Roman difuzne želučane varijantu rak osjetljivosti na E-kadherina (CDH1) introna 2: case control studija u talijanskom stanovništva

Roman difuzne želučane varijantu rak osjetljivosti na E-kadherina (CDH1
) introna 2: case control studija u talijanskom stanovništva
apstraktne pregled pozadine
nasljedni genetski faktori, kao što su E-kadherina (CDH1
) promotor varijante se vjeruje da utječu na rizik prema sporadičnim difuznom karcinoma želuca (DGC). Nedavno je novi regulatorno područje bitno za CDH1 pregled, prepisivanje je identificiran, u CDH1 pregled introna 2.
Metode pregled Mi genotipiziran sve poznate polimorfizama se nalazi unutar očuvanih sekvenci CDH1
introna 2 (rs10673765, rs9932686, rs1125557, rs9282650, rs9931853) u talijanskom populacije koja se sastoji od 134 DGC slučajeva i 100 zdravih ispitanika (55 bolesnika rodbine i 45 nepovezanih, uparenim pojedinaca). Utjecaj pojedinih varijanti na DGC rizika procijenjena je pomoću χ 2-testovi i logistička regresija. Relativni doprinos alela procijenjena je haplotip analiza pregled Rezultati pregled Mi primijetio značajan. (P < 0.0004) Udruga CDH1 pregled 163 + 37235G > Varijanta (rs1125557) sa DGC rizika. Tečajevi omjera su 4,55 (95% CI = 2,09-9,93) i 1,38 (95% CI = 0,75-2,55) za AA i GA prijevoznika, odnosno. Kada se uzme u dobi, spolu, statusu pušenja, uzimanja alkohola i H. pylori infekcije pregled, procjene rizika u velikoj mjeri ostaje značajan za AA prijevoznika. Haplotip analiza je upućivala na 163 + 37235A-alela pridonosi riziku bolesti neovisno o drugim varijantama studirao pregled Zaključak
CDH1 pregled 163 + 37235G > a. Polimorfizam može predstavljati novu varijantu osjetljivosti za sporadične DGC ako se potvrdi da je u ostale populacije. S obzirom na široki ekspresije E-kadherina u epitela, ova istraživačka studija potiče daljnju procjenu od 163 + 37235A-alela kao varijanta osjetljivosti u drugim karcinomima. Pregled Pozadina pregled, rak želuca je glavni uzrok smrtnosti od raka povezanih i obično se klasificiraju u dvije histoloških tipova, crijevni i raširen oblik (Lauren klasifikacija [1]). Opći Stope incidencije karcinoma želuca u stalnom padu, uglavnom zbog smanjenja stope crijevnog raka tipa. To pada frekvencije Vjeruje se da je rezultat poboljšane prehrane i sanitarnih uvjeta. Za razliku od toga, učestalost difuznom karcinoma želuca (DGC) sama pojavljuje više stabilna tijekom posljednjih nekoliko desetljeća [1, 2]. Takva stalna stopa ukazuje na značajniji doprinos naslijedio genetski rizik nego okolišnih čimbenika na difuznog oblika raka želuca.
Zahvaljujući svom ranom razvoju ispod želučane sluznice [3], DGC obično dijagnosticira u poodmakloj fazi i stoga povezana sa lošijom ishodom [1]. Dakle, genetski DGC markeri mogu olakšati identifikaciju pojedinaca u riziku i time doprinijeti poboljšanju DGC dijagnostici i terapiji.
Na molekularnoj razini, DGC se razlikuje od crijevna tipa na temelju svoje abnormalnom ekspresijom u stanici P stanica adhesion molecule E-kadherina [4]. E-kadherina je ključna komponenta u epitelnim adherens spoju i kao takva je potrebno za funkcionalnu međustanične adhezije u epitelnim listova [5]. Za razliku od mnogih drugih epitelnim karcinomima, E-kadherin je podreguliran vrlo rano tijekom DGC razvoja, što sugerira ulogu u pokretanju bolesti [3]. Mutacija i promotor Hipermetilacija od E-kadherina gena (CDH1 Netlogu) su najdosljedniji genetske promjene uočene u sporadičnim DGC [6, 7]. Nadalje, CDH1 pregled zametne linije mutacije pridobiti na nasljedne DGC [8] u skladu s inicirajući funkcija pomanjkanja E-kadherina u DGC. CDH1 pregled zametne linije mutacije obično co-odvajaju s dominantnom obrascu bolesti kod pogođene obitelji, a povremeno se može naći u izoliranim DGC slučajeva dijagnosticiranih u mladoj dobi (< 45 y) [9]. Međutim, oni čine samo oko 1% svih slučajeva DGC [9] i stoga se ne može objasniti genetski etiologije pretpostavlja da doprinese prividnim sporadične DGC slučajevima. Genetske promjene osim CDH1 pregled rasplodnih stanica mutacija Zato će se dodati na rizik za razvoj DGC u nedostatku jasne obiteljske povijesti ili mladoj dobi pri dijagnozi.
