Egy új diffúz gyomorrák hajlamosító variáns E-cadherin (Cdh1) intron 2: Egy eset-kontroll vizsgálat egy olasz population

Egy új diffúz gyomorrák hajlamosító variáns E-cadherin (Cdh1 katalógusa) intron 2: Egy eset-kontroll vizsgálat egy olasz népesség
Abstract
alapon
öröklött genetikai tényezők, mint például E-kadherin (Cdh1
) promoter variánsok úgy véljük, hogy befolyásolják a kockázat felé sporadikus diffúz gyomorrák (DGC). Nemrégiben egy új szabályozási terület alapvető fontosságú Cdh1 katalógusa transzkripciós azonosítottak a Cdh1 katalógusa intron 2 katalógusa Módszerek katalógusa Mi genotipizált összes ismert polimorfizmust található konzervált szekvenciák Cdh1 katalógusa intron 2 (rs10673765, rs9932686, rs1125557, rs9282650, rs9931853) egy olasz népesség mely 134 DGC esetek és 100 egészséges kontroll (55 beteg rokonok és 45 független, kiegyenlített egyének). A hatása egyes változatok DGC kockázatot értékelni, χ 2-tesztek és a logisztikus regresszió. A relatív hozzájárulását allélek által becsült haplotípus analízis. Katalógusa Eredmények katalógusa tapasztaltunk szignifikáns (p < 0,0004) egyesület a Cdh1 katalógusa 163 + 37235G > A variáns (rs1125557) a DGC kockázat. Odds arányok 4,55 (95% CI = 2,09-9,93) és 1,38 (95% CI = 0,75-2,55), az AA és GA hordozók, ill. Korrigálva életkor, a nem, a dohányzási státusz alkoholfogyasztás és a H. pylori fertőzés katalógusa, a kockázati becsléseket jórészt jelentős AA hordozók. Haplotípus analízis azt a 163 + 37235A allél hozzájárul a betegségek kockázatának függetlenül más változatok vizsgálták. Katalógusa Következtetés
Cdh1 katalógusa 163 + 37235G > A polimorfizmus alkalmazásával egy új érzékenység változatot szórványos DGC ha megerősítik más populációkban. Figyelembe véve a széles expresszióját az E-cadherin in hámban, ez a feltáró tanulmány ösztönzi a további értékelést a 163 + 37235A-allélt, mint egy fogékonyság variáns más karcinómák.
Alapon
gyomorrák egyik fő oka a rákhoz kapcsolódó mortalitás és általában sorolni két szövettani típus, a bél és a diffúz formában (Lauren osztályozás [1]). Az általános előfordulási aránya a gyomorrák vannak folyamatos csökkenést nagyrészt csökkenő árak a bélrák típusú. Ez a csökkenő gyakoriság úgy vélik, hogy az eredmény a jobb táplálkozás és az egészségügyi feltételek. Ezzel ellentétben, az előfordulási gyakorisága a diffúz gyomorrák (DGC) önmagában jelenik stabilabb az elmúlt néhány évtizedben [1, 2]. Egy ilyen állandó sebességgel sugallja egy nagyobb hozzájárulást az öröklött genetikai kockázati helyett környezeti tényezők a diffúz formája a gyomorrák.
