Skupina vedcov pod vedením Alison Murrayovej, Ph.D. myslí si to Výskumný ústav púšte (DRI) v Rene, a hľadajú mikrobióm antarktického ascidika nazývaného Synoicum adareanum, aby lepšie porozumeli možnostiam vývoja lieku špecifického pre melanóm.
Ascidici, alebo „morské striekačky“, sú primitívni, vačkovité morské živočíchy, ktoré žijú pripevnené k morskému dnu na celom svete, a živia sa planktónom filtráciou morskej vody.
S. adareanum, ktorý rastie v malých kolóniách vo vodách obklopujúcich Antarktídu, je známe, že obsahuje bioaktívnu zlúčeninu nazývanú „Palmerolid A“ so sľubnými anti -melanómovými vlastnosťami - a vedci sa domnievajú, že zlúčeninu produkujú baktérie, ktoré sú prirodzene spojené so S. adareanum.
V novom dokumente uverejnenom tento mesiac v časopise Marine Drugs, Murray a spolupracovníci z University of South Florida, Národné laboratórium Los Alamos, a Université de Nantes, Francúzsko, predstavujú dôležité nové zistenia merajúce hladiny palmerolidu vo vzorkách odobratých z antarktického súostrovia Anvers Island a charakterizujúce spoločenstvo baktérií, ktoré tvoria mikrobióm S. adareanum.
Našim dlhodobejším cieľom je zistiť, ktorá z mnohých baktérií v rámci tohto druhu produkuje palmerolid, ale urobiť to, je veľa, čo sa musíme naučiť o mikrobióme S. adareanum. Naša nová štúdia opisuje mnohé pokroky, ktoré sme za posledných niekoľko rokov urobili k dosiahnutiu tohto cieľa. “
Alison Murrayová, PhD., Výskumný ústav púští
V roku 2008, Murray pracoval s Billom Bakerom, Ph.D., z University of South Florida, a postdoktorandský výskumník DRI Christian Riesenfeld, Ph.D., publikovať štúdiu o mikrobiálnej diverzite jedného jedinca S. adareanum.
Ich nová štúdia nadväzuje na tento výskum a charakterizuje mikrobiálnu diverzitu 63 rôznych jedincov, ktorí boli zozbieraní z celého ostrova Anvers.
Ich výsledky identifikujú to, čo vedci nazývajú „jadrový mikrobióm“ tohto druhu - spoločná sada 21 bakteriálnych taxónov, ktoré boli prítomné vo viac ako 80 percentách vzoriek, a šesť bakteriálnych taxónov, ktoré boli prítomné vo všetkých 63 vzorkách.
"Je to kľúčové" prvé "pre antarktickú vedu, ktorá dokázala nájsť a identifikovať tento jadrový mikrobióm v pomerne rozsiahlej regionálnej štúdii týchto organizmov, „Povedal Murray.“ Toto sú informácie, ktoré potrebujeme na to, aby sme sa dostali k ďalšiemu kroku identifikácie výrobcu palmerolidu. “
Ďalšie „prvé“ pre antarktickú vedu, a na štúdium prírodných produktov v prírode vo všeobecnosti, bolo porovnaním hladín palmerolidu vo všetkých 63 vzorkách, ktoré ukázalo, že zlúčenina je prítomná v každej vzorke pri vysokých hladinách tkaniva (miligram na gram tkaniva), vedci však nenašli žiadne trendy medzi webmi, vzorky, alebo mikrobiómy.
Dodatočná analýza zameraná na vzťahy súbežného výskytu taxónov v rámci veľkého súboru údajov ukázala niektoré zo spôsobov, akými baktérie interagujú medzi sebou a s hostiteľskými druhmi v tomto morskom ekosystéme.
„Samotný mikrobióm je jedinečný v zložení od iných ascidikov, a zdá sa byť celkom zaujímavé, s mnohými interakciami, „Povedal Murray.“ Naša štúdia otvorila dvere k pochopeniu ekológie tohto systému. “
Zo súboru baktérií, ktoré vedci identifikovali ako tvoriace jadrový mikrobióm S. adareanum, ďalej dúfajú, že použijú genomický prístup, aby boli konečne schopní identifikovať, ktoré z baktérií produkujú palmerolid - dôležitý a potrebný pokrok smerom k vývoju liečby melanómu.
„Bolo by veľmi dôležité použiť túto zlúčeninu na vývoj lieku na boj proti melanómu, pretože v súčasnosti je len veľmi málo liekov, ktoré je možné použiť na liečbu, “Povedal Murray.
„Ak dokážeme identifikovať baktérie, ktoré produkujú túto chemikáliu, a so svojim genómom pochopte, ako ho kultivovať v laboratórnom prostredí, to by nám umožnilo poskytnúť udržateľné dodávky palmerolidu, ktoré by sa nespoliehali na zber voľne žijúcich populácií tohto druhu v Antarktíde. “