PLOS ONE: single nucleotide polymorphisms av One-kolmetabolism och cancer i matstrupe, magsäck och lever i en kinesisk Population

Abstrakt

En kolmetabolism (folatmetabolismen) anses viktigt i cancer på grund av sitt engagemang i DNA-syntes och biologiska metyleringsreaktioner. Vi undersökte de sammanslutningar av single nucleotide polymorphisms (SNP) i folat metaboliseringsväg och risken för tre GI cancer i en populationsbaserad fallkontrollstudie i Taixing City, Kina, med 218 matstrupscancer fall 206 magcancer fall 204 lever cancerfall, och 415 friska befolkningskontroll. Deltagarna i studien intervjuades med ett standardiserat frågeformulär, och blodprover samlades in efter intervjuerna. Vi genotypas SNP i MTHFR
, MTR
, MTRR
, DNMT1
och ALDH2
gener, med hjälp av PCR- RFLP, SNPlex eller TaqMan-analyser. Redogöra för multipla jämförelser och minska risken för falska rapporter, använde vi semi-Bayes (SB) krympning analys. Efter krympning och justering för potentiella felkällor, fann vi positiva associationer mellan MTHFR
rs1801133 och magcancer (alla T kontra C /C, SB odds ratio [sbor]: 1,79, 95% bakre gränser: 1,18, 2,71) och levercancer (sbor: 1,51, 95% bakre gränser: 0,98, 2,32). Det fanns ett omvänt samband mellan DNMT1
rs2228612 och matstrupscancer (alla G mot A /A, sbor: 0,60, 95% bakre Gränser: 0,39, 0,94). Dessutom upptäckte vi potentiella heterogenitet över alkoholens status för de yttersta randområdena som rör MTRR
rs1801394 till matstrupen (bakre homogenitet P
= 0,005) och magcancer (bakre homogenitet P
= 0,004), och de yttersta randområdena som rör MTR
rs1805087 till levercancer (bakre homogenitet P
= 0,021). Bland icke-alkoholkonsumenter, var varianten allelen (allel G) av dessa två SNP omvänt samband med risken för dessa cancerformer; medan ett positivt samband observerades bland allt alkoholkonsumenter. Våra resultat tyder på att genetiska polymorfismer relaterade till en-kol-metabolism kan vara associerad med cancer i matstrupe, magsäck och lever. Heterogenitet över alkoholkonsumtion status sambandet mellan MTR
/ MTRR
polymorfism och dessa cancerformer indikerar potentiella interaktioner mellan alkoholdrickande och en kol metaboliska vägen

Citation. Chang SC, Chang PY, Butler B, Goldstein BY, Mu L, Cai L, et al. (2014) single nucleotide polymorphisms av One-Carbon Metabolism och cancer i matstrupe, magsäck och lever i en kinesiska befolkningen. PLoS ONE 9 (10): e109235. doi: 10.1371 /journal.pone.0109235

Redaktör: Nathan A. Ellis, University of Arizona, USA

Mottagna: 5 februari 2014. Accepteras: 9 september 2014. Publicerad: 22 oktober 2014

Copyright: © 2014 Chang et al. Detta är en öppen tillgång artikel distribueras enligt villkoren i Creative Commons Attribution License, som tillåter obegränsad användning, distribution och reproduktion i alla medier, förutsatt den ursprungliga författaren och källan kredit

Finansiering:. Detta arbete stöds delvis av den internationella unionen mot cancer (UICC) Technology Transfer gemenskap (ICRETT) tilldelas Li-Na Mu och Stiftelsen för författare National Excellent Doktorsavhandling PR Kina, nr 200.157, tilldelas Dr . Lin Cai. Studien också delvis stöd av NIH National Institute of Environmental Health Sciences, National Cancer Institute, Department of Health and Human Services, beviljar ES06718, ES 011.667, CA09142, liksom Alper Research Program of Environmental Genomics av ​​UCLA Jonsson Omfattande cancer Center och UCLA Clinical nutrition Research Unit. Finansiärerna hade ingen roll i studiedesign, datainsamling och analys, beslut att publicera, eller beredning av manuskriptet

Konkurrerande intressen:.. Författarna har förklarat att inga konkurrerande intressen finns