Common alelne varijante s blagim funkcionalnog učinka može utjecati na rizik za sporadične bolesti. Doista, jedan nukleotidnih polimorfizama (SNP) u sklopu CDH1 pregled promotor (-160C > A) je bila povezana sa znatno povećanim rizikom od sporadičnih DGC u pojedinim velike incidencije populacija [10-13]. Istraživanog CDH1 pregled, SNP je -160A promotor alel je za sada jedini varijanta upleten u DGC rizik, ali čini se da djeluje u kombinaciji s drugim CDH1 pregled polimorfizama [10, 13]. Pregled, nedavno, novi CDH1 pregled regulatorno područje je opisano u [14]. Ovo područje nalazi se unutar CDH1 pregled introna 2, najveći je nekodirajuće CDH1 pregled segment (66% od ukupnog slijeda) te se pokazalo da će biti potrebni i za pokretanje i održavanje CDH1 pregled aktivnosti transkripcije u diferenciranim epitela. Važno je, introna 2 sekvenci također su neophodni za normalan CDH1 pregled prepisivanje tijekom odraslog života, pružajući mogućnost da varijante unutar ove regije mogu utjecati na difuznu želučane karcinogeneze.
U ovoj studiji, genotipiziran smo sve poznate varijante koje se nalaze unutar sačuvanih sekvenci od CDH1 pregled introna 2 i određuje njihove alelne frekvencije u grupama od talijanskih sporadičnih DGC slučajevima i zdravih osoba kako bi razotkrio moguće udruge s bolešću.
Metode pregled pacijenata
DNA uzorci su dobiveni od 134 DGC pacijenata koji su bili rodom iz Distrikta Pesaro-Urbino, Regija Marche, središnjoj Italiji. Nakon operacije, dijagnoza DGC neovisno je potvrđena dva patologa. Bolesnici su klinički ispituje na lokalnoj onkologiju jedinici Medical (bolnica d'Urbino), gdje su također završila demografske list uključujući i njihove osobne i obiteljske povijesti raka. Podaci su potvrdili tijekom intervjua s njihovim onkoloških liječnicima, a njihova obitelj je povijest sežu za ≥3 generacije i bočno do 2 nd i 3 stupanj rd rođaka. Na temelju ove procjene, niti jedan od pacijenata ispunila kliničke kriterije za poznate sindroma raka obiteljskih. Kriteriji za uključivanje za pogodnih bolesnika bili su: bijele rase etnicitet, rodom iz promatranog zemljopisnom području i nedostatka obiteljske povijesti raka. Isti kriteriji plus nedostatak osobne povijesti raka usvojeni su za kontrole. kontrolni uzorci DNK dobivene su od 55 zdravih rođaka, koji su bili ili zdravi roditelji (n = 15), braća i sestre (22) i djecu (18) proučavanih DGC pacijenata. Kao što je zdrava rođaci nisu bili dostupni za svaku DGC pacijenta, uključene su uzorci DNA iz grupe zdrava osoba (n = 45) identificirane kroz bazen bivših i sadašnjih davalaca krvi iz bolnice d'Urbino, čime je ukupno 100 kontrola. Nevezano Kontrole su nasumično odabrane frekvencije odgovara za slučajeve po dobi i spolu. Srednja dob DGC bolesnika bez rodbine bio 54,6 y ± 11.41SD, a da od njihovih usporednih nadzora 52,2 y ± 10.21SD. Svi ispitanici su bili intervjuirani o njihovim pušenja i pijenja. H. pylori pregled stanja utvrđena je patološki pregled uzoraka želuca za slučajeve, a po krvi ili dah testovi za kontrole. Etički zahtjevi su bili provjereni i odobreni od strane unutarnje Etičkog povjerenstva (bolnica d'Urbino), a svi sudionici studije su dali svoj pisani pristanak.
