Romaani hajanainen mahasyövän alttius muunnos E-kadheriinin (CDH1) introni 2: A case control study in Italian population

Romaani hajanainen mahasyövän alttius muunnos E-kadheriinin (CDH1
) intronin 2: A case control study in italialainen populaatio
tiivistelmä
tausta
peritty geneettiset tekijät, kuten E-kadheriinin (CDH1
) promoottorivariantteja uskotaan vaikuttavan riskiä kohti satunnaista diffuusi mahasyövän (DGC). Äskettäin uusi säätelyalue välttämättömiä CDH1
transkriptio on havaittu CDH1
intronin 2. Tool Menetelmät
Me genotyyppi kaikkia tunnettuja polymorfismit sijaitsevat konservoituneet sekvenssit CDH1
intronin 2 (rs10673765, rs9932686, rs1125557, rs9282650, rs9931853) italialaisessa väestö koostuu 134 DGC tapauksissa ja 100 tervettä verrokkia (55 potilasta sukulaiset ja 45 ulkopuoliselta Hyväksytty henkilöä). Vaikutus yksittäisten muunnoksia DGC riski arvioitiin käyttämällä χ 2-testejä ja logistinen regressio. Suhteellinen osuus alleelien arvioitiin haplotyyppianalyysissä.
Tulokset
Havaitsimme merkittävän (p < 0,0004) yhdistys on CDH1
163 + 37235G > variantti (rs1125557) kanssa DGC riski. Kerroin suhteet olivat 4,55 (95% CI = 2,09-9,93) ja 1,38 (95% CI = +0,75-+2,55) AA ja GA kantajia, vastaavasti. Oikaistu ikä, sukupuoli, tupakointi, alkoholin nauttiminen ja helikobakteeri
infektion riskiestimaattien pysyi jokseenkin merkittävä AA harjoittajille. Haplotyyppianalyysi ehdotti 163 + 37235A-alleelin, myötävaikuttaa sairauden riskin toisistaan ​​riippumatta varianttien tutkittu.
Päätelmä
CDH1
163 + 37235G > polymorfismi voi edustaa uutta alttius muunnos satunnaista DGC, jos vahvistetaan muut populaatiot. Kun otetaan huomioon laaja ilmentyminen E-kadheriinin in epiteeli, tässä valmistelevassa tutkimuksessa rohkaisee arviointi 163 + 37235A-alleeli kuin alttius variantin muut syövät.
Tausta
Mahalaukun syöpä on suurin syy syöpään liittyvää kuolleisuutta ja yleensä luokitellaan kahteen histologisia tyyppejä, suoliston ja hajanainen lomake (Lauren luokittelu [1]). Yleinen esiintymistiheys mahasyövän ovat tasaisesti laskenut, mikä johtuu suurelta osin vähentämällä määriä suoliston syöpä-tyyppiä. Tämä falling taajuus uskotaan olevan seurausta paremmalla ravinnolla ja hygieniaolot. Sen sijaan esiintyvyys hajakuormituksen mahasyövän (DGC) yksin näyttää vakaampi viime vuosikymmeninä [1, 2]. Tällainen tasaisella nopeudella merkitsee suurempaa osuutta perinnöllinen geneettinen riski sijaan ympäristötekijät on hajanainen muodossa mahasyöpä.
Koska sen varhaisen kehityksen alla mahalaukun limakalvon pinnalla [3], DGC diagnosoidaan yleensä edennyt pitkälle ja näin ollen liittyy huonompi tulos [1]. Siksi geneettiset DGC markkereita voivat helpottaa tunnistamista riskihenkilöt ja siten edistää paranemiseen DGC diagnosoinnissa ja hoidossa.