Adódóan fejlődés korai alatt a gyomor nyálkahártya felületére, [3] DGC általában diagnosztizálják egy előrehaladott szakaszában, és Következésképpen társított rosszabb kimenetele [1]. Ezért genetikai DGC markerek azonosítását megkönnyítő veszélyeztetett egyének, és ezáltal hozzájárul javulásához DGC diagnózis és terápia. Katalógusa Molekuláris szinten, DGC elkülönülnek a bél típusú alapján az abnormális expressziója a sejt cellás adhéziós molekula az E-cadherin [4]. E-cadherin a legfontosabb eleme a hámsejtek adherens kapcsolatban, és mint ilyen szükséges funkcionális intercelluláris adhéziós belül epithelialis lap [5]. Ellentétben sok más epiteliális rákok, E-cadherin downregulált nagyon korai szakaszában DGC fejlesztés, ami arra utal szerepet megindítását ez a betegség [3]. Mutáció és promoter hipermetiláció az E-cadherin gén (Cdh1
) vannak a leginkább konzisztens genetikai eltérések megfigyelhető szórványos DGC [6, 7]. Továbbá Cdh1 katalógusa csírasejt-mutáció hajlamosít örökletes DGC [8] összhangban kezdeményező funkció E-cadherin hiányosság DGC. Cdh1 katalógusa csírasejt-mutáció rendszerint együtt elkülönít egy domináns minta betegségek között az érintett családok, és néha megtalálható izolált DGC esetet diagnosztizálnak a fiatal korban (< 45 y) [9]. Ezek azonban csak körülbelül 1% -a DGC esetben [9], és így nem tudja megmagyarázni a genetikai eredete feltételezik, hogy részt látszólagos szórványos DGC esetben. Genetikai eltérések kivételével Cdh1 katalógusa csírasejt-mutáció, ezért valószínű, hogy adjunk a kialakulásának kockázatát DGC hiányában egyértelmű családjában vagy fiatal korban a diagnózis idején.
Közös allélvariánsokra enyhe funkcionális hatása mind a kockázata szórványos betegség. Valóban, egy egyedi nukleotid polimorfizmus (SNP) belül Cdh1
promóter (-160C > A) összefüggésbe hozták egy jelentősen megnövekedett kockázata szórványos DGC bizonyos magas előfordulási populációk [10-13]. A vizsgált Cdh1 katalógusa SNP, a -160A promóter allél eddig az egyetlen variáns vont DGC kockázatot, de úgy tűnik, hogy jár együtt más Cdh1 katalógusa polimorfizmusok [10, 13]. Katalógusa Nemrégiben egy új Cdh1
szabályozó régió leírták [14]. Ez a régió tartalmazza Cdh1
intron-2, a legnagyobb nem-kódoló Cdh1
szegmensben (66% a teljes szekvenciát) és kimutatták, hogy szükséges mind a megindításában és fenntartásában transzkripciós Cdh1 katalógusa aktivitás differenciált hámban. Fontos, intron-2 szekvenciák is szükségesek a normális Cdh1
transzkripció során felnőtt élet, amely a lehetőségét, hogy a variánsok ez a régió hatással lehet diffúz gasztrikus carcinogenesis.
Ebben a vizsgálatban, mi genotipizálása összes ismert változatok belül található konzervált szekvenciák Cdh1 katalógusa intron 2 és meghatároztuk azok allél frekvenciák csoportokban olasz szórványos DGC esetekben és egészséges egyének megfejteni lehetséges egyesületek betegség. katalógusa módszerek katalógusa betegek katalógusa DNS mintákat vettünk a 134 DGC betegeknél, bennszülöttek a kerületi Pesaro-Urbino, Region Marche, Közép-Olaszország. A műtét után a DGC diagnózist függetlenül megerősítette két patológusok. A betegeket klinikailag helyi Medical Oncology Unit (Hospital d'Urbino), ahol szintén elvégezte a demográfiai mérleg beleértve a személyes és családi rák története. Adatait ellenőrizték interjúk során azok onkológiai orvosok és a család történetét vezethető vissza ≥3 generációk és oldalt 2 nd és 3 rd rokonok. Az ezen értékelés alapján, sem a beteg megfelelt a klinikai kritériumok ismert familiáris daganatos szindrómák. A felvétel kritériumai alkalmas betegek voltak: kaukázusi ethnicity, natív a vizsgált földrajzi területen és nem a családjában rákos. Ugyanezeket a kritériumokat, valamint hiányzik a személyes történetét a rák fogadták az ellenőrzés. Control DNA vettünk 55 egészséges rokonok, akik vagy nem érintett szülők (n = 15), testvérek (22) vagy gyermekek (18) A vizsgált DGC betegeknél. Mivel az egészséges rokonai nem voltak elérhetőek minden DGC beteg, DNS-minta egy csoportja független egészséges egyének (n = 45) azonosítottak a medence volt és jelenlegi véradók a Hospital d'Urbino vontak így összesen 100 ellenőrzést. Független ellenőrzés véletlenszerűen kiválasztott frekvenciák illő esetekre életkor és nem szerint. Az átlagéletkor a DGC nélküli betegek rokonai volt 54,6 y ± 11.41SD, míg az illesztett kontroll 52,2 ± y 10.21SD. Minden pácienst kérdeztek a dohányzás és az alkoholfogyasztás. H. pylori katalógusa állapot határoztuk patológiai vizsgálat a gyomor minták esetekben, illetve a vér vagy levegőt vizsgálatok ellenőrzéseket. Az etikai követelmények ellenőrizték, és jóváhagyta a belső etikai bizottság (Hospital d'Urbino) és az összes vizsgálatban résztvevők adták írásos beleegyezését adta.