Introduktion

Övre gastrointestinal (GI) cancer är huvudorsakerna till morbiditet och mortalitet över hela världen. Baserat på GLOBOCAN 2012 uppskattningar, mage, lever, och matstrupen cancer är den femte, sjätte och åttonde vanligaste cancer respektive med en global incidens på ca 2.189.829 nya cancerfall (15,5% av det totala) och 1,868,700 dödsfall (22,8 % av det totala) [1]. De flesta av dessa cancerfall (1,694,874 fall, 77,4%) förekommer i mindre utvecklade länder. Kina ensamt står för nästan hälften av alla tillbud GI cancer (1,023,072 fall, 46,7%) [1].

Fortsatt forskning om inblandning av single nucleotide polymorphisms (SNP) i etiologin av dessa tre övre GI cancer har varit givande. Av särskilt intresse är de SNP ligger inom gener som är involverade i folatmetabolism [2] - [4]. Folat bibehåller DNA-stabilitet genom att reglera DNA-biosyntes, DNA-reparation och DNA-metylering [5]. Neoplasmer kan utvecklas när denna väg är disregulated genom utarmning av mikronäringsämnen eller genom inkorporering av polymorfismer [5]. Flera enzymer är involverade i en-kol-metabolism, inklusive metylentetrahydrofolatreduktas (MTHFR), metionin-syntas (MTR), metionin-syntas-reduktas (MTRR), DNA-metyltransferaser (DNMTs), och mitokondrie aldehyddehydrogenas 2 (ALDH2). MTHFR, MTR, och MTRR är involverade i DNA-syntes, och genereringen av S-adenosylmetionin (SAM) -a universella metyl-donator för metylering reaktioner. DNMTs katalyserar DNA-metylering och replikera metyleringsmönster. ALDH2 ansvarar för metabolizing acetaldehyd som alstras under alkoholmetabolism. Alkohol och acetaldehyd kan hämma folat absorption och försämrar DNA-metylering [6].

Rollen av folat och en kolmetabolism i övre GI cancer är inte helt klarlagd. Djurstudier lämnat vissa bevis för en effekt av låga folatnivåer i oxidativ stress, DNA-metylering och hepatocarcinogenesis [7], [8]; medan hög folatintag kan öka den globala DNA-metylering och minska gastric cancerrisk [9], [10]. Epidemiologiska studier har visat att genetisk polymorfism av gener i ett kol metaboliseringsväg kan modulera risken för esofagus och magcancer [4]. Men publicerade resultaten inte är entydiga och begränsad i termer av antalet gener /polymorfismer undersöks. Eventuell ändring av närstående mikronäringsämnen och kända riskfaktorer har sällan undersökts. Därför, med tanke på vikten av en kolmetabolism i övre GI cancerutveckling, undersökte vi de associationer mellan åtta SNP i gener i ett kol metaboliska vägen och cancer i matstrupe, magsäck och lever i en kinesisk befolkning. Vi utvärderade även heterogenitet av organisationerna i olika skikt av plasmamikronäringsämnen (inklusive folat, vitamin B12, och totalt homocystein) och kända riskfaktorer för dessa cancerformer.

Material och metoder

Etik uttalande

Denna studie undantogs av Institutional Review board av University of California i Los Angeles (Certified undantagna 02-248).

Study Design och befolknings

En detaljerad beskrivning av studiedesign har tidigare publicerats [11], [12]. I korthet var detta en populationsbaserad fallkontrollstudie genomfördes i Taixing City, Jiangsu-provinsen, Kina. Stödberättigade fallen nydiagnostiserade patienter med patologiskt eller kliniskt bekräftad matstrupscancer (mellan den 1 juni och December 30, 2000), magcancer (mellan den 1 juni och December 30, 2000), och levercancer (mellan den 1 januari och 30 juni 2000) rapporteras till Taixing CDC Tumör registret. Andra inklusionskriterier inklusive är 20 år eller äldre, i stabil sjukdom som bestäms av en läkare, hemvist i Taixing i 10 år eller mer, och vilja att delta. Totalt 218 matstrupen cancerfall, 206 mage cancerfall och 204 levercancerfall deltog, vilket motsvarar 67, 65 och 57%, respektive, av alla nydiagnostiserade cancerpatienter.

