E Roman diffusen gastric Kriibs waat Variant zu E-cadherin (CDH1) intron 2: E Fall Kontroll studéieren an eng italienesch population

E Roman gastric Kriibs waat Variant zu E-cadherin (CDH1 VerfÜgung) intron 2 diffusen: E Fall Kontroll studéieren an eng italienesch Populatioun VerfÜgung méiglech VerfÜgung Background VerfÜgung genetesch Faktoren ierflecher wéi e-cadherin (CDH1 VerfÜgung) Promoteur Varianten sinn gegleeft de Risiko Richtung sporadesch diffusen gastric Kriibs (DGC) ze beaflossen. Kuerzem, gouf zu CDH1 eng nei reglementaresche Regioun essentiel fir CDH1 VerfÜgung Transkriptiouns identifizéiert VerfÜgung intron 2. VerfÜgung Method VerfÜgung Mir all bekannt schiefgang genotyped innerhalb conserved Message vun CDH1 VerfÜgung intron 2 (rs10673765, rs9932686, rs1125557, rs9282650, rs9931853) an eng italienesch Populatioun aus 134 DGC Fäll an 100 gesond Kontrollen (55 Patient Bekannten an 45 stinn, stemmt Individuen). Den Afloss vun eenzelne Varianten op DGC Risiko war mat évaluéieren χ 2-Tester a Logistikzenter Réckgang. Der relativer Bäitrag vun alleles war vun haplotype Analyse geschate VerfÜgung Resultater VerfÜgung Mir wesentlechen observéiert. (P &Si besteet; 0.0004) Associatioun vun der CDH1 VerfÜgung 163 + 37235G &plain Eng Variant (rs1125557) mat DGC Risiko. Chance nennen sech 4.55 (95% CI = 2.09-9.93) a 1.38 (95% CI = 0.75-2.55) fir AA an GA wwerreeche, bzw.. Wann den Alter ugepasst, Geschlecht, Fëmmen Status, Alkohol ofgeroden a H. pylori VerfÜgung Wonn, blouf de Risiko Aschätzunge fir AA wwerreeche schiddene bedeitend. Haplotype Analyse proposéiert den 163 + 37235A-allele dréit zu Krankheet Risiko onofhängeg vun der aner Varianten studéiert VerfÜgung Conclusioun VerfÜgung D'CDH1 VerfÜgung 163 + 37235G &plain. A polymorphism engem Roman waat Variant fir sporadesch DGC bedeiten kann, wann bestätegt an anere Populatiounen. der breeder Ausdrock vu E-cadherin zu epithelia que, dat ëmmer Etude encouragéiert weider Evaluatioun vun den 163 + 37235A-allele als waat Variant zu anere carcinomas. VerfÜgung Background VerfÜgung Gastric Kriibs eng grouss Ursaach vum Kriibs-Zesummenhang veruerteelt ass an ass normalerweis an zwee histological Zorte séiert, déi intestinal an der diffusen Form (Lauren Klassifikatioun [1]). Déi allgemeng Heefegkeet Tariffer fir Mo. Kriibs sinn an enger roueger réckleefeg, haaptsächlech wéinst Taux vun der intestinal Kriibs-Typ ofgeholl. Dat riskéiert Frequenz ass gegleeft d'Resultat vun verbessert Ernährung a sanitär Bedingungen ze ginn. Am Géigesaz, schéngt d'Heefegkeet vun diffusen gastric Kriibs (DGC) eleng méi stabil an de leschte Jorzingte [1, 2]. Esou e konstante Taux mobiliséiert engem erweiderten Bäitrag vun ierflecher genetesch Risiko anstatt Ëmwelt- Facteure fir d'diffusen Form vun Mo. Kriibs. VerfÜgung ënnert der gastric mucosal Uewerfläch bis seng fréi Entwécklung CLL [3], ass DGC normalerweis um Diplôme Etapp festgestallte an doduercher mat engem aarmen Resultat verbonne [1]. Dofir, kann genetesch DGC lues d'Identifikatioun vun Individuen Risiko erliichtert an droen domat zu enger Verbesserung vun DGC Diagnos an Therapie. VerfÜgung Op enger molekulare Niveau, ass DGC Ënnerscheedung vun de intestinal Typ op der Basis vun hirem Manque