Estudo:o sequenciamento do genoma completo pode melhorar a vigilância,

controle de gastroenterite Um novo estudo sobre uma das principais causas de gastroenterite no Reino Unido mostrou como o sequenciamento do genoma completo pode melhorar a vigilância e o controle da doença.

Clostridium perfringens bactérias são responsáveis ​​por cerca de 80, 000 casos de diarreia no Reino Unido todos os anos, quer de intoxicação alimentar quer de origem nosocomial não alimentar. Para a maioria, os sintomas são desagradáveis, mas normalmente desaparecem em 24 horas.

Contudo, em casos muito raros, C. perfringens a infecção pode evoluir para formas mais graves. Para grupos vulneráveis, como idosos que vivem em lares de idosos, pode ocorrer uma infecção crônica debilitante de longa duração que, em casos raros, pode ser fatal.

Para ajudar a combater esse problema, precisamos de mais informações sobre como essas bactérias se espalham e infectam as pessoas. Pesquisadores do Instituto Quadram trabalharam com a Public Health England para analisar C. perfringens surtos de origem alimentar e não alimentar durante um período de 7 anos na Inglaterra e no País de Gales.

Trabalhando com colegas da Universidade de Cambridge, eles usaram o sequenciamento do genoma completo para realizar uma análise detalhada das cepas bacterianas associadas à gastroenterite humana. 109 amostras de C. perfringens isolados de casos de doenças ou alimentos suspeitos de causar infecções na Inglaterra e País de Gales entre 2011 e 2017 tiveram todo o seu genoma sequenciado.

Isso permitiu uma análise dos genes presentes que são responsáveis ​​pela produção de toxinas, bem como características relacionadas que auxiliam na infecção, como resistência antimicrobiana.

Mais importante, a análise comparativa dos diferentes genomas permite que os pesquisadores vejam como estão relacionadas as diferentes cepas, que é uma forma fundamental de rastrear de onde eles podem ter vindo.

O time, publicação no jornal Genômica Microbiana , descobriram que nove surtos distintos associados a lares de idosos no Nordeste da Inglaterra durante um período de cinco anos foram causados ​​por doenças muito próximas
cepas de C . Perfringens . Isso indica uma possível fonte comum ligando-os, embora a fonte exata não possa ser identificada após o evento.

Usando o sequenciamento do genoma completo para vigilância de rotina, especialmente em locais como asilos, onde pessoas vulneráveis ​​precisam de proteção, pode ser crucial para prevenir a propagação de surtos futuros e para localizar rapidamente as fontes de contaminação.

Além de monitorar surtos, uma vigilância mais ampla pode fornecer dados vitais de diversas fontes que ajudarão os pesquisadores a entender mais sobre a bactéria, como eles sobrevivem e por que causam doenças.

'Este é um estudo empolgante que destaca a força das colaborações entre instituições acadêmicas como o Quadram Institute e autoridades de saúde pública como Public Health England, e como abordagens de ponta podem ser usadas para determinar o perfil e rastrear bactérias importantes associadas a intoxicações alimentares ", disse a Dra. Lindsay Hall, do Instituto Quadram.

"Esperamos usar as informações geradas para identificar potenciais cepas de Clostridium perfringens que podem estar associados a surtos para que possamos no futuro desenvolver estratégias de intervenção para tentar prevenir a propagação. "

Os pesquisadores foram apoiados por financiamento do Conselho de Pesquisa em Biotecnologia e Ciências Biológicas, o Wellcome Trust e a Food Standards Agency.

Os dados obtidos neste estudo mostraram que os genes que codificam a toxina-chave responsável por causar gastroenterite não estão limitados ao cromossomo bacteriano, mas também podem ser transportados em plasmídeos de virulência que podem ser transferidos em torno das bactérias.

Dados adicionais fornecerão mais conhecimento sobre como os fatores de virulência se disseminam e ajudarão a identificar reservatórios de bactérias persistentes. Isso ajudará a melhorar as estratégias de intervenção e as formas de prevenir surtos e infecções e, em última análise, proteger as comunidades vulneráveis.

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