Up-Regulatioun vun CLDN1 Up-Regulatioun vun CLDN1 zu gastric Kriibs ass mat reduzéierter survival

soll zu gastric Kriibs mat reduzéierter Iwwerliewe VerfÜgung méiglech VerfÜgung Background soll ass VerfÜgung D'genetesch Verännerungen an gastric adenocarcinoma sinn extrem komplexen an zouverlässeg entholl lues hunn nach net identifizéiert ginn. Et sinn och remarquabel geographesch Ënnerscheeder an der Verdeelung vun dëser Krankheet. Eist Zil war déi differentially reegelen Genen am 20 gastric adenocarcinomas aus engem norwegesche Auswiel ze identifizéieren, am Verglach zu reagéiert normal mucosa, a mir hunn eis Conclusiounen ze hätt, Survival a chronescher Helicobacter pylori VerfÜgung Wonn dinn. VerfÜgung Method
Biopsies aus gastric adenocarcinomas an bascht normal gastric mucosa sech aus 20 Patiente direkt folgend chirurgesch resection vun der entholl kritt. Ganz Nepgen, war cDNA microarray Analyse op d'vun der Prouf Puer isoléiert RNS standing der Gentherapie Ausdrock Profiler tëscht der entholl géint reagéiert mucosa ze vergläichen. D'Echantillon waren microscopically gastritis ze klassifizéieren iwwerpréift. D'Präsenz vun H. pylori VerfÜgung war mat microscopy an immunohistochemistry iwwerpréift. VerfÜgung Resultater VerfÜgung 130 Genen zougedréckt Ënnerscheed Regelung virun enger predefinéiert präventive Niveau. Interleukin-8 (IL-8 VerfÜgung) an Claudin-1 (CLDN1 VerfÜgung) waren déi konsequent weider-reegelen Genen vun der erhéijen. Héich CLDN1 VerfÜgung Ausdrock vun der entholl war wéi eng onofhängeg a wesentleche Estimatioun Gentherapie vun reduzéiert Post-grënnen Iwwerliewe identifizéiert. Et waren gemaach verschiddene Ausdrock Profiler tëscht der entholl Grupp an d'Kontroll mucosa Grupp, an der histological subsets vun deer Zort, diffusen Typ an intestinal Zort Kriibs bewisen weider sub-Käre. Up-reegelen Genen huet zu Zell-Haftung Ëmgéigend, collagen-Zesummenhang Prozesser an angiogenesis hierkommen normal intestinal Funktiounen wéi unzereegen an excretion mat verwandelt-reegelen Genen verbonne waren. Mir beschäftegen déi aktuell Conclusiounen fir eisen virdrun Studium op der Gentherapie Äntwert vun gastric epithelial Zellen ze H. pylori VerfÜgung Wonn. VerfÜgung Konklusiounen VerfÜgung CLDN1 VerfÜgung war héich an gastric Kriibs up-reegelen, an CLDN1
war Ausdrock onofhängeg mat engem aarme Post-grënnen hätt verbonnen, a wichteg prognostic Wäert hunn kann. IL-8 VerfÜgung an CLDN1 VerfÜgung kann Mëtt Linken tëscht der Gentherapie Äntwert vertrieden zu Fouss H. pylori VerfÜgung Wonn vun gastric epithelial Zellen gesinn, an schlussendlech gastric Kriibs. VerfÜgung Schlësselwieder VerfÜgung Gastric Kriibs Interlukin 8 Claudin-1 Helicobacter pylori VerfÜgung cDNA microarray traureg hätt Background VerfÜgung Gastric Kriibs (GC) nëmmen zweeter zu haett Kriibs am Welt-grouss Kriibs-Zesummenhang Doudesfäll, awer do sin super geographesch Ënnerscheeder am GC Verdeelung ass. Date vun 2010 bewisen, datt de GC Heefegkeet vun Norwegen Ganz niddereg ass (Männercher 6,9, Weibercher 3.0 pro 100.000) [1] am Verglach zu manner entwéckelten Regiounen, besonnesch an Osteuropa an Asien, wou d'Heefegkeet ass ongeféier 6-fantastesch (Männercher 42,4, Weibercher 18,3 pro 100.000) [2]. VerfÜgung genetesch Gastric adenocarcinoma bemierkenswäert heterogen ass, cytologically an architektonesch Verglach zu anere gastrointestinal carcinomas. D'Sich no verléisslech entholl lues a konsequent prognostic Indicateuren huet schwiereg erwisen. Verschidden Auteuren baséiert op eenzel oder méi Genen GC Krankheet an hätt versicht ze soe [3-8], mä et sinn Vigel tëscht den Etüden, an am Moment keng Gentherapie Ënnerschrëft oder biomarkers sinn an Iddi Medeziner benotzen. de Mechanismen Basisdaten gastric Kriibs Versteesdemech ass ee vun de groussen Erausfuerderungen an Kriibs genomics. D'Lauren Klassifikatioun trennt adenocarcinomas an dräi verschiddene histological bestemmt: intestinal an diffusen Typen an e gemëschte Variant [9], déi geduecht sinn verschidden Weeër vun carcinogenesis ze huelen. D'intestinal Typ ass zum Deel bis e multistep