Ausdrock vun der Zell -cell Haftung Protein E-cadherin [4]. E-cadherin ass d'Schlësselelement vun der epithelial adherens menaarbecht an esou ass fir funktionell intercellular Haftung bannent epithelial Blieder néideg [5]. Am Géigesaz zu villen aneren epithelial Cancers, ass E-cadherin ganz fréi während DGC Entwécklung downregulated, eng Roll an der Initiatioun vun dëser Krankheet suggeréiert [3]. Stattfannen an Promoteur hypermethylation vun der E-cadherin Gentherapie (CDH1 VerfÜgung) sinn déi konsequent genetesch zu sporadesch DGC observéiert hire Restaurant [6, 7]. Ausserdeem, CDH1 VerfÜgung germline Projet'en ze ierflech DGC predispose [8] konsequent mat enger domat Funktioun vun E-cadherin hunn zu DGC. (; 45 y &Si besteet) [9] CDH1 VerfÜgung germline kennen normalerweis Co-segregate mat engem dominante Muster vun Epidemien ënnert betraffe Famillen, a kann heiansdo an isoléiert DGC Fäll bei engem jonken Alter festgestallte fonnt ginn. Mä si Kont fir nëmmen ëm 1% vun all DGC Fäll [9] an domat net d'genetesch aetiology erkläre kann postulated ze offensichtlech sporadesch DGC Fäll ze bedeelegen. Genetesch hire Restaurant aner wéi CDH1 VerfÜgung germline Projet'en sinn dofir wahrscheinlech de Risiko vun Entwécklungslänner DGC an dem Fehlen vun enger kloer Famill Geschicht oder engem jonken Alter bei Diagnos ze erhéichen. VerfÜgung Gemeinsam allelic Varianten mat enger mëll funktionell Effekt kann den Afloss Risiko fir sporadesch Krankheet. Iwwerhaapt, eng eenzeg Nukleotid polymorphism (SNP) bannent der CDH1 VerfÜgung Promoteur (-160C > A) huet mat enger däitlech méi Risiko vun sporadesch DGC zu bestëmmte héich-Heefegkeet Populatiounsschichte [10-13] assoziéiert gouf. Vun der Technik CDH1 VerfÜgung SNPs, ass de -160A Promoteur allele sou wäit déi eenzeg Variant zu DGC Risiko agebonne mä ebenfalls mat anere CDH1 VerfÜgung schiefgang an alleng ze handelen [10, 13]. VerfÜgung Viru Kuerzem, eng nei CDH1 VerfÜgung reglementaresche Regioun huet beschriwwe ginn [14]. Dës Regioun ass Texter bannent CDH1 VerfÜgung intron 2, de gréisste Net-coding CDH1 VerfÜgung Segment (66% vun der totaler Haaptrei) an ass fir souwuel d'Initiatioun an Ënnerhalt vun transcriptional CDH1 VerfÜgung Aktivitéit gewise gin néideg an ënnerscheet epithelia. Wichtegst néideg sinn, intron 2 Message och fir normal CDH1 VerfÜgung Transkriptiouns während erwuessener Liewen, d'Méiglechkeet gëtt, datt an dëser Regioun Varianten diffusen gastric carcinogenesis Afloss kann. An dëser Etude VerfÜgung, genotyped mir all bekannt Varianten am conserved Message wellkomm vun CDH1 VerfÜgung intron 2 an hir allelic Ofstänn an Gruppen vun italienesch sporadesch DGC Fäll a gesond Persounen alles méiglech Associatiounen mat Krankheet ergrënnen. VerfÜgung Method VerfÜgung kennen VerfÜgung DNA Echantillon vun 134 DGC Patiente kritt huet, déi sech Velospiste vun der District vu Pesaro-Urbino, Regioun Marche, Central Italien. No Agrëff, war d'DGC Diagnos vun zwee pathologists onofhängeg confirméiert. Patienten goufen klinesch um lokal Medical Zukunft Eenheetspräis (Hospital d'Urbino) bewäert, wou se och eng demographesch Blat och hir perséinlech a familial Kriibs Geschicht ofgeschloss. Date goufen während Interviewen mat hir Zukunft Dokteren