Identifikatioun vum Roman Cyclooxygenase-2-ofhängeg Genen vun Helicobacter pylori Wonn am vivo

Identifikatioun vun Roman Cyclooxygenase-2-ofhängeg Genen vun Helicobacter pylori VerfÜgung Wonn am VIVO
méiglech VerfÜgung Background VerfÜgung Helicobacter pylori
ass e wichtege Faktor Bestëmmung vun der pathogenesis vun benign an neoplastic gastric Krankheeten. Cyclooxygenase-2 (Cox-2) ass den inducible Schlëssel Aktivitéit vun arachidonic Seier ukuerbelt an ass eng zentral Vermëttler am inflammation a Kriibs. Ausdrock vun der Gentherapie Cox-2 VerfÜgung ass an der gastric mucosa während H. pylori VerfÜgung Wonn bis-reglementéiert mee de pathobiological Konsequenzen vun dësem verstäerkte Cox-2 Ausdrock sinn nach net charakteriséiert. D'Zil vun dëser Etude war Roman Genen verwandelt-stero Transfert vun Cox-2 an eng vun VIVO VerfÜgung Modell ze identifizéieren, doduerch potentiell Ziler fir d'Etude vun der Roll vun Cox- 2 zu H. pylori VerfÜgung pathogenesis Identifikatioun an de Initiatioun vun Ethikcode kriibserreegend Ännerungen. VerfÜgung Resultater VerfÜgung Gene Ausdrock Profiler vun der gastric mucosa vun Mais mat engem spezifeschen Cox-2 inhibitor (NS398) oder Gefier behandelt goufen op verschiddene Zäit Punkten analyséiert (6, 13 an 19 WK) no H. pylori VerfÜgung Wonn. H. pylori VerfÜgung Krankheet betraff dem Wëllen vun 385 Genen iwwer d'experimentell Period, dorënner Reglementatioun vun gastric Physiologie, Prolifératioun, apoptosis an mucosal Ofwier. Ënnert de Konditiounen vun Cox-2 inhibition, goufen 160 Zil- Genen als Resultat vum H. pylori VerfÜgung Wonn reegelen. D'Cheshire-2 ofhängeg Ziel abegraff déi beaflossen gastric Physiologie (Gastrin, Galr1 VerfÜgung), epithelial Barrière Funktioun (Tjp1, connexin45, Aqp5 VerfÜgung), inflammation (Icam1 VerfÜgung), apoptosis (Clu VerfÜgung) an Prolifératioun (Gdf3, Igf2 VerfÜgung). Behandlung mat NS398 eleng ëmmer Ënnerscheed Ausdrock vun 140 Genen, 97 vun deenen eenzegaarteg huet, wat beweist, datt dës Genen ënner Konditiounen vun basal regulariséiert ginn Cox-2 Ausdrock. VerfÜgung Conclusioun VerfÜgung Dës Etude engem Rot vu Roman Cox-2 identifizéiert huet onselbstänneg Genen ënner souwuel beaflosst normal an der demagogesch Konditiounen entschlof vum H. pylori VerfÜgung Wonn. Dës Donnéeë wichteg nei Linken tëscht Cox-2 an demagogesch Prozesser, epithelial Reparatur an Integritéit. VerfÜgung Background VerfÜgung Helicobacter pylori VerfÜgung Wonn mat enger Rei vun gastric Entwécklungsstéierungen dorënner chronescher gastritis, peptic oppent Krankheet verbonnen ass, mucosa assoziéiert lymphatic Otemschwieregkeeten (Malz) lymphoma, an gastric adenocarcinoma [1, 2]. D'pathogenicity vun der Bakterie ass vun epidemiological Afloss souwéi bakteriell an Provider Facteure sech [1, 3]. Bakteriell Kolonisatioun vun der gastric mucosa féiert zu der Entwécklung vun enger chronescher demagogesch infiltrate, déi duerch verstäerkte release vun demagogesch mediators, Wuesstem Faktoren a reaktiv Sauerstoff metabolites [2, 4]. VerfÜgung D'inducible Cox-2 Aktivitéit an hiren constitutively ausgedréckt begleet gëtt isoform Cox-1 sinn de Schlëssel Reglementatioun vum Mënsch prostaglandin ukuerbelt [5-7]. D'Enn Produite vun hire enzymatic Aktivitéit besteet aus engem Rot vu prostaglandins an thromboxanes, déi esou kritesch Reglementatioun vun fundamental Fro gestallt an agebousst Prozesser dorënner platelet Usammlung, parturition, T-Zell Entwécklung, inflammation a Kriibs identifizéiert ginn [5-7]. Cox-2 enzymatic Aktivitéit ass haaptsächlech reegelen duerch de Novo VerfÜgung Synthes vun Cox-2 FAQ [5, 6]. VerfÜgung Am Mo verstäerkte Cox-2 VerfÜgung Ausdrock huet während H. pylori fonnt ginn
