Poligenske ocene tveganja iz podatkov o več populacijah bi lahko izboljšale napovedi KVČB

Z uporabo genetskih podatkov skoraj 30, 000 ljudi, Raziskovalci Mount Sinai so zgradili ocene tveganja iz kombinacije podatkovnih nizov, ki predstavljajo različne populacije prednikov, ki izboljšujejo napovedovanje tveganja za vnetne črevesne bolezni (KVČB), vključno s Crohnovo boleznijo in ulceroznim kolitisom. Študija je bila objavljena leta Gastroenterologija 24. decembra.

Raziskovalci so ugotovili, da ocene poligenskega tveganja, zgrajena z uporabo podatkov o združenjih iz več populacij v večetnični BioMe Biobank Mount Sinai, maksimalne napovedi KVČB za vsako populacijo v biobanki. BioMe je sistemsko prizadevanje na gori Sinaj, ki revolucionira diagnozo in klasifikacijo bolezni glede na molekularni profil pacienta.

Študija je pokazala, da so ocene tveganja, izračunane na podlagi združevanja podatkov, bistveno izboljšale napovedi med posamezniki z evropskimi, Aškenazi Judje, in latinsko predniki v BioMe, kot tudi evropski posamezniki v biobanki Združenega kraljestva, ki vsebuje biološke in zdravstvene podatke o pol milijona ljudi, starih od 40 do 69 let, ki živijo v Združenem kraljestvu. Moč napovedovanja je bila nižja pri bolnikih z afriškim prednikom, verjetno zaradi bistveno manjših referenčnih podatkovnih nizov in bistveno večje genetske raznolikosti v populacijah afriškega porekla.

Sposobnost natančnega napovedovanja tveganja za genetske bolezni pri posameznikih iz vseh prednikov je kritična pot, ki lahko pozitivno vpliva na rezultate pacientov, saj se obravnavajo in razvijajo zgodnji posegi in celo preventivni ukrepi. Te ugotovitve podpirajo potrebo po večji genetski raznolikosti, vključno z več podatki o afroameriški populaciji, povečati napovedi tveganja za bolezni in zmanjšati zdravstvene razlike za vse populacije. "

Judy H. Cho, MD, Atudyjev starejši avtor, Dekan translacijske genetike in direktor Inštituta za osebno medicino Charles Bronfman, Medicinska šola Icahn, Gora Sinaj

Te ocene poligenskega tveganja-ki predstavljajo oceno celotnega tveganja na podlagi vsote številnih posameznikov, večinoma pogosti, genetske variante-izračunane so z uporabo podatkov o povezavi s KVČB iz kohort z evropskimi, Afriško ameriški, in aškenaskega judovskega ozadja.

Poleg tega, Raziskovalci so v vsaki populaciji ocenili redke variante genov, povezanih z zelo zgodnjim nastopom KVČB, in ugotovili, da so afroameriški nosilci občasnih variant LRBA pokazali zmanjšano izražanje beljakovin LRBA in CTLA-4. Pomanjkanje LRBA poveča dovzetnost za KVČB in povzroči nižjo ekspresijo CTLA-4, ki ga je mogoče odpraviti s običajno predpisanim antimalaričnim zdravilom klorokin. Prihodnje študije laboratorija Cho se bodo osredotočile na napovedovanje, za katere podskupine bolnikov bi lahko koristilo ciljanje na to pot.

"Ker lahko znižana ekspresija LRBA in CTLA-4 povzroči IBD, spodbudno je, da lahko klorokin delno obnovi izraz, "pravi prvi avtor študije Kyle Gettler, Doktor znanosti, podoktorski sodelavec na Oddelku za genetiko in genomske znanosti na Medicinski fakulteti Icahn na gori Sinaj.

• Študija ugotavlja učinke podhranjenosti na preživetje bolnikov po operaciji srca
• Faza 2/3 študije COVID-19 ocenjuje varnost,