Fra an hir Famill Geschicht war erëm fir ≥3 Generatiounen a säitlech zu 2 rg an 3 drëtte Diplome Famill verdanken. Op der Grondlag vun dëser Beuerteelung, keent vun de Patiente begéint de Medeziner Critèrë fir familial Kriibs syndromes bekannt. Der Inclusioun Critèrë fir dierfe Patienten goufen: Caucasian Herkunft, gebierteg vun der studéiert geographesch Géigend an opgepasst Famill Geschicht vu Kriibs. D'selwecht Critèren plus opgepasst perséinlech Geschicht vum Kriibs huet fir Kontrollen adoptéiert. Kontroll DNA Echantillon sech aus 55 gesond Famill kritt, deen entweder onberéiert Elteren waren (n = 15), Geschwëster (22) oder Kanner (18) vun de Studien DGC Patienten. Wéi gesond Bekannten fir all DGC Patient net disponibel waren, DNA Echantillon vun engem Grupp vun allerdéngs net gesond Persounen (n = 45) duerch de Pool vu fréier an aktuell Blutt Donateuren aus der Klinik d'Urbino identifizéiert goufen och eng total vun 100 Kontrollen noginn. Allerdéngs Kontrollen waren ausgewielt mat Ofstänn un Fäll vum Alter a Geschlecht bruecht. Déi heeschen Alter vun DGC Patienten ouni Famill war 54,6 y ± 11.41SD, iwwerdeems déi vun hirem reagéiert Kontrollen war 52,2 y ± 10.21SD. All Sujeten waren iwwer hir fëmmen an drénken Gewunnechten Interview. H. pylori VerfÜgung Zoustand war vun agebousst Ënnersiche vun gastric Echantillon fir Fäll alles, a vum Blutt oder Goalchance Tester fir Kontrollen. D'ethesch Ufuerderunge goufen déi intern ethneschen Comité (Hospital d'Urbino) an all Etude Participanten hirt schrëftlech informéiert Zoustëmmung Fra a guttgeheescht. VerfÜgung CDH1 intron 2 Regiounen conserved an schiefgang VerfÜgung Conserved Regioune vun CDH1 VerfÜgung intron 2 (GenBank NC_000016) waren déi Fotoen an entspriechend Mënsch, chimpanzee, Grenzwäerter a Maus Message vun der NCBI Datebank (NCBI, Entrez Nukleotid) gefollegt vun Formatioun mat der NCBI Server (NCBI, Grondakommes lokal Formatioun Search Tool) an Invitrogen Vecteure NTI Virausbezuelung identifizéiert ™ 9.0 Software (Accelrys Software INC, San Diego, USA). Conserved Regiounen sech definéiert als no manner wéi 5% leien Machtënnerscheeder tëscht de verschiddenen Arten. D'conserved Regioune waren Hinnen alleguer-Kick an Fragmenter vun iwwer 200 BP Gréisst phpNuke. Déi entspriechend primers (kuckt Table 1 fir e Message an Konditiounen) sech mat der GeneFisher online Outil [15] an hiergestallt vum Fläch-Proligo (Fläch-Aldrich Corporation, St. Louis, USA) entworf. FastStart Taq DNA Polymerase (Roche, Basel, Schwäiz) an PTC-200 Hinnen alleguer Maschinnen (MJ Fuerschung, Waltham, USA) gebraucht goufen. Déi folgend schiefgang Libre (Ensemble GenomeBrowser [16]) am Kick Regiounen: 163 + 14184ΔAGGG (rs10673765, matzen am Hinnen alleguer ofgesprengt C2F1), 163 + 14384C > T (rs9932686, C2F2), 163 + 37235G > A (rs1125557, C3F2 ), 163 + 37276T > a (rs9282650, C3F2), an 163 + 49526C > G (rs9931853, C4F1). D'Tess online Outil [17] gouf benotzt fir putative Transkriptiouns bindend Faktor Siten ze sichen, datt déi virun variants.Table 1 Hinnen alleguer primers a Konditiounen VerfÜgung betraff kann zu Stiermer primer
Réckproduktioun primer
ta *
MG ++ †
DMSO ‡
