Финансирование:. Эта работа поддерживается частично Международным союзом против рака (UICC) передача технологии общения (ICRETT) присуждена доктору Ли-Na Му и Фондом Автор Национальной Excellent докторской диссертации по связям с общественностью Китая, № 200157, присужденной Dr . Lin Cai. Исследование было также частично поддержана NIH Национального института гигиены окружающей среды наук, Национальный институт рака, Департамент здравоохранения и социальных служб, предоставляет ES06718, ES 011667, CA09142, а также научно-исследовательскую программу Alper природообустройства геномики UCLA Jonsson Comprehensive Центр рака и клинических исследований пищеблока UCLA. Доноры не играет никакой роли в дизайн исследования, сбора и анализа данных, решение о публикации или подготовки рукописи
<р> Конкурирующие интересы:.. Авторы заявили, что не существует никаких конкурирующих интересов
Введение
<р> Верхняя желудочно-кишечного тракта (ЖКТ) рака являются основными причинами заболеваемости и смертности во всем мире. На основе GLOBOCAN 2012 оценки, желудка, печени и рака пищевода являются пятой, шестой и восьмой наиболее распространенных видов рака, соответственно, с глобальной частотой около 2189829 новых случаев рака (15,5% от общего количества) и 1,868,700 смертей (22,8 % от общего числа) [1]. Большинство этих случаев рака (1,694,874 случаев, 77,4%) происходят в менее развитых странах. Только в Китае приходится почти половина всех случаев рака инцидент GI (1,023,072 случаев, 46,7%) [1].
<р> Продолжение исследований относительно участия одиночных нуклеотидных полиморфизмов (SNP) в этиологии этих трех верхних рака GI есть было плодотворным. Особый интерес представляют ОНП, расположенные в пределах генов, вовлеченных в метаболизм фолиевой кислоты [2] - [4]. Фолиевая кислота сохраняет стабильность ДНК путем регуляции биосинтеза ДНК, репарации ДНК и ДНК-метилирования [5]. Опухоли могут развиваться, когда этот путь disregulated истощением питательных микроэлементов или путем включения полиморфизмов [5]. Некоторые ферменты участвуют в одноуглеродным обмене веществ, в том числе метилентетрагидрофолатредуктазы (MTHFR), метионинсинтетазы (МТР), метионинсинтетаза редуктазы (MTRR), метилтрансферазам ДНК (ДНК-метилтрансфераз), и митохондриальная альдегиддегидрогеназа 2 (ALDH2). МТГФР, ССО и MTRR участвуют в синтезе ДНК, и генерация S-аденозилметионин (SAM) -a универсального метил-донора для метилирования реакций. ДНК-метилтрансфераз катализирует метилирование ДНК и репликации модели метилирования. ALDH2 отвечает за метаболизировать ацетальдегида, генерируемого во время метаболизма алкоголя. Алкоголь и ацетальдегид может ингибировать поглощение фолиевой кислоты и ухудшают метилирование ДНК [6].
<Р> Роль фолиевой кислоты и одного углеродного метаболизма в верхних рака GI конца не изучен. Исследования на животных, при условии, некоторые доказательства для эффекта низких уровней фолата в окислительный стресс, метилирование ДНК и гепатоканцерогенезе [7], [8]; в то время как высокое потребление фолиевой кислоты может увеличить глобальное метилирование ДНК и снижают риск развития рака желудка [9], [10]. Эпидемиологические исследования показали, что генетические полиморфизмы генов в одноуглеродным пути метаболизма может модулировать риск развития пищевода и рака желудка [4]. Тем не менее, опубликованные результаты не являются окончательными и ограничены с точки зрения количества генов /полиморфизмов расследуются. Возможные модификации связанными микроэлементами и известных факторов риска редко были изучены. Поэтому, принимая во внимание важность одноуглеродным метаболизма в развитии рака верхней GI, мы исследовали ассоциации между восемью полиморфизмов в генах, в одноуглеродным метаболического пути и рака пищевода, желудка и печени в китайской популяции. Мы также оценили гетерогенность ассоциаций в разных слоях плазмы микроэлементов (в том числе фолиевой кислоты, витамина B12, а также общего гомоцистеина), а также известные факторы риска для этих видов рака.
