Alison Murray vezette tudóscsoport, Ph.D. a Reno -i Sivatagi Kutatóintézet (DRI) szerint, és a Synoicum adareanum nevű antarktiszi aszidiánus mikrobiómáját keresik, hogy jobban megértsék a melanoma-specifikus gyógyszer kifejlesztésének lehetőségeit.
Ascidians, vagy "tengeri fröcskök", primitívek, zsákszerű tengeri állatok, amelyek világszerte az óceánfenékhez kötődnek, és planktonból táplálkoznak a tengervíz szűrésével.
S. adareanum, amely kis kolóniákban nő az Antarktisz körüli vizekben, Ismert, hogy "Palmerolide A" nevű bioaktív vegyületet tartalmaz, amely ígéretes melanomaellenes tulajdonságokkal rendelkezik - és a kutatók úgy vélik, hogy a vegyületet olyan baktériumok állítják elő, amelyek természetesen kapcsolódnak az S. adareanum -hoz.
Ebben a hónapban a Marine Drugs folyóiratban megjelent új cikkben Murray és munkatársai a Dél -Floridai Egyetemen, a Los Alamos Nemzeti Laboratórium, és a Nantes -i Egyetem, Franciaország, fontos új eredményeket mutat be, amelyek az Antarktisz Anvers Island Archipelago -jából gyűjtött mintákon mérik a palmerolid szintet, és jellemzik a S. adareanum mikrobiomját alkotó baktériumok közösségét.
Hosszabb távú célunk az, hogy kiderítsük, hogy a faj számos baktériuma közül melyik termel palmerolidot, de ezt megtenni, sok mindent meg kell tanulnunk a S. adareanum mikrobiómájáról. Új tanulmányunk számos előrelépést ír le, amelyeket az elmúlt néhány évben e cél elérése érdekében tettünk. "
Alison Murray, PhD., Sivatagi Kutatóintézet
2008-ban, Murray Bill Bakerrel dolgozott, Ph.D., a Dél -Floridai Egyetemről, és a DRI posztdoktori kutatója, Christian Riesenfeld, Ph.D., tanulmányt közzétenni egy S. S. adareanum mikrobiális sokféleségéről.
Új tanulmányuk erre a kutatásra épül, és jellemzi az Anvers -sziget környékéről gyűjtött 63 különböző egyén mikrobiális sokféleségét.
Eredményeik azonosítják azt, amit a kutatók a faj "magmikrobiómájának" neveznek - egy 21 bakteriális taxonból álló közös készletet, amely a minták több mint 80 százalékában volt jelen, és hat bakteriális taxont, amelyek mind a 63 mintában jelen voltak.
"Az" első "kulcsfontosságú az antarktiszi tudomány számára, hogy képes volt megtalálni és azonosítani ezt az alapvető mikrobiomot ezen organizmusok meglehetősen nagy regionális vizsgálatában, "Ezt Murray mondta." Ez olyan információ, amelyet el kell érnünk a következő lépéshez, hogy azonosítsuk a palmerolid gyártóját. "
Egy újabb "első" az antarktiszi tudomány számára, és általában a természetben lévő természetes termékek tanulmányozására, összehasonlítottuk a palmerolid szintet mind a 63 mintában, amelyek azt mutatták, hogy a vegyület minden mintában magas (milligramm / gramm mintaszövet) szintben volt jelen, de a kutatók nem találtak trendeket az oldalak között, minták, vagy mikrobiom baktériumok.
A taxonok együttes előfordulási összefüggéseit vizsgáló további elemzés a nagy adathalmazban azt mutatta, hogy a baktériumok kölcsönhatásba lépnek egymással és a gazdálkodó fajokkal ebben a tengeri ökoszisztémában.
"A mikrobiom összetétele egyedülálló más aszidiánoktól, és elég érdekesnek tűnik, sok interakcióval, "Murray azt mondta:" Tanulmányunk megnyitotta az ajtókat e rendszer ökológiájának megértéséhez. "
A baktériumokból, amelyek a kutatók szerint a S. adareanum mag mikrobiómáját alkotják, majd azt remélik, hogy genomikai megközelítést alkalmaznak, hogy végre azonosítani tudják, melyik baktérium termeli a palmerolidot - ez fontos és szükséges előrelépés a melanoma kezelésének fejlesztése felé.
"Nagyon nagy dolog lenne ezt a vegyületet felhasználni egy gyógyszer kifejlesztésére a melanoma leküzdésére, mert jelenleg csak kevés gyógyszer használható a kezelésre, - mondta Murray.
"Ha be tudjuk azonosítani azokat a baktériumokat, amelyek ezt a vegyi anyagot termelik, és genomjával megérteni, hogyan kell művelni laboratóriumi körülmények között, ez lehetővé tenné számunkra, hogy fenntartható palmerolid -kínálatot biztosítsunk, amely nem függne e faj vadpopulációinak legyűjtésétől az Antarktiszon. "