Molekyylitasolla, DGC eroaa suolen tyypin perusteella sen epänormaalia ilmentymistä solun -solujen adheesiomolekyyli E-kadheriinin [4]. E-kadheriinin on avaintekijä epiteelin vyöliitos ja sellaisenaan edellyttää toiminnallista välistä adheesiota kuluessa epiteelikalvot [5]. Toisin kuin monissa muissa epiteelisyöpien, E-kadheriinin on vaimentua hyvin varhaisessa vaiheessa DGC kehitys, mikä viittaa rooli aloittamisen tämän taudin [3]. Mutaatio ja promoottori hypermetylaatiota E-kadheriinin geeni (CDH1
) ovat johdonmukaisia ​​geneettisiä muutoksia havaittu satunnaista DGC [6, 7]. Lisäksi CDH1
ituradan mutaatioita altistavia perinnöllisiä DGC [8] mukainen aloittava toiminta E-kadheriinin vajaus DGC. CDH1
ituradan mutaatioita yleensä yhteistyössä eritellä määräävä rakenteessa tauti keskuudessa heidän perheenjäsenilleen ja joskus löytyy yksittäisiä DGC diagnosoitu nuorena (< 45 y) [9]. Kuitenkin ne muodostavat vain noin 1% kaikista DGC tapauksissa [9] ja näin ollen voi selittää geneettisen etiologian oletetaan lisäävän ilmeistä satunnaisia ​​DGC tapauksissa. Geneettisiä muutoksia muu kuin CDH1
ituradan mutaatioita ovat siten todennäköisesti lisää riskiä sairastua DGC puuttuessa selvästi suvussa tai nuori ikä diagnoosin.
Yhteinen alleelivariantit miedolla funktionaalinen vaikutus voi vaikuttaa riski satunnaista tauti. Itse asiassa yhden nukleotidin polymorfismi (SNP) sisällä CDH1
promoottori (-160C > A) on liittynyt merkittävästi lisääntynyt riski satunnaista DGC tietyissä korkeamman esiintyvyyden populaatiot [10-13]. Tutkituista CDH1
SNP: The -160A promoottori-alleeli on toistaiseksi ainoa vaihtoehto osallisena DGC riskin, mutta näyttää toimivan yhdessä muiden CDH1
polymorfismien [10, 13].
Äskettäin uusi CDH1
säätelyalue on kuvattu [14]. Tämä alue on sisällä CDH1
intronin 2, suurin ei-koodaavan CDH1
segmentin (66% koko sekvenssin) ja sen on osoitettu olevan tarpeen sekä aloittamisen ja ylläpidon transkription CDH1
toimintaa eriytetty epiteeli. Tärkeää on, introni 2 sekvenssit ovat myös välttämättömiä normaalille CDH1
transkriptio aikuisiässä, joka tarjoaa mahdollisuuden, että vaihtoehdot tällä alueella voi vaikuttaa hajanainen mahasyövän.
Tässä tutkimuksessa me genotyyppi kaikki tunnetut variantit sijaitsevat konservoituneet sekvenssit of CDH1
intronin 2 ja määritettiin niiden Alleelifrekvenssien ryhmissä Italian satunnaisia ​​DGC tapauksissa ja terveiden ihmisten purkamaan mahdollisia assosiaatioita tautiin. Tool menetelmät
potilaat
DNA-näytteet saatiin 134 DGC potilasta, jotka olivat kotoisin District of Pesaro-Urbinon, Marchen alue, Keski-Italiassa. Leikkauksen jälkeen DGC diagnoosi itsenäisesti vahvistettu kahdella patologia. Potilaat arvioitiin kliinisesti paikallisen Medical Oncology Unit (sairaala d'Urbino), jossa he valmistui myös demografinen arkki lukien henkilö- ja familiaalinen syöpä historiaa. Tiedot tarkistettiin haastatellessa niiden onkologian lääkärit ja heidän suvussa jäljitettiin takaisin ≥3 sukupolvien ja sivusuunnassa 2 nd ja 3 rd asteen sukulaisia. Sen tämän arvioinnin perusteella yksikään potilaista sai kliiniset kriteerit tiedossa familiaalinen syöpien hoitamiseksi. Sisällyttäminen tukikelpoisille potilaat olivat: valkoihoinen etnisyys, kotoisin tutkittujen maantieteellisen alueen ja puute suvussa syöpää. Samoja perusteita plus puute henkilökohtainen historia syövän hyväksyttiin valvontaa. Kontrolli-DNA-näytteet on saatu 55 tervettä sukulaisia, jotka olivat joko vaikuta vanhempien (n = 15), sisarukset (22) tai lapsia (18) tutkittiin DGC potilailla. Koska terve sukulaiset puuttuivat jokaista DGC potilaalle, DNA-näytteitä ryhmästä liity terveiden yksilöiden (n = 45) avulla määriteltyjä altaan entisten ja nykyisten verenluovuttajien päässä Hospital d'Urbino sisällytetty saatiin yhteensä 100 valvontaa. Sukulaiskontrolleista valittiin satunnaisesti taajuuksilla matching tapauksiin iän ja sukupuolen mukaan. Keskimääräinen ikä DGC potilailla, joilla ei sukulaisia ​​oli 54,6 y ± 11.41SD, kun taas niiden verrokkia oli 52,2 y ± 10.21SD. Kaikki koehenkilöt haastateltiin heidän tupakointi ja juominen tottumukset. Helikobakteeri
tila määritettiin patologinen tutkimus mahalaukun näytteitä tapauksissa ja veren tai hengitystesteissä valvontaa. Eettisiä vaatimuksia tarkistettiin ja hyväksyttiin sisäisen eettisen lautakunnan (sairaala d'Urbino) ja kaikki tutkimuksen osallistujat antoivat kirjallisen tietoisen suostumuksensa.