Kontroller valdes slumpmässigt bland friska invånare om Taixing City med en 2:03 frekvensmatchningsgrad till den kombinerade individgrupp på fem år ålderskategorier (20-24 till 80-84), kön och hemvist (by på landsbygden township eller i en urban bostadshus i centrala Taixing Stad). Det finns 23 församlingar (landsbygdsområden) och en central stad (stadsområde) i Taixing City. Varje landsbygden township består av 10-12 byar, och den centrala tätorten består av 10-12 bostadshus. Andra inklusionskriterier var samma som de fallen. Totalt 464 möjliga kontroller närmade sig och 415 (89,4%) samtyckt att delta.

Epidemiologiska datainsamling

Alla rekryterade fall och kontroller avslutat ett standardiserat frågeformulär som administreras av utbildade intervjuare. Intervjuer ägde rum antingen på deltagarnas hem, på sjukhusen (för fall), eller i länet läkarmottagningen (för kontroller). Cancerfall var oftast intervjuades inom 6 månader efter diagnos. Frågeformuläret samlat in detaljerad information om demografiska faktorer, aktuell längd och vikt, kost historia, rökning historia, alkoholens historia, te dryckesvanor, arbetshistoria, familjehistoria av cancer, och fysisk aktivitet.

laboratorieanalyser

Varje studiedeltagare som en 5-ml prov av perifert blod efter sina intervjuer. DNA isolerades från blodproppar, med användning av fenol-kloroform-metoden. Hepatit B-virus ytantigen (HBsAg), IgG-antikroppar för hepatitis C-virus (HCV), och IgG-antikroppar för CagA- Helicobacter pylori
(H. pylori
) mättes med enzymkopplad immunsorbentanalys (ELISA) med användning av kit från reagens Company i Shanghai sjukhus för smittsamma sjukdomar (Shanghai, Kina), Shanghai Huamei Biological Company (Shanghai, Kina) och reagens Company i Shanghai Biotechnology Industry Park (Pudong, Shanghai, Kina), respektive. Plasma aflatoxin B1 (AFB1) -albumin addukt Nivåer bestämdes genom ELISA-analys, såsom beskrivits tidigare [13], med användning av fri aflatoxin (Supelco) för de aflatoxin standarder. En jämförelse mellan fria och bundna aflatoxin standarder visade en log-linjärt förhållande, vilket tillåter oss att uppskatta de absoluta värdena för proven. Plasma folat och vitamin B12-nivåer mättes med en konkurrenskraftig radioassay med jod 125-märkt folat och kobolt 57-märkt vitamin B12 som spårämnen (Quantaphase II B12 /folat radiobinding kit, Bio-Rad, CA). Plasma total homocystein (tHcy) mättes med hjälp av en kommersiellt tillgänglig kemiluminiscent immunsystemet (IMMULITE 1000 Automated Analyzer, DPC, Los Angeles, CA).

Vi valde åtta SNP från MTHFR
MTR
, MTRR
, DNMT1
och ALDH2
gener, som grundar sig på följande kriterier: 1) SNP som är funktionella eller potentiellt funktionella (SNP belägna i den kodande, 3'- och 5'-otranslaterade regioner); 2) SNP som tidigare rapporterats i samband med övre GI cancer; och 3) SNP med mindre allel frekvens av minst 5% i National Center for Biotechnology Information SNP databas. Genotypning utfördes med användning av TaqMan ( MTR
rs1805087, MTRR
rs1532268 /rs1801394, och ALDH2
rs886205) eller SNPlex ( DNMT1
rs2228612 och ALDH2
rs2238151) analys, såsom beskrivits tidigare (Applied Biosystems från Life Technologies, Foster City, CA) [14], eller PCR-RFLP-analys ( MTHFR
rs1801133 och ALDH2
rs671) ändras från tidigare publicerade metoder [15], [16]. Genotypning samtalspriser var över 97% för TaqMan och PCR-RFLP metoder, och över 80% för SNPlex analysen. Reproducerbarhet var 98% för SNPlex analys (3% slumpmässig duplikatprov) [17], och 100% för TaqMan analys (10% slumpvis dubbelprov).

