Interleukin-8 ass déi eenzeg déi weider-reegelen Gentherapie am ganze Nepgen profiling vun H. pylori ausgesat gastric epithelial cells

Interleukin-8 ass déi eenzeg déi weider-reegelen Gentherapie am ganze Nepgen profiling vun H. pylori VerfÜgung gastric epithelial Zellen ausgesat
Wat VerfÜgung Background VerfÜgung D'Associatioun tëscht Helicobacter pylori VerfÜgung Wonn an ieweschter gastrointestinal Krankheet ass gutt etabléiert. Mä nëmmen eng kleng Ëmwandlung vu H. pylori VerfÜgung wwerreeche Krankheet entwéckelt, an et si vill geographesch Ënnerscheeder am Krankheet penetrance. D'Erklärung fir dës Zäitgenossen läit an der Interaktioun tëscht der Bakterie an de Provider. H. pylori VerfÜgung Ausland Membran Phospholipase A (OMPLA) gouf virgeschlo eng Roll an der virulence vun dëser Bakterie ze spillen. D'Zil vun dëser Etude gouf déi bedeitendst bewosst Weeër a biologesche Prozesser an gastric epithelial Zelle betraff zu Profil während 24 h vum H. pylori VerfÜgung aussetzt, an ze studéieren der demagogesch Äntwert ze OMPLA + an OMPLA -. H. pylori VerfÜgung Varianten VerfÜgung Resultater VerfÜgung Interleukin-8 war déi vill weider-reegelen Gentherapie an ebenfalls e primordialer Roll an der epithelial Zell Äntwert ze H. pylori VerfÜgung Wonn ze spillen an an der agebousst Prozesser ze gastric Krankheet Haaptfiguren. MAPK an NF-kappaB bewosst Weeër sech mächteg Aktivatioun, mee anscheinend net de impressionnant IL-8 VerfÜgung Äntwert ze erklären. Et war bis-Regulatioun vun TP53BP2 VerfÜgung markéiert, deem entspriechend FAQ ASPP2 so kann mat H. pylori VerfÜgung CagA a verursaache markéiert p53 Ennerdréckung vun apoptosis. Aner Reglementatioun vun apoptosis zougedréckt och abberant Regulatioun. Mir och weider-Regulatioun vun e puer oncogenes an Ugrëff-Regulatioun vun entholl suppressor Genen esou fréi wéi am éischten 24 h vu Wonn identifizéiert. H. pylori VerfÜgung OMPLA Phase Variant schéngs net d'demagogesch epithelial Zell Gentherapie Äntwert op dës Experimenter ze beaflossen. VerfÜgung Conclusioun VerfÜgung Am ganzen Nepgen Analyse vun der epithelial Äntwert ze H. pylori VerfÜgung aussetzt, IL- 8 VerfÜgung bewisen, déi an-Regulatioun markéiert, a war a ville vun de wichtegsten bewosst Äntwert Prozesser un d'Wonn Équipe. Et war dysregulation vun apoptosis, entholl suppressor Genen an oncogenes esou fréi wéi an den éischten 24 h vum H. pylori VerfÜgung Wonn, déi fréi Unzeeche vun gastric tumorigenesis vertriede kënnen. OMPLA +/- net de Fouss dohinner demagogesch Äntwert ze H. pylori VerfÜgung. VerfÜgung Background VerfÜgung H. Afloss huet pylori VerfÜgung ass och de primären Ursaach vun peptic oppent Krankheet an der gemaach hunn vun der multistep CASCADE flénke gastric adenocarcinoma etabléiert. Obwuel gastric Kriibs d'véiert stäerkste gemeinsam Kriibs weltwäit an zweeter nëmmen zu haett Kriibs an dauernd Kriibs Zesummenhang Doudesfäll ass [1], sinn do formidabel Differenzen an der Verdeelung vun dëser Krankheet tëscht westlech an déi ëstlech Länner. De Verloscht vun gastric Kriibs matt H. pylori VerfÜgung prevalence an der westlecher Welt, mä dëst Phänomen der grousser geographesch Ënnerscheeder zu gastric Kriibs Verdeelung net komplett erklären. De Grond firwat nëmmen 1-2% vun H. pylori VerfÜgung -infected Persounen gastric malignancies entwéckele bleift unexplained, an ëmfaasst souwuel Differenzen an bakteriell analyséieren, dat Wichtegst cagA VerfÜgung Status, Provider Genetik an Ëmwelt Aspekter. VerfÜgung H . pylori VerfÜgung carcinogenesis implizéiert indirekt Aktioun vun de Bakterien duerch chronescher inflammation vun der gastric Corpus mucosa, an och direkt Aktioun vum H. pylori VerfÜgung op epithelial Zellen. Bestänneg inflammation ass mat verstäerkte Produktioun vun verschidden pro-demagogesch cytokines, wéi IL-1β, TNF-α assoziéiert, IL-6, IL-7 an IL-8 [2] wat apoptosis Erhéijung, hyperproliferation a Produktioun vun reaktiv Sauerstoff a Stéckstoff Mënschegeschlecht dauernd DNA Schued a kennen. Zousätzlech, pylori