C1F1 VerfÜgung ccgccttaaagaaactcttg VerfÜgung accggtggcaaatactag VerfÜgung 65 ° C VerfÜgung 1,5 VerfÜgung - VerfÜgung C1F2 VerfÜgung tagaagggttgaacctgttc VerfÜgung tcttagtccacgagaagaag VerfÜgung 65 ° C VerfÜgung 1,5 VerfÜgung -
C1F3 VerfÜgung taggagagcttgtaacaagc VerfÜgung cactcggttctaccgaag VerfÜgung 65 ° C 1,5
- VerfÜgung C2F1 VerfÜgung tgtattagccacagagaag VerfÜgung ctaaaactagaccacgaag VerfÜgung 65 ° C VerfÜgung 1,5 VerfÜgung - VerfÜgung C2F2 VerfÜgung gtcacaaaacagcttg VerfÜgung ccttccttgagcaaggc VerfÜgung 65 ° C VerfÜgung 1,5 VerfÜgung - VerfÜgung C3F1 VerfÜgung ttgcctaaggccccctttttgttc VerfÜgung gaatctgcgaagtctacatc VerfÜgung 65 ° C VerfÜgung 1,5
- VerfÜgung C3F2 VerfÜgung acactagccacacatgggactcaag VerfÜgung tgctggtgtggattcaaatgtg VerfÜgung 65 ° C VerfÜgung 1,5 VerfÜgung - VerfÜgung C4F1 VerfÜgung acctccgcctcctgggttcaagc VerfÜgung ttcctcccgcttagtg VerfÜgung 60 ° C VerfÜgung 1,5 VerfÜgung - VerfÜgung C4F2 VerfÜgung tggccaggcctgtcttaaactc VerfÜgung ttcttaggtccgtgggtttttacg VerfÜgung 65 ° C VerfÜgung 1,5 VerfÜgung - VerfÜgung C4F3 VerfÜgung aaagtgctgggattacaggtgtgag VerfÜgung tcgataatcccgagaactc VerfÜgung 55 ° C
1.0 VerfÜgung + VerfÜgung C4F4 VerfÜgung gaaccataggactttgactgatgg VerfÜgung actgatggttatccgggttcccttg VerfÜgung 65 ° C VerfÜgung 1,5 VerfÜgung - VerfÜgung C4F5 VerfÜgung agctgttgagctgtcatcacaatcc VerfÜgung gaatttcctacccgtctatggtagg VerfÜgung 65 ° C VerfÜgung 1,5 VerfÜgung - VerfÜgung C5F1 VerfÜgung tagtggggagtggggtcttagcttc VerfÜgung tcgttcaccctcctttcttcttacc VerfÜgung 58 ° C VerfÜgung 1,5 VerfÜgung - VerfÜgung C5F2 VerfÜgung gggcatgttgaaatatacccagtc VerfÜgung tctgagtaatagaggggtacgttgg VerfÜgung 65 ° C VerfÜgung 1,5 VerfÜgung - VerfÜgung C5F3 VerfÜgung cttgccagcgtgacagtg VerfÜgung cgaaaccccgtggagtag VerfÜgung 65 ° C VerfÜgung 1,5 VerfÜgung - VerfÜgung C5F4 VerfÜgung caggttggggctcctcgtcatactg VerfÜgung cttccgacgtgacttaaggaaagag
65 ° C VerfÜgung 1,5 VerfÜgung - VerfÜgung C5F5 VerfÜgung gcttgtctcaactttcactgtc VerfÜgung gaatttcctacccgtctatggtagg VerfÜgung 65 ° C VerfÜgung 1,5 VerfÜgung - VerfÜgung C6F1 VerfÜgung tggtattcaggaggatgcag VerfÜgung acctacgatcgtaaaaagt VerfÜgung 65 ° C VerfÜgung 1,5 VerfÜgung - VerfÜgung C6F2 VerfÜgung cccatcaatgcttatttgttctt VerfÜgung gcctgggagacggagact VerfÜgung 65 ° C VerfÜgung 1,5 VerfÜgung - VerfÜgung C6F3 VerfÜgung tgggctgtttgagttttgttc
cggtgtaaaaggttcgtgac VerfÜgung 65 ° C VerfÜgung 1,5 VerfÜgung - VerfÜgung * ta annealing Temperatur; † MG ++ - Konzentratioun vun MM kritt ass; ‡ DMSO gouf um 5% fc VerfÜgung Single-staarkt conformation polymorphism VerfÜgung Single-staarkt conformation polymorphism (SSCP) benotzt dobäi den conserved intron 2 Regioun an 19 italienesch DGC Patienten fir d'Präsenz vun zousätzleche gemeinsam ze scannen mä population- spezifesch schiefgang. SSCP war ëmschriwwen standing [18], mat der Ausnahm, dass Uls ™ 495 fluorophore (Kreatech Déi, Amsterdam, Holland) gouf amplaz vu Radioaktivitéit benotzt d'Fragmenter zu Etikett. An dowéinst, war 1 μl Hinnen alleguer Produit mat 0,2 μl Hoerfaarw zu engem 20 μl Reaktioun incubated. . Gels huet en private Liewen molekulare pauschal fënnt gescannt benotzt (BioRad, Hercules, USA) op 488 nm VerfÜgung Genotyping VerfÜgung Déi folgend Restriktioun Enzymen fir d'genotyping vun DNA benotzt goufen Varianten: 0,06 U /μl BsaXI fir 163 + 14184ΔAGGG, 1 U /μl BanII VerfÜgung