Statistisk analys

Vi använde Pearsons chi-kvadrat-test för Hardy-Weinberg-jämvikt (HWE) för de fördelningar av genotyp frekvenser av de åtta SNP i enbart kontrollerna. Testning för HWE bland kontrollerna är ett vanligt använt preliminär kvalitetskontrollmetod i genetiska associationsstudier för att identifiera systematiska genotypning fel i obesläktade individer. Vi analyserade varje SNP-cancer förening enligt kodominant, log-linjär, dominant, och recessiva genetiska modeller, med hjälp av ovillkorliga logistiska regressionsmodeller för att beräkna oddskvoter (ORS) och 95% konfidensintervall (CIS). Modeller ingår åldersmatchade kategorier, kön, hemvist (stad /landsbygd), utbildning (analfabetism /grundskola /högre än mellanstadiet), body mass index (BMI, kontinuerlig), rökning pack-år (kontinuerliga), alkoholkonsumtion frekvens ( aldrig /ibland /ofta /varje dag), H. pylori
infektion (magcancer, negativ /positiv), HBsAg status (levercancer, negativa /positiva) och plasma AFB1-albumin additionsnivåer i kvintiler (levercancer, beräknas kvintilen: < 222,7, 222,7 till 344,2, 344.2- 442,6, 442,6 till 588,5, och > 588,5 fmol /mg). Att justera för resterande störande effekter från ålder, ingår vi också avvikelsen av varje persons ålder från medelåldern i varje ålderskategori [18]. Vi varnar för att ett antal justeringsvariabler kan påverkas av genetiska variationer, eftersom dessa variabler uppstår efteråt. I bästa fall våra beräkningar är för direkta genotyp effekter, och i övrigt kan vara över justeras eller förvirrad av okontrollerade faktorer som påverkar både justeringsvariabler och resultatet [19]. Således, vi kontrollerat uppskattningar för direkt genotyp effekter mot uppskattningar endast justeras för ålder och kön.

Vi genomförde ytterligare skiktade analyser för att kontrollera heterogenitet över strata av mikronäringsämnen eller påverkbara riskfaktorer, inklusive plasmamikronäringsämnen (folat, vitamin B12, och tHcy), rökning, alkoholkonsumtion, H. pylori
infektion (magcancer), HBsAg status (levercancer), och plasma AFB1 nivåer (levercancer). Vi använde beräknade median-nivåer i kontroller för att dichotomize plasmanivåer av folat (12,76 nmol /l), vitamin B12 (228,88 pmol /l), tHcy (9,5 | j, mol /l), och AFB1 (388,95 fmol /mg). Vi använde den dominerande genetisk modell, som antas att effekten av variant allelen är dominant om förhållandet mellan de yttersta randområdena jämföra variant allel homozygoter för heterozygoter var mindre än att jämföra heterozygoter på vanliga allel homozygoter; annars vi använde recessiv genetisk modell. Vi bedömde heterogenitet över strata med hjälp av sannolikheten kvotkriteriet genom att jämföra modeller med och utan produktmässigt.

För att minska riskerna för flera jämförelser artefakter och gles data partiskhet, använde vi en semi-Bayes (SB) krympning ( straffas-sannolikhet) för att uppskatta genotyp koefficienter [20]; oddsen utväxling beräkningar vi rapporterar är antilogs av dessa koefficienter. Krympning uppskattning har rekommenderats i stor utsträckning som ett alternativ överlägsen Bonferroni i den statistiska litteraturen för att eliminera flera test artefakter i jämförande studier [21] - [24]. I krympning uppskattning, i stället för att ändra alfanivå, regredierar vi ( "krympa") uppskattningarna mot noll till en grad som är proportionell mot den beräknade variationer och omvänt proportionell mot tidigare variationer v. Den tidigare variansen spelar en roll analog med den justerade α -nivån, i att mindre värden motsvarar strängare avslag /detektion kriterier med α = 0 och v = 0 är den undre gränsen för justering vid vilken blir omöjlig förkastande av noll. Den andra ytterligheten, sker ingen justering när det ursprungliga värdet av α eller en stor (i praktiken oändligt) värde för v.