direkt Aktioun vum H. VerfÜgung op epithelial Zellen kann och carcinogenesis förderen. cagA VerfÜgung + VerfÜgung H. pylori VerfÜgung analyséieren bakteriell Produiten an epithelial Zellen duerch eng mechanesch Typ IV Sprëtz Prozess sprëtzen, déi intracellular sécher Weeër activéiert, besonnesch d'mitogen-ageschalt FAQ kinase Famill (MAPK) Passerelle [3] an der Nuklearenergie Faktor Kappa B (NF-κB), a kann epithelial-mesenchymal Transitioun [4], all vun deem bäidroen kënnen ze neoplastic Transformatioun vereinfachen. Ausserdeem, ass entholl Entwécklung mat Prolifératioun an apoptosis inhibition verbonne [5, 6] hierkommen exzessiv apoptosis geduecht ass gastric oppent Équipe ze förderen. Den Effet vun H. pylori VerfÜgung op gastric epithelial apoptosis huet contraire Beweiser huet. Puer kënschtlech Studien hun gewisen dass H. apoptosis VerfÜgung stimuléieren pylori [7, 8] hierkommen puer vun VIVO Studie weisen inhibition vun apoptosis [9, 10]. CagA Sprëtzen an gastric epithelial Zellen up-reguléieren der anti-apoptotic MCL FAQ [11] an interferes mat apoptosis-Spannend FAQ 2 vun p53 (ASPP2) [12]. ASPP2 inhibition bewierkt ofgeschnidden vun p53 coopération, op eng Manéier gläicht DNA entholl Viren, doduerch apoptotic Aktivitéit ofgeholl, wat d'fräi Risiko vun GC mat cagA verbonne erkläre kann VerfÜgung + VerfÜgung H. pylori VerfÜgung Wonn . VerfÜgung Tannæs et al. datt de H. pylori pldA VerfÜgung Gentherapie virdrun gemellt hunn, coding fir bakteriell baussegt Membran phospholipase A (OMPLA), weist Phase Variant geplatzt "ON" (OMPLA +) a "Luucht" (OMPLA - ) Ëmstellung vun OMPLA Aktivitéit wéinst engem spontan slippage zu engem homopolymer (C) TRACT vun der Gentherapie [13]. D'OMPLA + Variant mat fräi bakteriell Iwwerliewe vun engem dono Ëmwelt, onvergläichleche hemolysis an release vun urease an VacA Verglach zu der OMPLA verbonne war - Variant [14]. OMPLA huet och an der virulence vun anere gastrointestinal pathogens [15], an engem Link tëscht OMPLA Aktivitéit an gastric inflammation gouf an enger viregter Etude ugeholl [16]. VerfÜgung Obwuel d'gastric epithelial Zell Äntwert ze H. pylori agebonne ginn
erausgestallt huet zënter der Entdeckung vun de Bakterie vun 1984 [17] zu vill Experimenter ënnerworf ginn, nëmmen e puer Studien cDNA microarray Technik [18-29] geheescht hunn. Bal all vun deenen Experimenter goufen op asiatesch H. pylori VerfÜgung analyséieren gesuergt, an keen Auteuren hunn d'epithelial Zell Äntwert ze OMPLA Verglach + géint OMPLA - Bakterien. D'Zil vun der aktueller Etude war d'séchert Gentherapie Ausdrock Äntwert vun gastric epithelial Zellen zu engem klinesch kritt H. pylori VerfÜgung Deformatioun ausgesat ze ermëttelen, an de Beitrag vun OMPLA op der demagogesch Äntwert ze iwwerpréifen. Wäert huet op d'wichtegst biologescher Äntwerte no gouf mat Hëllef Gene Ontologie (BEI) Begrëffer an verbonne bewosst sécher Weeër. VerfÜgung Resultater zu der bewosst Wirklechkeet ze studéieren folgenden H. pylori VerfÜgung Wonn um 3 an 6 h, Net -exposed an H. pylori VerfÜgung Zellen ausgesat goufen Kierchefënster an mat immunofluorescence microscopy (Dorënner 1) iwwerpréift. Op béiden 3 an 6 Auer gouf et keen groussen Ënnerscheed an der Fähegkeet tëscht der OMPLA + an OMPLA - H. pylori VerfÜgung zu AGS Zellen ze halen, an do waren keng Differenze vun der morphological Ännerungen an der AGS Zellen an Äntwert ze Belaaschtung fir de zwou Varianten. Mir waren net kënnen all statistesch Differenze vun der Gentherapie Ausdrock ze identifizéieren tëscht der ze OMPLA ausgesat Zellen + an OMPLA - Varianten zu all Zäit Punkt iwwer d'24 h vum Co-Kultur (p VerfÜgung &Si besteet; 0,05). Mir ofgeschloss dofir dass Analyse vun de Resultater ouni weider Contrepartie vun Differenzen an Phas Variant opgeféiert ginn hätt. Figur 1 Immunofluorescence Biller vun AGS Zellen ze H. pylori ausgesat. AGS Zellen waren Net-ausgesat, oder plakeg fir OMPLA + an OMPLA- H. pylori VerfÜgung op engem MOI vun 300: 1 a Co-cultured fir 3 a 6 