Skupina znanstvenikov pod vodstvom Alison Murray, Dr. Desert Research Institute (DRI) v Renu tako mislijo, in iščejo mikrobiom antarktičnega ascidiana, imenovanega Synoicum adareanum, da bi bolje razumeli možnosti za razvoj zdravila, specifičnega za melanom.
Ascidijci, ali "morske brizge", so primitivni, morske živali, podobne vreči, ki živijo pritrjene na morsko dno po vsem svetu, in se hranijo s planktonom s filtriranjem morske vode.
S. adareanum, ki raste v majhnih kolonijah v vodah okoli Antarktike, je znano, da vsebuje bioaktivno spojino, imenovano "palmerolid A" z obetavnimi lastnostmi proti melanomu - in raziskovalci menijo, da spojino proizvajajo bakterije, ki so naravno povezane s S. adareanum.
V novem prispevku, objavljenem ta mesec v reviji Marine Drugs, Murray in sodelavci z Univerze v Južni Floridi, Nacionalni laboratorij Los Alamos, in Univerza v Nantesu, Francija, predstaviti pomembne nove ugotovitve, ki merijo ravni palmerolida v vzorcih, zbranih na antarktiškem otočju Anvers Island Archipelago, in označujejo skupnost bakterij, ki sestavljajo mikrobiom S. adareanum.
Naš dolgoročni cilj je ugotoviti, katera od številnih bakterij te vrste proizvaja palmerolid, ampak da bi to naredil, o mikrobiomu S. adareanum se moramo veliko naučiti. Naša nova študija opisuje številne napredke, ki smo jih v zadnjih nekaj letih dosegli pri doseganju tega cilja. "
Alison Murray, Doktor znanosti, Inštitut za raziskovanje puščav
Leta 2008 je Murray je sodeloval z Billom Bakerjem, Doktor znanosti, z Univerze v Južni Floridi, in podoktorski raziskovalec DRI Christian Riesenfeld, Doktor znanosti, objaviti študijo o mikrobni raznolikosti enega posameznika S. adareanum.
Njihova nova študija temelji na tej raziskavi z opisom mikrobne raznolikosti 63 različnih posameznikov, zbranih z otoka Anvers.
Njihovi rezultati identificirajo tisto, kar raziskovalci imenujejo "jedrni mikrobiom" vrste - skupni sklop 21 bakterijskih taksonov, ki so bili prisotni v več kot 80 odstotkih vzorcev, in šest taksonov bakterij, ki so bili prisotni v vseh 63 vzorcih.
"To je ključni" prvi "za antarktično znanost, ki je uspel najti in identificirati ta osrednji mikrobiom v precej obsežni regionalni študiji teh organizmov, "To je informacija, ki jo moramo preiti na naslednji korak pri identifikaciji proizvajalca palmerolida."
Še en "prvi" za antarktično znanost, in za preučevanje naravnih proizvodov v naravi na splošno, je bila primerjava ravni palmerolida v vseh 63 vzorcih, ki je pokazala, da je bila spojina prisotna v vsakem vzorcu pri visokih (miligramov na gram vzorca tkiva vzorca), vendar raziskovalci niso našli trendov med spletnimi mesti, vzorci, ali mikrobiomske bakterije.
Dodatna analiza, ki obravnava sočasne odnose taksonov v velikem naboru podatkov, je pokazala nekatere načine medsebojnega delovanja bakterij med seboj in z gostiteljsko vrsto v tem morskem ekosistemu.
"Sam mikrobiom je edinstven po sestavi drugih ascidijcev, in se zdi precej zanimivo, z veliko interakcije, "Je dejal Murray." Naša študija je odprla vrata za razumevanje ekologije tega sistema. "
Iz zbirke bakterij, za katere so raziskovalci ugotovili, da tvorijo osrednji mikrobiom S. adareanum, naslednjič upajo, da bodo z genomskim pristopom končno ugotovili, katera od bakterij proizvaja palmerolid - pomemben in potreben napredek pri razvoju zdravljenja melanoma.
"Uporaba te spojine bi bila res velika za razvoj zdravila za boj proti melanomu, ker je trenutno le malo zdravil, ki jih je mogoče uporabiti za zdravljenje, "Je rekel Murray.
"Če lahko prepoznamo bakterije, ki proizvajajo to kemikalijo, in s svojim genomom razumeti, kako ga gojiti v laboratoriju, to bi nam omogočilo trajnostno oskrbo s palmerolidom, ki se ne bi opirala na nabiranje divjih populacij te vrste na Antarktiki. "