I vår studie, tilldelas vi en tidigare variansen 0,50, och en tidigare median OR = 1 (ingen förening), vilket resulterar i en 95% före sannolikhet att hamna inom intervallet 0,25, 4. Detta drar de observerade föreningar mot noll till den grad som skulle uppstå om det hade funnits en tidigare null experiment observera 4 /v = 8 fall totalt och det hade slagits samman med de aktuella data [20], [25]. När olika stratum specifika SNP effekter tilläts, såsom i stratifierade analyser, var den tidigare variansen minskas till 0,25, vilket motsvarar en varians av 0,50 för koefficienten av stratum-SNP produkt (interaktion). För varje SB posterior uppskattning vi vidare ge riktnings (ensidiga) SB P-värden, som lika den bakre sannolikheten för att punktuppskattningen är på fel sida av noll enligt den anpassade modell och krympnings priors [26], [27].

för att sammanfatta de sammanslutningar av de 8 SNP för vart och ett av de tre övre GI cancer, konstruerade vi en polygenetisk risk poäng (PRS) [28]. PRS beräknades som den viktade summan av risken genotyp (under antingen dominant eller recessiv modell som i skiktade analyser) räknas, där vikten för varje SNP bestämdes av semi-Bayes log eller dess association med varje cancer i fullständigt justerade modell. PRS endast uppskattas bland dem med fullständiga genotypen uppgifter om alla de 8 SNP, som omfattar 126 matstrupen cancerfall, 125 magen cancerfall, 142 levercancer fall och 287 kontroller. Utbudet (max minus minimum) av PRS för varje cancer delades upp i tre lika åtskilda kategorier; dessa områden var 0,11-2,05 för matstrupscancer, 0-1,91 för magcancer, och 0-1,40 för levercancer. Dataanalyser genomfördes med hjälp av SAS 9.1.3 (SAS Institute, Cary, NC).

Resultat

Jämfört med befolkningskontroll, tenderade cancerfall att vara rökare, hade lägre BMI, och lägre utbildning nivåer (tabell 1). Esofagus och magen cancerfall var äldre än kontrollerna, medan levercancer fall var den yngsta. patienter levercancer hade den högsta manliga till kvinnliga förhållandet mellan 3,53 och var mest benägna att konsumera alkohol; esofagus cancerpatienter drack oftare än de andra cancerfall och kontroller i denna studie. För riskfaktorer som är specifika för varje cancerform, vi inte observera olika frekvens av H. pylori
infektion mellan patienter och kontroller magcancer. Jämfört med kontroller, patienter levercancer visade en högre andel av HBsAg positiva (65 jämfört med 25%), anti-HCV-positiva (9 jämfört med 3%), och hade högre plasma AFB1-albumin additionsnivåer (30 jämfört med 20% i 5 ^{th kvintilen) katalog}

Tabell 2 presenterar SB odds ratio uppskattningar (sbor) för varje SNP-cancer associering av de åtta SNP. Tabell S1, S2, S3, S4, S5, visar S6 skiktade föreningar och Figur 1 sammanfattar valda resultat. Genotyp fördelning bland kontrollerna verkade kompatibel med Hardy-Weinberg-jämvikt, med eventuellt undantag för DNMT1
rs2228612, som hade P
= 0,010, under den traditionella alfanivå på 0,05, men större än den Bonferroni- justerade alfanivå på 0,05 /8 = 0,006 (testa alla åtta SNP). Vi noterar dock att matcha maj partiskhet styr bort från jämvikt om de matchande faktorer är förknippade med både SNP och cancer.

Vi har tidigare rapporterat positiva associationer av T-allelen av MTHFR
rs1801133 med mage och levercancer [11], [12]. I denna analys, förblev dessa föreningar uppenbara efter confounder justering och SB krympning (alla T kontra C /C, fullständigt justerade sbor: 1.79, 95% bakre Gränser: 1,18, 2,71 för magcancer, sbor: 1,51, 95% bakre gränser: 0,98, 2,32 för levercancer). I skiktade SB analyser, sambandet mellan MTHFR
rs1801133 och magcancer verkade starkare bland individer som hade lägre plasma folatnivåer, högre plasma vitamin B12 eller tHcy nivåer, och bland rökare (Figur 1). Det fanns inget klart samband med MTHFR
rs1801133 med matstrupscancer (tabell 2 och tabellerna S1, S2, S3, S4, S5).