CDH1 intronin 2 säilyneitä alueita ja polymorfismien
säilyneisiin alueisiin CDH1
intronin 2 (GenBank NC_000016) tunnistettiin hakemalla vastaava ihmisen, simpanssin, rotan ja hiiren sekvenssit NCBI tietokannasta (NCBI, Entrez nukleotidin) seurasi linjaus käyttäen NCBI-palvelimen (NCBI, Basic Local Alignment Search Tool) ja Invitrogen Vector NTI Advance ™ 9.0 ohjelmistot (Accelrys Software Inc, San Diego, USA). Konservoituneita alueita oli määritelty olevan alle 5% sekvenssin pientä vaihtelua eri lajia. Konservoituneiden alueiden PCR-monistettiin osaksi päällekkäisiä palasia noin 200 emäsparin kokoinen. Vastaava alukkeita (katso taulukko 1 sekvenssit ja olosuhteet) suunniteltiin käyttämällä GeneFisher verkkotyökalu [15] ja valmistaja Sigma-Proligo (Sigma-Aldrich Corporation, St. Louis, USA). FastStart Taq DNA Polymerase (Roche, Basel, Sveitsi) ja PTC-200-PCR-koneet (MJ Research, Waltham, USA) käytettiin. Seuraavat polymorfismien sijaitsevat (Ensemble GenomeBrowser [16]) sisällä monistettiin alueet: 163 + 14184ΔAGGG (rs10673765, joka sijaitsee PCR-fragmentti C2F1), 163 + 14384C > T (rs9932686, C2F2), 163 + 37235G > A (rs1125557, C3F2 ), 163 + 37276T > A (rs9282650, C3F2), ja 163 + 49526C > G (rs9931853, C4F1). TESS verkkotyökalu [17] käytettiin etsimään otaksutun transkription sitomistekijästä sivustoja, jotka voivat vaikuttaa edellä variants.Table 1 PCR-alukkeita ja olosuhteissa

Forward pohjamaali
käänteisaluke-
Ta *
Mg ++ †
DMSO ‡
C1F1
ccgccttaaagaaactcttg
accggtggcaaatactag
65 ° C
1,5 -
C1F2
tagaagggttgaacctgttc
tcttagtccacgagaagaag
65 ° C
1,5
-
C1F3
taggagagcttgtaacaagc
cactcggttctaccgaag
65 ° C
1,5 -
C2F1
tgtattagccacagagaag
ctaaaactagaccacgaag
65 ° C
1,5
-
C2F2
gtcacaaaacagcttg
ccttccttgagcaaggc
65 ° C
1,5 -
C3F1
ttgcctaaggccccctttttgttc
gaatctgcgaagtctacatc
65 ° C
1,5
-
C3F2
acactagccacacatgggactcaag
tgctggtgtggattcaaatgtg
65 ° C
1,5 -
C4F1
acctccgcctcctgggttcaagc
ttcctcccgcttagtg
60 ° C
1.5 -
C4F2
tggccaggcctgtcttaaactc
ttcttaggtccgtgggtttttacg
65 ° C
1,5 -
C4F3
aaagtgctgggattacaggtgtgag
tcgataatcccgagaactc
55 ° C
1.0
+
C4F4
gaaccataggactttgactgatgg
actgatggttatccgggttcccttg
65 ° C
1,5 -
C4F5
agctgttgagctgtcatcacaatcc
gaatttcctacccgtctatggtagg
65 ° C
1.5
- C5F1
tagtggggagtggggtcttagcttc
tcgttcaccctcctttcttcttacc
58 ° C
1,5 -
C5F2
gggcatgttgaaatatacccagtc
tctgagtaatagaggggtacgttgg
65 ° C