CDH1 introna 2 konzervirane regije i polimorfizmi
konzervirana područja CDH1 pregled introna 2 (GenBank NC_000016) su identificirali preuzimanja odgovarajućih ljudi, čimpanza, miša i štakora sekvence iz NCBI bazi podataka (NCBI, Entrez nukleotida), nakon čega slijedi usklađivanje pomoću NCBI poslužitelja (NCBI, Basic Local Alignment Search Tool) i Invitrogen Vector NTI Advance ™ 9.0 softver (Accelrys Software Inc, San Diego, SAD). Sačuvane regije su definirane kao da varijacija manji od 5% sekvence među različitim vrstama. Na konzervirane regije su PCR uvećan na preklapanje ulomaka oko 200 veličine bp. Odgovarajući primeri (vidi tablicu 1 za redoslijedu i uvjetima) su napravljeni pomoću GeneFisher online alat [15] i proizvela tvrtka Sigma-Proligo (Sigma-Aldrich Corporation, St. Louis, USA). Korištene su FastStart Taq DNA polimeraze (Roche, Basel, Switzerland) i PTC-200 PCR strojeva (MJ Research, Waltham, USA). Sljedeće polimorfizmi nalaze (Ensemble GenomeBrowser [16]) u amplificiranim regije: 163 + 14184ΔAGGG (rs10673765, koji se nalazi u PCR fragmentom C2F1), 163 + 14384C > T (rs9932686, C2F2), 163 + 37235G > A (rs1125557, C3F2 ), 163 + 37276T > a (rs9282650, C3F2) i 163 + 49526C > G (rs9931853, C4F1). TESS online alata [17] se koristi za traženje potencijalnog prepisivanje obvezujući faktor web stranice koje mogu biti pogođene gore variants.Table 1 PCR početnice i uvjeti pregled pregled Forward primer
zadnji primer
Ta *
Mg ++ †
DMSO ‡
C1F1 pregled ccgccttaaagaaactcttg pregled accggtggcaaatactag pregled 65 ° C pregled 1.5
- C1F2 pregled tagaagggttgaacctgttc pregled tcttagtccacgagaagaag pregled 65 ° C
1,5 pregled -
C1F3 pregled taggagagcttgtaacaagc pregled cactcggttctaccgaag pregled 65 ° C
1.5
- C2F1 pregled tgtattagccacagagaag pregled ctaaaactagaccacgaag pregled 65 ° C
1.5
- pregled C2F2 pregled gtcacaaaacagcttg pregled ccttccttgagcaaggc pregled 65 ° C pregled 1.5
- C3F1 pregled ttgcctaaggccccctttttgttc pregled gaatctgcgaagtctacatc pregled 65 ° C
1.5
- pregled C3F2 pregled acactagccacacatgggactcaag pregled tgctggtgtggattcaaatgtg pregled 65 ° C
1.5
- C4F1 pregled acctccgcctcctgggttcaagc pregled ttcctcccgcttagtg pregled 60 ° C
1.5
- C4F2 pregled tggccaggcctgtcttaaactc pregled ttcttaggtccgtgggtttttacg pregled 65 ° C pregled 1.5
- C4F3 pregled aaagtgctgggattacaggtgtgag pregled tcgataatcccgagaactc pregled 55 ° C
1,0 pregled + pregled C4F4 pregled gaaccataggactttgactgatgg pregled actgatggttatccgggttcccttg pregled 65 ˝ Kasiopejski pregled 1.5
- C4F5 pregled agctgttgagctgtcatcacaatcc pregled gaatttcctacccgtctatggtagg pregled 65 ° C pregled 1.5
- C5F1 pregled tagtggggagtggggtcttagcttc pregled tcgttcaccctcctttcttcttacc pregled 58 ° C pregled 1.5
- C5F2 pregled gggcatgttgaaatatacccagtc pregled tctgagtaatagaggggtacgttgg pregled 65 ° C
1.5
- C5F3 pregled cttgccagcgtgacagtg pregled cgaaaccccgtggagtag pregled 65 ° C pregled 1.5
- C5F4 pregled caggttggggctcctcgtcatactg pregled cttccgacgtgacttaaggaaagag
65 ° C
1.5
- C5F5 pregled gcttgtctcaactttcactgtc pregled gaatttcctacccgtctatggtagg pregled 65 ° C
1.5
- C6F1 pregled tggtattcaggaggatgcag pregled acctacgatcgtaaaaagt pregled 65 ° C
1.5
- C6F2 pregled cccatcaatgcttatttgttctt pregled gcctgggagacggagact pregled 65 ° C pregled 1.5
- C6F3 pregled tgggctgtttgagttttgttc
cggtgtaaaaggttcgtgac pregled 65 ° C