gastritis souwéi an mucosal Stress lesions, gastroduodenal ulcers an der ischemia /reperfusion Schued [8-10] -triggered. Cox-2 an hir wëssenschaftlech prostanoids schéngen och un der pathogenesis vun gastric Kriibs bäidroen. Gastric adenocarcinoma an premalignant mucosal lesions dacks iwwer-ausdrécklech de Cox-2 VerfÜgung Gentherapie [11-14], an nik intratumoral Cox-2 Niveauen schéngs mat verstäerkter entholl Invasioun [15] an eng fräi Frequenz vun lymphatic Metastasen verbonne ginn [ ,,,0],16]. Ausserdeem hunn Cox-2 inhibitors Gewise ginn Prolifératioun vu mënschlechen gastric Kriibs Zellen kënschtlech VerfÜgung [1, 17, 18] souwéi experimentell gastric adenocarcinomas an Sauna Mais [17] zu potently oofgesinn. Kuerzem Ee, hunn eng Zuel vun Rapporten d'Notioun erausgefuerdert datt dës anti entholl Aktivitéit wéinst inhibition vun Cox-2 ass selwer [19]. Jiddferee huelen Cox-inhibitors muss gemellt ginn menge engem reduzéierten Risiko ze affichéieren fir Entwécklung vun gastric carcinoma [20], awer de Rapport Ausdauer Säit Effekter verbonne mat chronescher coxib Administratioun datt Krankheete Benotzung vun Cox- inhibitors fir anti-carcinogenic Behandlung kontrovers ass (Ech zu [21]). VerfÜgung Expression vun der VerfÜgung Cox-2 Gentherapie schéngt also e wichtege Schrëtt an der pathogenesis vun benign an malignant gastric Krankheeten an dofir, ob net nëmme vun hiren Bäitrag zu H. pylori gin
-dependent pathogenesis, mee och d'afgerappt Auswierkunge vun Cox Drogen ass vu spezielle Medeziner Bedeitung inhibiting. VerfÜgung Mir bewisen, virdrun hunn, dass H. pylori VerfÜgung direkt Ausdrock vu-Cox 2 VerfÜgung duerch an gastric epithelial Zellen Afloss kann transcriptional Mechanismen, an identifizéiert MAPK-Erk-ofhängeg Aktivatioun vun enger proximal well VerfÜgung -regulatory CRE-Ebox Element als Schlëssel Schrëtt an der H. pylori VerfÜgung -response vun de Cox-2 VerfÜgung Gentherapie [22] . Iwwerdeems weider dës Resultater der pathophysiological Lien tëscht de Bakterie an Cox-2 VerfÜgung, molekulare effectors wellkomm afgerappt vun Cox-2 während gastric H. pylori VerfÜgung Wonn blouf onidentifizéierte confirméiert. VerfÜgung Hei analyséiert mir Gentherapie Ausdrock vun der gastric epithelium vun Mais mat de Cox-2 spezifesch inhibitor NS398, bei verschiddene Zäit Punkten no H. pylori VerfÜgung Wonn benotzt DNA microarrays behandelt a konnten Gentherapie Ausdrock Profiler vun H. pylori VerfÜgung duerch Cox-2-ofhängeg regulariséiert ze definéieren an onofhängeg Mechanisme. VerfÜgung Resultater VerfÜgung Entschlossenheet vun Cox-2 inhibitor Konzentratioun VerfÜgung fir déi entspriechend Konzentratioun vun inhibitor vun eisem H. pylori VerfÜgung Wonn Modell, PGE2 Niveauen waren gemooss an der gastric mucosa der H. bestëmmen pylori VerfÜgung Wonn an d'Presenz oder Feele vun Cox-2 inhibition mat NS398. Krankheet Mais awer eng 50% Erhéigung vun PGE2 Niveau vun der gastric mucosa. Traitement vun Krankheet Mais mat NS398 (10 mg /kg) an der PGE2 esou zu enger Reduktioun gefouert, datt et net vun der Kontroll Grupp ënnerscheeden huet (Donnéeën net gewisen). Mir ofgeschloss dofir dass eng Dose vu 10 mg /kg genuch war Cox 2 Aktivitéit an der Presenz vun engem H. pylori VerfÜgung Wonn ze oofgesinn. Laangzäitbetreiungsservicer Verwaltung vun de spezifeschen Cox-2 inhibitor VerfÜgung NS398 bedeitend net bakteriell Afloss Kolonisatioun oder demagogesch Fändelen VerfÜgung All Mais an d 'Krankheet Gruppe mat H. pylori VerfÜgung koloniséiert goufen, wéi déi grouss Kultur sech. D'bakteriell Laaschten fräi nëmme liicht am Zäitraum tëscht 6 an 19 Wochen (Dorënner 1A). Administration vun NS398 schéngen net e groussen Effet op bakteriell Kolonisatioun ze hunn. Krankheet mat H. pylori VerfÜgung engem niddregen bis Mëtt Schouljoer gastritis zu infizéiert Mais ëmmer, datt zu Gravitéit iwwer Zäit ze klammen Lien, mä zu oppent Opstellung oder Beweiser vun metaplasia hutt grimmelstussi 1B, an Dorënner 1c fir Vergläicher vu Mais an (kuckt vun all Grupp op Woch 13). Dës Observatiounen ginn an Aklang mat Rapporten aus anere Studien wou Mais fir ähnlech Zäitspann infizéiert goufen [23, 24]. Histological Analyse zougedréckt Administratioun vum Gefier an NS398 induces eleng engem niddregen-Schouljoer gastritis méi Zäit (well 1B). Figur 1 Administration vun der spezifesch Cox-2 inhibitor NS398 net vill bakteriell Kolonisatioun oder demagogesch Fändelen betreffen. A. Prefabrizéierten mat NS398 heescht Afloss net H. pylori VerfÜgung Kolonisatioun an C57 BL /6 Mais. CFU aus der Mamm vun eenzelne Mais Sensor um 6, 13 an 19 Wochen Post Wonn (gefëllt Kreeser). B. Distribution vun wirklech Fändelen zu infizéiert a Kontroll Mais. Wirklech war no der Sydney System huet wéi follegt zesummen: kee inflammation (0), niddereg Schouljoer, Net -active gastritis an niddreg Schouljoer mëll-aktiv gastritis (1), Mëtt Schouljoer mëll aktiv gastritis (2). C. Hematoxylin an Eosin Kierchefënster paraffin Sektiounen aus 13 Wochen Post Wonn, Vertrieder Biller aus Net-Krankheet Mais behandelt mat nëmmen Gefier (V), Net Krankheet Mais behandelt mat NS398 (NS398), Krankheet Mais (V + HP VerfÜgung), a Personal Mais behandelt mat NS398 (NS398 + HP VerfÜgung). Vun Woch 13 (17 Wochen Post-Wonn), war moderéiert aktiv gastritis observéiert zu souwuel d'V + HP VerfÜgung an NS398 + HP VerfÜgung Gruppen. Original Vergréisserung 20 ×, Skala Bar = 50 μm VerfÜgung RNS vun Déieren mat ähnlechen Fändelen an Kolonisatioun Niveauen (3 Mais pro Grupp) waren hinzeginn a benotzt déi dräi experimentell Vergläicher ze maachen:. Net-Krankheet versus Krankheet (V vs
V + HP VerfÜgung), Krankheet versus NS398 (V + HP) vs VerfÜgung NS398 + HP VerfÜgung behandelt a Personal, an Net-Krankheet versus Net-Krankheet an NS398 (V vs VerfÜgung NS398 behandelt) (Well 2A). D'Experimenter konzipéiert eis ze erméiglechen Gentherapie Ausdrock Profiler an der Mamm vu Mais ze bestëmmen eleng oder NS398 am Gefier Erhalen Gefier, an deenen aus de Folge vum H. pylori VerfÜgung Wonn ze isoléieren. Figur 2 Global Gentherapie Ausdrock vun der gastric mucosa vun Mais mat H. pylori infizéiert. A. Venn Diagramm Decompte vun differentially ausgedréckt Genen z (méi wéi 3 fantastesch uewen oder ënnen) iwwer d'Period vun der Etude. D'Zuel vun de Genen de präventive Critèren laanschtgoungen ass fir all experimentell Verglach uginn: infizéiert versus Net-Krankheet Mais (V vs VerfÜgung V + HP VerfÜgung), Mais Krankheet versus NS398 behandelt a Personal Mais (V + HP vs VerfÜgung NS398 + HP VerfÜgung), an Net-Krankheet Mais versus NS398 behandelt (V vs VerfÜgung NS398). Zuelen an parentheses vertrieden d'Zuel total Genen anescht an der dräi experimentell Vergläicher ausgedréckt. B. Trend Diagrammen representéiert Ausdrock global Gentherapie gemooss an d'3 experimentell Vergläicher. All Punkt op der y-Axen duerstellt der Moyenne Ausdrock Verhältnis fir Genen de präventive Critèren am Wochen 6, 13 an 19 an der Behandlung fänkt laanschtgoungen, i.e. eng Linn stellt ee Gentherapie. Déi 33 Wonn-Zesummenhang Genen datt anescht wéi engem Resultat vun NS398 Behandlung ausgedréckt huet si fir all Vergläicher vun rout beliicht. Cox-2 (Ptgs2) ass vun der Gieler Linn uginn. VerfÜgung Global Gentherapie Ausdrock vun der gastric mucosa vun H. pylori Krankheet Mais
D'RNS an dëser Etude benotzt gouf aus der gastric mucosa VerfÜgung ofgebaut nëmmen, an histological Analysë vun Mamm an dës Manéier preparéiert hunn confirméiert, datt Fleesch oder aner connective Otemschwieregkeeten der mucosa Basisdaten net an eis Virbereedungen abegraff waren (net gewisen). D'Verännerungen an der Gentherapie Ausdrock vun dëser Etude gesinn sinn also héich wahrscheinlech eng transcriptional Äntwert op déi vun gastric epithelial Zellen limitéiert nozedenken an den Entwécklungslänner Rezepter an granulocytic infiltrates déi chronesch H. pylori VerfÜgung Wonn Markenzeeche. Cut-Off fir groussen Ännerungen an der Gentherapie Ausdrock bei p &Si besteet Formatioun huet; 0,05 an dräi fantastesch änneren [25]. VerfÜgung Am H. pylori VerfÜgung Krankheet Mais, den 385 Genen der cut- während dem Studium (Dorënner 2A) Critèren op mannst eng Kéier ugefaangen. H. pylori VerfÜgung Mais Krankheet déi mat NS398 behandelt goufen no 160 differentially Gene ausgedréckt. An Mais mat NS398 behandelt eleng, goufen 140 Genen differentially ausgedréckt (Dorënner 2A). Mat Hëllef vun engem subtractive Approche, goufen Genen an subgroups ënnerdeelt bidden de groussen experimentell Effekter:. H. pylori VerfÜgung Wonn, Cox-2 Negatioun, an Cox-2 Ennerdréckung während Wonn VerfÜgung Wonn mat H. pylori VerfÜgung engem