Заявление по этике
<р> Это исследование было освобождаться этическими комитетами из Калифорнийского университета в Лос-Анджелесе (сертифицировано Освобожденный 02-248).
Дизайн исследования и населения
<р> подробное описание того дизайн исследования были опубликованы ранее [11], [12]. Если коротко, то это было исследование случай-контроль на основе населения проводилось в Taixing Город, провинция Цзянсу, Китай. Приемлемые случаи были вновь диагностированных пациентов с патологически или клинически подтвержденным раком пищевода (в период с 1 июня по 30 декабря 2000 г.), рак желудка (с 1 июня по 30 декабря 2000 года) рака печени, а также (в период с 1 января по 30 июня 2000 г.) сообщили в опухолевые реестра Taixing CDC. Другие критерии включения в том числе быть в возрасте 20 лет и старше, в стабильном состоянии здоровья, как определено врачом, по месту жительства в Taixing в течение 10 или более лет, и готовность участвовать. В общей сложности 218 случаев рака пищевода, 206 случаев рака желудка, а также 204 случаев рака печени участвовали, представляющих 67, 65 и 57%, соответственно, всех вновь выявленных больных раком.
Органы управления были выбраны случайным образом среди здоровых жителей из Taixing города с соотношением 2:03 частот согласования с объединенной группы по делу 5-летних возрастных категорий (20-24 до 80-84), пола и места жительства (деревня в сельской местности в поселке или в городском жилом квартале в центре Taixing Город). Есть 23 поселков (сельской местности) и один центральный город (городской округ) в Taixing города. Каждый сельский городок состоит из 10-12 деревень, а центральная городская территория состоит из 10-12 жилых домов. Другие критерии включения были такими же, как и случаев. В общей сложности 464 потенциальных управлений подошли, и 415 (89,4%) согласились принять участие.
Каждый участник исследования предоставил 5-мл периферической крови после того, как образец их интервью. ДНК выделяли из сгустков крови, используя метод фенол-хлороформ. Гепатит B поверхностный антиген вируса (HBsAg), IgG антитела к вирусу гепатита С (HCV), и IgG антитела к CagA- хеликобактерной Результаты Для DNMT1
(H. пилори
) измеряли методом ферментативного иммуноферментный анализ (ELISA) с использованием наборов из Reagent Company больницы Шанхай инфекционных заболеваний (Шанхай, Китай), Шанхай Huamei биологической Company (Шанхай, Китай), а также Reagent Company Шанхайской биотехнологии парка промышленности (Pudong, Шанхай, Китай), соответственно. Плазменный афлатоксина В1 уровни (AFB 1) -albumin аддукта определяли с помощью ELISA-анализа, как описано ранее [13], с использованием свободного афлатоксин (Supelco) для стандартов афлатоксина. Сравнение между свободными и связанными стандартами афлатоксина выявили взаимосвязь Логлинейный, что позволяет нам оценить абсолютные значения образцов. Плазменный фолиевой кислоты и уровни витамина B12 измеряли с помощью конкурентного ауторадиографическое исследование с йодом 125-меченого фолиевой кислоты и кобальта 57-меченого витамина B12 в качестве трассеров (фолат комплект radiobinding Quantaphase II B12 /, Bio-Rad, CA). общая гомоцистеина плазмы (гомоцистеина) были измерены с использованием коммерчески доступного хемилюминесцентной системы иммуноанализа (IMMULITE 1000 автоматический анализатор, DPC, Лос-Анджелес, Калифорния).