Werdegang vun chronescher gastritis duerch gastric atrophy, metaplasia, dysplasia an schlussendlech malignant Krankheet [10]. Diffusen Zorte vu chronescher inflammation ouni VerfÜgung eng kloer Sortie vun Tëscherapport premalignant Schrëtt [11-13] féiere kënnen. D'gemëscht Typ weist Net-homogen Dampgemësch souwuel intestinal an diffusen Typ Architektur, an eventuell eng separat Kriibs Kategorie mat exklusiv Gentherapie kennen an engem méi aggressiv natierlech [14, 15] vertrieden. An trotz breeder Fuerschung an d'genetesch Verännerungen vun GC, sinn d'Mechanismen déi Krankheet Basisdaten nach wäit vun verstan, an d'Krankheet duerch eng adenoma-carcinoma Modell ka wéi an colorectal Kriibs net einfach erkläert. Et ginn dräi molekulare Mechanismen datt gastric carcinogenesis fueren: Chromosome Instabilitéit, microsatellite Onstabilitéit an epigenetic hire Restaurant [16]. D'Netz Resultat ass Aktivatioun vun oncogenes, inactivation vun entholl suppressor Genen an Dereguléierung vun sécher Weeër [11, 12]. Aberrant Zell Zyklus Regulatioun a Ännerungen an der Ausdrock vu Wuesstem Facteuren an cytokines regléieren dat an Iwwerliewe vun entholl Zellen. Projet'en vun Zell-Haftung an angiogenic Genen Leeschtung wichteg Roll an der invasiv an metastatic Behuele vun GC Zellen. VerfÜgung D'Zil vun der aktueller Etude gouf am meeschte differentially reegelen Genen vun surgically resected gastric adenocarcinoma Verglach zu reagéiert normal mucosa ze identifizéieren, mat ganz Nepgen cDNA microarray profiling. Mir probéieren och Genen identifizéieren déi GC hätt an Iwwerliewe Afloss. Déi Resultater sinn am Verglach zu der gastric epithelial Zell Gentherapie Äntwert ze H. pylori VerfÜgung Krankheet, déi zu engem virdrun publizéiert Pabeier analyséiert gouf [17]. Dës Etude unhat Ënnerstëtzung fir d'Bedeitung vun IL-8 VerfÜgung an CLDN1 VerfÜgung zu gastric carcinogenesis, wéi wichteg genetesch Verännerungen am GC an hir méiglech Relevanz fir H. pylori VerfÜgung Wonn. VerfÜgung Method weist
Ray an Patient Charakteristiken VerfÜgung Biopsies sech mat Net-Cardia gastric adenocarcinoma um endoscopy am Klinik um Akershus University Spidol, Norwegen festgestallte vu Patiente kritt. Thoraco-postwendend misse berechnen tomography Imaging war Patienten ze schléisst mat metastatic Krankheet land. 20 Patiente mat béiden intestinal an diffusen Zorte vun GC sech abegraff. Patienten an clinicopathological Charakteristiken virgestallt ginn an Table 1. Op den Entrée fir Regionalarchivar Agrëff, geschriwwen, Awëllegung fir Participatioun vun der Etude war vun der Participanten kritt. Bannent 5 Minutten Prise vun den Haapt chirurgesch specimen, goufen Echantillon aus béide der entholl Grenz an aus gesond gastric corpal mucosa am selwechten Mo. Beräich geholl awer méi wéi 5 cm vun der entholl ewech, an gespäichert op RNAlater VerfÜgung (Obwuel Biosystems , USA). All Echantillon sech fir ongeféier 1-2 Wochen zu + 4 ° C gespäichert zu komplett Otemschwieregkeeten Pénétratioun vun RNAlater VerfÜgung erlaben, ier en Echantillon gedréchent goufen an definitif zu -80 ° C gespäichert. All Prouf Acquisitioun an bedénge waren déi selwecht individual.Table 1 Patienten- Beméien an clinicopathological Charakteristike vun de 20 gastric erhéijen an der Etude benotzt standing VerfÜgung Sex VerfÜgung Weibchen n = 5, Männercher n = 15 VerfÜgung Herkunft
Caucasian n = 18, asiatesch n = 2 VerfÜgung Alter bei Agrëff VerfÜgung Total: 68,7 Joer (± 12.5) VerfÜgung Weibchen: 65,7 Joer (± 21.8) VerfÜgung Geschlechter: 69,7 Joer (± 8.6)
Wat haalt Dir dovun Iwwerliewe (verstuerwenen Persounen) VerfÜgung Total: 13,2 Méint (± 8,8) VerfÜgung Weibchen (n = 4): 16,6 Méint (± 6.4) VerfÜgung Geschlechter (n = 10): 12,0 Méint (± 9,7 ) VerfÜgung Wat haalt Dir dovun Iwwerliewe (lieweg Persounen um Etude Enn) VerfÜgung Total: 45,8 Méint (± 7.9) VerfÜgung Weibchen (n = 1): 48,0 Méint VerfÜgung Geschlechter (n = 5): 44,9 Méint (± 8,8) VerfÜgung entholl Gréisst VerfÜgung 49 mm (± 27) VerfÜgung entholl Etapp VerfÜgung T1 VerfÜgung 2 VerfÜgung T2 VerfÜgung 10 VerfÜgung T3 VerfÜgung 5 zur VerfÜgung T4
