A genomra kiterjedő asszociációs tanulmány feltárja a divertikuláris betegség mögött rejlő potenciális géneket

A nyugati féltekén a 40 év feletti felnőttek több mint felének bél belsejében kis domború tasakok vannak, amelyeket divertikulának neveznek. A bél külső bélésének gyengülése okozza, ezek a tasakok általában ártalmatlanok.

De egyeseknek, ezek a tasakok fájdalmasan gyulladhatnak vagy fertőzhetnek, antibiotikum -kezelést igényel - vagy súlyos esetekben, műtét a vastagbél eltávolítására. Jelenleg, senki sem tudja, mi okozza a divertikulózist (azoknak a tasakoknak a kialakulását) vagy a divertikulitist (a tasakok gyulladása).

Lillias Maguire, M.D., kolorektális sebész a Michigan Medicine -ban, nem volt megelégedve a gyakori gyulladásos betegség tipikus magyarázataival, ami több mint 200 -at okoz, 000 kórházi felvétel évente az Egyesült Államokban.

"Az volt a gyanú, hogy az étrend okozza, "Maguire mondja." Úgy gondolták, hogy a divertikulitisz összefüggésben lehet az alacsony rosttartalommal, mivel a tipikus nyugati étrendet fogyasztó emberek viszonylag székrekedtek.

"Azonban, ha jobban megnézed, úgy tűnik, ez a magyarázat nem ráz meg. "

Tanulmányok kimutatták, hogy a divertikulitisz általában öröklődik, - mondja Maguire, azonos ikrekkel nagyobb a hasonlóság a betegség kialakulásának valószínűségében, mint a testvér ikreknél. Ez egy valószínű genetikai összetevőre utal.

Többet megtudni, felkereste Elizabeth Speliotes -t, M.D., Ph.D., gasztroenterológiai adjunktus, Belgyógyászat, valamint a számítástechnikai orvoslás és a bioinformatika, akik nagymértékben részt vettek többféle betegség genetikai vizsgálatában.

A Speliotes mentorálta Maguire-t egy genomra kiterjedő asszociációs tanulmányon keresztül, hogy felkutassa az állapot hátterében álló géneket. A tanulmány a folyóiratban jelenik meg Természeti genetika .

Nagyszabású elemzés

Genomszintű asszociációs vizsgálatok, vagy GWAS, viszonylag új és hatékony eszköz a komplex állapotok genetikájának vizsgálatához, amelyek mind genetikai, mind környezeti összetevővel rendelkeznek, és nem közvetlenül szülőről gyermekre öröklődnek.

Ezek a tanulmányok nagy genomgyűjtemények rendelkezésre állására támaszkodnak - és a nagyobbakra, a jobb.

"Nincs lehetőség igazi GWAS elvégzésére 1 -es csoportban, 000 vagy akár 5, 000 ember egyszerűen azért, mert a genom olyan nagy, - mondja Maguire.

Szerencsére, ilyen gyűjtemény létezik az Egyesült Királyság Biobankja formájában, amely több mint 500 genetikai és orvosi információt tartalmaz, 000 ember 40 és 69 év között. Példátlan erőforrás, amelyhez a tudósok a világ minden tájáról fordulnak, hogy megpróbálják feltárni a gyakori betegségek, például a szívbetegségek, genetikáját. rák és demencia.

Ebben az esetben, az adatoknak volt potenciáljuk. "Az orvosi nyilvántartásokon keresztül, tudjuk, hogy körülbelül 28, Az Egyesült Királyság Biobankjában ezer embert vettek fel divertikulitisz miatt, - mondja Maguire. A Speliotes laboratóriumának segítségével összehasonlította ezeket az embereket körülbelül 31 fős kohorszukkal, 000 ember a Michigan Genomics Initiative-tól az UM-en.

A cél:olyan közös genetikai változatok megtalálása, amelyek azonosíthatják a betegség mögött álló potenciális géneket. "Egy GWAS -ban, olyan génváltozatokat keresünk a genomokban, amelyek egyedülállóak az egyének számára, "Maguire mondja." Nem feltétlenül határozzák meg a genetikai mutációkat, de a genom egy olyan régiójára mutatnak, ahol több gén is van a közelben. "

Új kapcsolatok létrehozása

Az Egyesült Királyság Biobank mintájának felhasználásával a kutatók 42 olyan helyet találtak, amelyek 99 érdekes génhez kapcsolódtak. Köszönetet mondanak a nagyszámú embernek, hogy segítenek azonosítani sok helyet.

"Ezután hatalmas statisztikai tesztet végzünk annak megállapítására, hogy mely változatok kapcsolódnak szorosan a divertikulitiszhez, - mondja Maguire.

De ez nem jelenti azt, hogy mind a 42 szükségszerűen jelentős. A minta puszta mérete azt jelenti, hogy bizonyos lókuszok csak zajok, - teszi hozzá.

Amikor összehasonlították a brit Biobank 42 lókuszát a Michigan Genomics Initiative mintával, a nyolc csoport közösnek bizonyult a két csoport között.

"Amikor a lokuszok replikációját látjuk a populációk között, biztonságban érezzük magunkat, ha erős összefüggés van, - mondja Maguire.

Mi érdekes, azonban, mihez kapcsolódnak az általuk azonosított gének.

A divertikulitisz összefüggésében "a látott gének értelmesnek tűntek, - mondja Maguire. - A kötőszöveti sejtek génjeit azonosítottuk, az útvonalak, amelyekről tudjuk, hogy más kötőszövetekkel vannak kapcsolatban, sérv, és más betegségek, például az aneurizmás érbetegségek, amelyek szintén kötőszöveti eredetűek. Ezt látjuk és elkezdünk gondolkodni, 'RENDBEN, valami jót ütünk. "

A megállapítások tájékoztatják a jövőt

Az elemzés új és hasznos betekintést nyújt a divertikulitiszbe. Maguire csapata közül harminckilencet soha nem azonosítottak.

Maguire úgy véli, hogy kiindulópontként szolgálhatnak ahhoz, hogy végre megmagyarázzák ennek a betegségnek az eredetét.

"Talán úgy, hogy megvizsgáljuk néhány célunkat, választ kaphatunk arra, hogy miért fordul elő ez a betegség, és kifejleszthetünk egy olyan gyógyszert vagy terápiát, amely sokkal jobban működik, mint csak a vastagbél egy darabjának kivétele, vagy az antibiotikumok ismételt kezelése, " ő mondja.

E felfedezések egyike sem, a kutatók tudják, lehetséges lenne biobankok nélkül.

"Azok az emberek, akik előrelátóan létrehozták és részt vettek a Michigani Genomikai Kezdeményezésben, biztosították és fejlesztik ezt a csodálatos erőforrást, amely lehetővé teszi számunkra, hogy sokkal több tanulmányt végezzünk, hogy valóban megértsük, mi történik az emberekkel - nemcsak divertikulitiszben, hanem más betegségekkel, ő mondja. - Ez csak a kezdet.

• A Guillain Barré -szindrómás orvos visszatér a normális élethez
• Genetikus jelátviteli rendszer a bél mikrobiomához