h. D'Bakterien sech Kierchefënster mat Kanéngchen anti-Helicobacter VerfÜgung antibody. Biller waren déi unisse microscopy ageholl. VerfÜgung D'cDNA Profil vun H. pylori VerfÜgung AGS Zellen ausgesat goufen Verglach géint Net-Krankheet Kontroll Zellen um sechs separat Zäit Punkten innerhalb vun 24 h. 7498 Chip Ämter bis 6237 mënschleche Genen zougedréckt Ënnerscheed Ausdrock vun der Krankheet Zellen Verglach entspriechend Zellen manner um keen ze kontrolléieren wéi 1 Zäit Punkt (p VerfÜgung &Si besteet; 0 05) (Zousätzleche Fichier 1: Table S1). D'Zuel vun bedeitend differentially ausgedréckt Genen bei all Zäit Punkt Verglach zu Net-Krankheet AGS-Zellen, a wéi si op verschidde Zäit Punkten iwwerlageren sinn an Table 1 an Dorënner 2.Table 1 Zuel vun differentially reegelen Genen illustréiert VerfÜgung Time

0.5

1

3

6

12

24

Up-reegelen VerfÜgung 0 VerfÜgung 2 VerfÜgung 91 VerfÜgung 123 VerfÜgung 1679 bis 2997 VerfÜgung Down-reegelen VerfÜgung 0 VerfÜgung 1 VerfÜgung 26 zu 65
2034 bis 2492 VerfÜgung Total VerfÜgung 0 VerfÜgung 3 VerfÜgung 117 zu 188 VerfÜgung 3713 bis 5489 VerfÜgung Zuel vun bedeitend differentially reegelen Genen (p VerfÜgung &Si besteet; 0,05) VerfÜgung Dorënner de probéieren Zäit Punkten bei all vun no enger Period vun de Ko-incubation vun H. pylori VerfÜgung zu AGS Zellen 2 Venn Diagrammer vun reegelen Genen bedeitend. Venn Diagrammer vun differentially ausgedréckt Genen vun H. pylori VerfÜgung -infected AGS Zellen Verglach Zellen ze kontrolléieren (p VerfÜgung &Si besteet; 0,05). D'intersecting Kreeser weg phpNuke Genen um uginn Zäit Punkten. AGS = non-Krankheet Kontroll AGS Zellen. VerfÜgung sech Do keng bedeitend Genen bei 0,5 h ausgedréckt, eng moderéiert Erhéijung vun der Zuel vun de Genen vun 1 bis 6 h, an enger 20-fantastesch Zouhuele vu 6 bis 24 h. Vun ee spezielle Punkt un déi nächst, déi Genen iwwerlageren, awer eng considérabel Zuel vun eenzegaarteg Genen och reglementéiert differentially bei all Zäit Punkt (Dorënner 2). Ongeféier 47% vun der Gesamtzuel vun däitlech ausgedréckt Genen sech weider-reegelen, an 53% zougedréckt verwandelt-Regulatioun am Verglach zu Kontroll. Vun der méi wéi 6000 däitlech ausgedréckt Genen, war IL-8 VerfÜgung déi eenzeg déi differentially ausgedréckt Gentherapie (Dorënner 3). Figur 3 Hiarchical Käre vun de meeschte vill differentially reegelen Genen. Hiarchical Käre vun bedeitend differentially reegelen Genen (log2FC > 1,5, p VerfÜgung &Si besteet; 0,05). Feil weist op IL-8 VerfÜgung. VerfÜgung D'Lëscht vun all bedeitend Genen war fir verbonne Kyoto Enzyklopedie vun Genen an Genomes (Kegg) Signal Weeër duerch Passerelle Express bei all Zäit Punkt analyséiert. Signifikativ verkuebelt Weeër a sinn an Table 2. Early Äntwert Signal Weeër virgestallt Impact Factor (WANN) entspriechend datt zu H. pylori VerfÜgung Wonn Passerelle, cytokine-cytokine receptor Interaktioun, Maut-wëll receptor bedeitend beaflosst huet sécher de epithelial Zell abegraff ( TLR) sécher Weeër wéi och vill Kriibs-Zesummenhang Weeër a immunological Weeër. Um 1 h, IL-8 VerfÜgung war am meeschte vun de betraffene Signal Weeër Équipe. Op 3 an 6 h, déi meescht vun de héchste klasséiert Weeër no e puer Genen gemeinsam, wéi NFKB1, NFKB2, NFKBIA, NFKBIE, BIRC2, BIRC3, Yaso, CCND1 VerfÜgung an AKT3 VerfÜgung. D'phosphatidylinositol sécher System ass eng héich WANN op 6 h duerch d'Bedeitung vun enger eenzeger Gentherapie, PIK3C2B VerfÜgung zougewisen, déi duerch e Log 2FC vu -0,58 verwandelt-reglementéiert ass a spillt eng wichteg Roll an dësem Passerelle. Um 12 h, waren déi betraffe bewosst Édouard de leukocyte transendothelial Migratioun, Zell Haftung Molekülle, DNA Gedächtnis Passerelle, p53 sécher Passerelle souwéi verschidde Kriibs-Zesummenhang Weeër. Relativ ähnlech Resultater sinn um 24 h gesinn, awer sinn e puer vun de Kriibs-Zesummenhang Weeër representéiert weider iwwer d'Lëscht (Donnéeën net nëmmen dës, 10 an 2 Table dës erop) .Table 2 Time natierlech: Kegg bewosst Weeër an der Gentherapie Ontologie