3 VerfÜgung Nodal Etapp VerfÜgung N0 VerfÜgung 10 VerfÜgung N1 VerfÜgung 5 zur VerfÜgung N2 VerfÜgung 3 VerfÜgung N3 VerfÜgung 2 VerfÜgung Histological Typ VerfÜgung Intestinal
5 zur VerfÜgung Firwat VerfÜgung 12 VerfÜgung Bréissel VerfÜgung 3 VerfÜgung Patienten- Beméien an clinicopathological Charakteristike vun de 20 gastric an der Etude benotzt erhéijen. Wäerter sinn déi mengen plus /Minus Standard deviation. VerfÜgung vun der entholl No resection, den Haapt specimen vun zwee Senior Spezialist pathologists zu histolopathological Examen ënnerworf war d'Diagnos ze confirméieren an der entholl klassifizéieren no der Lauren Klassifikatioun [9]. Antral an corpal sech gastric mucosa fir gastritis, atrophy an metaplasia iwwerpréift, an d'Presenz oder Feele vun H. pylori VerfÜgung microscopically iwwerpréift gouf a Folleg vun immunohistochemistry identifizéiert. D'Aktualiséiert Sydney System huet sech d'Ausmooss vun gastritis [18, 19]. VerfÜgung der Etude ze klassifizéieren an Schouljoer benotzt gouf vum norwegesche Regional Comité fir Medical a Gesondheet Research Ethik (REC South Osten) abruecht. All Echantillon an Patient Donnéeën war virun Analyse kodéiert an blinded. RNS Isolatioun VerfÜgung, Qualitéitskontroll an cDNA Synthes VerfÜgung Total RNS war mat der RNeasy Blood an Otemschwieregkeeten Kit (QIAGEN GMBH, Däitschland) laut den Hiersteller d'Norm Virbereedung Protokoll isoléiert . RNS Konzentratioun an Qualitéit huet mat enger NanoDrop ND-1000 spectrophotometer (NanoDrop Technologies, USA) an Agilent 2100 Bioanalyzer (Agilent Technologies, USA) sech. D'RNS Integritéit Zuel war fir cDNA Synthes adequate. VerfÜgung der Illumina TotalPrep RNS amplification Kit (Ambion Galaxy USA) benotzt gouf RNS fir hybridization op Illumina BeadChips zu Meenungsfreiheet nennt. Fir éischt staarkt cDNA vun ëmgedréint Transkriptiouns synthesize, mir ginn total RNS aus all Prouf virun gesammelt. No der zweeter staarkt cDNA Synthes an cDNA Offäll Schrëtt, déi kënschtlech VerfÜgung Transkriptiouns Crna zu synthesize war fir 12 Stonnen Iwwernuechtung virbereet. VerfÜgung cDNA oligonucleotide microarray Analyse VerfÜgung der Gentherapie Ausdrock Profiler gemooss goufen benotzt Illumina Mënscherechter HT-12 v3 Expression BeadChip (Illumina, USA), déi Nepgen-grouss Ausdrock Analyse (48800 gët, entspriechend bis ongeféier 37800 Genen) vun 12 Echantillonen an parallel op enger eenzeger microarray erméiglecht. 35967 vun den Ämter goufen mat der RefSeq (bauen 36,2, release 22) Bibliothéik an 12,837 Ämter entworf vum UniGene ofgeleet goufen (bauen 199) Datebank [20, 21]. VerfÜgung Immunohistochemistry VerfÜgung D'Präsenz vun H. pylori
an der chirurgesch uplanzen war mat engem polyclonal anti-Helicobacter VerfÜgung -antibody (Dako, Dänemark, Code B0471, dilution 1: 200) analyséieren. 4 μm Rubriken vun formalin-fix, paraffin-Ënnerbewosstsinn Otemschwieregkeeten aus Net-tumorous mucosa sech op Beschichtete drënner applizéiert. Deparaffinization, abordablel an epitope retrieval sech zu engem Dako PT Link (Dako, Dänemark) bei 97 ° C fir 20 min gesuergt. D'immunostaining Prozedur war an engem Dako Autostainer Plus Applikatioun vum Stellt ™ FlexLanguage, High pH System (Dako, Dänemark) duerchgefouert. VerfÜgung Bioinformatik a war domatter VerfÜgung R /BioConductor [22, 23] mat der Pauschalrees Beadarray [24] sech fir preprocessing vun der microarray Text Daten aus BeadStudio benotzt. Aménagement artifacts sech mat verkleeden geläscht [25] virun der Ausdrock Date goufen Logbuch 2-transforméiert a quantile normalized. D'Logbuch 2 fantastesch änneren (FC) vun all ewell op der Partie bannent all Otemschwieregkeeten Pair (entholl vs reagéiert normal mucosa) war da berechent, an d'Donnéeë sech an de J-auszedrécken Software Package iwwerlaascht [26]. Attributer Produit Testen [27] war dann zu Test standing ob der Ënnerscheed Ausdrock tëscht entholl Otemschwieregkeeten iwwereneestëmmen normal mucosa bedeitendst war. Den Ënnerscheed Ausdrock war bedeitendst deklaréiert wann der seng p-value, i.e. der FDR q-value, war manner wéi 0,05. Hierarchie