Även om det inte fanns någon tydlig helhets association mellan SNP i MTR Mössor och MTRR Mössor och någon cancer i huvudeffektanalyser (tabell 2), heterogenitet föreningsföreslogs i skiktade analyser av alkoholkonsumtionen, inklusive sammanslutningar av MTR
rs1805087 med levercancer (homogenitet P
= 0,021), och MTRR
rs1801394 med både matstrupen (homogenitet P
= 0,005) och magcancer (homogenitet P
= 0,004). Medan G allel bärare av MTR
rs1805087 var omvänt samband med levercancer hos icke-alkoholkonsumenter (sbor: 0,57, 95% bakre Gränser: 0,31, 1,04), var de positivt i samband med levercancer bland alkoholkonsumenter (sbor: 1,48, 95% bakre gränser~~POS=HEADCOMP: 0,85, 2,57) (Figur 1). På samma sätt, G allel-bärare av MTRR
rs1801394 var omvänt samband med matstrupen och magcancer bland icke-alkoholkonsumenter (sbor: 0,59, 95% bakre Gränser: 0,37, 0,94 för matstrupscancer, sbor: 0,49, 95% bakre gränser~~POS=HEADCOMP: 0,30, 0,79 för magcancer) men positivt i samband med cancer bland drinkers (sbor: 1,56, 95% bakre gränser~~POS=HEADCOMP: 0,95, 2,56 för matstrupscancer, sbor: 1,39, 95% bakre gränser~~POS=HEADCOMP: 0,83, 2,32 för magcancer) ( . Figur 1) katalog

för DNMT1
polymorfism var rs2228612 omvänt samband med matstrupscancer i den dominerande genetisk modell (alla G mot A /A, sbor: 0,60, 95% bakre gränser: 0,39 , 0,94) (tabell 2). Bland tre ALDH2
SNP, rs671 förknippades med matstrupscancer i den recessiva genetiska modellen (A /A mot någon G, sbor: 1,76, 95% bakre Gränser: 0,96, 3,24). I skiktade justerade analyser ALDH2
rs671 verkade i samband med matstrupscancer bland individer med lägre plasma folat nivåer (A /A kontra någon G, sbor: 2,12, 95% bakre Gränser: 1.01, 4.44) (Figur 1) . ALDH2
rs2238151 verkade omvänt samband med levercancer när man jämför T-allelen transportörer att de med C /C genotyp (ålder och kön justerad sbor: 0,47, 95% bakre Gränser: 0,24, 0,92). Även om vi inte hitta samband mellan ALDH2
rs886205 och cancerbenägenhet i huvudeffektanalyser, stratum specifika sbor föreslog att ALDH2
rs886205 positivt samband med magcancer bland deltagare med högre plasma vitamin B12 nivåer (sbor: 1,87, 95% bakre gränser~~POS=HEADCOMP: 1,09, 3,20) (Figur 1) katalog

med undantag för analys på enskilda SNP modeller, gjorde vi också gemensamma SNP analys genom att inkludera alla de 8 SNP i en modell. (tabell 3). Resultaten från gemensamma SNP analys föreslog liknande sammanslutningar som i de enskilda SNP-modeller, men 95% bakre intervall var bredare.

Analysen på PRS föreslog ungefär en fördubbling av oddsen för esofagus och levercancer bland individer i högsta PRS kategori jämfört med dem i den lägsta kategorin (sbor: 2,06; 95% bakre gränser: 1,13, 3,77 för matstrupscancer och sbor: 2,09, 95% bakre gränser~~POS=HEADCOMP: 1,05, 4,17 för levercancer), med något mindre konsekvens i kategorier för magcancer. I den kontinuerliga PRS analys föreslog resultaten en fördubbling av oddsen för dessa tre övre GI cancer med en enhet (i log OR) ökning av PRS (tabell 4). Vi varnar dock att PRS analyserar inte redogöra för resultatet konstruktion från data, och därmed kan överskatta effekterna och underskatta variationen i de resulterande beräkningarna.