Time
Kegg bewosst Passerelle Numm
WANN VerfÜgung up-reegelen Genen VerfÜgung GO VerfÜgung
GO verwandelt-reegelen Genen VerfÜgung 0,5
Nee bedeitendst Genen keen groussen Genen VerfÜgung Nee bedeitendst Genen
1 VerfÜgung Epithelial Zell sécher an Helicobacter pylori Wonn VerfÜgung 16,6
Nee bedeitendst GO VerfÜgung Nee bedeitendst Genen VerfÜgung Cytokine-cytokine receptor Interaktioun VerfÜgung 8.1 VerfÜgung BBC Kriibs VerfÜgung 7.5 VerfÜgung Maut-wëll receptor sécher Passerelle VerfÜgung 6,6 VerfÜgung Base excision Reparatur VerfÜgung 6.0 VerfÜgung primär immunodeficiency VerfÜgung 5.9 VerfÜgung Weeër an Kriibs VerfÜgung 5,4 VerfÜgung 3 VerfÜgung Epithelial Zell sécher an Helicobacter pylori Wonn VerfÜgung 17,8 VerfÜgung anti-apoptosis
Nee bedeitendst GO VerfÜgung Weeër an Kriibs VerfÜgung 16,9 VerfÜgung Regulatioun vun Realitéit Nepgen klenger Zell haett Kriibs
14,2 VerfÜgung Gedächtnis VerfÜgung MAPK Passerelle sécher VerfÜgung 14,2 VerfÜgung T -helper 1 Zell dat VerfÜgung Apoptosis VerfÜgung 12,5 VerfÜgung negativ Regulatioun vun LPe-mediated sécher Passerelle VerfÜgung Adipocytokine Passerelle sécher VerfÜgung 12,3 VerfÜgung negativ Regulatioun vun glat Muskel Zell Migratioun VerfÜgung Aarbecht Kriibs
11,4 VerfÜgung Regulatioun vun MAP kinase Aktivitéit chemotaxis VerfÜgung Maut-wëll receptor sécher Passerelle VerfÜgung 11,1 VerfÜgung FAQ Aminosaier dephosphorylation VerfÜgung T Zell receptor sécher Passerelle VerfÜgung 10,5 VerfÜgung neutrophil Aktivéierung
B Zell receptor sécher Passerelle VerfÜgung 9,9 VerfÜgung entrainment vun circadian Auer VerfÜgung 6 VerfÜgung Phosphatidylinositol sécher System VerfÜgung 32,2 VerfÜgung anti-apoptosis VerfÜgung Nee bedeitendst GO VerfÜgung Epithelial Zell sécher zu Helicobacter pylori Wonn VerfÜgung 15,5 VerfÜgung Regulatioun vun Realitéit Nepgen klenger Zell haett Kriibs VerfÜgung 14,2 VerfÜgung Gedächtnis VerfÜgung Weeër an Kriibs VerfÜgung 12,4 VerfÜgung T-Mathëllef 1 Zell dat VerfÜgung
Apoptosis VerfÜgung 11,6 VerfÜgung neutrophil Aktivéierung VerfÜgung Adipocytokine sécher Passerelle VerfÜgung 10,1 VerfÜgung negativ Regulatioun vun I-kappaB VerfÜgung Maut-wëll receptor sécher Passerelle VerfÜgung 8,9 VerfÜgung kinase /NF -kB CASCADE VerfÜgung MAPK sécher Passerelle VerfÜgung 8.7 VerfÜgung Aféierungs- vu positive chemotaxis VerfÜgung BBC Kriibs VerfÜgung 8,5 VerfÜgung Servicer sinn dendritic Zell dat VerfÜgung B Zell receptor sécher Passerelle VerfÜgung 8.3
12 VerfÜgung Leukocyte transendothelial Migratioun VerfÜgung 309,7 VerfÜgung Zell Zyklus verhaft VerfÜgung Äntwert un matt FAQ VerfÜgung Zell Haftung Molekülle (Cams) VerfÜgung 75,4 VerfÜgung Aminosaier Transport VerfÜgung S-adenosylmethionine biosynthetic Prozess VerfÜgung DNA Gedächtnis VerfÜgung 25,0 VerfÜgung positive Regulatioun vun Transkriptiouns VerfÜgung Zell Zyklus VerfÜgung 20,0 VerfÜgung Äntwert ze Stress VerfÜgung Weeër an Kriibs VerfÜgung 19,4 VerfÜgung Regulatioun vun MAP kinase Aktivitéit VerfÜgung p53 sécher Passerelle VerfÜgung 17,0 VerfÜgung Antigen Veraarbechtung a Presentatioun VerfÜgung 15,7 VerfÜgung MAPK sécher Passerelle VerfÜgung 13,2 VerfÜgung klenger Zell haett Kriibs VerfÜgung 12,2 VerfÜgung Circadian Rhythmus
11,9 VerfÜgung 24 VerfÜgung Leukocyte transendothelial Migratioun VerfÜgung 80,3 VerfÜgung keratinocyte dat VerfÜgung Cholesterol biosynthetic Prozess VerfÜgung Zell Zyklus VerfÜgung 24,4 VerfÜgung Aminosaier Transport VerfÜgung Äntwert un matt FAQ
p53 sécher Passerelle VerfÜgung 20,9 VerfÜgung keratinization VerfÜgung isoprenoid biosynthetic Prozess VerfÜgung Circadian Rhythmus VerfÜgung 18,6 VerfÜgung angiogenesis VerfÜgung Ausdrock biosynthetic Prozess VerfÜgung DNA Gedächtnis VerfÜgung 18,0 VerfÜgung apoptosis VerfÜgung Äntwert ze oxidative Stress VerfÜgung Adherens Échangeur zu 16,1 VerfÜgung Äntwert ze Stress VerfÜgung Weeër an Kriibs VerfÜgung 14,9 VerfÜgung Zell Zyklus verhaft VerfÜgung Nukleotid excision Reparatur VerfÜgung 14,3