Käre war mat Duerchschnëtt linkage an ausgeet Distanz Mooss gesuergt. D'Analysë sech mat de J-auszedrécken Software Package standing [26] VerfÜgung Fir eng ëmmer Stad Lëscht vun de meeschte differentially ausgedréckt Genen produzéiere, hu ausgedréckt Genen sech op enger cutoff Niveau vum FC > Filter aus. 1.5, eng Lëscht vun den 130 am meeschte differentially ausgedréckt Genen produzéiert. Dës Donnéeën war importéiert Distanzschoss-Express an Passerelle Express [28, 29], Deel vun der Distanzschoss-Tools Software suite, fir funktionell Analyse, an gruppéiere an Gene Ontologie (BEI) Begrëffer a Kegg (Kyoto Enzyklopedie vun Genen an Genomes) bewosst sécher Weeër [30]. Passerelle Express rechent en Impact Factor (WANN), déi benotzt gëtt déi gefrote sécher Weeër ze zielen, baséiert op der fantastesch änneren, d'Zuel vun der Équipe Genen vun der Passerelle, an den Undeel vu perturbation vun afgerappt Genen [31]. VerfÜgung d'Donnéeën war agaangen PASW Statistics (SPSS Versioun 18.0.2) bivariate Korrelatioun Analyse ze Leeschtunge Genen déieren, datt mat clinicopathological Parameteren assoziéiert. Béid Pearson an Spearman sech Korrelatioun Ech ugestallten correlating Genen ze identifizéieren. Dorënner Genen dat soll, huet mer besonnesch interesséiert Leit, déi eng ähnlech Ausdrock an eiser virdrun publizéiert Etude vum H. pylori VerfÜgung -exposed gastric epithelial Zellen zougedréckt [17]. Déi gewielte Genen sech dann zu engem Cox multivariate Réckgang Analyse ënnerworf ze ermëttelen, ob keng vun den Genen onofhängeg dacks Post-grënnen Iwwerliewe vun de GC Patienten, onofhängeg vun histological Typ, entholl Etapp a Gréisst, nodal Krankheet, an Alter bei Agrëff huet. An der eng Estimatioun vun der Gentherapie, datt bestëmmt war, goufen verschidden präventive Niveauen héich an niddreg Ausdrock Niveau Gruppen ze bauen applizéiert, ier statistesch Bedeitung tëscht de Gruppen évaluéieren war e Log-Platz (Mantel-Cox) Test mat. A Kaplan-Meier Iwwerliewe geséchert war, hunn d'Differenz zu Iwwerliewe tëscht der high- an héich-Ausdrock Gruppen ze beweisen. VerfÜgung D'microarray Daten sinn si ënnert dem Bäitrëtt Zuel E-MTAB-1440 an der ArrayExpress Datebank [32].
Resultater VerfÜgung Gene Ausdrock VerfÜgung Lait Nepgen Ausdrock profiling vun 20 reagéiert gastric entholl Echantillon war mat cDNA microarrays gesuergt. Attributer Produit statistesch Testen [27] vun der Läschlëscht 2 fantastesch änneren (FC) Ausdrock Wäerter vu ronn 38000 Genen op d'microarray Chip réischt 2297 Genen dass vill sech weider-reglementéiert an 2259 Genen datt an der entholl bedeitend erof-regulariséiert goufen Otemschwieregkeeten Verglach zu reagéiert normal mucosa (p &Si besteet; 0.01). Den 130 Filter Genen déi differentially vun Moyenne FC > regulariséiert goufen; 1.5 sinn an Table 2, an dat wor den Donnéeën opgelëscht op déi weider Etude gemaach gëtt. Vun de meeschte differentially Genen reegelen, hien huet 30 Gene weider-Regulatioun a sech 100 Genen verwandelt-reegelen. IL-8 VerfÜgung war den eenzege Meeschter an-reegelen Gentherapie, up-reglementéiert 18 vun 20 Otemschwieregkeeten opzefëllen, mat enger Moyenne FC vun 2,6 (Dorënner 1), gefollegt vun COL1A1 VerfÜgung an CLDN1 VerfÜgung (Dorënner 2 ). De stäerkste verwandelt-reegelen Gentherapie war PGA4 VerfÜgung, sou bemierkenswäert verwandelt-reglementéiert 18 vun 20 Otemschwieregkeeten opzefëllen, gefollegt vun GIF VerfÜgung an ATP4A VerfÜgung. Hierarchie Käre vun den Donnéeën (Dorënner 3) gewisen, datt d'entholl a Kontroll Stoffer gemaach verschiddene Gentherapie Ausdrock Kéip gemaach. An der entholl Stärekoup, déi verschidden histological Kategorien diffusen, intestinal a gemëscht Kriibs bal exklusiv eenzel Kéip gemaach, an all vun der histological subsets no genetesch funktionéiert Musiktherapie-. Ënnert der Kontroll Stoffer, an ënnert der H. pylori VerfÜgung positive Persounen, keng besonnesch Käre war seen.Table 2 De stäerkste differentially reegelen Genen vun gastric entholl vs Kontroll mucosa VerfÜgung Up-reegelen Genen (n = 30)
zu Down-reegelen Genen (n = 100)
Gene Symbol