fir 163 + 14384C > T, 0,2 U /μl MaeIII VerfÜgung fir 163 + 37276T > a, an 0,4 U /μl HpaII VerfÜgung fir 163 + 49526C > G. All Enzymen sech aus New England Biolabs (Ipswich, USA) mat der Ausnam vun MaeIII VerfÜgung aus Roche (Basel an der Schwäiz). Reaktioune waren Iwwernuechtung incubated a Fragmenter sech op 4% getrennt (w /v) agarose gels VerfÜgung schiefgang 163 + 37235G &plain. A an 163 + 37276T > A op engem Abi Prism 7900 (Obwuel Biosystems, Foster City, USA) genotyped sech mat der real-Zäit Hinnen alleguer-baséiert allelic Diskriminatioun assays aus Obwuel Biosystems no der gëtt Uweisungen. VerfÜgung sequencing VerfÜgung fonnt Varianten vun direkten sequencing mat der USB thermosequencing Kit (USB, Cleveland, USA) an engem LiCor 4000L Fra sech DNA sequencer (LiCor, Lincoln, Nebraska USA). VerfÜgung statistique Analyse VerfÜgung sech évaluéieren Ënnerscheed distributions ënnert Fäll a Kontrollen vun der χ 2-Test (mat DF = 2 fir genotypes an DF = 1 fir alleles) . Risiko war vun univariate Analyse an déi verschidde Logistikzenter Réckgang (StataLanguage Software, StataCorp LP, College Station, USA) geschat. De χ 2-Test (DF = 2) war och ënnersicht Hitparad vun Hardy-Weinberg Gläichgewiicht benotzt. Alter Differenzen Patienten verschiddene genotypes Droen sech berechent eng 2-tailed T-Test mat. VerfÜgung Haplotype Ofstänn vu unphased genotypes an linkage disequilibrium opgebaut goufen (LD) tëscht SNPs ugeholl gouf mat der SHEsis Software Plattform [19, 20]. Nëmmen haplotypes mat enger relativer Frequenz > 0,03 an entweder Fäll oder Kontrollen waren an der Analyse abegraff. Global Associatioun vun haplotypes mat Krankheet war berechent vun engem χ 2-Test (DF = 7). Den 163 + 14184ΔAGGG an 163 + 14384C > T Varianten huet net an der läschter Analyse abegraff wéi se net praktesch goufen. D'Associatioun vun eenzelne haplotypes mat Krankheet huet op 2 × 2 weider Dëscher am Verglach zu der A-A-C haplotype baséiert. LD war den r ausgedréckt 2, mat r 2 = 1 besot komplett LD, r 2 = 0 Feele vun LD, an r 2 &Si besteet; 0,33 suggeréiert minimal LD. VerfÜgung Resultater VerfÜgung Six conserved Regioune mat enger total Gréisst vun 3,2 kbp goufen 2. Ausser de fënnef bekannt schiefgang (CDH1 VerfÜgung 14184ΔAGGG (rs10673765) 163 + bannent CDH1 VerfÜgung intron identifizéiert, 163 + 14384C > T (rs9932686), 163 + 37235G > a (rs1125557), 163 + 37276T > a (rs9282650), an 163 + 49526C > G (rs9931853)), keng zousätzlech gemeinsam schiefgang spezifesch fir d'italienesch Populatioun ënnert Etude goufen vun SSCP an de sechs Regioune entdeckt. VerfÜgung Restriktioun ofgesprengt Längt polymorphism an allelic Diskriminatioun assays benotzt, d'Bekannten Ofstänn vun der genotypes vun de fënnef Varianten ergi sech an der DGC Fäll an der Kontrollen alles. Sequencing vun zoufälleg Echantillon confirméiert de respektiven genotypes. All schiefgang waren an Hardy-Weinberg Gläichgewiicht fir zwee Fäll a Kontrollen (p > 0.19). Table 2 resüméiert d'genotype distributions an hiren Ënnerscheeder tëscht Fäll an controls.Table 2 CDH1 VerfÜgung intron 2 genotype distributions ënnert DGC Fäll a Kontrollen VerfÜgung + 14184ΔAGGG Fäll (n = 134)
+ 14184ΔAGGG Kontrollen (n = 100)
χ2-Test
ODER (95% CI) *, †
ODER (95% CI) *, †
