Un grupo de científicos dirigido por Alison Murray, Doctor. del Desert Research Institute (DRI) en Reno creo que sí, y están analizando el microbioma de una ascidia antártica llamada Synoicum adareanum para comprender mejor las posibilidades de desarrollo de un fármaco específico para el melanoma.
Ascidias o "chorros de mar", son primitivos, animales marinos con forma de saco que viven adheridos a los fondos oceánicos de todo el mundo, y se alimentan de plancton filtrando el agua de mar.
S. adareanum, que crece en pequeñas colonias en las aguas que rodean la Antártida, se sabe que contiene un compuesto bioactivo llamado "Palmerolida A" con propiedades anti-melanoma prometedoras, y los investigadores creen que el compuesto es producido por bacterias que están naturalmente asociadas con S. adareanum.
En un nuevo artículo publicado este mes en la revista Marine Drugs, Murray y colaboradores de la Universidad del Sur de Florida, el Laboratorio Nacional de Los Alamos, y la Université de Nantes, Francia, presentan nuevos hallazgos importantes que miden los niveles de palmerólido en muestras recolectadas del archipiélago de la isla Anvers en la Antártida y caracterizan la comunidad de bacterias que componen el microbioma de S. adareanum.
Nuestro objetivo a largo plazo es averiguar cuál de las muchas bacterias de esta especie está produciendo palmerolida, pero para hacer esto, Hay mucho que debemos aprender sobre el microbioma de S. adareanum. Nuestro nuevo estudio describe muchos avances que hemos logrado hacia ese objetivo en los últimos años ".
Alison Murray, Doctor., Instituto de Investigaciones del Desierto
En 2008, Murray trabajó con Bill Baker, Doctor., de la Universidad del Sur de Florida, y el investigador postdoctoral de DRI Christian Riesenfeld, Doctor., publicar un estudio sobre la diversidad microbiana de un individuo S. adareanum.
Su nuevo estudio se basa en esta investigación al caracterizar la diversidad microbiana de 63 individuos diferentes que se recolectaron en los alrededores de la isla Anvers.
Sus resultados identifican lo que los investigadores llaman el "microbioma central" de la especie, un conjunto común de 21 taxones bacterianos que estaban presentes en más del 80 por ciento de las muestras. y seis taxones bacterianos que estaban presentes en las 63 muestras.
"Es una" primicia "clave para la ciencia antártica haber podido encontrar e identificar este microbioma central en un estudio regional bastante amplio de estos organismos, ", Dijo Murray." Esta es la información que necesitamos para dar el siguiente paso para identificar al productor de palmerolida ".
Otra "primicia" para la ciencia antártica, y para el estudio de los productos naturales en la naturaleza en general, fue una comparación de los niveles de palmerolida en las 63 muestras que mostró que el compuesto estaba presente en cada muestra en niveles altos (miligramos por gramo de tejido de muestra), pero los investigadores no encontraron tendencias entre sitios, muestras, o bacterias del microbioma.
Un análisis adicional que examinó las relaciones de co-ocurrencia de los taxones en el gran conjunto de datos mostró algunas de las formas en que las bacterias interactúan entre sí y con las especies hospedadoras en este ecosistema marino.
"El microbioma en sí es único en composición de otras ascidias, y parece bastante interesante con mucha interacción, Murray dijo. "Nuestro estudio ha abierto las puertas para comprender la ecología de este sistema".
A partir del conjunto de bacterias que los investigadores han identificado como componentes del microbioma central de S. adareanum, Luego esperan usar un enfoque genómico para finalmente poder identificar cuál de las bacterias está produciendo palmerolida, un avance importante y necesario hacia el desarrollo de un tratamiento para el melanoma.
"Sería muy importante utilizar este compuesto para desarrollar un fármaco para combatir el melanoma, porque hay muy pocos medicamentos en este momento que se pueden usar para tratarlo, "Dijo Murray.
"Si podemos identificar las bacterias que producen este químico, y con su genoma entender cómo cultivarlo en un entorno de laboratorio, esto nos permitiría proporcionar un suministro sostenible de palmerolida que no dependería de la recolección de poblaciones silvestres de esta especie en la Antártida ".