Cdh1 intron2 konzervált régiók és polimorfizmusok
konzervált régiók Cdh1 katalógusa intron2 (GenBank NC_000016) azonosítottunk visszakeresésére megfelelő humán, csimpánz, patkány és egér szekvenciákat az NCBI adatbázisban (NCBI, Entrez nukleotid), majd igazítás használatával az NCBI szerver (NCBI, Basic Local Alignment Search Tool) és az Invitrogen Vector NTI Advance ™ 9.0 szoftver (Accelrys Software Inc., San Diego, USA). Konzervált régiókat meghatározás szerint kevesebb, mint 5% -os szekvencia variációk közül a különböző fajok. A konzervált régiókat PCR-amplifikált átfedő fragmenseket körülbelül 200 bp méretű. A megfelelő primereket (lásd az 1. táblázatot a szekvenciákat és feltételek) terveztünk a GeneFisher online eszköz [15], és gyártja a Sigma-Proligo (Sigma-Aldrich Corporation, St. Louis, USA). FastStart Taq DNS-polimerázt (Roche, Basel, Svájc) és a PTC-200 PCR gépek (MJ Research, Waltham, USA) használtunk. A következő polimorfizmusok találhatók (Együttes GenomeBrowser [16]) az amplifikált régiókban: 163 + 14184ΔAGGG (rs10673765, található a PCR-fragmens C2F1), 163 + 14384C > T (rs9932686, C2F2), 163 + 37235G > A (rs1125557, C3F2 ), 163 + 37276T > A (rs9282650, C3F2), és 163 + 49526C > G (rs9931853, C4F1). A TESS online eszköz [17] arra használták, hogy keressen feltételezett transzkripciós faktor kötő helyek, hogy hatással lehet a fenti variants.Table 1 PCR primerek és feltételek katalógusa katalógusa Forward primer Matton Fordított primer Matton Ta * Matton Mg ++ † Matton DMSO ‡ Matton C1F1
ccgccttaaagaaactcttg
accggtggcaaatactag katalógusa 65 ° C katalógusa 1.5 -
C1F2 katalógusa tagaagggttgaacctgttc katalógusa tcttagtccacgagaagaag katalógusa 65 ° C
1,5 katalógusa -
C1F3 katalógusa taggagagcttgtaacaagc katalógusa cactcggttctaccgaag katalógusa 65 ° C
1,5 -
C2F1 katalógusa tgtattagccacagagaag katalógusa ctaaaactagaccacgaag katalógusa 65 ° C
1,5 katalógusa -
C2F2
gtcacaaaacagcttg katalógusa ccttccttgagcaaggc katalógusa 65 ° C katalógusa 1.5 -
C3F1 katalógusa ttgcctaaggccccctttttgttc katalógusa gaatctgcgaagtctacatc katalógusa 65 ° C
1.5
- www.Booked.hu C3F2 katalógusa acactagccacacatgggactcaag katalógusa tgctggtgtggattcaaatgtg katalógusa 65 ° C
1,5 -
C4F1 katalógusa acctccgcctcctgggttcaagc katalógusa ttcctcccgcttagtg katalógusa 60 ° C
1.5 -
C4F2 katalógusa tggccaggcctgtcttaaactc katalógusa ttcttaggtccgtgggtttttacg katalógusa 65 ° C katalógusa 1.5 -
C4F3 katalógusa aaagtgctgggattacaggtgtgag katalógusa tcgataatcccgagaactc katalógusa 55 ° C
1,0 katalógusa + katalógusa C4F4 katalógusa gaaccataggactttgactgatgg katalógusa actgatggttatccgggttcccttg katalógusa 65 ° C katalógusa 1.5 -
C4F5 katalógusa agctgttgagctgtcatcacaatcc katalógusa gaatttcctacccgtctatggtagg katalógusa 65 ° C
1,5 -
C5F1 katalógusa tagtggggagtggggtcttagcttc katalógusa tcgttcaccctcctttcttcttacc katalógusa 58 ° C katalógusa 1.5 -
