Grupa znanstvenika predvođena Alison Murray, Dr. Sc. Instituta za istraživanje pustinje (DRI) u Renu misli tako, te traže mikrobiom antarktičkog ascidijana pod imenom Synoicum adareanum kako bi bolje razumjeli mogućnosti razvoja lijeka specifičnog za melanom.
Ascidijanci, ili "morske šprice", primitivni su, morske životinje nalik vrećicama koje žive vezane uz dna oceana diljem svijeta, i hrane se planktonom filtriranjem morske vode.
S. adareanum, koja raste u malim kolonijama u vodama koje okružuju Antarktik, poznato je da sadrži bioaktivni spoj pod nazivom "Palmerolid A" s obećavajućim svojstvima protiv melanoma - a istraživači vjeruju da spoj proizvode bakterije koje su prirodno povezane sa S. adareanum.
U novom članku objavljenom ovog mjeseca u časopisu Marine Drugs, Murray i suradnici sa Sveučilišta Južna Florida, Nacionalni laboratorij Los Alamos, i Université de Nantes, Francuska, predstavljaju važna nova otkrića koja mjere razinu palmerolida u uzorcima prikupljenim s antarktičkog otočnog arhipelaga Anvers i karakteriziraju zajednicu bakterija koje čine mikrobiom S. adareanum.
Naš dugoročni cilj je otkriti koja od mnogih bakterija unutar ove vrste proizvodi palmerolid, ali da to učiniš, moramo puno naučiti o mikrobiomu S. adareanum. Naša nova studija opisuje mnoge pomake koje smo postigli prema tom cilju u posljednjih nekoliko godina. "
Alison Murray, Doktor znanosti, Institut za istraživanje pustinje
Godine 2008. Murray je radio s Billom Bakerom, Dr. Sc., sa Sveučilišta Južna Florida, i DRI postdoktorski istraživač Christian Riesenfeld, Dr. Sc., objaviti studiju o mikrobnoj raznolikosti jedne jedinke S. adareanum.
Njihova nova studija nadograđuje ovo istraživanje karakterizirajući mikrobnu raznolikost 63 različite jedinke prikupljene s otoka Anvers.
Njihovi rezultati identificiraju ono što istraživači nazivaju "jezgreni mikrobiom" vrste - zajednički skup od 21 bakterijske svojte koje su bile prisutne u više od 80 posto uzoraka, i šest svojti bakterija prisutnih u sva 63 uzorka.
"To je ključni" prvi "za antarktičku znanost koji je uspio pronaći i identificirati ovaj središnji mikrobiom u prilično velikoj regionalnoj studiji ovih organizama, "Ovo je podatak koji nam je potreban da prijeđemo na sljedeći korak identifikacije proizvođača palmerolida", rekao je Murray.
Još jedan "prvi" za antarktičku znanost, i za proučavanje prirodnih proizvoda u prirodi općenito, bila je usporedba razine palmerolida u svih 63 uzorka koja je pokazala da je spoj prisutan u svakom uzorku na visokim razinama (miligram po gramu tkiva uzorka), ali istraživači nisu pronašli trendove između web stranica, uzorci, ili mikrobiomske bakterije.
Dodatna analiza koja se bavi odnosima zajedničke pojave svojti u velikom skupu podataka pokazala je neke od načina na koje bakterije međusobno djeluju i s vrstama domaćinima u ovom morskom ekosustavu.
"Sam mikrobiom je jedinstven po sastavu od drugih ascidijanaca, i čini se prilično zanimljivim, s puno interakcije, "Murray je rekao." Naša studija otvorila je vrata za razumijevanje ekologije ovog sustava. "
Iz skupa bakterija za koje su istraživači utvrdili da čine jezgru mikrobioma S. adareanum, zatim se nadaju da će koristiti genomski pristup kako bi konačno mogli identificirati koje od bakterija proizvode palmerolid - važan i potreban napredak prema razvoju liječenja melanoma.
"Bilo bi zaista velika stvar upotrijebiti ovaj spoj za razvoj lijeka za borbu protiv melanoma, jer trenutno postoji tako malo lijekova koji se mogu koristiti za liječenje, “Rekao je Murray.
"Ako možemo identificirati bakterije koje proizvode ovu kemikaliju, i sa svojim genomom razumjeti kako ga uzgajati u laboratorijskim uvjetima, to bi nam omogućilo održivu opskrbu palmerolidom koja se ne bi oslanjala na sakupljanje divljih populacija ove vrste na Antarktiku. "