1,5 -
C5F3
cttgccagcgtgacagtg
cgaaaccccgtggagtag
65 ° C
1,5 -
C5F4
caggttggggctcctcgtcatactg
cttccgacgtgacttaaggaaagag
65 ° C
1,5 -
C5F5
gcttgtctcaactttcactgtc
gaatttcctacccgtctatggtagg
65 ° C
1,5 -
C6F1
tggtattcaggaggatgcag
acctacgatcgtaaaaagt
65 ° C
1,5 -
C6F2
cccatcaatgcttatttgttctt
gcctgggagacggagact
65 ° C
1,5 -
C6F3
tgggctgtttgagttttgttc
cggtgtaaaaggttcgtgac
65 ° C
1,5 -
* Ta hehkutus lämpötila; † Mg ++ - pitoisuus annetaan mM; ‡ DMSO lisättiin 5% fc
Yksijuoste konformaatiopolymorfismi-
Yksijuoste konformaatiopolymorfismi- (SSCP) käytettiin skannata säilytetyn intronin 2 alueella 19 Italian DGC potilaita varten on muita yleisiä, mutta väestöpohjainen erityisiä polymorfismit. SSCP suoritettiin, kuten on kuvattu [18], paitsi että ULS ™ 495 fluorofori (Kreatech Biotechnology, Amsterdam, Alankomaat) sijasta käytettiin radioaktiivisuuden merkitä fragmentteja. Lyhyesti, 1 ui PCR-tuotetta inkuboitiin 0,2 ui väriainetta 20 ui reaktiossa. Geelit skannattiin käyttäen FX molekyyli- Imager (BioRad, Hercules, USA) 488 nm: ssä.
Genotyypin
seuraavat restriktioentsyymien käytettiin genotyypin DNA varianttien: 0,06 U /ul BsaXI ja 163 + 14184ΔAGGG, 1 U /ul BanII
varten 163 + 14384C > T, 0,2 U /ul MaeIII
varten 163 + 37276T > A, ja 0,4 U /ul HpaII
varten 163 + 49526C > G. Kaikki entsyymit olivat New England Biolabs (Ipswich, USA) lukuun ottamatta MaeIII
Roche (Basel, Sveitsi). Reaktioita inkuboitiin yön yli ja fragmentit erotettiin 4% (w /v) agaroosigeelissä.
Polymorfismit 163 + 37235G > A ja 163 + 37276T >: A genotyypitettiin ABI Prism 7900 (Applied Biosystems, Foster City, USA) käyttäen reaaliaikaista PCR-pohjainen alleelinen erottelutesteissä Applied Biosystems mukaisesti annettuja ohjeita.
Sequencing
Havaitut muunnokset varmistettiin suoralla sekvensoinnilla käyttäen USB thermosequencing kit (USB, Cleveland, USA) ja licoria 4000L DNA sekvensseri (Licor, Lincoln, Nebraska USA).
tilastollinen analyysi
Differential jakaumat joukossa tapauksia ja verrokit arvioi χ 2-testi (dF = 2 genotyyppien ja df = 1 alleelien) . Riski arvioitiin yhden muuttujan analyysin ja useiden logistinen regressio (STATA ohjelmisto, StataCorp LP, College Station, USA). Χ 2-testi (df = 2) käytettiin myös tutkimaan poikkeamat Hardy-Weinberg tasapaino. Ikä eroja potilaiden kuljettaa eri genotyypit laskettiin käyttäen 2-tailed t-testiä.