C5F2 katalógusa gggcatgttgaaatatacccagtc katalógusa tctgagtaatagaggggtacgttgg katalógusa 65 ° C
1,5 -
C5F3 katalógusa cttgccagcgtgacagtg katalógusa cgaaaccccgtggagtag katalógusa 65 ° C katalógusa 1.5 -
C5F4 katalógusa caggttggggctcctcgtcatactg katalógusa cttccgacgtgacttaaggaaagag
65 ° C
1,5 -
C5F5 katalógusa gcttgtctcaactttcactgtc katalógusa gaatttcctacccgtctatggtagg katalógusa 65 ° C
1,5 -
C6F1 katalógusa tggtattcaggaggatgcag katalógusa acctacgatcgtaaaaagt katalógusa 65 ° C
1,5 -
C6F2 katalógusa cccatcaatgcttatttgttctt katalógusa gcctgggagacggagact katalógusa 65 ° C katalógusa 1.5 -
C6F3 katalógusa tgggctgtttgagttttgttc
cggtgtaaaaggttcgtgac katalógusa 65 ° C
1,5 -
* Ta hőkezelés hőmérsékletét; † Mg ++ - koncentráció van megadva mM; ‡ DMSO adunk 5% fc katalógusa Egyszáiú konformáció polimorfizmus katalógusa Egyszáiú konformáció polimorfizmus (SSCP) használtunk, hogy átvizsgálja a konzervált intron 2 régióban 19 olasz DGC betegek jelenlétében további közös, de populációs adott polimorfizmus. SSCP ismertetett módon hajtottuk végre [18], azzal a kivétellel, hogy ULS ™ 495 fluorofor (Kreatech Biotechnology, Amszterdam, Hollandia) használtunk helyett radioaktivitás címkén a töredékek. Röviden, 1 ul PCR-terméket inkubáltuk 0,2 ul festék egy 20 ul reakció. A géleket szkennelése egy FX Molecular Imager (BioRad, Hercules, USA) 488 nm-en.
Genotipizálása
A következő restrikciós enzimeket alkalmaztuk a genotipizálás DNS változatok: 0,06 egység /ml koncentrációjú BsaXI 163 + 14184ΔAGGG, 1 U /ul BanII
163 + 14384C > T, 0,2 E /ul MaeIII
163 + 37276T > a, és 0,4 U /ul HpaII
163 + 49526C > G. Minden enzimeket a New England Biolabs (Ipswich, USA), kivéve a MaeIII katalógusa: Roche (Basel, Svájc). A reakciókat egy éjszakán át inkubáltuk, és fragmenseket elválasztottuk 4% (tömeg /tf) agaróz gélen.
Polimorfizmusait 163 + 37235G > A és 163 + 37276T > A genotipizálása egy ABI Prism 7900 (Applied Biosystems, Foster City, Amerikai Egyesült Államok) a real-time PCR-alapú allél megkülönböztetés vizsgálatokban az Applied Biosystems utasításai szerint biztosított. katalógusa szekvenálása
észlelve variánsok igazoltuk direkt szekvenálás segítségével az USB thermosequencing kit (USB, Cleveland, USA) és a Licor 4000L DNS-szekvenáló (Licor, Lincoln, Nebraska USA). katalógusa Statisztikai analízis
differenciál eloszlás között az esetek és kontrollok értékelte a χ 2-teszt (df = 2 genotípusok és df = 1 allél) . Kockázati becsültük egyváltozós analízissel és többszörös logisztikus regresszió (STATA szoftver, StataCorp LP, College Station, USA). A χ 2-teszt (df = 2) is használják, hogy vizsgálja eltérések Hardy-Weinberg egyensúly. Életkor közötti különbségek hordozó betegek genotípusok alkalmazásával számoltuk 2 farkú t-tesztet.