Duerchschnëttlech FC
Gene Symbol
Duerchschnëttlech FC VerfÜgung
Gene Symbol
Duerchschnëttlech FC
Gene Symbol
Duerchschnëttlech FC
IL-8 VerfÜgung 2,58
PGA4
-5.58
MAL
-2.22
AKR7A3
-1.79
COL1A1
2.18
GIF
-5.48
SCNN1B
-2.22
KIAA1324 VerfÜgung -1,79 VerfÜgung CLDN1 VerfÜgung 2,14
ATP4A
-5.28
SOX21
-2.22
CCDC121
-1.78
SPP1
2.09
PGA3
-4.72
CAPN9
-2.21
FBP2
-1.76
CLDN2
2.09
ATP4B
-4.71
AGXT2L1
-2.20
FCGBP
-1.75
CEACAM6
2.09
PGA5
-4.34
HDC
-2.18
ORM2
-1.75
SERPINB5
2.06
LIPF
-3.91
GSTA1
-2.18
FAM3B
-1.73
KRT17 VerfÜgung 2,00
CPA2
-3.78
KLK11
-2.12
TRIM50
-1.73
H19
1.94
GHRL
-3.75
APLP1
-2.12
DUOX1
-1.72
CLDN7 VerfÜgung 1,93
GKN2
-3.26
MT1H
-2.09
RAP1GAP
-1.70
TFF3
1.92
KCNE2
-3.19
ADH1C
-2.09
EEF1A2
-1.70
OLFM4
1.91
SST
-3.12
DPCR1
-2.06
ANGPTL3
-1.70
THBS2
1.91
CHGA
-3.02
AKR1B10
-2.03
B3GAT1
-1.69
PI3
1.90
PSCA
-3.00
MT1G
-2.03
C6ORF105
-1.68
SULF1
1.89
CHIA
-2.88
CKB
-2.01
FGG
-1.68
BGN
1.82
GKN1
-2.88
SH3GL2
-1.99
ADA VerfÜgung -1,65
KRT6B
1.80
KCNJ16
-2.82
REP15
-1.97
C6ORF58
-1.63
THY1
1.72
GC
-2.66
CKM
-1.95
ZNF533
-1.60
MMP11
1.70
CLIC6
-2.65
FGA
-1.95
RPESP
-1.59
KLK6
1.67
SOSTDC1
-2.53
SLC9A4
-1.92
MT1F
-1.58
SERPINA3
1.65
ESRRG
-2.52
MFSD4
-1.92
PNPLA7
-1.57
FNDC1
1.64
CCKBR
-2.51
ALDOB
-1.89
FUT9
-1.57
COL1A2
1.63
TMED6
-2.44
SCNN1G
-1.87
RPRM
-1.56
CST1
1.63
MT1M
-2.44
IRX2
-1.87
GUCA2B
-1.56
FAP
1.60
GPER VerfÜgung -2,43
SLC26A9
-1.87
TCN1
-1.55
COL6A3
1.60
CKMT2
-2.36
CLCNKA
-1.87
PKIB
-1.55
SFRP4
1.56
VSIG2
-2.36
CAPN13
-1.86
SLC9A2 VerfÜgung -1,55 VerfÜgung TMEM158 VerfÜgung 1,53 VerfÜgung FLJ42875 VerfÜgung -2,33 VerfÜgung TTR VerfÜgung -1,86 VerfÜgung HOMER2 VerfÜgung -1,53 VerfÜgung MMP7 VerfÜgung 1.50
CXCL17
-2.32
GSTA2
-1.85
AKR1C4
-1.50
MMP10
1.50
CA9
-2.32
NKX6-2
-1.83
REG3A
-1.50
AKR1C2 VerfÜgung -2,27 VerfÜgung CA2 VerfÜgung -1,83 VerfÜgung PI16 VerfÜgung -1,50 VerfÜgung ALDH3A1 VerfÜgung -2,24 VerfÜgung FOLR1 VerfÜgung -1,82 VerfÜgung MAP7D2 VerfÜgung - 1.50 VerfÜgung SCGB2A1 VerfÜgung -2,23 VerfÜgung RDH12 VerfÜgung -1,81 VerfÜgung AQP4 VerfÜgung -2,24 VerfÜgung IRX3 VerfÜgung -1,80 VerfÜgung Differentially reegelen Genen mat Duerchschnëtt log2FC vu > 1,5 (n = 130). aus ganz Nepgen Ausdrock ofgebaut. Duerchschnëtt log2FC Niveauen un all Gentherapie entspriechend sinn opgezielt. Néng Genen. fett Typ gewisen. Souwuel déi aktuell Etude ähnlech Regelung bewisen an enger viregter Etude wou gastric epithelial Zellen ze H. ausgesat goufen pylori VerfÜgung [17]. VerfÜgung Dorënner 1 Interleukin-8 Gentherapie Ausdrock vun gastric erhéijen vs reagéiert Kontroll mucosa. Déi staark Linn stellt d'famill Verhältnis vun IL-8 VerfÜgung Ausdrock vun entholl Otemschwieregkeeten Verglach zu reagéiert Kontroll gastric mucosa, wéi d'log2 fantastesch änneren (log2 entholl /Ausdrock Niveauen Kontroll). Eng positiv stoung beweist eng héich Ausdrock vun der entholl Verglach zu de normal gastric mucosa. IL-8 VerfÜgung war déi konsequent weider-reegelen Gentherapie vun der Etude. D'groen Hannergrond duerstellt dem Wëllen vun ongeféier 37 800 aner Genen. VerfÜgung zu gastric erhéijen vs reagéiert Kontroll mucosa 2 Claudin 1 Gentherapie Ausdrock Dorënner. Déi staark Linn stellt relativ Verhältnis vun CLDN1 VerfÜgung Ausdrock am entholl Otemschwieregkeeten Verglach zu reagéiert Kontroll gastric mucosa, wéi d'log2 fantastesch änneren (log2 entholl /Ausdrock Niveauen Kontroll). Eng positiv stoung beweist eng héich Ausdrock vun der entholl Verglach zu de normal gastric mucosa. D'groen Hannergrond duerstellt dem Wëllen vun ongeféier 37 800 aner Genen. VerfÜgung 3 Hierarchie Käre vun der Gentherapie Ausdrock vun 20 gastric erhéijen a Kontroll mucosa Dorënner. Ganz Nepgen Ausdrock vun 20 entholl /Kontroll Otemschwieregkeeten Puer sech Filter engem Donnéeën ze produzéieren der 130 am meeschte differentially reegelen Genen mat. Déi meescht déi entholl Echantillon trennen zu der Kontroll Echantillon Strooss. D'diffusen Typ entholl Echantillon am Liicht gro beliicht sinn, déi intestinal Typ vun mëttelfristeg gro an deer Zort vun däischter gro der subclustering vun den dräi verschidde histological Kriibs Zorte Ganzt. VerfÜgung Genen vun