entschlof komplex Muster vun global Gentherapie Ausdrock iwwer d'Period vun der Experimenter (Dorënner 2B). Traitement vun Krankheet Mais mat NS398 e schéinen z'ënnerscheedde Gentherapie Ausdrock Ënnerschrëft, wat fir d'Wierkung vun Wonn zousätzlech war. Drësseg-dräi vun de Genen anescht zu infizéiert Mais ausgedréckt war e Resultat vun NS398 Behandlung (rout Genen Optakt), nieft enger weiderer 107 Genen waren nëmmen zu NS398 behandelt a Personal Mais ausgedréckt. Op dës Manéier eng Ënnergrupp vu Genen definéiert Cox-2 ofhängeg Genen gegrënnt gouf. Mir ënnerdeelt dës Genen an subgroups weider Analyse ze vereinfachen baséiert op den Gene Ontologie Kategorien der DAVID Hëllefsprogramm fir Gentherapie Annotation um NCBI http benotzt:... //David abcc ncifcrf Gov /. Table 1 enthält ausgewielt Cox-2 ofhängeg Genen (eng komplett Lëscht kann an Weider Fichier 1, Table S2 fonnt ginn). Déi meescht Genen huet e fluctuating Ausdrock Muster beweist dass Kontroll Mechanismen an der entwéckele Auswierkunge vun béiden Wonn an Cox-2 Ennerdréckung eng Roll an der Gentherapie Ausdrock iwwer time.Table 1 hun Design VerfÜgung Week
zu -4 & -3
0
6
13
19
Mais (n) VerfÜgung Motorrad nëmmen VerfÜgung (V. ) VerfÜgung 17 VerfÜgung mierkt Wonn VerfÜgung Prefabrizéierten VerfÜgung 5 zur VerfÜgung 6 VerfÜgung 6 VerfÜgung NS398 (10 mg /kg) VerfÜgung (NS398) VerfÜgung 17 VerfÜgung begin mierkt Wonn VerfÜgung Prefabrizéierten fänken VerfÜgung 5 zur VerfÜgung 6 VerfÜgung 6 VerfÜgung Motorrad plus H. pylori VerfÜgung (V + HP VerfÜgung) 24
SS1 VerfÜgung Prefabrizéierten globalen fänken VerfÜgung 8 VerfÜgung 8 VerfÜgung 8 VerfÜgung NS398 (10 mg /kg) plus H. pylori
(NS398 + HP VerfÜgung) VerfÜgung 24 VerfÜgung SS1 globalen VerfÜgung Prefabrizéierten fänken VerfÜgung 8 VerfÜgung 8 VerfÜgung 8 VerfÜgung der Woch 0 Mais Dag sc dobäi. injections vun NS398 oder eleng Gefier wéi uginn. Mais sech um 6. 13 an 19 Wochen nom Ufank vun Behandlung ëmbruecht an H. pylori VerfÜgung Kolonisatioun (cfu), dann waren wirklech Fändelen alles an total RNS preparéiert war. VerfÜgung Effekt vun NS398 op gastric Gentherapie Ausdrock Profiler
virdrun Studien op der Cox-2 inhibitor NS398 zu enger Rei vu kënschtlech VerfÜgung an VIVO VerfÜgung Modeller hunn bewisen dat e spezifeschen inhibitor vun Cox-2 Aktivitéit ass mat wéineg oder keen Afloss op d'streng wëssenschaftlech, constitutively ausgedréckt Cox-1 VerfÜgung [26, 27]. An eiser Etude, wossten langfristeg Administratioun Auswierkungen op Gentherapie Ausdrock ze hunn, datt geléist goufen kënnt oder fir no e puer Méint kompenséiert, wéi e groussen Deel vun de Genen déi reegelen an-waren der Woch 6 vun Administratioun net anescht der Woch ausgedréckt huet 13 (Dorënner 2B an Table 1). Nëmmen 33 vun de Genen déi vun NS398 beaflosst huet sech och an Äntwert zu Lombardia reegelen. Eng komplett Lëscht vun de Genen als Resultat vun NS398 Behandlung reglementéiert ass dës (Zousätzleche Fichier 1, Table S3. VerfÜgung der "subtractive 'Method vun classifying Genen Fir komplementar, Daten waren mat enger unsupervised Approche Strooss. A Self-Bestelle Matrixentgasung (er) war all Cox-2 ofhängeg Genen hunn benotzt, well 3 weist eng er Komplott vun der Cox2-ofhängeg Genen vun der Etude (lénks Rot) identifizéiert, d'Recht Rot weist eng Matrixentgasung vun der selwechter Genen den Effet vun H unzeginn . pylori VerfÜgung op der selwechter Genen eleng Wonn (Kuckt och Table 2). Ganze, Spillzich den reegelen Genen an der funktionell Kategorien vun 2 bis epithelial Barrière Funktioun, Prolifératioun an Entretien oder inflammation (zesummegefaasst dorënner 3B) .Table Zesummenhang gëtt fantastesch Ännerung vun der Gentherapie Ausdrock vun ausgewielt Genen als Resultat vun Wonn mat H. pylori VerfÜgung reglementéiert an /oder Behandlung mat der konkreter Cox-2 inhibitor NS398 VerfÜgung Symbol
Gene NAME
Gene Ontologie VerfÜgung V vs V + HP VerfÜgung
V + HP vs NS398 + HP
V vs Ns398
6 VerfÜgung 13 zu 19 VerfÜgung 6 VerfÜgung 13 zu 19
6 VerfÜgung 13 zu 19 VerfÜgung vum VerfÜgung adipsin VerfÜgung chymotrypsin, Aktivitéit. VerfÜgung komplementar activation.