Haplotípus volt rekonstruálható unphased genotípusok és kapcsolódási egyenlőtlenség (LD) között SNP becsültük meg a SHEsis szoftver platform [19, 20]. Csak haplotípusok relatív gyakoriság > 0,03 mindkét esetben vagy kontrollokat az elemzésben. Globális szövetség haplotípusok a betegség úgy számították ki, a χ 2-teszt (df = 7). A 163 + 163 + 14184ΔAGGG és 14384C > T változatok nem kerültek be a végső soron mivel azok nem voltak informatív. Az egyesület egyes haplotípusok a betegség alapult 2 × 2 kontingencia táblázatok képest az A-A-C haplotípus. LD fejeztük r 2, ahol R 2 = 1 jelezve a teljes LD, r 2 = 0 hiányában LD, és az r 2 < 0.33 utal minimális LD. Katalógusa Eredmények katalógusa hat konzervált régiók a teljes mérete 3,2 kbp azonosítani Cdh1 katalógusa intron 2 eltekintve az öt ismert polimorfizmusok (Cdh1 katalógusa 163 + 14184ΔAGGG (rs10673765), 163 + 14384C > T (rs9932686), 163 + 37235G > a (rs1125557), 163 + 37276T > a (rs9282650), és 163 + 49526C > G (rs9931853)), további közös polimorfizmusok egyedi az olasz tanulmányozott populáció volt által felfedezett SSCP a hat régióban.
restrikciós fragmens hossz polimorfizmus és allél megkülönböztetés esszékben a relatív gyakoriságát a genotípusok származó öt variánsok határoztuk meg a DGC esetek és a kontrollok. Szekvenálása szúrópróbaszerűen megerősítette a megfelelő genotípusok. Minden polimorfizmusok Hardy-Weinberg egyensúly mindkét esetek és a kontrollok (p > 0,19). A 2. táblázat összefoglalja a genotípus eloszlás és különbségek esetekben és controls.Table 2 Cdh1 katalógusa intron 2 genotípus eloszlás között DGC esetek és a kontrollok katalógusa + 14184ΔAGGG esetben (n = 134) Matton + 14184ΔAGGG kontrollok (n = 100) Matton χ2-teszt Matton OR (95% CI) *, † Matton OR (95% CI) *, † Matton + /+ katalógusa + /Δ Δ katalógusa /Δ katalógusa + /+ katalógusa + /Δ Δ katalógusa /Δ katalógusa p katalógusa Δ /Δ vs + /+ katalógusa + /Δ vs + /+ katalógusa 128 katalógusa 4 katalógusa 2 | 96
3 katalógusa 1 katalógusa 0,947 katalógusa 1,50 (0,13-16,78) hotelben 1,00 (0,21-4,57) hotelben 95,5% katalógusa 3% katalógusa 1,5% katalógusa 97%
1,5% 1,5% katalógusa katalógusa 14,2% 2,5% katalógusa katalógusa + 14384C > T esetben (n = 134) hotelben + 14384C > T kontroll (n = 100) hotelben χ 2 -teszt katalógusa OR (95% CI) hotelben OR (95% CI) hotelben CC katalógusa CT katalógusa TT katalógusa CC katalógusa CT katalógusa TT katalógusa p
TT vs CC katalógusa CT vs CC katalógusa 130 katalógusa 2 | 2 | 98 katalógusa 1 katalógusa 1 katalógusa 0,895 katalógusa 1,51 (0,13-16,87) hotelben 1,51 (0,13-16,87) hotelben 97,0% 1,5% katalógusa katalógusa 1,5% katalógusa 98,0% 1,0% katalógusa katalógusa 1,0% katalógusa 12,3% 12,3% katalógusa katalógusa + 37235G > A esetek (n = 134) hotelben + 37235G > A kontroll (n = 100) hotelben χ 2 próba katalógusa OR (95% CI) hotelben OR (95% CI) katalógusa GG katalógusa GA katalógusa AA katalógusa GG katalógusa GA katalógusa AA katalógusa p katalógusa AA vs GG
GA vs GG