der aktueller Donnéeën goufen Kräiz-stemmt géint d' meeschte differentially reegelen Genen vun eiser leschter Etude identifizéiert, wou gastric epithelial Zellen fir 24 Stonnen ze H. pylori VerfÜgung ausgesat goufen kënschtlech VerfÜgung [17]. Béid H. pylori VerfÜgung -exposed gastric epithelial Zellen an der entholl biopsies bewisen bedeitend weider-Regulatioun vun fënnef gemeinsam Genen (IL-8, CLDN1, KRT17, CLDN7 VerfÜgung an MMP7 VerfÜgung) an Ugrëff-Regulatioun vu véier gemeinsam Genen (GPER, KIAA1324, ADA VerfÜgung an SLC9A2 VerfÜgung). VerfÜgung Gene Ontologie VerfÜgung Next, d'Donnéeën vun den 130 am meeschte differentially reegelen Genen war fir funktionell Annotation benotzt GO Begrëffer (Table 3) analyséieren. Vun der 30 weider-reegelen Genen, Zell-Haftung Prozesser, a besonnesch Kalzium-onofhängeg Zell-Zell Haftung, waren ënnert de meeschte héich beräichert Begrëffer. Ausserdeem, Entwécklung syntheteschen Prozesser wéi Haut morphogenesis a Blutt pompelen, wéi och zwee catabolic an syntheteschen collagen-Zesummenhang Prozesser sech ënnert de wesentleche Begrëffer identifizéiert. Nëmmen e klenge Prozentsaz vun de verwandelt-reegelen Genen sech ze bestëmmter agestallte Persoun Ëmgéigend Verglach zu der up-reegelen Genen, wou unzereegen an excretion déi beräichert Begrëffer huet. Puer metabolic Prozesser, pH Regulatioun an cobalamin an ioun Transport GO Begrëffer och däitlech ënner dem verwandelt-reegelen Genen beräichert huet (Table 4) .Table 3 Gene Ontologie Associatiounen an up-reegelen Genen VerfÜgung P-Wäert
Nee vun Genen Équipe
% vun Genen
Gene Ontologie VerfÜgung Équipe VerfÜgung GO: Zuel
0,00066 VerfÜgung 3 VerfÜgung 10.0 VerfÜgung Kalzium -independent Zell-Zell Haftung VerfÜgung GO: 0016338 VerfÜgung 0,0007 VerfÜgung 2 VerfÜgung 6,67 VerfÜgung Skin morphogenesis VerfÜgung GO: 0043589 VerfÜgung 0,023 VerfÜgung 5 zur VerfÜgung 16,67 VerfÜgung Zell Haftung VerfÜgung GO: 0007155 VerfÜgung 0,023 VerfÜgung 2 VerfÜgung 6,67 VerfÜgung Collagen catabolic Prozess VerfÜgung GO: 0030574 VerfÜgung 0,023 VerfÜgung 2 VerfÜgung 6,67 VerfÜgung Collagen fibril Organisatioun VerfÜgung GO: 0030199 VerfÜgung 0,027 VerfÜgung 2 VerfÜgung 6,67 VerfÜgung Blood pompelen development
GO:0001568
0.042
1
3.33
Copulation
GO:0007620
0.042
1
3.33
Regulation vun der Realitéit Nepgen Gedächtnis VerfÜgung GO: 0045870 VerfÜgung 0,042 VerfÜgung 1 VerfÜgung 3,33 VerfÜgung Responsen zu corticosteroid Impulser VerfÜgung GO: 0031960 VerfÜgung 0,042 VerfÜgung 1 VerfÜgung 3,33 VerfÜgung Zännofdréck mineralization VerfÜgung GO: 0034505 VerfÜgung signifikativ beräichert Gene Ontologie Begrëffer an der up-reegelen Genen vun de Donnéeën VerfÜgung Table 4 Gene Ontologie Associatiounen an Ugrëff-reegelen Genen VerfÜgung P-Wäert VerfÜgung Genen keen vun
% vun Genen Équipe Équipe
Gene ontology

GO:number

0.0
8
7.41
Digestion
GO:0007586
0.00011
5
4.63
Excretion
GO:0007588
0.0005
3
2.78
Creatine metabolic Prozess VerfÜgung GO: 0006600 VerfÜgung 0,0019 VerfÜgung 3 VerfÜgung 2,78 VerfÜgung bewosst aldehyde metabolic Prozess VerfÜgung GO: 0006081 VerfÜgung 0,0043 VerfÜgung 3 VerfÜgung 2,78 VerfÜgung Reglement vun pH VerfÜgung GO: 0006885 VerfÜgung 0,013 VerfÜgung 2 VerfÜgung 1,85 VerfÜgung Cobalamin Transport VerfÜgung GO: 0015889 VerfÜgung 0,015 VerfÜgung 9 VerfÜgung 8,33 VerfÜgung Ion transport
GO:0006811
0.015
2
1.85
Secretion
GO:0046903
0.015
2
1.85
Cobalt ioun Transport VerfÜgung GO: 0006824 VerfÜgung 0,02013 VerfÜgung 2 VerfÜgung 1,85 VerfÜgung Morphogenesis vun enger epithelium VerfÜgung GO: 0002009 VerfÜgung signifikativ beräichert Gene Ontologie Begrëffer am Ugrëff-reegelen Genen vun de Donnéeën . VerfÜgung Kegg bewosst sécher Weeër VerfÜgung D'Donnéeën dann fir Kegg bewosst sécher Passerelle Associatiounen analyséiert huet. 11 vun den 30 bis-reegelen Genen huet zu 8 bedeitendst Kegg Édouard (p &Si besteet; 0,05) Ëmgéigend. Besonnesch waren der Zell Haftung Molekülle (CAM) Passerelle an leukocyte transendothelial Migratioun Passerelle eng héich Impakt Faktor, wéinst der staarker up-Regulatioun vun CLDN1, CLDN7 VerfÜgung, an THY1 VerfÜgung Genen, an déi héich relativ Impakt vun uechtzéng dës Genen op d'CAM Passerelle. IL-8, COL1A1, COL1A2, THBS2, SPP1, COL6A3 VerfÜgung an SFRP4 VerfÜgung diverse héichgradeg verkuebelt Weeër Ëmgéigend waren: leukocyte transendothelial Migratioun, extracellular Matrixentgasung receptor Interaktioun, knapper menaarbecht, epithelial Zell sécher an H. pylori