3.06
1.9
-1.32
-2.4
1.93
-1.07
-1.53
-2.56
-1.97
Akt3
thymoma Haren proto-oncogene 3 VerfÜgung FAQ Aminosaier phosphorylation
-1.52
6.68
-1.02
-1.09
1.28
1.33
-1.44
-1.03
-1.06
AV148957
Connexin 45 VerfÜgung Waasser transport
1.39
-3.25
-1.04
1.29
-1.11
1.39
1
1.09
-1.01
Ccl5
chemokine (CC Motif) ligand 5 zur VerfÜgung chemokine Aktivitéit. VerfÜgung demagogesch Äntwert VerfÜgung 1,23 VerfÜgung -1,13 VerfÜgung 3,01 VerfÜgung 1,08 VerfÜgung -1,13 VerfÜgung -1,54 VerfÜgung -1,21
1,48 VerfÜgung 1,08 VerfÜgung Crpd. Dmbt1 VerfÜgung zu malignant Gehir erhéijen 1 /CRP ductin, muclin VerfÜgung Ralley receptor Aktivitéit. VerfÜgung entholl geläscht suppressor
4.15
-3.15
7.74
-2.64
-2.09
-2.15
1.78
1.28
-1
Gast
gastrin
hormone Aktivitéit VerfÜgung 6,37 VerfÜgung -1,21 VerfÜgung 1,8 VerfÜgung -8,41 VerfÜgung -1,87 VerfÜgung -1,01 VerfÜgung 1 VerfÜgung -2,35 VerfÜgung 1,45 VerfÜgung Hsp70-3
Hëtzt Schock FAQ 1A VerfÜgung chaperone activity
5.3
-1.86
1.31
-5.41
1.13
-1.15
3.23
-1.35
1.11
Icsbp1
interferon Konsens weider bindend FAQ 1 VerfÜgung immun Äntwert;. Transkriptiouns regulation
1
-1.31
3.36
1.19
1.23
-1.39
1
2.04
-1.37
Ifi47
interferon ESO inducible FAQ VerfÜgung ATP verbindlechen activity
1.3
-1.29
6.03
1.2
-1.13
-1.97
-1.85
-1.29
1.45
Ly75
lymphocyte antigen 75 VerfÜgung Ofwier Äntwert VerfÜgung 1,23 VerfÜgung -2,25 VerfÜgung 3,37 VerfÜgung 1,36 VerfÜgung -1,15 VerfÜgung 1 zu 1 zu 1 VerfÜgung 1,39 VerfÜgung Mup5
groussen Duerchfall Infektioun FAQ 5 zur VerfÜgung pheromone bindend Aktivitéit; Transport; Fernsehn activity
4.94
-1.08
3
-6.56
-1.23
-2.5
7.56
-1.5
1.31
Ptgs1
prostaglandin-endoperoxide synthase 1 VerfÜgung prostaglandin biosynthesis
-1.36
-1.03
-1.02
1.16
1.03
1
1.26
1.47
1.12
Ptgs2
prostaglandin-endoperoxide synthase 2 VerfÜgung prostaglandin biosynthesis
1.27
4.34
1.47
-1.02
1.17
1
-1.55
-1.24
-1.47
Odc
Ornithine decarboxlyase VerfÜgung carboxy- lyase Aktivitéit VerfÜgung 1.05 VerfÜgung -1,69 VerfÜgung -1,19 VerfÜgung -1,34 VerfÜgung -3,12 VerfÜgung -1,11 VerfÜgung 1,94 VerfÜgung -1,4 VerfÜgung 1,23 VerfÜgung Slc7a11. cd98 Liicht VerfÜgung Musée gouf Famill 7 Member 11. CD98 Liicht VerfÜgung cationic Aminosaier transporter
1.37
3.42
1.19
1.09
2.24
1.33
-1.7
-1.64
-1.07
Tff1
trefoil Faktor 1 VerfÜgung Äntwert ze wounding
-2.94
5.57
-3.06
-2.28
9.16
-1.56
-1.37
-6.56
2.84
Tgtp
T-cell spezifesch GTPase VerfÜgung GTP bindend Aktivitéit VerfÜgung 1,26 VerfÜgung -1,24 VerfÜgung 8,29 VerfÜgung 1,55 VerfÜgung -1,17 VerfÜgung -2,72 VerfÜgung -1,37 VerfÜgung 1,31 VerfÜgung 1,43
d'Gene Ontologie (bEI) Klassifikatioun beweist Gentherapie Funktioun. eng komplett Lëscht vun den Ausdrock Niveau vun all Genen an der Etude vun Weider Fichier 1, Dëscher S1-3 fonnt ginn. VerfÜgung 3 Expression Muster vun Cox-2 ofhängeg Dorënner . Genen A. zwee-selwerdroend-Bestelle Matrixentgasung (er) Stärekoup relativ Ausdrock Niveau vun all Cox-2 ofhängeg Genen identifizéiert an dëser Etude (p > 0,05) weist. Bastelen oder erof-Reglementer, déi rout uginn, oder blo shading bzw.. Black shading beweist ähnlechen Gentherapie Ausdrock vun zwou Echantillon. de Recht Rot Stärekoup vun der Gentherapie Ausdrock Muster an NS398 behandelt Mais (V + HP VerfÜgung vs NS398 + HP VerfÜgung). déi lénks Rot weist sech weist de . Prolifératioun /apoptosis (lauter blo: Ausdrock vun der selwechter Genen vun Krankheet Mais (unclustered) Gene Funktiounen a Literatur Referenze relevant bis H. pylori VerfÜgung Wonn an Table gewise ginn 3. Genen den Hulk funktionell Kategorien Milieu sinn mat Faarf Optakt ), epithelial Integritéit (orange), demagogesch Äntwert (rout) an gastric Physiologie (gréng) B. Ofstand Message de globale gestallt Effet vun Cox-2 ofhängeg Genen iwwer d'Period vun der Experimenter, Gentherapie Examinateuren wéi am A. faarweg