1,5
- * temperaturu Ta združivanja; † Mg ++ - koncentracija je dano u mM; ‡ DMSO je dodan na 5% fc pregled jednolančanih konformacijski polimorfizma pregled konformaciju polimorfizma s jednim cjedilu (SSCP) se koristi za skeniranje očuvanu introna 2 regiju u 19 talijanskih DGC pacijenata na prisustvo dodatnog zajedničkog, ali population- specifičnih polimorfizama. SSCP je izvedena kao što je opisano [18], uz iznimku da ULS ™ 495 fluorofor (Kreatech Biotechnology, Amsterdam, Nizozemska) umjesto radioaktivnosti za označavanje fragmenata. Ukratko, 1 ul PCR proizvoda se inkubira s 0,2 ul bojom u reakciji od 20 ul. . Gelovi su skenirani pomoću FX molekulske imager (BioRad, Hercules, USA) pri 488 nm pregled Genotipizacija
Sljedeći restrikcijski enzimi su korišteni za određivanje genotipa DNA varijante: 0,06 U /ul BsaXI za 163 + 14184ΔAGGG, 1 U /ul BanII pregled za 163 + 14384C > T, 0,2 U /ul MaeIII pregled za 163 + 37276T aminokiselina, i 0,4 U /ul HpaII pregled za 163 + 49526C > G. Svi enzimi od New England Biolabs (Ipswich, SAD) s izuzetkom MaeIII Netlogu od Roche (Basel, Švicarska). Reakcije su inkubirane preko noći, a fragmenti su razdvojeni na 4% (w /v) agaroza gel pregled polimorfnih oblika 163 + 37235G >. A i 163 + 37276T > A su genotipizirani na ABI Prism 7900 (Applied Biosystems, Foster City, USA) pomoću real-time PCR-based alelne diskriminacije eseji iz Applied Biosystems u skladu s uputama koje se nalaze. pregled, sekvenciranje
Otkrivene varijante potvrđene su izravnim sekvenciranje pomoću USB thermosequencing kit (USB, Cleveland, USA) i LiCor 4000 litara DNA sekvencer (LiCor, Lincoln, Nebraska USA). pregled, Statistička analiza
diferencijal distribucija među predmetima i kontrola su ocijenjeni od strane χ 2-testa (sa df = 2 za genotipova i DF = 1 za alela) , Rizik se procjenjuje univarijantne analizom i multiple logističke regresije (Stata softvera, StataCorp LP, College Station, SAD). Χ 2-testa (df = 2) je također bio korišten za ispitivanje odstupanja od Hardy-Weinberg ravnoteže. Dobne razlike među pacijentima koji nose različite genotipove izračunate su pomoću dva kraka t-testa.
Haplotipa su frekvencije rekonstruirati iz unphased genotipova i povezivanja neravnoteže (LD) između SNP-ova je procijenjena korištenjem SHEsis softverske platforme [19, 20]. Samo haplotipovi s relativnom učestalošću > 0,03 bilo u slučajevima ili kontrole su uključene u analizu. Globalna povezanost haplotipova s ​​bolestima izračuna se pomoću χ 2-testa (df = 7). 163 + 14184ΔAGGG i 163 + 14384C > T varijante nisu bili uključeni u konačnu analizu kako oni nisu bili informativan. Udruga pojedinih haplotipova s ​​bolestima temelji se na 2 × 2 nepredviđene tablice u odnosu na A-A-C haplotip. LD je izražena kao r 2, pri čemu je r 2 = 1, što ukazuje kompletan LD, R 2 = 0 odsutnost LD, a R 2 < 0,33 upućuje na minimalni LD pregled. Rezultati
Šest konzervirane regije s ukupnom veličinom od 3.2 kbp su identificirati CDH1 pregled introna 2. Osim pet poznatih polimorfizama (CDH1 pregled 163 + 14184ΔAGGG (rs10673765), 163 + 14384C > T (rs9932686), 163 + 37235G > a (rs1125557), 163 + 37276T > a (rs9282650) i 163 + 49526C > G (rs9931853)), bez dodatne zajedničke polimorfizmi specifični za talijansku populaciju pod istraživanja bili su otkrio SSCP u šest regija.