<р> Мы выбрали восемь SNPs из MTHFR
, MTR
, MTRR
, DNMT1
, и ALDH2
гены, основанные на следующих критериях: 1) ОНП, которые являются функциональными или потенциально функциональный (ОНП расположенные в кодировании, 3'-, и 5'-нетранслируемые области); 2) ОНП сообщалось ранее, связаны с верхними раки GI; и 3) ОНП с малой частотой аллеля, по меньшей мере, на 5% в Национальном центре биотехнологической информации базы данных SNP. Генотипирование проводили с использованием TaqMan ( MTR
rs1805087, MTRR
rs1532268 /rs1801394 и ALDH2
rs886205) или SNPlex ( DNMT1
rs2228612 и ALDH2
rs2238151) анализ, как описано ранее (Applied Biosystems от Life Technologies, Foster City, CA) [14], или анализ ПЦР-ПДРФ ( MTHFR
rs1801133 и ALDH2
rs671) изменен из ранее опубликованных методов [15], [16]. ставки генотипирование вызова были более 97% для TaqMan и ПЦР-ПДРФ методами, и более 80% для анализа SNPlex. Воспроизводимость составила 98% для SNPlex анализа (3% образцов случайным образом дубликатов) [17], и 100% для TaqMan анализа (10% образцов случайным образом дубликатов).
Статистический анализ
<р> Мы использовали критерий хи-квадрат Пирсона для Харди-Вайнберга (HWE) для распределений частот генотипов восьми ОНП только в контрольной группе. Тестирование HWE среди элементов управления является широко используемым предварительным методом контроля качества в генетических исследованиях ассоциации для выявления систематических ошибок генотипирования в неродственных индивидуумов. Мы проанализировали каждую ассоциацию SNP-рака под кодоминирует, Логлинейный, доминантная и рецессивных генетических моделей, используя безусловные модели логистической регрессии для расчета шансов (ОШ) и 95% доверительные интервалы (ДИ). Модели из подобранных по возрасту категории, пола, места проживания (город /село), образование (неграмотность /начальная школа /выше, чем средняя школа), индекс массы тела (ИМТ, непрерывный), курение вьючных лет (непрерывный), частота потребления алкоголя ( никогда /иногда /часто /каждый день), H. Pylori
инфекции (рак желудка, негатив /позитив), HBsAg статус (рак печени; отрицательные /положительные) и плазменные уровни аддукта AFB 1-альбумина в квинтилях (рак печени, по оценкам квентилю: &л; 222,7, 222.7-344.2, 344.2- 442,6, 442.6-588.5, и > 588,5 фмоль /мг). Для регулировки остаточных искажающих эффектов от возраста, мы также включили отклонение возраста каждого человека от среднего возраста в каждой возрастной категории [18]. Мы предупреждаем, что ряд переменных перестройки может зависеть от генетических вариаций, так как эти переменные происходят позже. В лучшем случае, наши оценки для прямого воздействия генотипа, а в противном случае могут быть чрезмерно настроенное или путает неконтролируемых факторов, которые влияют на обе переменные перестройки и результаты [19]. Таким образом, мы проверили оценки для прямого генотипов эффекта в отношении оценок регулируется только по возрасту и полу.
<Р> Кроме того, мы провели слоистые анализы для проверки гетерогенность по стратам микронутриентов или модифицируемых факторов риска, в том числе плазмы микронутриентов (фолиевой кислоты, витамина B12, и гомоцистеина), курение, употребление алкоголя, H. пилори
инфекции (рак желудка), HBsAg статус (рак печени), а плазменные уровни AFB 1 (рак печени). Мы использовали оцененные Средние уровни в контрольной группе до дихотомизации плазменные уровни фолиевой кислоты (12,76 нмоль /л), витамин В12 (228,88 пмоль /л), гомоцистеина (9,5 мкмоль /л), и количество AFB 1 (388,95 фмоль /мг). Мы использовали доминирующую генетическую модель, которая предполагается, что эффект варианта аллеля является доминирующим, если отношение ОШ сравнивающих вариантных аллеля гомозиготы к гетерозигот был меньше, чем у гетерозигот, сравнивающих к общим гомозигот аллеля; в противном случае мы использовали рецессивный генетическую модель. Мы оценивали гетерогенность по слоям с использованием отношения правдоподобия тестов путем сравнения моделей с точки зрения и без продуктов.