Confirmatioun vun Ausdrock vun ausgewielt Cox-2 ofhängeg Genen VerfÜgung zu Ausdrock Niveau vun Cox1 (Ptgs1) VerfÜgung an Cox2 (Ptgs2) VerfÜgung, an eng Auswiel vun Cox2-ofhängeg Genen Équipe an inflammation (intracellular D'mengen änneren Haftung Protein 1, Icam1 VerfÜgung; Zitt Wuesstem Faktor b1, Tgfb1 VerfÜgung), gastric Funktioun (Gastrin, Gast VerfÜgung), Barrière Funktioun (Aquaporin 5, Aqp5; VerfÜgung knapper menaarbecht FAQ 1, Tjp1 VerfÜgung) an Prolifératioun /carcinogenesis (Ornithine decarboxylase , Odc1 VerfÜgung) war fir individuell Mais bei all Zäit Punkten vun real-Zäit Hinnen alleguer (Zousätzleche Fichier 1, Table S4) alles. An 94% vun Fäll Ausdrock der änneren (Bastelen oder down- reegelen iwwer déi dräi-fantastesch frecken Critèren) confirméiert ginn hätt. VerfÜgung zu NS398 behandelt Mais, VerfÜgung den Ausdrock vun Tjp1 dramatesch an d'Grondsteen fräi vun der Etude am Verglach zu infizéiert Mais (Dorënner 3). D'Maus EST homologous zu connexin 45 (AV148957, Gja7) war ofgeholl och vun Krankheet Mais, egal NS398 behandelen, wéi eng gastric aquaporin Aqp5 (Dorënner 3) war. Dëst ugeholl datt Cox-2 inhibition en Effet op d'H. pylori huet VerfÜgung Afloss vun gastric Barrière Funktioun mediated, also propagéieren mir dës weider an eng kënschtlech VerfÜgung Modell. Western blot Analyse gewisen, datt Wonn mat H. pylori VerfÜgung och zu Erhéijunge Zona gefouert occludens 1 (ZO1, Mënscherechter homologue zu Tjp1) FAQ Ausdrock kënschtlech VerfÜgung zu MKN28 gastric epithelial Zellen, an datt dës Hausse war an der inhibited Präsenz vun NS398 (Dorënner 4A). Spannen, war dëst Effekt onofhängeg vun der Präsenz vun enger intakt Typ IV secretion System, oder d'Präsenz vun der cytotoxin VacA, den H. pylori VerfÜgung Läschen mutants och ZO1 Ausdrock (Dorënner 4B) entschlof. Ausdrock vun ODC war zu MKN28 Zellen behandelt mat NS398 (Dorënner 4C), a war och onofhängeg vun der Präsenz vun engem funktionell Typ IV Rubrik Staatsapparat oder VacA ofgeholl. Figur 4 Cox-2 ofhängeg Ausdrock vun ZO1 an Ornithine decarboxylase zu MKN28 Zellen ofhängeg vun H. pylori Wonn. A. Expression vun zona occludens-1 (ZO1) war mat entweder H. pylori VerfÜgung wëll Typ vum südwestlechen blot op 6 h Post Wonn am MKN28 Zellen sech P12 oder der isogenic mutants de ganze cag PAI (PAI) feelt, oder VacA (VacA). ZO1 war an der Wonn reegelen, onofhängeg vun CagA PAI oder VacA (uewen), wobäi d'Expressioun vun Zellen mat NS398 (ënnen) behandelt ofgeholl huet. B. Expression vun Ornithine decarboxylase FAQ (ODC) war betraff net vum H. pylori VerfÜgung Wonn, mä war an der Präsenz vun NS398. VerfÜgung Diskussioun VerfÜgung D'Zil vun dëser Etude rofgaang war eist Wëssen iwwer d'ze verbesseren Roll vun cyclooxygenase-2 zu H. pylori VerfÜgung -triggered mucosal inflammation déi nei afgerappt molekulare effectors z'identifizéieren. D'zu VIVO VerfÜgung Approche hei geholl huet och Asiicht um transcriptome Niveau gëtt, an déi komplex Ännerungen, déi als Resultat vun der chronescher demagogesch Äntwert ze H. pylori VerfÜgung Wonn geschéien an zu Cox-2 inhibition. VerfÜgung béid H. pylori VerfÜgung Wonn, an NS398 Behandlung elicited eenzegaarteg transcriptional Ënnerschreften vun der gastric mucosa vun Mais, trotz der Ähnlechkeet zu wirklech Fändelen an Kolonisatioun Dicht tëscht de verschiddene Gruppen (Dorënner 1). Dat ass interessant, well an aneren Rapport engem Modell vun mucosa-verbonne lymphoid Otemschwieregkeeten lymphoma (Malz lymphoma), transcriptional Profiler an BALB /c Mais Krankheet mat H. astellen heilmannii VerfÜgung no 12 bis 24 Méint décidéiert huet, an de groussen Ännerungen an der Gentherapie Priedegt Regulatioun vun der éischter Etappe vun der Krankheet (&Si besteet; 12 Méint, mëll ze moderéiert wirklech) [28]. No dëser Zäit, Käre vun den 300 am meeschte differentially ausgedréckt Genen Segregatioun vun Krankheet Mais an Gruppen entspriechend bal genee mat hire agebousst characterization erlaabt. Opgrond vun eiser Donnéeën, mir dass während der fréi Entwécklung Phase vun chronescher aktiv gastritis, Norm wirklech Analyse Ofschloss géif et net kënnen dezent ze erkennen, mee wichteg Ännerungen am mucosa. VerfÜgung NS398 bremst speziell d'Aktivitéit vun de Cox-2 FAQ, an hire