Ryhmä tiedemiehiä Alison Murrayn johdolla, Ph.D. Renon Desert Research Institute (DRI):n mielestä, ja etsivät Etelämantereen ascidianin mikrobiomia nimeltä Synoicum adareanum ymmärtääkseen paremmin melanoomaspesifisen lääkkeen kehittämismahdollisuuksia.
Ascidians, tai "meriruiskuja", ovat alkeellisia, pussimaisia merieläimiä, jotka elävät kiinni merenpohjassa ympäri maailmaa, ja ruokkivat planktonia suodattamalla merivettä.
S. adareanum, joka kasvaa pienissä pesäkkeissä Etelämanterta ympäröivillä vesillä, tiedetään sisältävän bioaktiivisen yhdisteen nimeltä "Palmerolide A", jolla on lupaavat melanooman vastaiset ominaisuudet - ja tutkijat uskovat, että yhdistettä tuottavat bakteerit, jotka liittyvät luonnollisesti S. adareanumiin.
Uudessa artikkelissa, joka julkaistiin tässä kuussa Marine Drugs -lehdessä, Murray ja yhteistyökumppanit Etelä -Floridan yliopistosta, Los Alamosin kansallinen laboratorio, ja Nantesin yliopisto, Ranska, esittelee tärkeitä uusia havaintoja, jotka mittaavat palmerolidipitoisuuksia Antarktiksen Anvers Islandin saaristosta kerättyjen näytteiden välillä ja luonnehtivat S. adareanumin mikrobiomin muodostavaa bakteeriyhteisöä.
Pidemmän aikavälin tavoitteemme on selvittää, mikä tämän lajin monista bakteereista tuottaa palmerolidia, mutta tehdäkseni tämän, meidän on opittava paljon S. adareanumin mikrobiomista. Uusi tutkimuksemme kuvaa monia edistysaskeleita, joita olemme tehneet kohti tätä tavoitetta viime vuosina. "
Alison Murray, Tohtori, Desert Research Institute
Vuonna 2008, Murray työskenteli Bill Bakerin kanssa, Ph.D., Etelä -Floridan yliopistosta, ja DRI -tutkijatohtori Christian Riesenfeld, Ph.D., julkaisemaan tutkimuksen yhden yksittäisen S. adareanumin mikrobien monimuotoisuudesta.
Heidän uusi tutkimus perustuu tähän tutkimukseen karakterisoimalla Anvers Islandin ympäriltä kerättyjen 63 eri yksilön mikrobien monimuotoisuutta.
Tulokset osoittavat, mitä tutkijat kutsuvat lajin "ydinmikrobiomiksi" - yhteiseksi 21 bakteeritaksoniksi, joita oli yli 80 prosentissa näytteistä, ja kuusi bakteeritaksonia, joita oli kaikissa 63 näytteessä.
"On tärkeä" ensimmäinen "Etelämantereen tieteelle, että se on pystynyt löytämään ja tunnistamaan tämän ydinmikrobiomin melko laajassa alueellisessa tutkimuksessa näistä organismeista, "Murray sanoi." Tämä on tieto, joka meidän on päästävä seuraavaan vaiheeseen palmerolidin tuottajan tunnistamiseksi. "
Toinen "ensimmäinen" Etelämantereen tieteelle, ja luonnontuotteiden tutkiminen luonnossa yleensä, verrattiin palmerolidipitoisuuksia kaikissa 63 näytteessä, mikä osoitti, että yhdistettä oli läsnä jokaisessa näytteessä korkeilla (milligramma grammaa näytteen kudosta) tasoilla, mutta tutkijat eivät löytäneet trendejä sivustojen välillä, näytteet, tai mikrobiomibakteereja.
Lisäanalyysi, jossa tarkasteltiin taksonien esiintymissuhteita suuressa tietojoukossa, osoitti joitain tapoja, joilla bakteerit ovat vuorovaikutuksessa keskenään ja isäntälajien kanssa tässä meren ekosysteemissä.
"Mikrobiomi itsessään on ainutlaatuinen koostumukseltaan muista ascideista, ja vaikuttaa mielenkiintoiselta, paljon vuorovaikutusta, "Murray sanoi." Tutkimuksemme on avannut oven ymmärtää tämän järjestelmän ekologiaa. "
Bakteerikokoelmasta, jonka tutkijat ovat tunnistaneet muodostavan S. adareanumin ydinmikrobiomin, seuraavaksi he toivovat käyttävänsä genomiikan lähestymistapaa voidakseen lopulta tunnistaa, mitkä bakteerit tuottavat palmerolidia - mikä on tärkeä ja tarpeellinen edistysaskel kohti melanoomahoidon kehittämistä.
"Olisi todella iso asia käyttää tätä yhdistettä kehittämään lääke melanooman torjumiseksi, koska tällä hetkellä on vain niin vähän lääkkeitä, joita voidaan käyttää sen hoitoon, "Murray sanoi.
"Jos voimme tunnistaa bakteerit, jotka tuottavat tätä kemikaalia, ja sen genomilla ymmärtää, kuinka sitä voidaan viljellä laboratorioympäristössä, Näin pystyisimme tarjoamaan kestävän palmerolidivarannon, joka ei olisi riippuvainen tämän lajin luonnonvaraisten kantojen keräämisestä Etelämantereella. "