et leurs médecins, mais il a le potentiel de conduire à de nouveaux tests de diagnostic et à de meilleurs traitements. »
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