Wonn, TGFβ sécher Passerelle, Péage-wëll receptor sécher an Wnt sécher (Table 5). Keen vun den 100 verwandelt-reegelen Genen sech zu all bedeitend bewosst sécher Ëmgéigend Weeër Kegg pathways.Table 5 Kegg VerfÜgung Gemeng
Passerelle Numm
WANN
P-Wäert
1 VerfÜgung Zell Haftung Molekülle (Cams) VerfÜgung 734,0 VerfÜgung 0,000129 VerfÜgung 2 VerfÜgung Leukocyte transendothelial Migratioun VerfÜgung 672,1 VerfÜgung 0,000879 VerfÜgung 3 VerfÜgung ECM -receptor Interaktioun VerfÜgung 10,9 VerfÜgung 0,00215 VerfÜgung 4 VerfÜgung knapper Échangeur zu 10,6 VerfÜgung 0,000296 VerfÜgung 5 zur VerfÜgung Epithelial Zell sécher an Helicobacter VerfÜgung 7,2 VerfÜgung 0,006
6 VerfÜgung TGF-Beta sécher Passerelle VerfÜgung 6.3 VerfÜgung 0,013 VerfÜgung 7 VerfÜgung Brennwäit Haftung VerfÜgung 6.2 VerfÜgung 0,014 VerfÜgung 8 VerfÜgung Kalzium sécher Passerelle VerfÜgung 5.1
0,035 VerfÜgung signifikativ beräichert Kegg bewosst sécher Weeër an der Donnéeën (p &Si besteet; 0,05). Impact Factor (WANN) benotzt ass déi gefrote sécher Weeër ze zielen, baséiert op der fantastesch änneren, d'Zuel vun der Équipe Genen vun der Passerelle, an Montant vun perturbation vun afgerappt Genen. VerfÜgung Clinicopathological Korrelatioun VerfÜgung Ënnert dem Ganzen Formatioun den FC Ausdrock Niveau vun 20 Genen vun den 130 am meeschte differentially Genen reegelen, awer bedeitend Korrelatioun mat Post-grënnen Iwwerliewe, 8 Genen mat histological Typ soll, 5 Genen mat entholl Gréisst soll, an 1 Gentherapie mat lymph Node Etapp (Zousätzleche Fichier 1 soll ). Puer Genen zougedréckt Korrelatioun mat méi wéi ee Parameter. Well vun der moderéiert Prouf Gréisst (n = 20), eng Bedeitung Niveau vun p &Si besteet; 0,01 war dëse Match gaangen. VerfÜgung Cox multivariate Analyse vun de Genen mat Post-grënnen Iwwerliewe verbonne bewisen, dass eng héich CLDN1 VerfÜgung Ausdrock Niveau déi eenzeg onofhängeg Estimatioun Gentherapie vum Post-grënnen Iwwerliewe war. CLDN1 VerfÜgung Ausdrock an der covariates entholl Gréisst, positiv lymph Node Ëmwandlung, histological Typ, Geschlecht an Alter bei Agrëff sech an engem linear Réckgang Modell stëmmen (Table 6) Musiktherapie- datt nëmmen CLDN1 VerfÜgung a positiv lymph Node Ëmwandlung bedeitendst sech dacks Post-grënnen Iwwerliewensfro. Wann all Net-relevant determinants wou geläscht, et war eng staark negativ Korrelatioun tëscht CLDN1 VerfÜgung Ausdrock an Post-grënnen Iwwerliewe (R = -0,7, p &Si besteet; 0.001). Et huet kee groussen Veräin tëscht CLDN1 VerfÜgung Ausdrock an Lauren Klassifikatioun, H. pylori VerfÜgung Wonn, Herkunft, entholl Gréisst oder metastatic lymph Node status.Table 6 fir op Iwwerliewe fir gastric Kriibs folgenden Agrëff beaflossen VerfÜgung Co-variate
Korrelatioun souguer gemaach R
P-Wäert
CLDN1 VerfÜgung Ausdrock (log2 fantastesch änneren) VerfÜgung -0,53 VerfÜgung 0,008 VerfÜgung Lymph Node Ëmwandlung
-0,46 VerfÜgung 0,016 VerfÜgung entholl Gréisst VerfÜgung -0,27 VerfÜgung 0,186 VerfÜgung Alter bei Agrëff VerfÜgung -0,13 VerfÜgung 0,491 VerfÜgung Histological Typ (intestinal Typ) VerfÜgung -0,03 VerfÜgung 0,888 VerfÜgung Männlech Geschlecht VerfÜgung -0,05 VerfÜgung 0,792 VerfÜgung Linearschrëft Réckgang Analyse vun Multiple Facteure beaflossen Post-grënnen Iwwerliewe vun Patienten Agrëff fir gastric Kriibs amgaang. VerfÜgung fir Differenzen am Post-grënnen Detektioun Iwwerliewe tëscht Individuën mat héich an niddreg CLDN1 VerfÜgung -expressing erhéijen, verschidden präventive Niveauen sech ëm héich-ausdrécken an héich-ausdrécken Gruppen ze schafen. D 'CLDN1 VerfÜgung FC mengen (FC mengen = 2.14) als Grupp beräich, high- an héich-ausdrécken CLDN1 VerfÜgung Patienten vill verschidden Iwwerliewe Musteren bewisen (p &Si besteet; 0.001) den an der Kaplan-Meier Komplott illustréiert an Figur 4. Figur 4 Kaplan Meier Iwwerliewe geséchert Patienten mat resected gastric erhéijen. Déi staark Linn stellt ënnert der Moyenne CLDN1 VerfÜgung erhéijen -expressing (FC &Si besteet; 2.14) an der agekreest Linn stellt virun Duerchschnëtt CLDN1 VerfÜgung -expressing erhéijen (FC > 2.14). 