El estudio piloto, financiado por el Instituto Nacional del Cáncer de Francia y promovido por la Red de Hospitales Públicos de París (AP-HP) como parte de un programa hospitalario para la investigación clínica del cáncer (PHRC-K), condujo al desarrollo de un análisis de sangre no invasivo que identifica el fenómeno epigenético asociado con la disbiosis. La prueba fue validada en 1, 000 individuos. Estos hallazgos fueron publicados en la revista procedimientos de la Academia Nacional de Ciencias (PNAS) el 11 de noviembre de 2019.
El cáncer colorrectal esporádico se puede desarrollar en pacientes sin factores de riesgo conocidos. Ocurre como resultado de interacciones complejas entre las personas y su entorno. La creciente incidencia de esta condición refleja desarrollos ambientales negativos, que puede desencadenar alteraciones en el ADN genético y epigenético de las células huésped, promoviendo así la aparición de cáncer colorrectal esporádico.
Varios estudios han investigado el papel de la microbiota como mediadora de estas interacciones. El equipo del Departamento de Gastroenterología del Hospital Henri-Mondor AP-HP y la Universidad Paris-Est Créteil, junto con un equipo compuesto por miembros del Inserm y la Unidad de Patogenia Microbiana Molecular del Institut Pasteur (U1202), y la Cátedra de Microbiología y Enfermedades Infecciosas del Collège de France, demostraron en ratones que el mecanismo epigenético desencadenado por algunas bacterias de la microbiota contribuye a la aparición o promoción del cáncer colorrectal esporádico. Posteriormente validaron sus hallazgos en humanos.
Los 136 ratones del estudio fueron trasplantados con heces frescas de nueve pacientes con cáncer colorrectal esporádico o heces frescas de nueve pacientes sin trastornos del colon. El procedimiento se llevó a cabo en el Hospital Henri-Mondor AP-HP. Los dos puntos de los ratones se examinaron 7 y 14 semanas después del trasplante de microbiota fecal humana. Los equipos investigaron particularmente el número y el desarrollo de focos de criptas aberrantes (o ACF, un tipo de lesión precancerosa), el perfil microbiano y el daño al ADN colónico. También tomaron en cuenta la ingesta alimentaria de los animales, indicadores de peso y sangre.
Mediante pruebas estadísticas se identificó un vínculo entre la disbiosis fecal (un desequilibrio en la composición de las bacterias intestinales) y la firma genética y epigenética del ADN en los tejidos de los animales. Los ratones que habían recibido heces frescas de pacientes con cáncer colorrectal esporádico desarrollaron lesiones precancerosas conocidas como focos de criptas aberrantes (ACF) sin ningún cambio genético significativo en el colon. pero tenían una mayor cantidad de genes hipermetilados, que se han relacionado significativamente con la incidencia de ACF en la mucosa colónica.
Tras comprobar los vínculos entre la disbiosis fecal y las anomalías del ADN (metilación) en los pacientes con cáncer colorrectal esporádico que participaron en los trasplantes fecales, Se llevó a cabo un estudio piloto en humanos con el objetivo de desarrollar una análisis de sangre reproducible que se puede utilizar para el diagnóstico temprano de tumores colorrectales en pacientes asintomáticos. La validación prospectiva de la prueba se realizó el 1, 000 pacientes asintomáticos a los que se les debía realizar una colonoscopia. Para identificar las bacterias involucradas, se secuenció todo su genoma bacteriano. El nivel de hipermetilación de tres genes se definió como un índice de metilación acumulativo (CMI). Los pacientes fueron clasificados según su CMI (positivo o negativo). Un análisis identificó un CMI positivo como factor predictivo de la aparición de cáncer colorrectal esporádico.
Esta investigación muestra que la microbiota de sujetos con cáncer colorrectal esporádico induce lesiones precancerosas del colon en animales por la hipermetilación de un pequeño número de genes. Por tanto, la CMI y / o las bacterias metilantes podrían utilizarse como marcadores de diagnóstico para este tipo de cáncer. Estos hallazgos iniciales deberán evaluarse y confirmarse en un ensayo clínico.