Restaurant zu Cox-2 VerfÜgung Gentherapie Ausdrock kéint erwaart ginn, wa Personal Mais mat engem spezifeschen Cox-2 inhibitor behandelt goufen, entweder als Resultat vun enger méiglech Feedback Mechanismus PGE 2 [29] sensibiliséieren, oder wéi eng indemnité Mechanismus der enzymatic inhibition ze iwwerwannen. Nee wesentleche Changement an Cox-2 VerfÜgung Ausdrock war observéiert zu VIVO VerfÜgung Ee, d'Notioun ënnerstëtz, datt de Wëllen vun de Cox-2 VerfÜgung Gentherapie am Mo. duerch eng Rei vu Facteuren kontrolléiert ass. Cox-2 ass vun zwee demagogesch an gastric epithelial Zellen ausgedréckt [22] a sengem Ausdrock kann duerch verschidde Mechanismen verschidden Zellen Zorte kontrolléiert ginn. VerfÜgung Mir konnten en Ziel vun Genen ze identifizéieren, déi als Resultat vun Cox differentially ausgedréckt huet -2 Ennerdréckung, ervirhiewt den Ëmfang vum Afloss vun Cox-inhibitors zu gastric inflammation. Cox-2 ofhängeg Genen gefall an villen funktionell Kategorien, geziicht, déi an gastric Physiologie (Seier secretion, motility) Équipe, epithelial Reparatur a Prolifératioun, an demagogesch mediators. VerfÜgung Gastrin (Gast VerfÜgung) ass eng wichteg Vermëttler am Mo. [30-34] an Ausdrock vun der mucosa war staark beaflosst, net nëmmen duerch Krankheet mat H. pylori VerfÜgung, mä och vun Ennerdréckung vun Cox-2 Aktivitéit (Dorënner 3, Zousätzleche Fichier 1, Table S4). Nieft senger Roll gastric Seier secretion zu Regulatioun, huet gastrin trophic Effekter a reguléieren Prolifératioun a Reparatur vun der mucosa. Tatsächlech AFÜ-Gas transgenic Mais wat aus hypergastrinemia leiden carcinoma der Wonn mat H. pylori VerfÜgung [35] entwéckelen. D'Entwécklung vun carcinoma ass awer an dësem Modell ze Männercher limitéiert [35]. Aner Aarbechter hunn och gesinn, datt Cox-2 inhibition gastrin Ausdrock beaflosst an eng kënschtlech VerfÜgung colorectal Kriibs Modell [34] an och zu H. pylori VerfÜgung positive gastric Kriibs Patienten [36]. VerfÜgung Well Ausdrock vun der apoptosis mediating Wuesstem dat Faktor 3 (Gdf3 VerfÜgung) an c-Myc (Mycs VerfÜgung) Genen erreecht Woch 13, d'apoptosis inhibiting Gentherapie clusterin (Clu VerfÜgung) ofgeholl staark op dëser Zäit Punkt. Geholl zesummen, ass der Gentherapie Ausdrock Muster vun enger Verréckelung vun der Taux vun Prolifératioun /apoptosis vun der epithelium no 13 Wochen vun Wonn als Resultat vun NS398 Behandlung suggestiv. Méi-Begrëff Studien wier néideg fir festzestellen, ob dat Effekt weider oder recurs. Eng Zuel vun Genen déi virdrun observéiert goufen zu erhéijen (Mycs, Clu VerfÜgung) [37] iwwer-ausgedréckt gin, entholl suppressors (Material, Ptch VerfÜgung), oder soss Équipe an Metastasen oder DNA Reparatur: bikunin ( Ambp VerfÜgung) [38], ornithine decarboxylase Gentherapie (Odc VerfÜgung), Trefoil Faktor 1 (Tff1 VerfÜgung) [39], Insulin wéi Wuesstem Faktor (Igf2 VerfÜgung) [40] an DNA Reparatur FAQ 1 (Ddb1 VerfÜgung), waren och ausgedréckt differentially zu NS398 behandelt Krankheet Mais (Dorënner 3). Den Ausdrock Muster war awer komplex, an e puer mediators Lien vun Cox-2 Ennerdréckung gestäerkt ginn, iwwerdeems d'Majoritéit sech verwandelt-reegelen (Dorënner 3). Dëst reflektéiert wahrscheinlech e reglementaresche Roll fir Cox-2 als Deel vun engem Reseau vu Kontroll Mechanismen fir epithelial Ënnerhalt. D'Odc VerfÜgung Gentherapie, zum Beispill, encodes e Schlëssel reglementaresche Aktivitéit an der Produktioun vun polyamines wat fir Zell Prolifératioun Grondlinne sinn [41] a gouf nieft Cox-2 an der Entwécklung vun atrophic gastritis [42, eng Roll dës Distanz ze spillen 43]. Et gouf virgeschloen, datt Cox-2 inhibitors Odc inhibit kënnen, an an dëser Aart a Weis fir d'observéiert anti-proliferative Auswierkunge vun Cox-2 inhibitors [44] responsabel gin. Eis Observatioun vun Verloschter am Odc Ausdrock wéi engem Resultat vun NS398 behandelt H. pylori VerfÜgung Wonn am souwuel zu VIVO VerfÜgung an kënschtlech VerfÜgung Studien (Table 1 an Dorënner 4C) ass mat dësem Begrëff an hält.