Korištenje polimorfizam ograničenje duljine fragment i alelne analize diskriminacije, relativne frekvencije genotipova koji proizlaze iz pet varijanti su određene u slučajevima DGC i kontrolne skupine. Nizanje slučajnih uzoraka potvrdila odgovarajuće genotipova. Svi polimorfizmi su bili u Hardy-Weinberg ravnoteže u oba slučaja i kontrola (p > 0,19). Tablica 2 daje genotip distribucija i njihove razlike između predmeta i controls.Table 2 CDH1 pregled introna 2 genotip distribucija među DGC predmetima i kontrola pregled + 14184ΔAGGG slučajeva (n = 134)
+ 14184ΔAGGG kontrole (n = 100)
χ2-testa
ILI (95% CI) *, †
ILI (95% CI) *, †
+ /+ pregled + /Δ pregled Δ /Δ pregled + /+ pregled + /Δ pregled Δ /Δ pregled p pregled Δ /Δ vs + /+ pregled + /Δ vs + /+ pregled 128 pregled 4
2 pregled 96
3. pregled 1 pregled 0.947 pregled, 1,50 (0,13 - 16,78) pregled, 1,00 (0,21-4,57) pregled, 95,5%
3%
1,5% pregled, 97%
1,5%
1,5%
14,2%
2,5% pregled + 14384C > T slučajeva (n = 134) pregled + 14384C > T kontrola (n = 100) pregled, χ 2 -test pregled ILI (95% CI) pregled, OR (95% CI) pregled, CC pregled CT pregled, TT pregled CC pregled CT pregled, TT pregled p
TT vs CC
CT vs CC pregled 130 pregled 2 pregled, 2 pregled, 98 pregled, 1 pregled 1 pregled 0,895 pregled 1,51 (0,13 - 16,87) pregled 1,51 (0,13 - 16,87)
97,0%
1,5%
1,5%
98,0%
1,0%
1,0%
12,3%
12,3% pregled + 37235G > A slučajeva (n = 134) pregled + 37235G > A kontrole (n = 100) pregled, χ 2 -test pregled ILI (95% CI) pregled, OR (95% CI) pregled GG pregled GA pregled AA pregled GG pregled GA pregled AA pregled p pregled AA vs GG
GA vs GG
30
56
48
37 pregled, 50 pregled, 13 pregled 0,0003 pregled 4,55 (2,09-9,93) 1,38 (
0.75-2.55)
22,4%
41,8%
35,8%
37,0%
50,0%
13,0%
100%
40,6% pregled + 37276T > A slučajeva (n = 134) pregled + 37276T > A kontrola (n = 100)
χ 2 -test pregled ILI (95% CI) pregled, OR (95% CI) pregled, TT pregled TA pregled AA pregled TT pregled TA pregled AA
p pregled AA vs TT
TA vs TT
65 pregled, 65 pregled, 4
46 pregled, 51 pregled 3
0,929 pregled 0,94 (0,20-4,42 )
0,90 (0,53-1,53) pregled, 48,5%
48,5%
3,0%
46,0%
51,0%
3,0%
1,9%
1,6% pregled 49526C > G slučajeva (n = 134) pregled + 49526C > G kontrole (n = 100) pregled, χ 2 -test pregled ILI (95% CI) pregled, OR (95% CI) pregled CC pregled CG pregled GG pregled CC pregled CG pregled GG pregled p pregled GG vs CC
CG vs GG
34 pregled 82
18
30
58 Netlogu 12 pregled 0,727 pregled 1.32 (0.55-3.19)
1.25 (0.69-2.26)
25,4%
61,2%
13,4 %
30,0%
58,0%
12,0%
32,2%
22,5% pregled * ILI vrijednosti su neusklađeno. pregled † postotak ispod ili vrijednosti procjenjuje moć udruge za svaku varijantu na odgovarajući ili razini i uz pretpostavku razini značajnosti od 5% pregled od ispitivanih varijanti, samo 163 + 37235G >. SNP je značajno povezana s bolešću zbog overrepresentation a-alela među DGC slučajeva (56,7% vs 38% u kontrolnoj, χ 2 = 16.1, p < 0,0001; vidi tablicu 2). 