<Р> Для снижения рисков артефактов множественного сравнения и смещения разреженных данных, мы использовали полу-Байеса (SB) усадку ( нарушает правдоподобия) метод оценки коэффициентов генотипа [20]; оценки шансов, соотношение мы сообщаем являются antilogs этих коэффициентов. оценка усадка было рекомендовано широко, как альтернатива превосходит Бонферони в статистической литературе для устранения многократного тестирования артефактов в сравнительных исследованиях [21] - [24]. По оценке усадки, вместо того, чтобы изменить уровень альфа, мы регресс ( 'сжать') оценки к нулю до некоторой степени, пропорциональной их оценкам дисперсии и обратно пропорциональной предыдущих отклонений v. Настоятель дисперсия играет роль, аналогичную скорректированной α уровневый, в том, что меньшие значения соответствуют более жестким отвержение /обнаружения критериев, при а = 0 и v = 0 означает нижние пределы регулирования, при котором отклонение нуль становится невозможным. В другом крайнем случае, регулировка не происходит при использовании исходное значение альфа или огромным (фактически бесконечного) значения для V.
<Р> В нашем исследовании мы присвоили предварительное отклонение 0,50 и предварительное медиану OR = 1 (ни одна ассоциация), что приводит к 95% априорная вероятность попадания в интервал 0,25, 4. Это не тянет наблюдаемые ассоциации по направлению к нулевой до такой степени, что привело бы к окажись предыдущий нулевой эксперимент наблюдения 4 /V = 8 случаи, в общей сложности, и она была объединена с текущими данными [20], [25]. Когда отличаясь стратообразующий конкретных SNP эффекты были разрешены, например, в стратифицированных анализах, предшествующее дисперсия была уменьшена до 0,25, что соответствует дисперсии 0,50 для коэффициента продукта прослойка-SNP (взаимодействие). Для каждой оценки задней SB, мы дополнительно обеспечивают направления (односторонний) SB P-значения, которые равные апостериорной вероятности, что точечная оценка находится на неправильной стороне нуль при подобранной модели и усадки настоятели [26], [27].
<р> Резюмируя ассоциации 8 ОНП для каждого из трех верхних раков GI, мы построили полигенетической оценку риска (PRS) [28]. PRS была рассчитана как взвешенная сумма генотипа риска (при любом доминантных или рецессивных модели, как и в стратифицированных анализов) подсчитывает, где вес для каждого SNP определялось полуфинальном Байеса бревна или его ассоциации с каждым рака в полностью скорректирована модель. PRS была оценена только среди тех, с полными данными генотипа на всех 8 ОНП, которые включают в себя 126 случаев рака пищевода, 125 случаев рака желудка, 142 случаев рака печени, а также 287 управления. Диапазон (максимум минус минимум) PRS для каждого рака была разделена на три равноотстоящих категории; эти диапазоны были от 0,11 до 2,05 для рака пищевода, от 0 до 1,91 для рака желудка, и от 0 до 1,40 для рака печени. Анализ данных проводили с использованием SAS 9.1.3 (SAS Institute, Cary, NC).