Haplotyyppifrekvenssit oli rekonstruoitu unphased genotyyppien ja kytkentäepätasapaino- (LD) SNP: iden välillä arvioitiin käyttäen SHEsis ohjelmistoalusta [19, 20]. Vain haplotypes suhteellinen taajuus > 0,03 joko tapauksissa tai kontrollia sisällytettiin analyysiin. Global yhdistys haplotyyppien tautiin laskettiin jonka χ 2-testi (df = 7). 163 + 14184ΔAGGG ja 163 + 14384C > T variantteja ei sisällytetty lopulliseen analyysiin, koska ne eivät olleet informatiivisia. Yhdistyksen Yksittäisten haplotyyppien tautiin perustui 2 x 2 virhematriiseja verrattuna A-A-C haplotyyppi. LD ilmaistiin r 2, r 2 = 1 osoittaa täydellistä LD, r 2 = 0 puuttuessa LD, ja r 2 < 0.33 viittaa minimaalinen LD.
Tulokset
Kuusi säilyneitä alueita, joiden koko yhteensä 3,2 kbp tunnistettiin sisällä CDH1
intronin 2. lisäksi viidestä tiedossa polymorfismien (CDH1
163 + 14184ΔAGGG (rs10673765), 163 + 14384C > T (rs9932686), 163 + 37235G > A (rs1125557), 163 + 37276T > A (rs9282650), ja 163 + 49526C > G (rs9931853)), muita yhteisiä polymorfismien spesifinen Italian väestöstä tutkittavana oli löysi SSCP kuudella alueella.
käyttäminen restriktiofragmenttipituuspolymorfismin ja alleeliset erottelutesteissä suhteellinen taajuudet genotyyppien johtuvat viidestä variantteja määritettiin DGC tapauksissa ja valvontaa. Sekvensointi Satunnaisotos vahvisti kunkin genotyypit. Kaikki polymorfismit olivat Hardy-Weinberg tasapaino molemmissa tapauksissa ja (p > 0,19). Taulukossa 2 on yhteenveto genotyyppi jakaumat ja niiden väliset erot tapausten ja controls.Table 2 CDH1
intronin 2 genotyyppi jakaumien joukossa DGC tapausten ja kontrollien
+ 14184ΔAGGG tapauksissa (n = 134)
+ 14184ΔAGGG valvonnan (n = 100)
χ2-testi
OR (95% CI) *, †
OR (95% CI) *, †
+ /+
+ /Δ
Δ /Δ
+ /+
+ /Δ
Δ /Δ
p
Δ /Δ vs + /+
+ /Δ vs + /+
128
4
2
96
3
1
0,947
1,50 (0,13-16,78) B 1,00 (0,21-4,57) B 95,5%
3%
1,5%
97%
1,5%
1,5%
14,2%
2,5%
+ 14384C > T tapauksissa (n = 134) B + 14384C > T valvonnan (n = 100) B χ 2 -testi
OR (95% CI) B OR (95% CI) B CC
CT
TT
CC
CT
TT
p
TT vs CC
CT vs CC
130
2
2
98
1
1
0,895
1,51 (0,13-16,87) B 1,51 (0,13-16,87)
97,0%
1,5%
1,5%
98,0%
1,0%
1,0%
12,3%
12,3%
+ 37235G > A -tapausta (n = 134) B + 37235G > A on määräysvalta (n = 100) B χ 2 -testi
OR (95% CI) B OR (95% CI) B GG
GA
AA
GG
GA
AA
s
AA vs GG
GA vs GG
30
56
48
37
50
13
0,0003
4,55 (2,09-9,93)
1,38 (0,75-2,55) B 22,4%
41,8%
35,8%
37,0%
50,0%
13,0%
100%
40,6%
+ 37276T > A -tapausta (n = 134) B + 37276T > A on määräysvalta (n = 100)
χ 2 -testi
OR (95% CI) B OR (95% CI) B TT
TA
AA
TT
TA
AA
p
AA vs TT
TA vs TT
65
65
4
46
51
3
0,929
0,94 (0,20-4,42 )
0,90 (+0,53-+1,53) B 48,5%
48,5%
3,0%
46,0%
51,0%
3,0%
1,9%
1,6%
49526C > G tapauksissa (n = 134) B + 49526C > G valvonnan (n = 100) B χ 2 -testi
OR (95% CI) B OR (95% CI)
CC
CG
GG
CC
CG
GG
s
GG vs CC
CG vs GG
34
82
18
30
58
12
0,727
1,32 (0,55-3,19) B 1,25 (0,69-2,26) B 25,4%
61,2%
13,4 %
30,0%
58,0%
12,0%
32,2%
22,5%
* OR arvot ole mukautettu.