+ /+ VerfÜgung + /Δ VerfÜgung Δ /Δ VerfÜgung + /+ VerfÜgung + /Δ VerfÜgung Δ /Δ VerfÜgung p VerfÜgung Δ /Δ vs + /+ VerfÜgung + /Δ vs + /+ VerfÜgung 128 VerfÜgung 4 VerfÜgung 2 VerfÜgung 96
3 VerfÜgung 1 VerfÜgung 0,947 VerfÜgung 1.50 (0.13-16.78) VerfÜgung 1.00 (0.21-4.57) zu 95,5% zu 3% VerfÜgung 1,5 97% VerfÜgung%
1,5% VerfÜgung 1,5% VerfÜgung 14,2% VerfÜgung 2,5% VerfÜgung + 14384C > T Fäll (n = 134) VerfÜgung + 14384C > T Kontrollen (n = 100) VerfÜgung χ 2 Azeton VerfÜgung ODER (95% CI) VerfÜgung ODER (95% CI) VerfÜgung CC VerfÜgung CT VerfÜgung TT VerfÜgung CC VerfÜgung CT VerfÜgung TT VerfÜgung p
TT vs CC VerfÜgung CT vs CC VerfÜgung 130 VerfÜgung 2 VerfÜgung 2 VerfÜgung 98 VerfÜgung 1 zu 1 VerfÜgung 0,895 VerfÜgung 1,51 (0.13-16.87) VerfÜgung 1.51 (0.13-16.87) zu 97,0% VerfÜgung 1,5% VerfÜgung 1,5% VerfÜgung 98,0% VerfÜgung 1.0% VerfÜgung 1.0% VerfÜgung 12,3% VerfÜgung 12,3% VerfÜgung + 37235G > A Fäll (n = 134) VerfÜgung + 37235G > A Kontrollen (n = 100) VerfÜgung χ 2 Azeton VerfÜgung ODER (95% CI) VerfÜgung ODER (95% CI) VerfÜgung GG VerfÜgung GA VerfÜgung AA VerfÜgung GG VerfÜgung GA VerfÜgung AA VerfÜgung p VerfÜgung AA vs GG VerfÜgung GA vs GG VerfÜgung 30 zu 56 zu 48
37 zu 50 zu 13 VerfÜgung 0,0003 VerfÜgung 4.55 (2.09-9.93) VerfÜgung 1.38 (0.75-2.55) zu 22,4% VerfÜgung 41,8% VerfÜgung 35,8%
37,0% VerfÜgung 50,0% VerfÜgung 13,0% zu 100% zu 40,6% VerfÜgung + 37276T > A Fäll (n = 134) VerfÜgung + 37276T > A Kontrollen (n = 100)
χ 2 Azeton VerfÜgung ODER (95% CI) VerfÜgung ODER (95% CI) VerfÜgung TT VerfÜgung TA VerfÜgung AA VerfÜgung TT VerfÜgung TA VerfÜgung AA
p VerfÜgung AA vs TT VerfÜgung TA vs TT VerfÜgung 65 zu 65 VerfÜgung 4 VerfÜgung 46 zu 51 VerfÜgung 3 VerfÜgung 0,929 VerfÜgung 0.94 (0.20-4.42 ) VerfÜgung 0.90 (0.53-1.53) zu 48,5% VerfÜgung 48,5% VerfÜgung 3.0% VerfÜgung 46,0% VerfÜgung 51,0% VerfÜgung 3.0% VerfÜgung 1,9% VerfÜgung 1,6% VerfÜgung 49526C > G Fäll (n = 134) VerfÜgung + 49526C > G Kontrollen (n = 100) VerfÜgung χ 2 Azeton VerfÜgung ODER (95% CI) VerfÜgung ODER (95% CI) VerfÜgung CC VerfÜgung CG VerfÜgung GG VerfÜgung CC VerfÜgung CG VerfÜgung GG VerfÜgung p VerfÜgung GG vs CC VerfÜgung CG vs GG 34 zu 82 VerfÜgung
18 zu 30 zu 58 zu 12 VerfÜgung 0,727 VerfÜgung 1,32 (0.55-3.19) VerfÜgung 1,25 (0.69-2.26) zu 25,4% VerfÜgung 61,2% VerfÜgung 13,4 % VerfÜgung 30,0% VerfÜgung 58,0% VerfÜgung 12,0% VerfÜgung 32,2% VerfÜgung 22,5% VerfÜgung * ODER Wäerter sinn ofgeblennte. VerfÜgung † de Prozentsaz ënnert der ODER Wäerter Schätzunge d'Muecht vun Associatioun fir all Variant am entspriechende oDER Niveau an eng Bedeitung Niveau vun 5% unzehuelen VerfÜgung of der propagéieren Varianten, nëmmen den 163 + 37235G &plain. a SNP vill mat Krankheet op eng overrepresentation vun der a-allele ënnert der DGC wéinst verbonne war Fäll (56.7% vs. 38% vun Kontrollen, χ 2 = 16.1, p &Si besteet; 0,0001; gesinn Table 2). Den 163 + 37235AA genotype war 2,8 mol méi heefeg am Fäll Verglach zu Kontrollen. Déi entspriechend Chance Verhältnis (ODER) proposéiert eng bedeitend nik Risiko vun DGC Entwécklungslänner fir AA wwerreeche famill ze GG wwerreeche (ODER = 4,55, 95% CI = 2.09-9.93, p = 0,0002, Muecht vun association 100%; Table 2). Nee bedeitend méi Risiko war visuell vun der