<р> По сравнению с контрольной группой населения, случаи рака, как правило, курильщики, имели более низкий индекс массы тела, и более низкое образование уровни (таблица 1). Пищеводные и желудочные случаев заболевания раком были старше, чем у контрольных, в то время как случаи рака печени были самым молодым. больных раком печени имеет самое высокое отношение мужчины к женщине в 3.53, и, скорее всего, употреблять алкоголь; больных раком пищевода пили чаще, чем в других случаях рака и контроля в данном исследовании. Для факторов риска, характерных для каждого участка рака, мы не наблюдали, отличающуюся частоту H. пилори
инфекции между больных раком желудка и контрольной группы. По сравнению с контрольной группой, у больных раком печени показали более высокий процент HBsAg положительный (65 против 25%), анти-HCV положительные (9 против 3%), а также имели более высокие AFB 1-альбумин уровни аддукта в плазме (30 vs. 20% в 5 й квинтиль)
<р> в таблице 2 представлены оценки коэффициенты-соотношение SB (Sbor) для каждой ассоциации SNP рака из восьми ОНП. Таблица S1, S2, S3, S4, S5, S6 показывает слоистые ассоциации и рисунке 1 приведены отдельные результаты. Распределение генотипов в контрольной группе оказались совместимы с Харди-Вайнберга, за исключением, возможно, для DNMT1
rs2228612, которые были P
= 0,010, ниже традиционного уровня альфа 0,05, но больше, чем Bonferroni- скорректированный уровень альфа 0,05 /8 = 0,006 (тестирование всех восьми ОНП). Тем не менее, мы отмечаем, что соответствие может смещение контролирует от равновесия, если совпадающие факторы связаны с обоими ОНП и рак.
<Р> Ранее мы уже сообщали положительные ассоциации Т аллеля MTHFR
rs1801133 с желудка и рака печени [11], [12]. В настоящем анализе, эти ассоциации оставались очевидными после корректировки confounder и SB усадки (любой Т по сравнению с C /C, полностью скорректированной Sbor: 1,79, 95% Пределы задних: 1,18, 2,71 для рака желудка; Sbor: 1,51, 95% Пределы задних: 0,98, 2,32 для рака печени). В стратифицированной SB анализирует связь между MTHFR
rs1801133 и рак желудка появились сильнее среди людей, которые имели более низкие уровни в плазме фолиевой кислоты, более высокий витамина B12 в плазме или уровни гомоцистеина, и среди курильщиков (рисунок 1). Там не было четкой ассоциации MTHFR
rs1801133 с раком пищевода (таблица 2 и таблицы S1, S2, S3, S4, S5).
<Р> В то время как не было четкой общая связь между ОНП в MTR
и MTRR
и любой рак в основной эффект анализа (таблица 2), гетерогенность ассоциации было предложено в расслоённых анализы на употребление алкоголя, включая ассоциации MTR
rs1805087 с рак печени (гомогенность P
= 0,021), и MTRR
rs1801394 с обоими пищеводу (гомогенности P
= 0,005) и рак желудка (гомогенности P <бр> = 0,004). В то время как G аллеля носители MTR
rs1805087 были обратно связаны с раком печени среди трезвенников (Sbor: 0,57, 95% Пределы задних: 0,31, 1,04), они были положительно связаны с раком печени среди пьющих (Sbor: 1,48, 95% задние пределы: 0,85, 2,57) (рисунок 1). Точно так же, G аллеля носители MTRR
rs1801394 были обратно связаны с пищевода и раком желудка среди трезвенников (Sbor: 0,59, 95% пределы задних: 0,37, 0,94 рака пищевода; Sbor: 0,49, 95% задней ограничения: 0,30, 0,79 для рака желудка), но положительно связаны с раком среди пьющих (Sbor: 1,56, 95% пределы задних: 0,95, 2,56 для рака пищевода; Sbor: 1,39, 95% пределы задних: 0,83, 2,32 для рака желудка) ( . Рисунок 1)
полиморфизм, rs2228612 был обратно пропорционально связан с раком пищевода в доминирующей генетической модели (любой G по сравнению с A /A, Sbor: 0,60, 95% пределы задних: 0,39 , 0,94) (таблица 2). Среди трех ALDH2
ОНП, rs671 был связан с раком пищевода в рецессивной генетической модели (A /A против любого G, Sbor: 1,76, 95% пределы задних: 0.96, 3.24). В стратифицированных скорректированных анализов, ALDH2
rs671 появились связанные с раком пищевода среди лиц с уровнем ниже плазмы фолиевой кислоты (A /A в сравнении с любым G, Sbor: 2,12, 95% пределы задних: 1.01, 4.44) (рисунок 1) , В ALDH2
rs2238151 появился обратно пропорционально связан с раком печени при сравнении Т-носители аллели тем, с генотипом C /C (возраст и пол скорректированные Sbor: 0,47, 95% пределы задних: 0,24, 0,92). В то время как мы не нашли связи между ALDH2
rs886205 и рак восприимчивость в основной эффект анализа, прослойка конкретных Sbor предположил, что ALDH2
rs886205 был положительно связан с раком желудка среди участников с высшим витамина B12 в плазме уровни (Sbor: 1,87, 95% пределы задних: 1.09, 3.20) (рисунок 1)
<р> Кроме анализа на отдельных SNP моделей, мы также сделали совместный анализ полиморфизмов, включив все 8 ОНП в модели. (Таблица 3). Результаты совместного анализа полиморфизмов предложил подобные ассоциации, как и в отдельных моделях SNP, но интервалы задние 95% были шире.