pyrimidine Nukleotid metabolic VerfÜgung Ubiquitin mediated proteolysis VerfÜgung 14,2 VerfÜgung Prozess VerfÜgung Phosphatidylinositol sécher System VerfÜgung 13,7 VerfÜgung Aféierungs- vu positive chemotaxis signifikativ verkuebelt VerfÜgung bewosst Weeër Kegg a beräichert Gene Ontologie Begrëffer ( biologesch Prozesser nëmmen) (p VerfÜgung &Si besteet; 0,05) bei verschiddene Zäit Punkten folgenden Co-Kultur vum H. pylori VerfÜgung an AGS Zellen. Top 10 Édouard /agestallte Persoun abegraff wou Nummer 10. wéi WANN = Impakt Faktor VerfÜgung Well Analyse GO einfach differentially ausgedréckt Genen mat der agestallte Persoun Associéeën, do um Ranking déi richteg biologescher Bedeitung vun eenzelne Genen oder agestallte Persoun keen Versuch ass. Dofir, dorënner mer nëmme Genen mat e Log 2FC > 1.5 vun der GO Analyse, ausser hu Genen däitlech ausgedréckt dass an fehlerhafter GO Ranking wahrscheinlech Resultat waren. Nëmme Konditioune ënner biologesch Aarbechten kategoriséiert agebaut (2 Table), wéi dës de Schwéierpunkt vun der Etude waren. Nee GO Begrëffer sech op 0,5 oder 1 h Zäit Punkten beräichert. Ënnert der up-reegelen Genen op 3-6 h, déi dacks verbonne GOS sech anti-apoptosis, an e puer demagogesch an Anti-microbial Prozesser wéi Regulatioun vun Realitéit Nepgen Gedächtnis, T-Mathëllef 1 Zell dat, chemotaxis, neutrophil Aktivéierung an immun Aktivéierung. Bei 12-24 h, déi weider-reegelen Genen beräichert agestallte Persoun wëll Zell Zyklus verhaft, apoptosis, Stress Äntwert, Aminosaier Transport, angiogenesis an keratinization, während verschidde biosynthetic Prozesser sinn ënnert der verwandelt-reegelen Begrëffer. VerfÜgung Hierarchie Käre vun der 245 Genen mat e Log 2FC > 1.5 gemaach 5 z'ënnerscheedde Kéip (A-E), op enger Distanz loung vun 0,54, (Dorënner 3). All Stärekoup gouf fir GO a bewosst Signal Passerelle Associatiounen (Table 3) iwwerpréift. GO Analyse gëtt bedeitendst Conditioune fir all Kéip (p VerfÜgung &Si besteet; 0,05). Table 3 weist d'Top 10 bedeitend verkuebelt bewosst sécher Weeër an all Stärekoup, klasséiert no WANN. Stärekoup A enthale 9 Genen, an hien roueger Niveau bei 6-12 h virun engem Réckgang weist. Dräi Genen huet zu anti-apoptotic Prozesser Équipe an zwee Genen huet an MAPK sécher Équipe. Nëmmen 3 Genen sech ze Stärekoup B zougewisen, wou et war eng rapid a mächtegst Erhéijung vun Ausdrock während den éischten 3 h, déi vun engem Réckgank gefollegt. Vun den 3 Genen am Stärekoup, IL-8 VerfÜgung an CXCL2 VerfÜgung hu sech vill vun de Fouss dohinner demagogesch Prozesser wéi chemotaxis, immun Äntwert an neutrophil activation.Table 3 Koup profiling zu Alimentatioun: Kegg bewosst Weeër an Gene Ontologie
séchert Profil iwwer 24 h
bewosst Passerelle
Impact Factor VerfÜgung GO Numm
MAPK sécher Passerelle VerfÜgung 7.3 VerfÜgung GO: 0006916 VerfÜgung anti-apoptosis VerfÜgung Apoptosis VerfÜgung 7.1 VerfÜgung GO: 0045063 VerfÜgung heeschen Chinchilla Mathëllef 1 Zell dat VerfÜgung GO: 0031665 VerfÜgung negativ Regulatioun vun LPe-mediated sécher Passerelle VerfÜgung GO: 0014912 VerfÜgung negativ Regulatioun vun glat Migratioun Muskel Zell VerfÜgung GO: 0043405 VerfÜgung Regulatioun vun MAP kinase Aktivitéit
12,4 Epithelial Zell sécher an H. pylori VerfÜgung Wonn
GO: 0006935 VerfÜgung chemotaxis VerfÜgung cytokine-cytokine receptor Interaktioun VerfÜgung 10,2 VerfÜgung GO: 0006954 VerfÜgung demagogesch Äntwert VerfÜgung BBC Kriibs VerfÜgung 6,8 VerfÜgung GO: 0006955 VerfÜgung immun Äntwert VerfÜgung Maut-wëll receptor sécher Passerelle VerfÜgung 5.9 VerfÜgung GO: 0045091 VerfÜgung Regulatioun vun Realitéit Nepgen Gedächtnis VerfÜgung Weeër an Kriibs 4,8
GO: 0042119 VerfÜgung neutrophil Aktivéierung VerfÜgung GO: 0050930 VerfÜgung Aféierungs- vu positive chemotaxis VerfÜgung GO: 0030593 VerfÜgung neutrophil chemotaxis VerfÜgung WEIDER: 0030155 VerfÜgung Regulatioun vun Zell Haftung VerfÜgung GO: 0019722 VerfÜgung Kalzium-mediated sécher