† prosenttiosuus alapuolella TAI arvot arvioi valtaa yhdistyksen kunkin variantin vastaavalla OR taso ja olettaen merkitsevyystasolla 5%.
tutkittujen variantteja, vain 163 + 37235G > SNP oli merkitsevästi yhteydessä sairauteen takia yliedustus A-alleelin keskuudessa DGC tapauksessa (56,7% vs. 38% kontrolleissa χ 2 = 16,1, p < 0,0001; katso taulukko 2). 163 + 37235AA genotyyppi oli 2,8 kertaa yleisempää tapauksissa kontrolleihin verrattuna. Vastaava Odds Ratio (OR) ehdotti merkittävästi kohonnut riski sairastua DGC AA harjoittajille suhteessa GG harjoittajille (OR = 4,55, 95% CI = 2,09-9,93, p = 0,0002, voima yhdistyksen 100%, taulukko 2). Ei merkittävää kasvua riskiä ilmeni kantaen GA-genotyyppi (OR = 1,38, 95% CI = 0,75-2,55, p = 0,3, voima yhdistyksen 41%, taulukko 2). DGC riski AA harjoittajien pysynyt merkittävänä, kun syrjäisimmät alueet korjattiin ikä, sukupuoli, alkoholin nauttiminen ja helikobakteeri
infektio (taulukko 3). Tupakoitsijoilla on kuitenkin siihen liittyvä riski oli vain bevasitsumabia (p = 0,089, taulukko 3). Riskit liittyvät muiden vaihtoehtojen tutkittu pysyivät ei-merkitsevä seuraavat säätö (tuloksia ei ole esitetty). No association välillä havaittiin 163 + 37235G > SNP ja ikä diagnoosin (p > 0,16) .table 3 Oikaistu syrjäisimmät alueet liittyvät CDH1
intronin 2 163 + 37235G > variantti
Variable

163+37235

Cases

Controls

OR (95% CI)



n
%
n
%

Ikä
≤ mediaani
GG
17
20
20
34
1
GA
37
45
30
52
1,45 (0,65-3,25) B AA
29
35
8
14
4,26 (1,55-11,77 ) B > Mediaani
GG
13
25
17
40
1
GA
19
37
20
48
1,24 ( 0,48-3,24) B AA
19
37
5
12
4,97 (1,47-16,86)
Sukupuoli
Nainen
GG
13
20
20
34
1
GA
28
44
30
51
1,44 (0,60-3,42) B AA
23
36
9
15
3,93 (1,39-11,12) B Mies
GG
17
24
17
41
1
GA
28
40
20
49
1,40 (0,58-3,39) B AA
25
36
4
10
6,25 (1,79-21,84)
Tupakointi
Never
GG
17
24
25
42
1
GA
30
42
30
50
1,47 (0,66-3,26) B AA
25
35
5
8
7,35 (2,34-23,01)
Ever
GG
13
21
12
30
1
GA
26
42
20
50
1,20 (0,45-3,19) B AA
23
37
8
20
2,65 (0,86-8,16)) B Alkoholi
≤ 20 g /päivä
GG
24
26
26
40
1
GA
35
38
31
48
1,22 (0,59-2,55 ) B AA
34
37
8
12
4,60 (1,78-11,90) B > 20 g /vrk
GG
6
15
11
31
1
GA
21
51
19
54
2,01 (0,63-6,55) B AA
14
34
5
15
5,13 (1,23-21,36) B helikobakteeri
Negatiivinen
GG
2
11
16
37
1
GA
22
48
22
51
3,2 (1,00-10,26)
AA
19
41
5
12
12,16 (2,98-49,64)
Positiivinen
GG
25
28
21
37
1
GA
34
39
28
49
1,02 (0,472 -. 19) B AA
29
33
8
14
3.045 (1,15-8,07)
Sen määrittämiseksi CDH1
