Synoicum adareanum viser nye muligheder for udvikling af melanomspecifik medicin

Kan kuren mod melanom - den farligste form for hudkræft - være en forbindelse, der stammer fra et marine hvirvelløse dyr, der lever i bunden af ​​havet?

En gruppe forskere under ledelse af Alison Murray, Ph.d. fra Desert Research Institute (DRI) i Reno synes det, og ser til mikrobiomet fra en antarktisk ascidian kaldet Synoicum adareanum for bedre at forstå mulighederne for udvikling af et melanomspecifikt lægemiddel.

Ascidians, eller "havsprøjt" er primitive, sac-lignende havdyr, der lever knyttet til havbunden rundt om i verden, og lever af plankton ved at filtrere havvand.

S. adareanum, som vokser i små kolonier i farvandet omkring Antarktis, vides at indeholde en bioaktiv forbindelse kaldet "Palmerolid A" med lovende anti -melanomegenskaber - og forskere mener, at forbindelsen produceres af bakterier, der naturligt er forbundet med S. adareanum.

I et nyt papir, der blev offentliggjort i denne måned i tidsskriftet Marine Drugs, Murray og samarbejdspartnere fra University of South Florida, Los Alamos nationale laboratorium, og Université de Nantes, Frankrig, præsentere vigtige nye fund, der måler palmerolidniveauer på tværs af prøver indsamlet fra Antarktis Anvers Island Archipelago og karakteriserer det bakteriesamfund, der udgør mikrobiomet af S. adareanum.

Vores langsigtede mål er at finde ud af, hvilken af ​​de mange bakterier inden for denne art, der producerer palmerolid, men for at gøre dette, der er meget, vi skal lære om mikrobiomet af S. adareanum. Vores nye undersøgelse beskriver mange fremskridt, vi har gjort mod dette mål i løbet af de sidste par år. "

Alison Murray, Ph.d., Desert Research Institute

I 2008, Murray arbejdede sammen med Bill Baker, Ph.d., fra University of South Florida, og DRI -postdoktor Christian Riesenfeld, Ph.d., at publicere en undersøgelse om den mikrobielle mangfoldighed af et individ S. S. adareanum.

Deres nye undersøgelse bygger videre på denne forskning ved at karakterisere den mikrobielle mangfoldighed af 63 forskellige individer, der blev indsamlet fra omkring Anvers Island.

Deres resultater identificerer, hvad forskerne kalder artens "kernemikrobiom" - en fælles pakke med 21 bakterielle taxaer, der var til stede i mere end 80 procent af prøverne, og seks bakterielle taxa, der var til stede i alle 63 prøver.

"Det er en nøgle" første "for antarktisk videnskab at have været i stand til at finde og identificere dette kernemikrobiom i en temmelig stor regional undersøgelse af disse organismer, "Murray sagde." Dette er oplysninger, som vi har brug for at komme til det næste trin med at identificere producenten af ​​palmerolid. "

Endnu en "første" for antarktisk videnskab, og til undersøgelse af naturlige produkter i naturen generelt, var en sammenligning af palmerolidniveauer på tværs af alle 63 prøver, der viste, at forbindelsen var til stede i hver prøve ved høje (milligram pr. gram prøvevæv) niveauer, men forskerne fandt ingen tendenser mellem websteder, prøver, eller mikrobiombakterier.

Yderligere analyse, der kigger på taxa's forekomstrelationer på tværs af det store datasæt, viste nogle af måderne, hvorpå bakterier interagerer med hinanden og med værtsarterne i dette marine økosystem.

"Mikrobiomet i sig selv er unikt i sammensætning fra andre ascidianer, og synes at være temmelig interessant, med meget interaktion, "Murray sagde." Vores undersøgelse har åbnet dørene for at forstå økosystemet i dette system. "

Fra den samling af bakterier, som forskerne har identificeret som værende kernemikrobiomet i S. adareanum, de håber derefter at bruge en genomisk tilgang til endelig at kunne identificere, hvilke af bakterierne der producerer palmerolid - et vigtigt og nødvendigt fremskridt mod udviklingen af ​​en melanombehandling.

"Det ville være en virkelig stor ting at bruge denne forbindelse til at udvikle et lægemiddel til bekæmpelse af melanom, fordi der i øjeblikket er så få lægemidler, der kan bruges til at behandle det, "Sagde Murray.

"Hvis vi kan identificere de bakterier, der producerer dette kemikalie, og med dets genom forstår, hvordan man dyrker det i laboratoriemiljø, dette ville gøre det muligt for os at levere en bæredygtig forsyning af palmerolid, der ikke ville stole på at høste vilde populationer af denne art på Antarktis. "

• Psykologiske faktorer betyder mere end fysisk ydeevne til marin træning
• Irritabel tarmsygdom øger risikoen for demens