<Р> Анализ на ССБ предложил примерно удвоение шансов для пищевода и печени рака среди лиц в высшей категории ССБ по сравнению с теми, в самой низкой категории (Sbor: 2,06; 95% пределы задних: 1,13, 3,77 рака пищевода и Sbor: 2,09, 95% предельных величин задних: 1,05, 4,17 для рака печени), с несколько меньшей согласованности между категориями для рака желудка. В непрерывном анализе ССБ, результаты предложили удвоить шансы для этих трех верхних раков GI с одной единицей (в журнал OR) увеличение ССБ (таблица 4). Мы предупреждаем, однако, что ССБ анализы не учитывают партитуры строительства из данных, и, таким образом, могут завышать эффекты и недооценивают изменчивость получаемых оценок.
Обсуждение
<р> Мы исследовали ассоциации между восемью ОНП в генах, участвующих в метаболическом пути, одноуглеродным и восприимчивостью пищевода, желудка и рака печени в китайской популяции. После применения методов усадки SB и контроля потенциальных вмешивающихся, мы наблюдали, что любая T генотип MTHFR
rs1801133 был положительно связан как с желудка и рака печени. Мы также обнаружили обратную связь между вариантом G аллеля DNMT1
rs2228612 и рака пищевода. Кроме того, наше исследование показало, потенциальные или колебания между слоями потребления алкоголя, в том числе ассоциации MTRR
rs1801394 с рака пищевода и желудка, а также <ет> MTR
rs1805087 с раком печени. Шансы для верхних раков GI были примерно в два раза для китайских участников с одной единицы (в журнале OR) увеличение ССБ.
<Р> В одноуглеродным метаболизма, MTHFR необратимо катализирует превращение 5,10-метилентетрагидрофолатредуктазы (5, 10-methyleneTHF) до 5-метилтетрагидрофолата (5-methylTHF). 5,10-methyleneTHF имеет важное значение в пуриновых и thymidilate синтеза, а также 5-methylTHF является совместным субстратом для remethylation гомоцистеина в метионин, который затем преобразуется в SAM для метилирования реакций [5]. MTHFR
C677T (rs1801133) полиморфизм, что приводит к аланина на валин замещение приводит к снижению активности фермента MTHFR [29], снижение 5-methylTHF и накопление 5,10-methyleneTHF в красных кровяных телец [30].