Helicobacter VerfÜgung ass Wonn staark mat der Aféierungs- vun engem staarke Th1-Typ demagogesch Äntwert, mat héijen Niveau vun Ifnγ, verbonne deen Ausdrock vun anere demagogesch mediators wéi iNOS an Faktoren Cox-2 VerfÜgung, an och libre Wuesstem induces wéi gastrin [45]. Ënnerstëtzen d'Notioun dass Ifnγ d'Haaptroll spillt an attraktive an activating lymphocytes [46, 47], observéiert mir dass Ausdrock vun T-Zell Uewerfläch lues Icam1 VerfÜgung [48, 49] an Cd86 VerfÜgung an ligands (Verkafen
) [50] erreecht a Personal Mais bei Woch 13. D'interferon ofhängeg GTPases (Igtp VerfÜgung, Iigp-Erwaardung VerfÜgung) d'Anti-microbial Aktivitéite vun Ifnγ zu engem STAT1 ofhängeg Manéier regléieren [51, 52], an hiren Ausdrock war zu NS398 behandelt Mais duerch d'Enn vun dramatesch reduzéiert der Etude. Am Allgemengen, inhibition vun Cox-2 Aktivitéit Nerve engem reduzéierten Ausdrock vun demagogesch mediators tëscht Wochen 13 an 19 (Dorënner 3); Spannen war dës Ännerung net an der wirklech Fändelen reflektéiert. Cox-2 gouf zu demagogesch Äntwerte an inhibition vun Cox-2 benotzt NS398 Nerve eng Polariséierung tëscht der Iwwerhuelung vun kënschtlech VerfÜgung stimuléiert Mënsch PBMCs Richtung Th1 [53] de Th1 /Th2 Gläichgewiicht ze well gewisen. D'Auteuren postulated datt chronescher Ausdrock vun Cox-2 an Produktioun vun PGE2 Resultater vun enger inhibition vun der Efficacitéit vun der mucosal immun Äntwert vun engem Zoustand vun Toleranz Tempo. Der Gentherapie Ausdrock Muster mir hei observéiert ass jo mat enger Wierkung vun Cox-2 inhibition op der demagogesch Äntwert (Zréck Dorënner 3 an Table 1) obwuel d'Ännerungen am Ausdrock vu klassescher Th1 /Th2 mediators wéi IL-12 konsequent, ech-10 an IL-4 hat net vill an eiser Etude ënnerscheeden. VerfÜgung Wonn mat H. pylori VerfÜgung gemellt gouf fir epithelial Integritéit a verschidde potentiell Mechanismen ze Schued dat gemellt goufen (iwwer- [54]). CagA, eng grouss H. pylori VerfÜgung pathogenicity Faktor, ass an epithelial Zellen via den Typ IV secretion Staatsapparat translocated [55, 56]. Studien an engem canine Nier Zell Modell (MDCK) gewisen, datt CagA Mataarbechter mat der knapper menaarbecht adapter FAQ zona occludens 1 (zo-1, Maus homologue -tight menaarbecht FAQ 1, Tjp1) an der junctional Haftung Protein (Jcam oder Jam), Spëtzekandidat un enger laangwiereger Stéierungen epithelial Barrière Funktioun kënschtlech VerfÜgung [57]. Ier mir Ausdrock vun Tjp1 VerfÜgung um transcriptional Niveau vun NS398 behandelt Krankheet Mais fräi observéiert, war Jcam VerfÜgung Ausdrock net betraff. Zousätzlech, eng EST mat homology zu connexin 45 (AV148957, Gja7 VerfÜgung) an Aqp5 VerfÜgung vum H. beaflosst waren pylori VerfÜgung Wonn egal NS398 Behandlung (Dorënner 3). Als souwuel connexin 45 an Aqp5 si wëssen enger Roll an intercellular Transport vu Waasser a kleng Molekülle ze spillen, an et ass experimentéierte Beweis datt connexin 45 direkt mat Tjp1 openee [58, 59], wier et vläicht dass Cox-2 huet och eng Roll an den Entretien vun Waasser Gläichgewiicht an der gastric epithelium. Dës Iddi ass vun eiser kënschtlech VerfÜgung Observatioune vun engem Cox-2 ofhängeg Erhéijung vun Zo-1 FAQ Ausdrock vun MKN28 Zellen ënnerstëtzt. Am Géigesaz zu der Reportage vun Amieva et al. [57] gouf dësen Effekt net un der CagA Status vun H. pylori VerfÜgung (Dorënner 4) ze dinn. Barrière Funktioun Effekter vun der Maus Modell sinn an all Fall onwahrscheinlech fir d'Aktiounen vun CagA wéinst ze ginn, wéi wa mer fonnt, datt H. pylori VerfÜgung SS1 CagA FAQ ausgedréckt, ware mir net kënnen br zu entweder eng kënschtlech z'entdecken
oder zu VIVO VerfÜgung Experimenter (Donnéeën net gewisen). Dofir, géif et vläicht dass H. pylori VerfÜgung Wonn zousätzlech Mechanismen huet epithelial Integritéit ze beaflossen. Et ass och vun Note déi aner H. pylori VerfÜgung pathogenicity Faktor, vacuolating toxin (VacA) bewierkt Équipe vun Flesseggassystem-gefëllt vacuoles zu epithelial Zellen an en plus, kann dës Aktivitéit inhibited ginn kënschtlech VerfÜgung vun NS398 Behandlung [60] . Wéi de gastric aquaporin Aqp5 ass an der gastric crypts op der lateral an intercellular Schläimhait ausgedréckt [59], spekuléieren mir dat pore vun den Ännerunge knapper menaarbecht Proteinen beaflosst ass, an dass et eng Roll an der Entwécklung vun edema an der epithelium spillt während Wonn. VerfÜgung eng Zuel vun publizéiert Rapporten hunn versicht Liicht an H. pylori VerfÜgung Wonn op der Gentherapie Regulatioun datts de microarray Approche mat ze studéieren Ausdrock global Gentherapie zu gastric epithelial Zellen kënschtlech VerfÜgung [61-63] ( iwwerschafft an [64]), e rapid erop-Regulatioun vun demagogesch mediators an enger Rei vu Facteuren Transkriptiouns Berichterstattung der hallmarks vun der Ausdrock Muster gin.

• Bariatric Agrëff an T2DM Verbesserung Mechanismen: e mathematesche Modell
• Antimicrobial Aktivitéit vun Naturprodukter géint Helicobacter pylori: Iwwerpréiwung