Mokslininkų grupė, vadovaujama Alison Murray, Ph.D. Reno dykumos tyrimų instituto (DRI) nuomone, ir ieško Antarkties ascidiano mikrobiomo, vadinamo Synoicum adareanum, kad geriau suprastų melanomos specifinio vaisto kūrimo galimybes.
Ascidai, arba „jūros kibirkštys“, yra primityvūs, į maišelius panašūs jūrų gyvūnai, gyvenantys prie vandenyno dugno visame pasaulyje, ir maitinasi planktonu filtruodami jūros vandenį.
S. adareanum, auga mažose kolonijose Antarktidą supančiuose vandenyse, yra žinoma, kad joje yra bioaktyvus junginys, pavadintas „Palmerolide A“, turintis daug žadančių anti -melanomos savybių - ir mokslininkai mano, kad junginį gamina bakterijos, kurios natūraliai yra susijusios su S. adareanum.
Šį mėnesį žurnale „Marine Drugs“ paskelbtame naujame dokumente Murray ir bendradarbiai iš Pietų Floridos universiteto, Los Alamos nacionalinė laboratorija, ir Nanto universitetas, Prancūzija, pateikti svarbūs nauji atradimai, matuojantys palmerolidų kiekį mėginiuose, surinktuose iš Antarktidos Anverso salos salyno, ir apibūdinantys bakterijų, sudarančių S. adareanum mikrobiomą, bendruomenę.
Mūsų ilgalaikis tikslas yra išsiaiškinti, kuri iš daugelio šios rūšies bakterijų gamina palmerolidą, bet tai padaryti, turime daug sužinoti apie S. adareanum mikrobiomą. Mūsų naujame tyrime aprašoma daug pažangos, kurią padarėme siekdami šio tikslo per pastaruosius kelerius metus “.
Alison Murray, Daktaras, Dykumos tyrimų institutas
2008 m. Murray dirbo su Billu Bakeriu, Daktaras, iš Pietų Floridos universiteto, ir DRI postdoktorantas Christianas Riesenfeldas, Daktaras, paskelbti vieno individo S. adareanum mikrobų įvairovės tyrimą.
Jų naujas tyrimas grindžiamas šiuo tyrimu, apibūdinant 63 skirtingų asmenų, surinktų iš Anverso salos, mikrobų įvairovę.
Jų rezultatai nustato tai, ką tyrėjai vadina „pagrindiniu rūšies mikrobiomu“ - bendrą 21 bakterinių taksonų rinkinį, kuris buvo daugiau nei 80 proc. ir šeši bakteriniai taksonai, esantys visuose 63 mėginiuose.
„Tai yra pagrindinis„ pirmasis “, kad Antarkties mokslas sugebėtų rasti ir identifikuoti šį pagrindinį mikrobiomą gana dideliame regioniniame šių organizmų tyrime, "Murray sakė." Tai yra informacija, kurią turime pereiti prie kito žingsnio - nustatyti palmerolido gamintoją ".
Kitas „pirmasis“ Antarkties mokslui, ir apskritai gamtinių produktų tyrimui, buvo palygintas visų 63 mėginių palmerolido kiekis, kuris parodė, kad junginio buvo kiekviename mėginyje esant dideliam (miligramo vienam gramui audinio) kiekiui, tačiau tyrėjai nerado tendencijų tarp svetainių, pavyzdžiai, arba mikrobiomos bakterijos.
Papildoma analizė, apžvelgianti taksonų atsiradimo santykius dideliame duomenų rinkinyje, parodė kai kuriuos būdus, kaip bakterijos sąveikauja tarpusavyje ir su šios jūrų ekosistemos šeimininkėmis.
„Pats mikrobiomas yra unikalus kitų ascidų sudėtyje, ir atrodo gana įdomu, daug sąveikos, "Murray sakė:" Mūsų tyrimas atvėrė duris suprasti šios sistemos ekologiją. "
Iš bakterijų, kurias tyrėjai nustatė kaip pagrindinę S. adareanum mikrobiomą, surinkimo, jie tikisi naudoti genomikos metodą, kad pagaliau galėtų nustatyti, kurios bakterijos gamina palmerolidą - tai yra svarbi ir reikalinga pažanga kuriant melanomos gydymą.
„Būtų tikrai didelis dalykas panaudoti šį junginį kuriant vaistą kovai su melanoma, nes šiuo metu yra labai mažai vaistų, kurie gali būti naudojami jo gydymui, “ - sakė Murray.
"Jei mes galime nustatyti bakterijas, kurios gamina šią cheminę medžiagą, ir su savo genomu supranta, kaip jį auginti laboratorijoje, tai leistų mums užtikrinti tvarų palmerolido tiekimą, kuris nebūtų priklausomas nuo laukinių šios rūšies populiacijų surinkimo Antarktidoje “.