<р> Низкая MTHFR активность связана с риском увеличение рака из-за низкой крови 5-methylTHF и нарушение метилирования ДНК. С другой стороны, это может снизить риск развития рака за счет увеличения доступности 5,10-methyleneTHF для нормального синтеза ДНК и предотвращения урацил и хромосомной основанных на ошибке включени поломки [5]. Хотя доказательства в поддержку этих гипотез является слабой и непоследовательной [5], ап в пробирке
исследование показало, что эффект MTHFR
rs1801133 на стабильность ДНК и метилирования на конкретных участках и может зависеть на фолата доступности [31]. Когда фолата питания является адекватным или высоким, Т аллель MTHFR
связано с увеличением геномного метилирования ДНК в клетках рака толстой кишки, но уменьшились метилирование ДНК в клетках рака молочной железы. Когда фолата предложение ограничено, этот вариант связан со снижением и без изменений метилирования ДНК в толстой кишки и рака молочной железы клетки, соответственно [31]. Урацил основанных на ошибке включени уменьшается в клетках рака толстой кишки, выражающее MTHFR
аллель Т, и увеличение в клетках рака молочной железы, выражающее тот же вариант [31]. Этот сайт-специфические различия могут частично объяснить разницу в риске рака, связанного с MTHFR
rs1801133 полиморфизма [4]. В эпидемиологических исследованиях, Т аллеля, как представляется, уменьшить риск колоректального и рака молочной железы [32], [33], но повышает риск возникновения рака пищевода, желудка, печени, мочевого пузыря, шейки матки и легких [2] - [4], [34] - [36]
<р> В настоящем анализе с использованием SB усадку, мы подтвердили наши предыдущие выводы положительных ассоциаций между Т-аллеля MTHFR
rs1801133 и рака. желудок и печень в этой популяции Taixing [11], [12], подразумевая, что нарушение метилирования ДНК в результате этого варианта играет важную роль в желудке и печени канцерогенеза. Недавно проведенный мета-анализ сообщили аналогичные ассоциации (T /T по сравнению с C /C, OR: 1,40, 95% ДИ: 1.19-1.66 для рака желудка; ОР: 1,21, 95% ДИ: 0.95-1.56 для рака печени) [3], [4]. Кроме того, Zacho и др. [4] сообщили большую ассоциацию между MTHFR
rs1801133 и рака желудка среди исследуемых популяций без фортификации фолиевой кислоты (или: 1,60, 95% ДИ: 1.36-1.88), по сравнению с теми, с фортификации (ОР: 1,15 , 95% ДИ: 0.81-1.63), который похож на нашего нахождения более сильной ассоциации среди лиц с более низким уровнем фолиевой кислоты в плазме. Для рака пищевода, наши данные свидетельствуют о том повышенный риск среди MTHFR
rs1801133 аллеля Т (носители любого T по сравнению с C /C, Sbor: 1,25, 95% Пределы задних: 0,85, 1,84), что согласуется с результатами из мета-анализа 19 исследований (C /T по сравнению с C /C, или: 1,47, 95% ДИ: 1.32-1.63, T /T по сравнению с C /C, или: 1,69, 95% ДИ: 1.49-1.91) [ ,,,0],2].
<р> MTR и MTRR два других важных ферментов, участвующих в одноуглеродным обмене веществ. MTR катализирует метилирование гомоцистеина в метионин. MTR
A2756G (rs1805087), общий СНП приводит к замещению аспарагиновой кислоты с глицином, были в значительной степени изучены. Тем не менее, никаких явных ассоциаций не наблюдалось с раком на следующих сайтах: рак легких, предстательной железы, головы и шеи, мочевого пузыря, пищевода, желудка, молочной железы или толстой кишки и прямой кишки [37] - [46]. MTRR регенерирует функциональный MTR посредством восстановительного метилирования. Два общих полиморфизма, MTRR
A66G (rs1801394, преобразует изолейцин в метионин) и C524T (rs1532268, изменяет серин лейцин), было показано менее эффективно регенерировать ССО [47]. G аллеля носители MTRR
rs1801394 были связаны с повышенным риском развития гепатоцеллюлярной карциномы (ГЦК) [48]. И наоборот, ассоциации несовместимы с другими, в том числе злокачественных опухолей пищевода плоскоклеточный рак (ККЭС), рак желудка и толстой кишки [37], [44], [49] - [53]. Большинство исследований, изучавших MTRR
rs1532268 сообщили об отсутствии ассоциации с колоректальным, желудка, молочной железы и рака легких [44], [51], [53] - [56]. Следует иметь в виду, однако, что очевидные несоответствия и доклады не ассоциации могут только отражать ожидаемую вариацию P
-значения ( "статистической значимости"), а не каких-либо реальных конфликтов.