Circadian Rhythmus VerfÜgung 20,0 VerfÜgung GO: 0006915 VerfÜgung apoptosis VerfÜgung MAPK sécher Passerelle VerfÜgung 10,7 VerfÜgung GO: 0006950 VerfÜgung Äntwert VerfÜgung mTOR zu Stress Passerelle sécher VerfÜgung 7.5 VerfÜgung GO: 0007050 VerfÜgung Zell Zyklus verhaft VerfÜgung knapper menaarbecht VerfÜgung 7.0
GO: 0030216 VerfÜgung keratinocyte dat VerfÜgung Jak-Hëllef sécher Passerelle VerfÜgung 6,7 VerfÜgung GO: 0006865 VerfÜgung Transport Aminosaier VerfÜgung cytokine-cytokine receptor Interaktioun VerfÜgung 6.5 VerfÜgung GO: 0031424 VerfÜgung keratinization VerfÜgung Reglement vun autophagy VerfÜgung 6.4 VerfÜgung GO: 0008652 VerfÜgung Aminosaier biosynthetic Prozess VerfÜgung p53 sécher Passerelle VerfÜgung 5,6 VerfÜgung GO: 0006220 VerfÜgung pyrimidine Nukleotid metabolic Prozess VerfÜgung Reglement vun VerfÜgung actin cytoskeleton 5.2 VerfÜgung TGF-Beta sécher Passerelle VerfÜgung 5.2 VerfÜgung Natural Mäerderer Zell cytotoxicity VerfÜgung 4,7
Melanogenesis VerfÜgung 8.3 VerfÜgung mediated WEIDER: 0030146 VerfÜgung diuresis VerfÜgung GnRH sécher Passerelle VerfÜgung 7,6 VerfÜgung GO: 0030147 VerfÜgung natriuresis VerfÜgung ErbB sécher Passerelle VerfÜgung 6,7 VerfÜgung GO: 0048661 VerfÜgung positive Regulatioun vun glat Muskel Zell Prolifératioun VerfÜgung Weeër an Kriibs VerfÜgung 6.4 VerfÜgung GO: 0002268 VerfÜgung follicular dendritic Zell dat VerfÜgung Epithelial Zell sécher an H. pylori VerfÜgung Wonn VerfÜgung 5,7 VerfÜgung GO: 0031583 VerfÜgung Aktivatioun vun phospholipase d Aktivitéit vum G-FAQ kräftegen receptor FAQ sécher VerfÜgung GO: 0014826 VerfÜgung verfeelt glat Muskel Kontraktioun VerfÜgung GO: 0002467 VerfÜgung germinal Zentrum Opstellung VerfÜgung GO: 0030578 VerfÜgung PML Kierper Organisatioun VerfÜgung GO: 0030195 VerfÜgung negativ Regulatioun vun Blutt coagulation VerfÜgung GO: 0043507 VerfÜgung positive Regulatioun vun Aktivitéit juni kinase
Antigen Veraarbechtung a Presentatioun VerfÜgung 13,7 VerfÜgung GO : 0006695 VerfÜgung Cholesterol biosynthetic Prozess VerfÜgung MAPK Passerelle VerfÜgung GO VerfÜgung 9,7 sécher: 0006986 VerfÜgung Äntwert un matt FAQ VerfÜgung BBC Kriibs VerfÜgung 6.2 VerfÜgung GO: 0006916 VerfÜgung anti -apoptosis VerfÜgung Weeër an Kriibs VerfÜgung 6.1 VerfÜgung GO: 0006139 VerfÜgung nucleobase, -side, -tide an Nukleinsaier metabolic Prozess VerfÜgung Reglement vun actin cytoskeleton VerfÜgung 6.1 VerfÜgung GO: 0008299 VerfÜgung isoprenoid biosynthetic Prozess VerfÜgung GO: 0006601 VerfÜgung Ausdrock biosynthetic Prozess VerfÜgung GO: 0009416 VerfÜgung Äntwert ze Liichtjoer Impulser VerfÜgung GO: 0043154 VerfÜgung negativ Regulatioun vun caspase Aktivitéit VerfÜgung GO: 0007566 VerfÜgung Embryo ofgestouss VerfÜgung séchert Profiler vun 5 Haaptstrooss Stärekéip vun hiarchical Käre vun den 245 am meeschte differentially ausgedréckt Genen (p VerfÜgung &Si besteet identifizéiert; 0,05) an verbonne Gentherapie agestallte Persoun (biologesch Prozesser nëmmen) an Kegg bewosst sécher Weeër an all Stärekoup am H. pylori VerfÜgung AGS Zellen ausgesat. Eckdate ginn op 0,5, 1, 3, 6, 12 an 24 h vum Co-incubation. Feeler Baren vertrieden ± normale deviation vun Ausdrock am Stärekoup. Top 10 agestallte Persoun opgezielt wou Zuel ass erausgeet 10 VerfÜgung Koup C aus der gréisster Stärekoup, an enthale 150 Genen datt keng Ännerung bis no 6-12 h show gemaach. D'BEI Begrëffer apoptosis, Zell Zyklus verhaft a Stress Äntwert Genen huet Ofstand beräichert, an vill vun deene Genen wéi Jun, GADD45A, DDIT3, MKNK2, DUSP1, RPS6KA5, FLNC VerfÜgung, an RASGRP VerfÜgung och zu MAPK Équipe sech wéi sécher. Ausserdeem, CSF2RA VerfÜgung, IL24 VerfÜgung, IL20R VerfÜgung an der oncogene PIM1 VerfÜgung zu Jak-Hëllef sécher an cytokine-cytokine sécher Équipe huet. VerfÜgung Koup D engem moderaten Erhéijung peaking um 12 h huet, duerch eng Ofsenkung Richtung 24 h gefollegt. 