Diskussion

Vi undersökte de associationer mellan åtta SNP i gener som är involverade i ett kol metaboliska vägen och känslighet matstrupen, magsäcken, och levercancer i en kinesisk befolkning. Efter applicering SB krympningsmetoder och styrning för potentiella confounders, observerade vi att någon T genotyp av MTHFR
rs1801133 positivt samband med både mage och levercancer. Vi fann också ett omvänt samband mellan varianten G-allelen i DNMT1
rs2228612 och matstrupscancer. Dessutom föreslog potentiella eller variationer över skikt av alkoholkonsumtion, inklusive sammanslutningar av MTRR
rs1801394 med matstrupen och magcancer, och MTR
rs1805087 med levercancer vår studie. Oddsen för övre GI cancer var ungefär fördubblats för kinesiska deltagare med en enhet (i log OR) ökning av PRS.

I en kolmetabolism, MTHFR katalyserar irreversibelt omvandlingen av 5,10-metylentetrahydrofolatreduktas (5, 10-methyleneTHF) till 5-metyltetrahydrofolat (5-methylTHF). Den 5,10-methyleneTHF är viktigt i purin och thymidilate syntes, och 5-methylTHF är en co-substrat för remetylering av homocystein till metionin, som är ytterligare omvandlas till SAM för metyleringsreaktioner [5]. MTHFR
C677T (rs1801133) polymorfism, som resulterar i en alanin till valin substitution, leder till minskad MTHFR enzymaktivitet [29], minskade 5-methylTHF och en ackumulering av 5,10-methyleneTHF i röda blodkroppar [30].

låg MTHFR aktivitet är förknippad med riskökningen cancer på grund av lågt blodtryck 5-methylTHF och nedsatt DNA-metylering. Omvänt kan det minska cancerrisken genom att öka tillgången på 5,10-methyleneTHF för normal DNA-syntes och förhindra uracil misincorporation och kromosomskada [5]. Även bevis till stöd för dessa hypoteser är svag och inkonsekvent [5], en föreslog in vitro
studie att effekten av MTHFR
rs1801133 på DNA stabilitet och metylering är platsspecifik och kan bero på folat tillgänglighet [31]. När folat utbudet är tillräckligt eller hög, T-allelen av MTHFR
är associerad med ökad genomisk DNA-metylering i tjocktarmscancerceller, men minskade DNA-metylering i bröstcancerceller. När folat utbudet är begränsat, är denna variant i samband med minskad och oförändrad DNA-metylering i kolon och bröstcancerceller, respektive [31]. Uracil misincorporation minskas i tjocktarmscancerceller som uttrycker MTHFR
T-allelen, och ökade i bröstcancerceller som uttrycker samma variant [31]. Denna platsspecifik skillnad kan delvis förklara skillnaden i cancerrisken i samband med MTHFR
rs1801133 polymorfism [4]. I epidemiologiska studier, verkar T-allelen för att minska risken av colorectal och bröstcancer [32], [33], men ökar risken för cancer i matstrupe, magsäck, lever, urinblåsa, cervix uteri, och lunga [2] - [4], [34] - [36]

i den aktuella analysen med hjälp av SB krympning, bekräftade vi våra tidigare resultaten av positiva associationer mellan T-allelen av MTHFR
rs1801133 och cancer i. magen och lever i denna Taixing population [11], [12], vilket innebär att störningen av DNA-metylering till följd av denna variant spelar en viktig roll i magen och levern cancer. Senaste metaanalyser rapporterat liknande föreningar (T /T mot C /C, OR: 1,40, 95% CI: 1,19-1,66 för magcancer, OR: 1,21, 95% CI: 0,95-1,56 för levercancer) [3], [4]. Dessutom Zacho et al. [4] rapporterade en större samband mellan MTHFR
rs1801133 och magcancer bland studiepopulationer utan folsyra befästning (OR: 1,60, 95% CI: 1,36-1,88), jämfört med de med berikning (OR: 1,15 95% CI: 0,81-1,63), som liknar vår upptäckt av en starkare förening mellan individer med lägre plasmafolatnivåer. För matstrupscancer, våra data antydde en ökad risk bland MTHFR
rs1801133 T-allelen bärare (alla T mot C /C, sbor: 1,25, 95% bakre Gränser: 0,85, 1,84), vilket överensstämmer med resultaten från en metaanalys av 19 studier (C /T mot C /C, OR: 1,47, 95% CI: 1,32-1,63; T /T mot C /C, OR: 1,69, 95% CI: 1,49-1,91) [ ,,,0],2].

