Diagnostiska tester är fortfarande ett avgörande verktyg i kampen mot COVID-19-pandemin. Standardtester för detektion av SARS-CoV-2 involverar förstärkning av viralt RNA till detekterbara nivåer med användning av en teknik som kallas kvantitativ omvänd transkription PCR (RT-qPCR). Men först, RNA måste extraheras från provet. Tillverkare av RNA-extraktionssatser har haft svårt att hänga med i efterfrågan under COVID-19-pandemin, hindrar testkapacitet över hela världen. Med nya virusvarianter som dyker upp, behovet av bättre, snabbare test är större än någonsin.
Ett team under ledning av Robert B. Hufnagel, M.D., Ph.D., chef för NEI Medical Genetics and Ophthalmic Genomic Unit, och Bin Guan, Ph.D., en stipendiat vid Ophthalmic Genomics Laboratory på NEI, använde ett kelateringsmedel tillverkat av laboratorieförsörjningsföretaget Bio-Rad kallat Chelex 100-harts för att bevara SARS-CoV-2 RNA i prover för detektion med RT-qPCR.
"Vi använde nasofaryngeala och salivprover med olika virionkoncentrationer för att utvärdera om de kunde användas för direkt RNA -detektion, "sa Guan, huvudförfattare till en rapport om tekniken, som publicerades i veckan i iScience. "Svaret var ja, med markant hög känslighet. Också, detta preparat inaktiverade viruset, vilket gör det säkrare för laboratoriepersonal att hantera positiva prover. "
Hufnagels team gjorde sin upptäckt genom att testa en mängd olika kemikalier med hjälp av syntetiska och humana prover för att identifiera dem som kan bevara RNA i prover med minimal nedbrytning samtidigt som det möjliggör direkt detektion av viruset med RT-qPCR.
För att validera testet, NIDCR:s Blake M. Warner, D.D.S., Ph.D., M.P.H., och hans team samlade patientprover (på forskningsprotokoll NIH IRB 20-D-0094) och lagrade dem i antingen viraltransportmedium, eller den nyutvecklade chelateringshartsbufferten vid NIH Symptomatic Testing Facility.
Proverna i viraltransportmedia testades av testteamet COVID-19 vid NIH:s kliniska centrum, ledd av Karen M. Frank, M.D., Ph.D., med konventionell RNA-extraktion och RT-qPCR-testning. Proverna i chelateringshartsbufferten upphettades och viralt RNA var, sedan, testad med RT-qPCR. Det nya preparatet ökade avsevärt RNA -utbytet tillgängligt för testning, jämfört med standardmetoden.
Vi tror att denna nya metod har tydliga fördelar med att öka känsligheten, kostnads- och tidsbesparingar för testning. Metoden stabiliserar RNA vid rumstemperatur för enklare transport, lagring, och hantering i kliniska miljöer. "
Robert B. Hufnagel, M.D., Ph.D., Chef för NEI Medical Genetics and Ophthalmic Genomic Unit
NEI har skyddat den immateriella äganderätten kring denna teknik och söker partner för samutveckling/licensiering. Kontakta [email protected] för mer information ..
Esofageal cancerrisk kan minskas med esomeprazol och låg dos aspirin
COVID-19:Hur sjukdomen ser ut
Tarmbakteriell profil kan förutsäga tarmskador efter strålbehandling
Ny studie visar förbättrad överlevnad för patienter med avancerad kolorektal BRAF-mutant cancer
Studien beskriver den initiala baslinjen friska tarmmikrobiomdatabasen och överflödsprofilen
Lungmikrobiom förutspår allvarlighetsgraden av COVID-19
Sammansättning och struktur för nasofaryngeal mikrobiom relaterar till allvarlighetsgraden av COVID-19
Virusinfektioner är associerade med förändringar i övre luftvägarna/nasofaryngeal (NP) mikrobiomet. Dessutom, många studier antyder möjligheterna till superinfektioner på grund av undertryckt immunite
Patienter med IBS kan dra nytta av vitamin D -tillskott,
föreslår ny forskning Enligt en ny studie av forskare vid University of Sheffield, att ta vitamin D -tillskott kan hjälpa till att lindra de smärtsamma symptomen på Irritable Bowel Syndrome (IBS).
Svampar och bakterier i tarmen kan också påverka människors hälsa och sjukdomens svårighetsgrad
Tarmmikrobiomet har fått mycket uppmärksamhet, men ny forskning visar att svampar i tarmen också är en viktig mikroorganism för tarmens funktion och hälsa, som sedan påverkar människors hälsa.