GA-genotype Droen (ODER = 1,38, 95% CI = 0.75-2.55, p = 0.3, Muecht vun association 41%; Table 2). D'DGC Risiko fir AA wwerreeche nach bedeitend, wann Örs fir Alter ugepasst goufen, Geschlecht, Alkohol ofgeroden a H. pylori VerfÜgung Wonn (Table 3). An Fëmmerten, awer, war d'verbonne Risiko nëmmen vun geséchert Bedeitung (p = 0,089, Table 3). D'Risike verbonnen mat der aner Varianten studéiert blouf Net-relevant Upassung folgenden (Donnéeën net gewisen). A SNP an Alter bei Diagnos (p >; 0.16) .Table 3 seng Örs verbonne mat der CDH1 VerfÜgung intron 2 163 + 37235G > kee Veräin huet tëschent der 163 + 37235G > observéiert Eng Variant VerfÜgung Variable

163+37235

Cases

Controls

OR (95% CI)
zu zu VerfÜgung n
%
n
%
zu Alter VerfÜgung ≤ Paracetamol VerfÜgung GG VerfÜgung 17 zu 20 zu 20 zu 34 VerfÜgung 1 VerfÜgung GA VerfÜgung 37 zu 45 zu 30 zu 52 VerfÜgung 1,45 (0.65-3.25) VerfÜgung AA VerfÜgung 29 zu 35 VerfÜgung 8 VerfÜgung 14 VerfÜgung 4.26 (1.55-11.77 ) VerfÜgung > Paracetamol VerfÜgung GG VerfÜgung 13 zu 25 zu 17 zu 40 VerfÜgung 1 VerfÜgung GA 19
37 zu 20 zu 48 VerfÜgung 1,24 ( 0.48-3.24) VerfÜgung AA VerfÜgung 19 zu 37 VerfÜgung 5 zur VerfÜgung 12 VerfÜgung 4,97 (1.47-16.86) VerfÜgung Sex VerfÜgung Weiblech VerfÜgung GG VerfÜgung 13 <20 br> 20 zu 34 VerfÜgung 1 VerfÜgung GA VerfÜgung 28 zu 44 zu 30 zu 51 VerfÜgung 1.44 (0.60-3.42) VerfÜgung AA
23 zu 36 VerfÜgung 9 VerfÜgung 15 VerfÜgung 3.93 (1.39-11.12) VerfÜgung GG Männlech VerfÜgung 17 zu 24 zu 17 zu 41
20 1 VerfÜgung GA VerfÜgung 28 zu 40
49 VerfÜgung 1.40 (0.58-3.39) VerfÜgung AA VerfÜgung 25 zu 36 VerfÜgung 4 VerfÜgung 10 VerfÜgung 6,25 (1.79-21.84) VerfÜgung fëmmen VerfÜgung nie VerfÜgung GG VerfÜgung 17 zu 24 zu 25 zu 42 VerfÜgung 1 VerfÜgung GA VerfÜgung 30 <42 br> 30 zu 50 VerfÜgung 1.47 (0.66-3.26) VerfÜgung AA VerfÜgung 25 zu 35 VerfÜgung 5 zur VerfÜgung 8 VerfÜgung 7.35 (2.34-23.01)
Scho VerfÜgung GG 13 zu 21 zu 12 zu 30 VerfÜgung 1 VerfÜgung GA VerfÜgung 26 zu 42 zu 20 zu 50 VerfÜgung 1,20 (0.45-3.19) VerfÜgung AA VerfÜgung 23 zu 37 VerfÜgung 8 VerfÜgung 20 VerfÜgung 2,65 (0.86-8.16)) VerfÜgung Alkohol VerfÜgung ≤ 20 g /Dag
GG VerfÜgung 24 zu 26 zu 26 zu 40 VerfÜgung 1 VerfÜgung GA 35
38 zu 31 zu 48 VerfÜgung 1.22 (0.59-2.55 ) VerfÜgung AA VerfÜgung 34 zu 37 VerfÜgung 8 VerfÜgung 12 VerfÜgung 4.60 (1.78-11.90) VerfÜgung > 20 g /Dag VerfÜgung GG VerfÜgung 6 VerfÜgung 15 zu 11 zu 31 VerfÜgung 1 VerfÜgung GA VerfÜgung 21 zu 51 zu 19 zu 54
2,01 (0.63-6.55) VerfÜgung AA VerfÜgung 14 zu 34 VerfÜgung 5 zur VerfÜgung 15 VerfÜgung 5,13 (1.23-21.36) VerfÜgung H. pylori VerfÜgung Negativ VerfÜgung GG VerfÜgung 2 VerfÜgung 11 zu 16 zu 37 VerfÜgung 1 VerfÜgung GA VerfÜgung 22 zu 48 zu 22 zu 51 VerfÜgung 3,2 (1.00-10.26)
AA VerfÜgung 19 zu 41 VerfÜgung 5 zur VerfÜgung 12 bis 12.16 (2.98-49.64) VerfÜgung positiv VerfÜgung GG 25
28 zu 21
37 VerfÜgung 1 VerfÜgung GA VerfÜgung 34 zu 39 zu 28 zu 49 VerfÜgung 1.02 (0.472 -. 19) VerfÜgung AA VerfÜgung 29 zu 33