MTR och MTRR är två andra viktiga enzymer som är involverade i en kolmetabolism. MTR katalyserar metyleringen av homocystein till metionin. MTR
A2756G (rs1805087), en gemensam SNP leder till substitutionen av asparaginsyra med glycin, har i hög grad studerats. Dock har inga uppenbara föreningar observerats med cancer på följande platser: lunga, prostata, huvud och hals, urinblåsa, matstrupe, magsäck, bröst, eller tjock- och ändtarms [37] - [46]. MTRR regenererar en funktionell MTR via reduktiv metylering. Två vanliga polymorfismer, MTRR
A66G (rs1801394 omvandlar isoleucin till metionin) och C524T (rs1532268 ändrar serin till leucin), har angivits för att regenerera MTR mindre effektivt [47]. G allel bärare av har MTRR
rs1801394 satts i samband med ökad risk för hepatocellulär cancer (HCC) [48]. Omvänt, föreningar är oförenliga med andra maligniteter, inklusive esofagus skivepitelcancer (ESCC), magcancer och kolorektal cancer [37], [44], [49] - [53]. De flesta studier som har undersökt MTRR
rs1532268 rapporterade inga associationer med kolorektal, gastrisk, bröst- och lungcancer [44], [51], [53] - [56]. Man bör komma ihåg dock att uppenbara inkonsekvenser och rapporter om ingen förening endast kan återspegla förväntade variationen i P
-värden ( "statistisk signifikans") snarare än några verkliga konflikter.

Vår studie observer odds-kvoten variation av sambanden mellan dessa MTR
/ MTRR
polymorfismer och övre GI cancer över alkoholkonsumtion, även efter konservativa SB krympning. Alkoholkonsumtionen verkade ha ändrat odds-kvoter som rör MTR
rs1805087 till levercancer, och MTRR
rs1801394 att matstrupen och magcancer. G allel bärare av dessa två SNP positivt i samband med cancer bland dricker, och omvänt samband med cancer bland icke-alkoholkonsumenter. . Matsuo et al, observerade en liknande eller variation [57]: G /G genotyp bärare av MTR
rs1805087 visade högre kolorektal cancer risk bland alkoholkonsumenter och lägre risk bland icke-alkoholkonsumenter. Även den funktionella effekten av MTR /mtrr
polymorphisms har inte fastställts, våra resultat är biologiskt rimligt eftersom alkohol kan störa en kolmetabolism genom att hämma folat absorption, undertrycka SAM syntes, och försämrar DNA-metylering [6]. Alkohol kan också orsaka hämning av metioninsyntetas aktivitet [6]. Därför är det möjligt att varianten allelen av dessa två MTR /mtrr
polymorphisms är skyddande för de övre GI cancer under miljön utan alkohol exponeringar. Men det blir skadlig när en kolmetabolism störs av alkohol och dess metaboliter.

ALDH2 är involverad i alkohol metabolism genom att oxidera acetaldehyd, en grupp 2B cancerframkallande för människor, till ättiksyra. ALDH2
rs671 polymorfism-en välkänd variant som sker uteslutande i asiatiska populationer-orsakar en lägre katalytisk effektivitet ALDH2, och därmed gör lägre förmåga att eliminera acetaldehyd [58]. ALDH2
rs671 En allel (långsam typ) har associerats med ökad risk för huvud- och halscancer, liksom matstrupscancer [59], [60]. I överensstämmelse med tidigare fynd, observerade vi ett positivt samband mellan A /A genotyp och matstrupscancer i denna studie, och vidare rapporterat en starkare förening mellan individer med lägre plasmafolatnivåer. Acetaldehyd stör också folatmetabolismen [6].

• PLOS ONE: Mage Virtual Icke-Enhanced CT med andra generationens Dual-Energy CT: en förstudie
• PLOS ONE: ljus- och elektronmikroskopi Europeiska Bäver (Castor fiber) Mage Reveal unika morfologiska egenskaper med möjlig allmän biologisk Significance