Nový model by mohol predpovedať personalizovanú čakaciu dobu na progresiu rakoviny hrubého čreva a konečníka

Zrátané a podčiarknuté:Evolučný model využívajúci sériové vzorky krvi od pacientov s pokročilým kolorektálnym karcinómom liečených anti-EGFR terapiami v štúdii fázy II by mohol predpovedať personalizovaný čas čakania na progresiu.

Časopis, v ktorom bola štúdia publikovaná: Objavovanie rakoviny , časopis Americkej asociácie pre výskum rakoviny

Autori:Spoluautori Andrea Sottoriva, PhD., MSc, Chris Rokos, člen evolúcie a rakoviny, a vedúci tímu z Inštitútu pre výskum rakoviny, Londýn a Nicola Valeri, MD, PhD., vedúci tímu v biológii a genomike rakoviny gastrointestinálneho traktu na Ústave pre výskum rakoviny, Londýn, a konzultantom lekárskeho onkológa v The Royal Marsden NHS Foundation Trust

Východisko:„Kombináciou častého pozdĺžneho vzorkovania bezbunkovej DNA s matematickým modelovaním vývoja nádoru, boli sme schopní urobiť štatistické predpovede pacientov, u ktorých bolo riziko progresie, "Tiež sme mohli určiť, kedy sa rakovina vráti," povedala Sottoriva. od pacienta k pacientovi. Jedná sa o vôbec prvý prípad, kedy sa kvantitatívne prognózy tohto druhu úspešne použili pri rakovine. “

Zatiaľ čo klinickí lekári často používajú genotypizáciu nádoru na biopsiu nádoru, mnohé nádory majú vnútromaternicovú heterogenitu, ktorá môže viesť k rezistencii na liečbu; preto, na lepšie pochopenie toho, ako sa nádory vyvíjajú, aby odolali terapii, sú potrebné viaceré biopsie v čase a priestore, vysvetlil Valeri.

Tekuté biopsie sú neinvazívne, umožnenie zberu cirkulujúcej nádorovej DNA v mnohých časových bodoch bez ďalšieho rizika pre pacienta. Okrem toho, analýza cirkulujúcej nádorovej DNA môže zachytiť intratumorálnu heterogenitu lepšie ako malý kúsok nádoru, povedal Valeri.

Aj keď sa veľa výskumov zameriava na klinickú využiteľnosť bezbunkovej DNA (cfDNA) na monitorovanie chorôb, použitie tekutých biopsií ako prediktívneho nástroja na odhad času do progresie ochorenia nebolo dôkladne preskúmané, Sottoriva poznamenala.

Ako bola štúdia vykonaná a výsledky:Vedci analyzovali výsledky štúdie PROSPECT-C, ktorá hodnotila biomarkery reakcie a rezistencie na terapie anti-EGFR u pacientov s metastatickým kolorektálnym karcinómom RAS divokého typu. Biopsie nádoru boli odobraté pacientom vo vopred definovaných časových bodoch pred liečbou (východisková hodnota) a po liečbe (progresia ochorenia), a pri niektorých čiastočná odpoveď. Navyše, pacienti poskytovali vzorky plazmy každé štyri týždne až do progresie ochorenia.

Aj keď štandardná genotypizácia nádoru zaradila pacientov do kategórie metastázujúcich kolorektálnych karcinómov s divokým typom RAS, analýza základnej cfDNA odhalila, že mnohé z týchto nádorov pacientov mali odchýlky v RAS proteínoch, čo môže vysvetľovať, prečo boli rezistentné na cetuximab, inhibítor EGFR, poznamenal Valeri. Okrem toho, ultra hlboké sekvenovanie základných bioptických jadier nádorov odhalilo mutácie RAS, ďalšie zdôraznenie obmedzení štandardných metód genotypizácie nádorov, pridal.

Valeri a kolegovia vytvorili matematické modely, ktoré využívali hladiny cfDNA a karcinoembryonálneho antigénu (CEA) z plazmy jednotlivých pacientov na predpovedanie času do progresie. Výsledky boli validované pomocou meraní RECIST z rádiologických zobrazovacích údajov.

Matematický model využívajúci merania CEA bol aplikovaný na šesť pacientov na predpovedanie času do klinickej progresie. Z týchto predpovedí tri boli v rámci 10 percent času progresie, meraného pomocou RECIST.

Pozoruhodne, predpovede generované s vysokou citlivosťou profilovania cfDNA umožnili predpovedať čas progresie niekoľko týždňov vopred, v porovnaní s modelmi využívajúcimi merania CEA.

S informáciami získanými z cfDNA, vedci mohli vytvoriť viac modelov na základe predpovedaného rastu jednotlivých subklonov poháňaných rôznymi mutáciami. Presnosť modelov využívajúcich cfDNA závisí od identifikácie dominantných subklonov u pacientov s mechanizmami polyklonálnej rezistencie, Povedal Valeri.

Komentáre autora:„Integrácia nových monitorovacích technológií, ako je cfDNA, v kombinácii s matematickým modelovaním predpovedí nádorov, môže ponúknuť príležitosť konať skoro, zastaviť terapiu, alebo zmeňte liečbu, aby ste boli o krok pred chorobou, "povedala Valeri." Naša metóda umožňuje presnejšiu predikciu a tiež lepšie monitorovanie reakcie na terapiu. "

Obmedzenia štúdie:Obmedzenia štúdie zahŕňajú malú veľkosť vzorky, okrem zamerania sa na odchýlky dráhy RAS v matematických modeloch, keďže ostatné genetické a negenetické determinanty pravdepodobne spôsobia rezistenciu a progresiu ochorenia, poznamenala Sottoriva. Tento model bude potrebné prospektívne validovať v budúcich skúškach, pridal.

• UAH a UA oznamujú úplne nový spoločný titul Nursing Science Ph.D. program
• Vedci zistili dôvod, prečo mnoho pacientov s rakovinou močového mechúra nereaguje na imunoterapiu