Les voyageurs internationaux peuvent acquérir des gènes de résistance aux antimicrobiens spécifiques à la destination,

une étude révèle Les voyageurs à l'étranger peuvent attraper des bactéries et d'autres vecteurs contenant des gènes conférant une résistance aux antimicrobiens qui restent dans l'intestin lors de leur retour dans leur pays d'origine, selon une étude publiée dans Médecine du génome .

Une équipe de chercheurs de l'Université de Washington, États-Unis et Université de Maastricht, Les Pays-Bas ont étudié la présence de gènes de résistance aux antimicrobiens (RAM) dans le microbiome intestinal humain en analysant les échantillons de selles de 190 voyageurs néerlandais avant et après leur voyage vers des destinations en Afrique du Nord, Afrique de l'Est, Asie du Sud et Asie du Sud-Est.

Le microbiome intestinal comprend des bactéries et d'autres organismes qui vivent dans le tube digestif des humains. Les participants et leurs échantillons ont été extraits d'un sous-ensemble de données de l'étude COMBAT plus vaste portant également sur la résistance aux antimicrobiens. Les gènes AMR se sont naturellement développés dans les bactéries au cours des millénaires lorsqu'ils ont été exposés à des antibiotiques produits naturellement par quelques bactéries environnementales, mais la surutilisation et la mauvaise utilisation des antibiotiques en médecine humaine et en agriculture animale accélèrent le processus. Les bactéries résistantes aux antimicrobiens ne répondent pas au traitement avec des antibiotiques auxquels elles ont développé une résistance.

Les auteurs ont constaté une augmentation de la quantité et de la diversité des gènes de résistance aux antimicrobiens dans les échantillons de selles de voyageurs revenus de l'étranger, y compris les gènes de résistance aux antimicrobiens à haut risque qui résistent aux antibiotiques courants et de dernier recours (antibiotiques utilisés lorsque d'autres antibiotiques ne fonctionnent pas).

Les auteurs ont utilisé le séquençage du métagénome des microbiomes fécaux pour identifier les gènes AMR dans les échantillons en les faisant correspondre à une base de données de gènes AMR connus. Ils ont également identifié de nouveaux gènes de résistance aux antimicrobiens en testant si les gènes des échantillons, lorsqu'il est ajouté à un hôte E. coli, permettrait à ces E. coli d'acquérir une nouvelle résistance aux antibiotiques.

La diversité des gènes de RAM dans le microbiome a considérablement augmenté chez les individus revenant de toutes les destinations, avec des preuves de 56 gènes AMR différents acquis au cours d'un voyage. Cette diversité était la plus élevée chez ceux qui sont allés en Asie du Sud-Est. La diversité génétique de la RAM était plus faible entre les voyageurs qui se sont rendus à la même destination, ce qui signifie qu'ils avaient plus de gènes AMR en commun les uns avec les autres qu'avec les voyageurs de différentes destinations. Cela indique que les voyageurs ont récupéré des gènes de RAM spécifiques à la destination.

Une analyse génétique approfondie a identifié des gènes de résistance aux antimicrobiens à haut risque qui sont résistants aux antibiotiques courants et de dernier recours. Six des dix gènes à haut risque identifiés étaient présents après le voyage mais pas avant, ce qui indique qu'elles ont été acquises pendant le voyage. Par exemple, le gène mcr-1, qui confère une résistance à la colistine, un traitement de dernier recours pour les infections telles que la pneumonie et la méningite, n'a été trouvé que dans des échantillons après le voyage. Le gène a été trouvé principalement dans le microbiome des voyageurs en Asie du Sud-Est; 18 des 52 voyageurs (34,6 %) inclus dans l'étude qui ont voyagé vers des destinations de la région étaient porteurs du gène à leur retour. La découverte indique que les voyageurs peuvent avoir acquis le gène à leur destination.

Des échantillons fécaux du microbiome prélevés avant le voyage contenaient également des gènes de RAM et les auteurs reconnaissent qu'il est possible que les voyageurs aient également propagé des gènes de RAM aux destinations qu'ils ont visitées. Les auteurs manquaient d'échantillons des contacts avec lesquels les voyageurs ont interagi, on ne peut donc pas savoir avec certitude comment les voyageurs ont acquis les gènes AMR.

Ces résultats soutiennent fortement que les voyages internationaux risquent de propager la résistance aux antimicrobiens à l'échelle mondiale. Au retour, les microbiomes des voyageurs avaient acquis une quantité importante de gènes AMR. Beaucoup de ces gènes étaient des gènes de résistance aux antimicrobiens à haut risque, car ils confèrent une résistance aux antibiotiques couramment utilisés.

Alaric D'Souza, Auteur principal

Les auteurs concluent que comprendre comment les gènes de la RAM se propagent d'un pays à l'autre aidera à cibler les mesures de santé publique pour empêcher une nouvelle propagation. Des recherches futures pourraient étudier les contacts avec lesquels les voyageurs interagissent lors de leurs visites pour comprendre comment les gènes de résistance aux antimicrobiens sont transmis.

D'Souza a déclaré :« Il est vital que nous nous attaquions à la résistance aux antimicrobiens dans les pays à faible revenu avec des taux de résistance élevés et de faibles fonds de santé publique. Cette approche globale peut non seulement aider les pays respectifs, mais cela pourrait également profiter à d'autres en réduisant la propagation internationale des gènes de résistance. »

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