13 Genen huet zu dëser Stärekoup zougewisen, dorënner EDN1 VerfÜgung, eent vun de isoforms vun der mächtegst vasoconstrictor endothelin, déi quasi all vun der opgezielt GOS beräichert. NFKB2 VerfÜgung, eng vun zwou NF-κB subunits, HBEGF VerfÜgung an ETS1 VerfÜgung och zu dësem Stärekoup mat abegraff waren. VerfÜgung Koup E bewisen 71 Genen datt zougedréckt verwandelt-Reglement no 6-12 h an abegraff FGFR3 VerfÜgung an e puer Hëtzt Schock FAQ Genen datt an der MAPK sécher Passerelle an apoptosis inhibition Équipe huet. Och, e puer GO huet biosynthetic Prozesser beräichert. VerfÜgung der microarray Resultater ze confirméieren, kucke mer IL-8 VerfÜgung, fir z'iwwerpréiwen, wéi dat den eenzege Meeschter differentially reegelen Gentherapie vun der Etude war. mRNA an FAQ gläichzäiteg Punkte anerer goufen a vun RT-Hinnen alleguer an Elisa studéiert (Sauerdall 4 a 5). Et gouf eng Hausse vun IL-8 VerfÜgung mRNA deitlech no 1 h an der ganzer 3 h peaking. D'IL-8 VerfÜgung mRNA Äntwert ewechgelooss dann Richtung 6 an 12 h. Um 24 Auer war et eng zweet Erhéijung, awer mat enormen Varianz tëschent deenen zwee Experimenter. Bei 0,5 an 1 h vum Co-Kultur, IL-8 FAQ Niveauen sech niddereg a weisen hutt keng Verännerung. Tëscht 3 an 6 h vum Co-Kultur, war et e wesentlechen IL-8 Erhéijung déi kee Seuil no 6 h gewisen. Figur 4 Time-Cours vun IL-8 mRNA Ausdrock vun AGS Zellen Co-cultured mat H. pylori. Chemeschen Hinnen alleguer Analyse vun IL-8 VerfÜgung Ausdrock vun H. pylori VerfÜgung -infected AGS Zellen um sechs verschiddene probéieren Punkten iwwer 24 h. Eckdate sinn d'Wäerter vun dräi Zell Kultur gefaart aus zwee onofhängeg Experimenter, A a B. représentéieren der heeschen berechent bannent jiddereng vun den Experimenter. VerfÜgung Dorënner 5 Time-Cours vun IL-8 FAQ Ausdrock vun AGS Zellen Co-cultured mat H. pylori. Elisa Analyse vun IL-8 FAQ Ausdrock vun H. pylori VerfÜgung -infected AGS Zellen um sechs verschiddene probéieren Punkten iwwer 24 h. Eckdate sinn d'Wäerter vun dräi Zell Kultur gefaart aus zwee onofhängeg Experimenter, A a B. représentéieren der heeschen berechent bannent jiddereng vun den Experimenter. VerfÜgung Styl, wollt mir fir aner Gewerkschaften, datt de Match gaangen MOI war stabil mat wat fir AGS Gentherapie Ausdrock. Mir benotzt IL-8 VerfÜgung Äntwert wéi eng Luucht vun der Gentherapie Ausdrock, an AGS Zellen sech mat H. pylori VerfÜgung fir 3 h op verschiddene MOI zu zwee separat Experimenter (Dorënner 6) Co-incubated. Et war e bescheidenen IL-8 VerfÜgung Äntwert op MOI 15: 1 an 150: 1, mat engem wichtegen Erhéijung um MOI vun 300: 1. Et goufen dann negligible Ännerungen am IL-8 VerfÜgung Ausdrock virun 300: 1, déi proposéiert, datt d'Original inoculum vun 300: 1 adequate war eng biologesch Äntwert ze dran ouni d'Zell Kultur System overloading. Figur 6 Dose-Äntwert vun IL-8 mRNA Ausdrock vun AGS Zellen Co-cultured mat H. pylori. Chemeschen Hinnen alleguer Analyse vun IL-8 VerfÜgung Ausdrock vun H. pylori VerfÜgung -infected AGS Zellen, Co-incubated fir 3 h. Eckdate sinn d'Wäerter vun dräi Zell Kultur gefaart aus zwee onofhängeg Experimenter, A a B. zesummeféieren mengen d'berechent vertrieden an all vun den Experimenter. VerfÜgung Diskussioun VerfÜgung An dëser Etude mir engem groussen, direkt Äntwert vun AGS Zellen weisen fir d'Belaaschtung fir eng VerfÜgung H. pylori vun engem Medeziner Kader kritt Klischee. Méi wéi 6.000 mënschleche Genen zougedréckt statistesch groussen Ënnerscheed Regulatioun während den éischten 24 h vum Co-incubation. VerfÜgung H. pylori VerfÜgung Wonn gouf mat béiden Stimulatioun an inhibition vun apoptosis assoziéiert. Verschidde Zell Kultur Experimenter up-Regulatioun vun Genen mat apoptosis verbonne [7, 8] hierkommen puer vun VIVO Studie weisen Prolifératioun an apoptosis inhibition [9, 10]. VacA toxin gouf apoptosis an e puer Studien dës Distanz ze féieren [30-33] hierkommen d'Roll vun CagA contraire ass. CagA ass mat zwou Stimulatioun an inhibition vun apoptosis [11, 12, 34] assoziéiert. Biliary Zellen ze cagA ausgesat VerfÜgung + VerfÜgung H. pylori VerfÜgung op engem Héich inoculum (MOI 1: 1) fräi Zell Wuesstem bewisen, hierkommen um MOI vun 200: 1, apoptosis stimuléiert war [35 ]. CagA kann de pro-apoptotic Effet vun VacA