Tyrimas:viso genomo sekos nustatymas gali pagerinti stebėjimą,

gastroenterito kontrolė Naujas vienas pagrindinių JK gastroenterito priežasčių tyrimas parodė, kaip viso genomo sekos nustatymas gali pagerinti ligos stebėjimą ir kontrolę.

Clostridium perfringens bakterijos yra atsakingos už 80, 000 viduriavimo atvejų Jungtinėje Karalystėje kasmet dėl ​​apsinuodijimo maistu arba dėl ne maisto pagrindu pagamintos ligoninės. Daugumai, simptomai yra nemalonūs, bet paprastai išnyksta per 24 valandas.

Tačiau, labai retais atvejais, C. perfringens infekcija gali išsivystyti į sunkesnes formas. Pažeidžiamoms grupėms, pvz., Pagyvenusiems žmonėms, gyvenantiems globos namuose, gali pasireikšti ilgiau trunkanti sekinanti lėtinė infekcija, kuri retais atvejais gali būti mirtina.

Norėdami padėti kovoti su šia problema, mums reikia daugiau informacijos apie tai, kaip šios bakterijos plinta ir užkrečia žmones. „Quadram“ instituto mokslininkai kartu su Anglijos visuomenės sveikata analizavo C. perfringens maisto ir ne maisto protrūkiai per 7 metus Anglijoje ir Velse.

Dirbdamas su kolegomis Kembridžo universitete, jie panaudojo viso genomo seką, kad atliktų išsamią bakterijų padermių, susijusių su žmogaus gastroenterito sukėlimu, analizę. 109 pavyzdžiai C. perfringens izoliuotas nuo ligos atvejų ar maisto produktų, kurie, kaip įtariama, sukelia infekcijas Anglijoje ir Velse nuo 2011 iki 2017 m., buvo atliktas viso genomo sekos nustatymas.

Tai leido išanalizuoti esamus genus, atsakingus už toksinų gamybą, taip pat susijusios savybės, padedančios infekcijai, kaip atsparumas antimikrobinėms medžiagoms.

Svarbu, lyginamoji skirtingų genomų analizė leidžia tyrėjams pamatyti, kaip skirtingos padermės yra susijusios, kuris yra pagrindinis būdas atsekti, iš kur jie galėjo kilti.

Komanda, publikavimas žurnale Mikrobų genomika , nustatė, kad devynis skirtingus protrūkius, susijusius su globos namais Šiaurės Rytų Anglijoje per penkerius metus, sukėlė labai artimai susiję
padermės C . perfringenai . Tai rodo galimą bendrą šaltinį, siejantį juos, nors po įvykio negalima tiksliai nurodyti šaltinio.

Naudojant visą genomo seką įprastam stebėjimui, ypač tokiose vietose kaip globos namai, kur pažeidžiamus žmones reikia apsaugoti, gali būti labai svarbu užkertant kelią protrūkio plitimui ateityje ir greitai nustatant užteršimo šaltinius.

Be protrūkių stebėjimo, platesnė priežiūra galėtų suteikti gyvybiškai svarbių duomenų iš įvairių šaltinių, kurie padėtų tyrėjams geriau suprasti bakterijas, kaip jie išgyvena ir kodėl sukelia ligas.

„Tai įdomus tyrimas, kuriame pabrėžiamas akademinių institucijų, tokių kaip„ Quadram Institute “, ir visuomenės sveikatos institucijų, tokių kaip„ Public Health England “, bendradarbiavimo stiprumas, ir kaip galima naudoti pažangiausius metodus, apibūdinti ir sekti svarbias su apsinuodijimu maistu susijusias bakterijas “,-sakė dr. Lindsay Hall iš„ Quadram Institute “.

„Tikimės panaudoti gautą informaciją, kad nustatytume galimas padermes Clostridium perfringens tai gali būti susiję su protrūkiais, kad ateityje galėtume sukurti intervencijos strategijas, kad būtų išvengta plitimo “.

Mokslininkus rėmė Biotechnologijų ir biologijos mokslų tyrimų tarybos finansavimas, „Wellcome Trust“ ir Maisto standartų agentūra.

Šiame tyrime gauti duomenys parodė, kad genai, koduojantys pagrindinį toksiną, atsakingą už gastroenterito sukėlimą, neapsiriboja bakterijų chromosoma, bet taip pat gali būti pernešami ant virulentiškų plazmidžių, kurias galima pernešti aplink bakterijas.

Tolesni duomenys suteiks daugiau žinių apie tai, kaip plinta virulentiškumo veiksniai, ir padės nustatyti patvarių bakterijų rezervuarus. Tai padės pagerinti intervencijos strategijas ir būdus, kaip užkirsti kelią protrūkiams ir infekcijoms, ir galiausiai apsaugoti pažeidžiamas bendruomenes.

• Nauja Mayo Clinic Press knyga padeda pacientams, sergantiems fibromialgija, rasti geresnės sveikatos sprendimus
• Tyrimas įvertina naujus metodus, kaip pagerinti gydytojo ir paciento bendravimą gyvenimo pabaigoje