Los científicos de los NIH desarrollan un nuevo método de preparación de muestras para detectar el SARS-CoV-2

Los científicos de los Institutos Nacionales de Salud (NIH) han desarrollado un nuevo método de preparación de muestras para detectar el SARS-CoV-2, el virus que causa COVID-19. El método evita la extracción del material de ARN genético del virus, simplificando la purificación de muestras y potencialmente reduciendo el tiempo y el costo de la prueba. El método es el resultado de una colaboración entre investigadores del National Eye Institute (NEI), el Centro Clínico de los NIH (CC), y el Instituto Nacional de Investigaciones Odontológicas y Craneofaciales (NIDCR).

Las pruebas de diagnóstico siguen siendo una herramienta crucial en la lucha contra la pandemia de COVID-19. Las pruebas estándar para la detección de SARS-CoV-2 implican amplificar el ARN viral a niveles detectables mediante una técnica llamada PCR cuantitativa de transcripción inversa (RT-qPCR). Pero primero, el ARN debe extraerse de la muestra. Los fabricantes de kits de extracción de ARN han tenido dificultades para satisfacer la demanda durante la pandemia de COVID-19, obstaculizando la capacidad de prueba en todo el mundo. Con la aparición de nuevas variantes de virus, la necesidad de algo mejor, las pruebas más rápidas son mayores que nunca.

Un equipo dirigido por Robert B. Hufnagel, MARYLAND., Doctor., jefe de la Unidad de Genética Médica y Genómica Oftalmológica del NEI, y Bin Guan, Doctor., miembro del Laboratorio de Genómica Oftalmológica de NEI, usó un agente quelante fabricado por la compañía de suministros de laboratorio Bio-Rad llamado resina Chelex 100 para preservar el ARN del SARS-CoV-2 en muestras para su detección por RT-qPCR.

"Usamos muestras nasofaríngeas y de saliva con varias concentraciones de virión para evaluar si podrían usarse para la detección directa de ARN, "dijo Guan, el autor principal de un informe sobre la técnica, que publicó esta semana en iScience. "La respuesta fue sí, con una sensibilidad marcadamente alta. También, esta preparación inactivó el virus, lo que hace que sea más seguro para el personal de laboratorio manipular muestras positivas ".

El equipo de Hufnagel hizo su descubrimiento probando una variedad de productos químicos utilizando muestras sintéticas y humanas para identificar aquellos que podrían preservar el ARN en muestras con una degradación mínima al tiempo que permiten la detección directa del virus mediante RT-qPCR.

Para validar la prueba, Blake M. Warner de NIDCR, D.D.S., Doctor., M.P.H., y su equipo recolectaron muestras de pacientes (en el Protocolo de Investigación NIH IRB 20-D-0094) y las almacenaron en medios de transporte viral, o el tampón de resina quelante recientemente desarrollado en la Instalación de Pruebas Sintomáticas de los NIH.

Las muestras en medios de transporte viral fueron analizadas por el equipo de pruebas de COVID-19 en el Centro Clínico de los NIH. dirigido por Karen M. Frank, MARYLAND., Doctor., utilizando extracción de ARN convencional y pruebas de RT-qPCR. Las muestras en el tampón de resina quelante se calentaron y el ARN viral fue, luego, probado por RT-qPCR. La nueva preparación aumentó significativamente el rendimiento de ARN disponible para las pruebas, en comparación con el método estándar.

Creemos que esta novedosa metodología tiene claros beneficios de aumentar la sensibilidad, Ahorro de tiempo y costes en las pruebas. El método estabiliza el ARN a temperatura ambiente para facilitar el transporte, almacenamiento, y manipulación en entornos clínicos ".

Robert B. Hufnagel, MARYLAND., Doctor., Jefe de la Unidad de Genética Médica y Genómica Oftalmológica del NEI

NEI ha protegido la propiedad intelectual en torno a esta tecnología y está buscando socios para el desarrollo conjunto / licencias. Comuníquese con [email protected] para obtener más información.

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