Группа ученых под руководством Элисон Мюррей, Кандидат наук. из Исследовательского института пустынь (DRI) в Рино так думают, и изучают микробиом антарктического асцидиана под названием Synoicum adareanum, чтобы лучше понять возможности разработки лекарства, специфичного для меланомы.
Асцидийцы, или "морские брызги", примитивны, мешковидные морские животные, обитающие на дне океана по всему миру, и питаются планктоном, фильтруя морскую воду.
S. adareanum, который растет небольшими колониями в водах, окружающих Антарктиду, известно, что он содержит биоактивное соединение под названием «пальмеролид А» с многообещающими антимеланомными свойствами - и исследователи считают, что это соединение вырабатывается бактериями, которые естественным образом связаны с S. adareanum.
В новой статье, опубликованной в этом месяце в журнале Marine Drugs, Мюррей и его сотрудники из Университета Южной Флориды, Лос-Аламосская национальная лаборатория, и Нантский университет, Франция, представить важные новые результаты измерения уровней пальмеролида в образцах, собранных с архипелага острова Анверс в Антарктиде, и характеризующие сообщество бактерий, составляющих микробиом S. adareanum.
<цитата>Наша долгосрочная цель - выяснить, какая из многих бактерий этого вида продуцирует пальмеролид, но для этого Нам нужно многое узнать о микробиоме S. adareanum. Наше новое исследование описывает многие успехи, которых мы добились в достижении этой цели за последние несколько лет ».
Элисон Мюррей, Кандидат наук., Институт исследований пустынь
В 2008, Мюррей работал с Биллом Бейкером, Кандидат наук., Университета Южной Флориды, и докторант DRI Кристиан Ризенфельд, Кандидат наук., опубликовать исследование микробного разнообразия одной особи S. adareanum.
Их новое исследование основывается на этом исследовании, характеризуя микробное разнообразие 63 разных особей, собранных со всего острова Анверс.
Их результаты идентифицируют то, что исследователи называют «основным микробиомом» вида - общий набор из 21 бактериального таксона, который присутствовал в более чем 80 процентах образцов. и шесть бактериальных таксонов, которые присутствовали во всех 63 образцах.
«Это ключевая« первая »возможность для антарктической науки найти и идентифицировать этот основной микробиом в довольно большом региональном исследовании этих организмов, «Это информация, которая нам нужна, чтобы перейти к следующему этапу идентификации производителя пальмеролида», - сказал Мюррей.
Еще один «первый» для антарктической науки, и для изучения натуральных продуктов в природе в целом, было сравнение уровней пальмеролида во всех 63 образцах, которое показало, что соединение присутствует в каждом образце на высоких (миллиграмм на грамм ткани образца) уровнях, но исследователи не обнаружили тенденций между сайтами, образцы, или микробиомные бактерии.
Дополнительный анализ, направленный на одновременное появление взаимосвязей таксонов в большом наборе данных, показал некоторые способы взаимодействия бактерий друг с другом и с видами-хозяевами в этой морской экосистеме.
"Сам микробиом уникален по составу от других асцидий, и кажется довольно интересным, с большим взаимодействием, - сказал Мюррей. - Наше исследование открыло двери для понимания экологии этой системы ».
Из множества бактерий, которые исследователи определили как составляющие основной микробиом S. adareanum, Затем они надеются использовать подход геномики, чтобы, наконец, определить, какие из бактерий продуцируют пальмеролид - важное и необходимое продвижение в разработке лечения меланомы.
"Было бы очень важно использовать это соединение для разработки лекарства для борьбы с меланомой, потому что на данный момент существует очень мало лекарств, которые можно использовать для его лечения, "Сказал Мюррей.
"Если мы сможем идентифицировать бактерии, которые производят это химическое вещество, и с его геномом понять, как культивировать его в лабораторных условиях, это позволило бы нам обеспечить устойчивые поставки пальмеролида, которые не зависели бы от добычи диких популяций этого вида в Антарктиде ».