163 + 37235AA genotip bio je 2,8 puta češći u slučajevima u usporedbi s kontrolnom skupinom. Omjer odgovarajućih izgleda (OR) su ukazali na značajno povećan rizik od razvoja DGC za AA prijevoznika u odnosu na GG nosače (OR = 4,55, 95% CI = 2.09-9.93, p = 0,0002, moć udruge 100%, Tablica 2). Bez značajno povećanje rizika je bilo očito iz nosi GA-genotip (OR = 1,38, 95% CI = 0,75-2,55, p = 0.3, Snaga udruge 41%, Tablica 2). Rizik DGC za AA nosača ostala značajna, kada ORS su prilagođena dobi, spola, uzimanje alkohola i H. pylori pregled infekcije (tablica 3). U pušača, međutim, povezani rizik je bio samo graničnom značajnosti (p = 0,089, tablica 3). Rizici povezani s drugim varijantama proučavali su ostali bez značajnog sljedeće prilagodbe (podaci nisu prikazani). Nije zabilježena nikakva veza između 163 + 37235G > SNP i starost u vrijeme dijagnoze (p > 0,16) .table 3 Prilagođen ORS povezane s CDH1 pregled introna 2 163 + 37235G > Varijanta
Variable

163+37235

Cases

Controls

OR (95% CI)
pregled pregled pregled, n
%
n
%
pregled Age pregled ≤ Srednje pregled GG pregled 17 pregled, 20 pregled, 20 pregled, 34 pregled, 1
GA Netlogu 37 pregled, 45 pregled, 30 pregled, 52 pregled, 1,45 (0,65-3,25) pregled AA pregled 29. pregled 35
8
14 pregled, 4,26 (1.55-11.77 ) pregled > Medijan pregled GG pregled 13 pregled, 25 pregled, 17 pregled, 40
1 pregled GA
19 pregled, 37 pregled, 20 pregled, 48 pregled, 1,24 ( 0,48-3,24) pregled AA pregled 19 pregled, 37 pregled 5
12 pregled, 4,97 (1,47 - 16,86)
Sex pregled Ženski pregled GG pregled 13
20 pregled, 20 pregled, 34
1 pregled GA
28 pregled, 44 pregled, 30 pregled, 51 pregled, 1.44 (0.60-3.42) pregled AA
23 pregled, 36 pregled, 9
15 pregled, 3,93 (1,39 - 11,12) pregled Muški pregled GG
17 pregled, 24 pregled, 17 pregled, 41
1 pregled GA
28 pregled, 40 pregled, 20 pregled, 49 pregled, 1.40 (0.58-3.39) pregled AA pregled 25. pregled 36
4 pregled, 10 pregled, 6,25 (1,79 - 21,84)
Pušenje pregled Nikad pregled GG pregled 17 pregled, 24 pregled, 25 pregled, 42
1 pregled GA
30
42 pregled, 30 pregled, 50 pregled, 1,47 (0,66-3,26) pregled AA pregled 25
35 Netlogu 5 pregled osam pregled 7,35 (2.34-23.01)
Još
GG
13 pregled, 21 pregled, 12 pregled, 30
1 pregled GA
26 pregled, 42 pregled, 20 pregled, 50
1,20 (0,45-3,19) pregled AA pregled 23
37
8
20
2.65 (0.86-8.16))
Alkohol pregled ≤ 20 g /dan
GG
24 pregled, 26 pregled, 26 pregled, 40
1 pregled GA
35 pregled, 38 pregled, 31 pregled, 48 pregled, 1,22 (0,59-2,55 ) pregled AA pregled 34
37 Netlogu 8 pregled 12 pregled, 4,60 (1.78-11.90) izvoznici > 20 g /dan pregled GG pregled 6
15 pregled, 11 pregled, 31
1 pregled GA
21 pregled, 51 pregled, 19 pregled 54
2,01 (0,63-6,55) pregled AA pregled 14 pregled 34 pregled 5
15 pregled, 5,13 (1,23 - 21,36) pregled H. pylori
Negativan
GG pregled 2 pregled, 11 pregled, 16 pregled, 37
1 pregled GA
22 pregled, 48 pregled, 22 pregled, 51 pregled, 3.2 (1.00-10.26)
AA pregled 19 pregled, 41 pregled 5
12 pregled 12.16 (2,98-49,64)
Pozitivan pregled GG
25 pregled, 28 pregled 21
37 pregled 1 pregled GA
34 pregled, 39 pregled, 28 pregled, 49 pregled, 1,02 (0,472 -. 19) pregled AA pregled 29 pregled 33