6 Patienten an der niddereg CLDN1 VerfÜgung Grupp -expressing waren um Enn vun der Etude Period nach liewt, wéi déi vun de massive Linn vertikalen tics bewisen. VerfÜgung Histopathological Charakteristike vun bascht Net-kriibserreegend mucosa VerfÜgung Vun der 20 reagéiert mucosa uplanzen, 10 zougedréckt Beweiser vun Net-atrophic gastritis, an 10 bewisen multifocal atrophic gastritis. Intestinal metaplasia war vun 1-3 an der antrum an Corpus Beräicher vun der Echantillon Faarwen. D'intestinal Typ erhéijen sech vill mat béiden atrophic gastritis an intestinal metaplasia (p &Si besteet; 0.001) verbonnen, Coursë vum diffusen Typ erhéijen mat Net-atrophic gastritis (p &Si besteet; 0.001) verbonne waren. Béid histological an immunohistochemical Beweiser vum H. pylori VerfÜgung waren an der mucosa Kolleg vun 1 intestinal an 1 diffusen Typ Cancers (Sauerdall 5 a 6), souwuel an Okkultismus Patienten bewisen. Déi aner 18 Beem uplanzen zougedréckt keng Beweiser vum H. pylori VerfÜgung. Do ware keng grouss Ënnerscheeder tëscht Zorte vun Cancers, Zorte vu gastritis, oder d'Präsenz vun H. pylori VerfÜgung op engersäits, an der Korrelatioun mat der Gentherapie Ausdrock vun CLDN1 VerfÜgung oder IL-8 VerfÜgung. Figur 5 Histological Sektioun vum H. pylori Net-atrophic chronescher gastritis entschlof. De Feil weist en Deel vun aktiv inflammation mat charakteristesche granulocytic einfach an der Krypta epithelium eraus. VerfÜgung 6 Immunohistological Beweiser vum H. pylori Dorënner. H. pylori war an 2 vun den 20 mucosa Echantillon entdeckt. D'specimen vu kengem 5 gouf Behandlung vun Anti-Helicobacter VerfÜgung -antibody, staining H. pylori VerfÜgung brong. VerfÜgung Diskussioun VerfÜgung An dëser Etude op immunohistochemistry ënnerworf mir CLDN1 VerfÜgung als eent vun de identifizéiert meeschte konsequent Genen am GC up-reglementéiert an eng staark Korrelatioun tëschent mat gastric adenocarcinomas vun 20 Patiente an-Regulatioun vun CLDN1 VerfÜgung a reduzéiert Iwwerliewensfro. Dëst Korrelatioun ass och méi staark wéi fir aner Parameteren wéi lymph Node Etapp, entholl Gréisst a histological Typ ugepasst. Eis Medeziner Prouf Gréisst ass kleng, mee d'Resultater sinn konsequent. VerfÜgung Claudins sinn Proteinen am bewosst knapper junctions Équipe a sinn wichteg fir d'Erhalung vun normal epithelium, besonnesch Barrière Opstellung, Zell Polaritéit an Signal transduction. Dysregulation vun dësen Genen goufen an ville verschiddene Cancers identifizéiert. Baséierend op entholl Biologie, verwandelt-Regulatioun vun CLDN1 géif VerfÜgung an Zerstéierung vun knapper junctions Resultat an Verloscht vun Zell-ze-Zell Haftung entholl Werdegang dauernd [33] Ee vun de Medeziner Bedeitung vun gastric carcinogenesis méi komplex ass. Et ass evident, datt e puer vun de claudins, CLDN1 abegraff VerfÜgung, show waarden Niveau wéi gastric epithelium Verlaf metaplasia a fréi gastric carcinoma zu intestinal [34]. CLDN1 VerfÜgung kéint intracellular sécher Afloss, vum Liu bewisen et al. wien huet dat nik Ausdrock vun CLDN1 vun Zellen Broscht Kriibs derzou eng anti-apoptotic Effet duerch zwee Mechanismen: inhibition vun caspase-8 Rëss, an Aktivéierung vun der Wnt /β-catenin Signal Passerelle [35]. CLDN1 gouf am helle gastric Kriibs AGS Zellen kënschtlech VerfÜgung identifizéiert, e reglementaresche Roll vun CLDN1 op Zell Prolifératioun suggeréiert, Migratioun an invasiveness op engem nuklearen Niveau [36]. All Auteuren liesen an guttgeheescht der Finale mëttelalterlech Handschrëft. VerfÜgung

• Integrative Rollen vun transforméiert Wuesstem Faktor-α an der cytoprotection Mechanisme vun gastric mucosal blesséiert
• Association vun thiazolidinediones mat gastric Kriibs an Typ 2 Zockerkrank: eng Bevëlkerung-baséiert case-Kontroll study