30 katalógusa 56 katalógusa 48
37 katalógusa 50 katalógusa 13
0,0003 katalógusa 4,55 (2,09-9,93) hotelben 1,38 (0,75-2,55) hotelben 22,4% 41,8% katalógusa katalógusa 35,8%
37,0% katalógusa 50,0% 13,0% katalógusa katalógusa 100% katalógusa 40,6% katalógusa + 37276T > A esetek (n = 134) hotelben + 37276T > A kontroll (n = 100)
χ 2 próba katalógusa OR (95% CI) hotelben OR (95% CI) hotelben TT katalógusa TA katalógusa AA katalógusa TT katalógusa TA katalógusa AA
p katalógusa AA vs TT katalógusa TA vs TT
65 katalógusa 65 katalógusa 4 katalógusa 46 katalógusa 51 katalógusa 3 katalógusa 0,929 katalógusa 0,94 (0,20-4,42 ) hotelben 0,90 (0,53-1,53) hotelben 48,5% -ról 48,5% -ra katalógusa katalógusa 3,0% katalógusa 46,0% katalógusa 51,0% katalógusa 3,0% katalógusa 1,9% 1,6% katalógusa
49526C > G esetben (n = 134) hotelben + 49526C > G kontrollok (n = 100) hotelben χ 2 próba katalógusa OR (95% CI) hotelben OR (95% CI)
CC
CG katalógusa GG katalógusa CC katalógusa CG katalógusa GG katalógusa p katalógusa GG vs CC katalógusa CG vs GG
34 katalógusa 82
18 katalógusa 30 katalógusa 58 katalógusa 12 katalógusa 0,727 katalógusa 1,32 (0,55-3,19) hotelben 1,25 (0,69-2,26) hotelben 25,4% 61,2% katalógusa katalógusa 13.4 % katalógusa 30,0% katalógusa 58,0% katalógusa 12,0% 32,2% katalógusa katalógusa 22,5% katalógusa * OR értékek korrigálatlan. katalógusa † a százalékos érték az OR értékek becslése erejét egyesület minden változatra a megfelelő OR szint és feltételezve szignifikanciaszint 5%. Vélemények a vizsgált változatok, csak a 163 + 37235G > a SNP szignifikáns összefüggést mutat a betegség miatt felülreprezentáltsága az a-allél között DGC esetben (56,7% vs. 38% a kontroll, χ 2 = 16,1, p < 0,0001; lásd 2. táblázat). A 163 + 37235AA genotípus 2,8-szer gyakoribb azokban az esetekben, a kontroll csoporthoz képest. A megfelelő Esélyhányados (OR) javasolta szignifikánsan magasabb a kockázata a DGC AA hordozók képest GG hordozók (OR = 4,55, 95% CI = 2,09-9,93, p = 0,0002, erő az egyesülési 100%, 2. táblázat). Nem történt jelentős kockázatának növekedése volt kitűnik hordozó GA-genotípus (OR = 1,38, 95% CI = 0,75-2,55, p = 0,3, ereje egyesület 41%, 2. táblázat). A DGC kockázata AA hordozók szignifikáns maradt, amikor legkülső kiigazították az életkor, a nem, az alkoholfogyasztás és a H. pylori fertőzés katalógusa (3. táblázat). Dohányosoknál azonban a kapcsolódó kockázat csak a szignifikancia határán (p = 0,089, 3. táblázat). A kockázatok a további változatokat vizsgált maradt, nem szignifikáns következő állítás (nem közölt adatok). Nincs összefüggés volt megfigyelhető a 163 + 37235G > A SNP és az életkor a diagnózis (p > 0,16) .table 3 Korrigált legkülső kapcsolódó Cdh1 katalógusa intron 2 163 + 37235G > A variáns katalógusa Variable

163+37235

Cases

Controls