<Р> Наше исследование наблюдается изменение шансов-отношение ассоциаций между этими MTR
/ MTRR
полиморфизмов и верхних раков GI через потребление алкоголя, даже после того, как консервативное SB усадка. Потребление алкоголя, как представляется, модифицированные вероятным отношения, связанные MTR
rs1805087 к раку печени, а также MTRR
rs1801394 для рака пищевода и желудка. G аллеля носителей этих двух полиморфизмов были положительно связаны с раком среди пьющих, и обратно связано с раком среди трезвенников. . Мацуо и др, наблюдали аналогичные или вариации [57]: G /G генотипа носители MTR
rs1805087 показали более высокий риск развития рака ободочной и прямой кишки среди алкоголиков и более низкий риск среди трезвенников. Хотя функциональный эффект MTR /MTRR
полиморфизмы не было установлено, наши результаты являются биологически правдоподобным, как алкоголь может нарушить один углеродный метаболизм путем ингибирования абсорбции фолиевой кислоты, подавляет синтез SAM, и ухудшая метилирование ДНК [6]. Алкоголь может также вызывать ингибирование активности метионин-синтазы [6]. Поэтому, возможно, что вариант аллели этих двух <ЕМ> MTR /MTRR
полиморфизма является защитным для верхних видов рака GI в среде без алкоголя воздействий. Тем не менее, он становится вредным, когда один углеродный метаболизм нарушается алкоголя и его метаболитов.
<Р> ALDH2 участвует в метаболизме спирта путем окисления ацетальдегида, группа 2B канцероген для человека, в уксусной кислоте. ALDH2
rs671 полиморфизм-известный вариант, который происходит исключительно в азиатских популяциях, вызывает более низкую каталитическую эффективность ALDH2, и, следовательно, делает более низкую способность устранить ацетальдегид [58]. ALDH2
rs671 аллель (медленный тип) был связан с повышенным риском развития рака головы и шеи, а также рака пищевода [59], [60]. В соответствии с предыдущими результатами, мы наблюдали положительную связь между A /A генотипа и рака пищевода в данном исследовании, и далее сообщали более сильную ассоциацию среди лиц с более низким уровнем фолиевой кислоты в плазме. Ацетальдегид также препятствует метаболизм фолиевой кислоты [6].
Оральный секс может вызвать бактериальный вагиноз
Миграция влияет на микробиоту кишечника, что, в свою очередь, влияет на здоровье.
Западная диета может увеличить риск «смертельного сепсиса»,
Мужчины, которые едят йогурт два раза в неделю, реже заболевают раком кишечника.
Риск рака пищевода можно снизить с помощью эзомепразола и аспирина в низких дозах.
Микробы кишечника ос помогают бороться с пестицидами
Микробиом спермы выявлен с помощью секвенирования РНК
Новое исследование сообщает о первом подробном описании микробиома спермы человека. с использованием новейших методов секвенирования РНК, которые позволяют различать РНК сперматозоидов и РНК бактериал
Люди против вирусов - сможем ли мы избежать исчезновения в ближайшем будущем?
Эксперт утверждает, что антропогенные изменения окружающей среды могут привести к появлению болезнетворных микроорганизмов, не только извне, но и из нашего собственного микробиома, которые могут проло
Как факторы хозяина, такие как микробиом легких, помогают при инфекции SARS ‐ CoV ‐ 2?
Коронавирус 2 (SARS-CoV-2) тяжелого острого респираторного синдрома - это РНК-вирус, который принадлежит к роду Coronaviridae и подроду бета-коронавируса. Это новый и очень заразный патоген, ответстве