8 pregled 14 pregled 3,045 (1,15-8,07)
utvrditi da li je CDH1 pregled 163 + 37235A-alela prenosi DGC rizik samostalno ili u kombinaciji s drugim introna 2 varijante, haplotipovi rezultira iz pet polimorfizmi su obnovljena i njihove frekvencije su procijenjeni u slučajevima i kontrole. Dva 5'-varijante nisu bili informativni i stoga su isključeni. U introna 2 haplotipovi pokazala globalnu povezanost s bolešću (df = 7, χ 2 = 24,09, p < 0,002). Općenito, haplotipovi koji sadrže 163 + 37235A-alel bili su češći u slučajevima u odnosu na kontrole, a tri od četiri haplotipova s ​​G-alel bili su češći među kontrola (Tablica 4). Najjača povezanost s bolešću zabilježena je za AAG i ATC haplotipova (sa 163 + 37235A u 1). S druge strane, GAG i GTC haplotipovi su pokazali najjači zaštitu. Povezanost ravnoteže analiza pokazala je uglavnom odsutnog LD između ispitivanih varijanti (r 2 < 0,03; tablica 5), ​​što ukazuje da je CDH1 pregled 163 + 37235G > SNP mogu dati povećanu osjetljivost prema DGC neovisno o drugim varijantama investigated.Table 4 CDH1 pregled introna 2 frekvencije haplotipom među DGA predmetima i kontrola pregled pregled slučaju (frekvencija) †
pregled, kontrola (freq) †
Fisherov p
Pearsonov p
ILI (95% CI)
AAC * pregled 16.04 (0.060)
5.31 (0.027) pregled 0,088 pregled 0,088 pregled 2,33 (0,86-6,34) pregled AAG pregled 17.49 (0.065) pregled, 5,34 (0.027 ) pregled 0,056 pregled 0,056 pregled 2,55 (0,95-6,83)
ATC
73.09 (0.273)
35.43 (0.177)
0,015 pregled 0,015 pregled 1,74 (1,11 -2,74) pregled ATG
45.38 (0,169)
29.91 (0.150)
0,565 pregled 0,565 pregled 1.16 (0.70-1.92) pregled GAC pregled 21.73 (0,081)
24.18 (0,121)
0,152 pregled 0,152 pregled 0.64 (0.35-1.18)
gag pregled 17.75 (0,066)
22.17 (0,111)
0,087 pregled 0,087
0,57 (0,30-1,09) pregled GTC pregled 39.15 (0.146) pregled 53.07 (0,265) pregled 0.001
0.001 pregled, 0,47 (0,30 - 0,75) pregled GTG pregled 37.37 (0,139) pregled 24.85 (0,123) pregled 0.602
0.602 pregled, 1,16 (0,67-1,99) pregled * haplotip poredak: 163 + 37235G > A, 163 + 37276T > A, 163 + 49526C >G. Dva 5'-varijante nisu bili uključeni, kao i oni nisu dodatno razdvojiti haplotipova. Pregled † Brojevi se odnose na obnovljenih haplotipu brojeva među predmetima (257) i kontrolne skupine (192), a svaki pojedinac nosi dva kromosoma. Relativne frekvencije u postotku. Nisu svi genotip podaci uključeni u analizu, jer niske frekvencije haplotipova su odbačene.
Tablica 5. Povezanost neravnoteže između CDH1 pregled introna 2 polimorfizmi pregled r2 povezanost ravnoteže
pregled 163 + 14384C > T
163 + 37235G >
163 + 37276T >
163 + 49526C >G
163 + 14184ΔAGGG pregled 0.001
0.000
0.001
0.001 pregled, 163 + 14384C > T
- 0,002 pregled 0.000 Netlogu 0.000 pregled, 163 + 37235G > pregled -
- 0,028 pregled 0.000 pregled, 163 + 37276T >
- -
- 0.003 <

• Odnos rasta vaskularnog endotela polimorfizama faktor gena i klinički ishod u pacijenata s uznapredovalim rakom želuca liječenih FOLFOX: VEGF polimorfizma u želučanom cancer
• Preoperativna kemoradioterapiji za lokalno uznapredovalim želuca cancer