Clostridium perfringens a baktériumok a becslések szerint 80, Évente 000 hasmenéses eset fordul elő az Egyesült Királyságban, akár ételmérgezésből, akár nem élelmiszer-eredetű kórházi eredetből. Legtöbbnek, a tünetek kellemetlenek, de általában 24 órán belül elmúlnak.
Azonban, nagyon ritka esetekben, C. perfringens a fertőzés súlyosabb formákká fejlődhet. A sérülékeny csoportok, például a gondozó otthonokban élő idősek számára, hosszabb ideig tartó, legyengítő krónikus fertőzés léphet fel, amely ritka esetekben halálos lehet.
E probléma leküzdése érdekében több információra van szükségünk arról, hogy ezek a baktériumok hogyan terjednek és fertőzik meg az embereket. A Quadram Intézet kutatói az Angol Közegészségügyi Egyetemmel dolgoztak az elemzésben C. perfringens élelmiszer-és nem élelmiszer-eredetű járványok Angliában és Walesben 7 év alatt.
A Cambridge -i Egyetemen dolgozó kollégákkal, teljes genomszekvenálást alkalmaztak a humán gasztroenteritis okozta bakteriális törzsek részletes elemzésére. 109 minta C. perfringens Angliában és Walesben 2011 és 2017 között fertőző betegségektől vagy élelmiszerektől elzárt élelmiszerekből izolálták teljes genomjukat.
Ez lehetővé tette a toxinok termeléséért felelős gének elemzését, valamint a fertőzést elősegítő kapcsolódó jellemzők, mint például az antimikrobiális rezisztencia.
Fontos, a különböző genomok összehasonlító elemzése lehetővé teszi a kutatók számára, hogy lássák, milyen rokonságban állnak a különböző törzsek, amely kulcsfontosságú módja annak, hogy nyomon kövessék, honnan származhatnak.
A csapat, közzététel a folyóiratban Mikrobiális genomika , megállapította, hogy az északkelet -angliai gondozóotthonokkal öt év alatt kilenc különálló járványt nagyon szoros rokonság okozta
törzsek C . perfringens . Ez egy lehetséges közös forrást jelez, amely összekapcsolja őket, bár a pontos forrást nem lehet pontosan meghatározni az esemény után.
A teljes genomszekvenálás használata a rutin megfigyeléshez, különösen azokon a helyeken, mint például a gondozóotthonok, ahol a kiszolgáltatott személyek védelemre szorulnak, kulcsfontosságúak lehetnek a járvány jövőbeni terjedésének megakadályozásában és a szennyezés forrásának gyors meghatározásában.
A járványok nyomon követése mellett, a szélesebb körű felügyelet létfontosságú adatokat szolgáltathat különböző forrásokból, amelyek segítenek a kutatóknak jobban megérteni a baktériumokat, hogyan élik túl és miért okoznak betegséget.
„Ez egy izgalmas tanulmány, amely rávilágít a tudományos intézmények, például a Quadram Intézet és az olyan közegészségügyi hatóságok közötti együttműködés erősségére, mint a Public Health England, és hogyan lehet a legkorszerűbb megközelítéseket használni a fontos ételmérgezéssel kapcsolatos baktériumok profilozására és nyomon követésére "-mondta Dr. Lindsay Hall, a Quadram Intézet munkatársa.
"Reméljük, hogy a kapott információkat felhasználhatjuk a lehetséges törzsek azonosítására Clostridium perfringens ami járványokkal járhat, hogy a jövőben beavatkozási stratégiákat dolgozhassunk ki a terjedés megakadályozása érdekében. "
A kutatókat a Biotechnológiai és Biológiai Tudományok Kutatási Tanácsának támogatása támogatta, a Wellcome Trust és az Élelmiszerügyi Hivatal.
A tanulmányban kapott adatok azt mutatták, hogy a gasztroenteritisz kiváltásáért felelős kulcsfontosságú toxint kódoló gének nem korlátozódnak a bakteriális kromoszómára, hanem virulencia plazmidokon is hordozhatók, amelyek a baktériumok körül átvihetők.
További adatok további ismereteket adnak a virulencia faktorok terjedéséről, és segítenek azonosítani a perzisztens baktériumok tárolóit. Ez segít javítani a beavatkozási stratégiákat és a járványok és fertőzések megelőzésének módjait, és végső soron megvédi a kiszolgáltatott közösségeket.