163 + 37235A-alleeli antaa DGC riski itsenäisesti tai yhdessä muiden introni 2 variantteja, haplotypes johtuvat viisi polymorfismien kunnostettiin ja niiden taajuudet arvioitiin tapauksissa ja valvontaa. Kaksi 5'-variantit eivät olleet informatiivisia ja sitä näin ollen otettu. Intronin 2 haplotypes osoitti globaalin yhdessä tauti (df = 7, χ 2 = 24,09, p < 0,002). Yleensä haplotypes sisälsi 163 + 37235A-alleeli esiintyi useammin tapauksissa kontrolleihin verrattuna, kun taas kolme neljästä haplotyyppien kanssa G-alleelin olivat yleisempiä säätimet (taulukko 4). Vahvin yhdessä tauti havaittiin, että AAG ja ATC haplotyyppien (163 + 37235A asemassa 1). Sitä vastoin GAG ja GTC haplotyyppien osoittivat vahvimman suojan. Kytkentäepätasapaino- analyysi osoitti pitkälti poissa LD välillä tutkittujen varianttien (r 2 < 0,03; taulukko 5), mikä viittaa siihen, että CDH1
163 + 37235G > SNP voi antaa lisääntynyt alttius kohti DGC riippumatta muita muunnelmia investigated.Table 4 CDH1
intronin 2 haplotyyppifrekvenssit keskuudessa DGA tapausten ja kontrollien

Case (taajuus) †

ohjaus (taajuus) †
Fisherin s
Pearsonin s
OR (95% CI)
AAC *
16.04 (0,060)
5,31 (0,027) B 0,088
0,088
2,33 (0,86-6,34) B AAG
17,49 (0,065) B 5,34 (0,027 ) B 0,056
0,056
2,55 (0,95-6,83)
ATC
73,09 (0,273) B 35.43 (0,177) B 0,015
0,015
1,74 (1,11 -2,74) B ATG
45.38 (0,169)
29.91 (0,150) B 0,565
0,565
1,16 (0,70-1,92) B GAC
21,73 (0,081)
24.18 (0,121)
0,152
0,152
0,64 (0,35-1,18) B GAG
17,75 (0,066) B 22,17 (0,111) B 0,087
0,087
0,57 (0,30-1,09) B GTC
39.15 (0,146) B 53.07 (0,265) B 0,001
0,001
0,47 (0,30-0,75) B GTG
37.37 (0,139) B 24,85 (0,123) B 0,602
0,602
1,16 (0,67-1,99) B * Haplotyyppifrekvenssianalyysi järjestyksessä: 163 + 37235G > A, 163 + 37276T > A, 163 + 49526C > G. Kaksi 5'-variantteja ei sisällytetty, koska ne eivät vielä jakaa haplotyyppien.
† numerot viittaavat rekonstruoitu haplotyyppi numeroiden joukossa tapauksia (257) ja valvonta (192), jossa kukin yksittäinen mukanaan kaksi kromosomia. Suhteelliset taajuudet annetaan prosentteina. Kaikkia genotyyppitietoja sisällytettiin analyysiin, niin alhainen haplotyyppien pudotettiin.
Taulukko 5 Kytkentäepätasapaino välillä CDH1
intronin 2 polymorfismien
r2 kytkentäepätasapaino-

163 + 14384C > T
163 + 37235G >
163 + 37276T >
163 + 49526C > G
163 + 14184ΔAGGG
0,001
0,000
0,001
0,001
163 + 14384C > T -
0,002
0,000
0.000
163 + 37235G >
-
- 0,028
0,000
163 + 37276T >: A -
-
- 0,003 <

• Suhde verisuonten endoteelin kasvutekijän geenipolymorfismien ja kliinistä tulosta edennyt mahasyöpä potilaita hoidettiin FOLFOX: VEGF polymorfismi mahasyövän
• Preoperatiivinen kemosädehoito paikallisesti edennyt mahasyöpä