8 VerfÜgung 14 VerfÜgung 3.045 (1.15-8.07) VerfÜgung ob der 163 VerfÜgung CDH1 + 37235A-allele DGC Risiko jidferengem onofhängeg oder mat dem aneren intron 2 Varianten vun geschéckt fir erauszefannen, haplotypes aus dem schéine fënnef schiefgang goufen an hir Ofstänn waren am Fäll a Kontrollen geschat. Déi zwee 5'-Varianten waren net praktesch a sech domat ausgeschloss. D'intron 2 haplotypes weisen eng global Associatioun mat Krankheet (DF = 7, χ 2 = 24.09, p &Si besteet; 0.002). Am Allgemengen, wouvun haplotypes der 163 + 37235A-allele sech méi heefeg am Fäll Verglach zu Kontrollen, während dräi vun de véier haplotypes mat den G-allele ënnert d'Kontrolle méi heefeg goufen (Table 4). De stäerkste Associatioun mat Krankheet huet fir de AAG an der ATC haplotypes observéiert (mat 163 + 37235A op Positioun 1). Ëmgedréit, huet d'Série an de GTC haplotypes stäerkst Schutz. Linkage disequilibrium Analyse uginn schiddene feelen LD tëscht der propagéieren Varianten (r 2 &Si besteet; 0,03; Table 5) suggeréiert datt de CDH1 VerfÜgung 163 + 37235G > A SNP eng fräi waat Richtung DGC onofhängeg vun der aner Varianten eegens vläicht investigated.Table 4 CDH1 VerfÜgung haplotype intron 2 Ofstänn ënnert DGA Fäll a Kontrollen VerfÜgung zu Case (Natiirlech son se) †
Control (Natiirlech son se) †
Fisher d'p
Pearson d'p
ODER (95% CI)
AAC * VerfÜgung 16,04 (0,060) zu 5,31 (0,027) zu 0,088 VerfÜgung 0,088 VerfÜgung 2,33 (0.86-6.34) VerfÜgung AAG VerfÜgung 17,49 (0,065) VerfÜgung 5.34 (0.027 ) VerfÜgung 0,056 VerfÜgung 0,056 VerfÜgung 2,55 (0.95-6.83) VerfÜgung ATC 73,09 VerfÜgung (0.273) VerfÜgung 35,43 (0,177) zu 0,015 VerfÜgung 0,015 VerfÜgung 1.74 (1.11 -2.74) VerfÜgung ATG VerfÜgung 45.38 (0.169) VerfÜgung 29.91 (0.150) VerfÜgung 0,565 VerfÜgung 0,565 VerfÜgung 1.16 (0.70-1.92) VerfÜgung GAC VerfÜgung 21.73 (0.081)
24.18 (0.121) VerfÜgung 0,152 VerfÜgung 0,152 VerfÜgung 0.64 (0.35-1.18) VerfÜgung Série VerfÜgung 17.75 (0.066) VerfÜgung 22.17 (0.111) VerfÜgung 0,087 VerfÜgung 0,087
0.57 (0.30-1.09) VerfÜgung GTC VerfÜgung 39.15 (0.146) VerfÜgung 53.07 (0.265) VerfÜgung 0,001 VerfÜgung 0,001 VerfÜgung 0.47 (0.30-0.75) VerfÜgung GTG VerfÜgung 37.37 (0.139) VerfÜgung 24.85 (0.123) VerfÜgung 0,602 VerfÜgung 0,602 VerfÜgung 1.16 (0.67-1.99) VerfÜgung * Haplotype Bestellung: 163 + 37235G > A, 163 + 37276T > A, 163 + 49526C > G. Déi zwee 5'-Varianten sech net mat abegraff, wéi se de haplotypes net weider gemaach opgespléckt. VerfÜgung † Nummere kuckt rekonstruéiert haplotype Zuelen ënnert Fäll (257) a Kontrollen (192), mat all eenzel Saachen zwee chromosomes. Relativer Ofstänn sinn zu Prozent entscheet. Net all genotype Donnéeën an Analyse abegraff huet, wéi héich Frequenz haplotypes goufen annuléiert. VerfÜgung Table 5 Linkage disequilibrium tëscht CDH1 VerfÜgung intron 2 schiefgang VerfÜgung R2 linkage disequilibrium
zu 163 + 14384C > T
163 + 37235G > A
163 + 37276T > A
163 + 49526C > G
163 + 14184ΔAGGG VerfÜgung 0,001 VerfÜgung 0,000 VerfÜgung 0,001 VerfÜgung 0,001 VerfÜgung 163 + 14384C > T VerfÜgung - VerfÜgung 0,002 VerfÜgung 0,000 VerfÜgung 0,000 VerfÜgung 163 + 37235G > A VerfÜgung - VerfÜgung - VerfÜgung 0,028 VerfÜgung 0,000 VerfÜgung 163 + 37276T > A VerfÜgung - VerfÜgung - VerfÜgung - VerfÜgung 0,003 <

• D'Relatioun vun wiere endothelial Wuesstem Faktor Gentherapie schiefgang a Krankheete Resultat vun fortgeschratt Patienten gastric Kriibs behandelt mat FOLFOX: VEGF polymorphism zu gastric Kriibs
• Preoperative chemoradiotherapy fir lokalen fortgeschratt gastric Kriibs