OR (95% CI) Matton katalógusa katalógusa katalógusa n Matton% Matton n Matton % Matton katalógusa Kor katalógusa ≤ medián katalógusa GG katalógusa 17 katalógusa 20 katalógusa 20 katalógusa 34 katalógusa 1 katalógusa GA katalógusa 37 katalógusa 45 katalógusa 30 katalógusa 52 katalógusa 1,45 (0,65-3,25) hotelben AA katalógusa 29 katalógusa 35 katalógusa 8 katalógusa 14
4,26 (1,55-11,77 ) hotelben > Medián katalógusa GG katalógusa 13 katalógusa 25 katalógusa 17 katalógusa 40 katalógusa 1 katalógusa GA
19 katalógusa 37 katalógusa 20 katalógusa 48 katalógusa 1,24 ( 0,48-3,24) hotelben AA katalógusa 19 katalógusa 37 katalógusa 5 katalógusa 12 katalógusa 4,97 (1,47-16,86) hotelben szex fiatal női katalógusa GG katalógusa 13
20 katalógusa 20 katalógusa 34 katalógusa 1 katalógusa GA
28 katalógusa 44 katalógusa 30 katalógusa 51 katalógusa 1,44 (0,60-3,42) hotelben AA
23 katalógusa 36 katalógusa 9 katalógusa 15 katalógusa 3,93 (1,39-11,12) hotelben Férfi katalógusa GG
17 katalógusa 24 katalógusa 17 katalógusa 41 katalógusa 1 katalógusa GA
28 katalógusa 40 katalógusa 20 katalógusa 49 katalógusa 1,40 (0,58-3,39) hotelben AA katalógusa 25 katalógusa 36 katalógusa 4 katalógusa 10
6,25 (1,79-21,84) hotelben dohányzás katalógusa Soha
GG katalógusa 17 katalógusa 24 katalógusa 25 katalógusa 42 katalógusa 1 katalógusa GA
30
42 katalógusa 30 katalógusa 50 katalógusa 1,47 (0,66-3,26) hotelben AA katalógusa 25 katalógusa 35 katalógusa 5 katalógusa 8 katalógusa 7,35 (2,34-23,01)
Egyre
GG
13 katalógusa 21 katalógusa 12 katalógusa 30 katalógusa 1 katalógusa GA
26 katalógusa 42 katalógusa 20 katalógusa 50 katalógusa 1,20 (0,45-3,19) hotelben AA katalógusa 23 katalógusa 37 katalógusa 8 katalógusa 20 katalógusa 2,65 (0,86-8,16)) hotelben alkohol katalógusa ≤ 20 g /nap
GG
24 katalógusa 26 katalógusa 26 katalógusa 40 katalógusa 1 katalógusa GA
35 katalógusa 38 katalógusa 31 katalógusa 48 katalógusa 1,22 (0,59-2,55 ) hotelben AA katalógusa 34 katalógusa 37 katalógusa 8 katalógusa 12 katalógusa 4,60 (1,78-11,90) hotelben > 20 g /nap katalógusa GG katalógusa 6 katalógusa 15 katalógusa 11 katalógusa 31 katalógusa 1 katalógusa GA
21 katalógusa 51 katalógusa 19 katalógusa 54
2,01 (0,63-6,55) hotelben AA katalógusa 14 katalógusa 34 katalógusa 5 katalógusa 15 katalógusa 5,13 (1,23-21,36) hotelben H. pylori katalógusa Negatív katalógusa GG
2 | 11 katalógusa 16 katalógusa 37 katalógusa 1 katalógusa GA
22 katalógusa 48 katalógusa 22 katalógusa 51 katalógusa 3.2 (1,00-10,26)
AA katalógusa 19 katalógusa 41 katalógusa 5 katalógusa 12 katalógusa 12,16 (2,98-49,64) hotelben Pozitív katalógusa GG
25 katalógusa 28 katalógusa 21
37 Pg: 1 katalógusa GA
34 katalógusa 39 katalógusa 28 katalógusa 49 katalógusa 1,02 (0,472 -. 19) hotelben AA katalógusa 29 katalógusa 33
8
14
3.045 (1,15-8,07) hotelben Annak meghatározásához, hogy a Cdh1