direkt antagonize och, wéi an AGS Zellen gesinn [31]. Apoptosis koum no engem Zuel vun bewosst Evenementer, flénke Aktivatioun vun caspase-3, déi geduecht ass d'Basis effector vun apoptosis wor. Am Moment studéieren, souwuel inhibitory an stimulatory Genen zougedréckt groussen Ënnerscheed Ausdrock, d'Komplexitéit vun den Afloss vun H. pylori VerfÜgung op apoptosis Musiktherapie-: caspase inhibitors HSPA5 VerfÜgung an DHCR24 VerfÜgung ähnlechen zougedréckt spéiden verwandelt-Regulatioun als Hëtzt Schock Genen HSPA1B, HSPB1 VerfÜgung, déi och mat apoptosis Stimulatioun (Stärekoup E, Table 3) verbonne sinn. Wéinst dem TNFAIP3, BIRC2, BIRC3 VerfÜgung an SERPINB2 VerfÜgung, och mat apoptosis inhibition verbonnen, hien huet fréi a bestänneg up-Regulatioun zesummen am Stärekoup A. gruppéiere sech awer positiv Reglementatioun vun apoptosis PTPRH, TNFRSF12A, IL24, GADD45A, TRIB3, DDIT4, PHLDA4, PP1R15A VerfÜgung an SQSTM1 VerfÜgung all an ähnleche Muster up-regulariséiert goufen no 6-12 h (Stärekoup C). MCL1 VerfÜgung, en Anti-apoptotic Gentherapie an Äntwert ze CagA Sprëtz ausgedréckt [11], bewisen waarden bis-Regulatioun am Laf vun der Etude. Et huet kee groussen Ännerungen an BCL-2 VerfÜgung a ganz klenge Erhéijung vun Bax VerfÜgung Ausdrock vun eiser Etude, zwee wichteg Genen déi vun der Empfindlechkeet vun Zellen zu anere apoptotic stimuli [36-39] bestëmmen. Proctor, gouf et weider-Regulatioun vun TP53BP2 VerfÜgung markéiert, eng wichteg entholl suppressor Gentherapie (wënnt) zu Mënsch Kriibs, virun allem p53 Promotioun vun apoptosis Genen stimuléiert. Wéinst dem, ass coding TP53BP2 VerfÜgung ASPP2 FAQ, déi apoptosis onofhängeg vun p53 [40-42] ze stimuléieren dës och schonn huet. Allerdéngs, Buti et al. kuerzem bewisen, dass CagA an gastric epithelial Zellen heijen geziilte ASPP2 FAQ p53-mediated apoptosis [12] zu inhibit. D'fräi TP53BP2 VerfÜgung Ausdrock vun eiser Etude gesinn, kéinten also dës Effekt potentiate vun der CagA-ASPP2 Interaktioun waarden p53-mediated apoptosis ze féieren fräi inhibition vun. An Tatsaach, huet déi aktuell Etude dass p53 Zil- Genen vun apoptosis Équipe [43] wéi Sekondär VerfÜgung, DR4 VerfÜgung, TNFRSF10B VerfÜgung (och bezeechent als DR5 /Killer VerfÜgung), DCR1 VerfÜgung , DCR2 VerfÜgung, P53AIP1 VerfÜgung, CASP6 VerfÜgung, APAF1 VerfÜgung an BNIP3L VerfÜgung weisen net all bedeitend Augmentatioun, an BNIP3L VerfÜgung, CASP6 VerfÜgung an APAF1 VerfÜgung, Album
an Bax VerfÜgung nëmme wéineg Erhéijung gewisen. p53 Zil- Genen Regulatioun Net-apoptotic bewosst Prozesser dorënner MDM2 VerfÜgung, GADD45A VerfÜgung, CDKN1A VerfÜgung (och bekannt als P21 WAF1 /CIP1 VerfÜgung), EGFR VerfÜgung, CCND1 VerfÜgung, CCNG2
a TGFA VerfÜgung moderéiert bewisen ze ginn-Regulatioun markéiert. Dësen Ënnerscheed Gentherapie Ausdrock ënnert der p53 Zil- Genen an dëser Etude identifizéiert, uginn kann selektiv inhibition vun p53-mediated apoptosis wéinst fräi CagA-ASPP2 Interaktioun, konsequent mat Buti d'Conclusiounen. VerfÜgung Trotzdem, war dës Etude net ze bewäerten entworf ob de Punkto Zomm vun inhibitory an stimulatory Signaler vereinfacht apoptosis oder Prolifératioun vu epithelial Zellen. Déi aktuell Resultater Ganzt Komplexitéit vun apoptosis Regulatioun vun epithelial Zellen an Äntwert ze H. pylori VerfÜgung aussetzt, an Stärekoup Analyse hindeit, datt et eng biologesch Koordinatioun vun der Gentherapie Ausdrock ass Regulatioun apoptosis. Dat kann e puer vun de komplexe carcinogenic Mechanismus vun H. erklären an gastric adenocarcinoma pylori VerfÜgung. Et ass staark association tëscht H. pylori VerfÜgung infecton, besonnesch d'cagA VerfÜgung + genotype [44], an gastric adenocarcinoma [45, 46], an och aner Cancers ugeholl goufen fir eng Roll ervirbréngen H. pylori VerfÜgung [47, 48]. 0,05.

• Den Impakt vun den Entrée Diagnos op gastric emptying zu kritesch krank Patienten
• Impakt vun neoadjuvant Chimiotherapie mat PELF-protocoll versus Agrëff gehalen an der Behandlung vun fortgeschratt gastric carcinoma