163 + 37235A-allél ruházza DGC kockázat függetlenül vagy kombinációban más intron-2 variánsokat, haplotípusok eredő öt polimorfizmusok rekonstruált és frekvenciák becsülték az esetek és a kontrollok. A két 5'-változatok nem informatív volt, ezért kizárt. Az intron 2 haplotípus mutatott globális összefüggésben betegség (df = 7, χ 2 = 24,09, p < 0,002). Általában haplotípusok tartalmazó 163 + 37235A allél gyakoribb volt azokban az esetekben, a kontrollhoz képest, míg három a négy haplotípusok a G-allél gyakoribb volt között az ellenőrzések (4. táblázat). A legerősebb egyesület a betegség volt megfigyelhető az AAG és az ATC haplotípusok (163 + 37235A 1. pozícióban). Ezzel szemben, a GAG és a GTC haplotípusok mutatta a legerősebb védelmet. Kapcsolódási egyensúlyban analízis jelezte nagyrészt hiányzik LD között a vizsgált variánsok (r 2 < 0,03; 5. táblázat), ami arra utal, hogy a Cdh1
163 + 37235G > A SNP ruházhatnak fokozott fogékonyság felé DGC egymástól függetlenül variánsok investigated.Table 4 Cdh1 katalógusa intron 2 haplotípus között DGA esetek és a kontrollok katalógusa katalógusa Case (freq) †
Vezérlőpult (freq) † Matton Fisher p
Pearson p
OR (95% CI) Matton AAC * katalógusa 16,04 (0,060) hotelben 5,31 (0,027) hotelben 0,088 katalógusa 0,088 katalógusa 2,33 (0,86-6,34) hotelben AAG katalógusa 17.49 (0,065) hotelben 5,34 (0,027 ) hotelben 0,056 katalógusa 0,056 katalógusa 2,55 (0,95-6,83) hotelben ATC
73,09 (0,273) hotelben 35.43 (0,177) hotelben 0,015 katalógusa 0.015 katalógusa 1,74 (1,11 -2,74) hotelben ATG
45.38 (0,169) hotelben 29.91 (0,150) hotelben 0.565 katalógusa 0.565 katalógusa 1,16 (0,70-1,92) hotelben GAC
21.73 (0,081)
24,18 (0,121) hotelben 0,152 katalógusa 0,152 katalógusa 0,64 (0,35-1,18) hotelben GAG katalógusa 17.75 (0,066) hotelben 22.17 (0,111) hotelben 0,087 katalógusa 0,087
0,57 (0,30-1,09) hotelben GTC katalógusa 39.15 (0,146) hotelben 53.07 (0,265) hotelben 0,001 katalógusa 0.001 katalógusa 0,47 (0,30-0,75) hotelben GTG katalógusa 37.37 (0,139) hotelben 24.85 (0,123) hotelben 0,602 katalógusa 0,602 katalógusa 1,16 (0,67-1,99) hotelben * Haplotype sorrendben: 163 + 37235G > A, 163 + 37276T > A, 163 + 49526C >G. A két 5'-változatok nem szerepelnek, mivel nem tovább szét a haplotípusok. Katalógusa † számok az újjáépített haplotípus számok esetek között (257) és a kontrollok (192), és minden egyes könyv két kromoszóma. Relatív frekvenciákat százalékban adjuk. Nem minden genotípus adatokat bekerült elemzést, mivel az alacsony frekvenciájú haplotípusok ejtették. Katalógusa 5. táblázat kapcsolódási egyenlőtlenség között Cdh1 katalógusa intron2 polimorfizmusok katalógusa r2 kapcsolódási egyenlőtlenség Matton katalógusa 163 + 14384C > T Matton 163 + 37235G > A Matton 163 + 37276T > A Matton 163 + 49526C >G Matton 163 + 14184ΔAGGG katalógusa 0.001 katalógusa 0.000 katalógusa 0.001 katalógusa 0.001 katalógusa 163 + 14384C > T -
0,002 katalógusa 0.000 katalógusa 0.000 katalógusa 163 + 37235G > Egy fiatal - -
0,028 katalógusa 0.000 katalógusa 163 + 37276T > A
- - -
0,003 <

• A kapcsolat a vascularis endothelialis növekedési faktor gén polimorfizmusok és a klinikai kimenetel előrehaladott gyomorrákban FOLFOX kezelést kapott betegek: VEGF polimorfizmus gyomorrák
• Preoperatív sugárkezeléssel lokálisan előrehaladott gyomorrák