Navadna bakterija Escherichia coli (E. coli) , je del običajnega črevesnega mikrobioma pri živalih in ljudeh, redko povzroča težave, razen občasnega napada kratkotrajne driske. Vendar pa pod določenimi pogoji lahko postane škodljiv. V tem primeru lahko povzroči zastrupitev s hrano, okužbe sečil, ali pooperativne okužbe po kirurških posegih na črevesju. Približno 41. 000 primerov v Združenem kraljestvu, v letih 2017-18, to se je spremenilo v resno sepso z zastrupitvijo s krvjo (bakterije v krvnem obtoku, ali bakteremija), izdelovanje E. coli najpogostejši vzrok zastrupitve s krvjo v Angliji. V večini primerov je to nadaljevanje okužbe sečil. Približno 17% do 18% teh bolnikov umre.
Tridimenzionalna risba bakterije Escherichia coli - Avtor slike:Kateryna Kon / ShutterstockMnogi E. coli sevi, ki povzročajo bakteremijo, so v zadnjih dveh desetletjih postali odporni na antibiotike, tako pri živalih kot pri ljudeh. Najbolj zaskrbljujoči so tisti, ki kažejo aktivnost "razširjenega spektra beta-laktamaze" (ESBL). To se nanaša na prisotnost nekaterih encimov, ki uničujejo spojine, kot so penicilinski in cefalosporinski antibiotiki, ki imajo "beta-laktamsko" strukturo. Prisotnost ESBL je pogosto povezana z odpornostjo na druga pomembna zdravila, zaradi česar je te okužbe težko zdraviti. Po besedah Livermorea, "Približno 10 odstotkov primerov [zastrupitve s krvjo ali sepse] povzročajo zelo odporni sevi z ESBL."
Ne samo, da so tako odporne okužbe zaradi rodov ESBL vse pogostejše, povzročajo pa skoraj dvojno smrtnost.
Do te študije, pot širjenja odpornih E. coli okužba ni bila znana - ali se prenaša s hrano, ki vsebuje organizme, ali od ene okužene osebe do druge?
Študij
Če želite najti odgovor, raziskovalci so izvedli sekvenciranje genoma več E. coli sevi, pridobljeni iz številnih virov - iz vzorcev krvi, odvzetih pri bolnikih z bakteriemijo, človeški iztrebki, odplake iz človeških bivališč, živalska gnojevka ali odpadna voda iz bivališč živali, različne vrste mesa, pa tudi surovo sadje in zelenjava. Vzorce so odvzeli v obdobju od avgusta 2013 do decembra 2014, z različnih lokacij v Veliki Britaniji.
Raziskovalci so ugotovili ESBL- E. coli v 90% kultur, prejetih iz vzorcev krvi. Približno 11% vzorcev človeškega blata je vsebovalo ESBL- E. coli , in 65% vzorcev piščancev na drobno. Brez ESBL- E. coli najdemo v sadju ali zelenjavi in le nekaj drugih vzorcih mesa.
Na njihovo presenečenje, ugotovili so, da je med vsemi sevi pozitivnimi na ESBL iz človeških vzorcev prevladoval en sev-iztrebki, odplak in krvi. To je bil sev ST131. Predstavljala je 64% E. coli izolati iz krvi, 36% iz blata, in 22% iz vzorcev odplak. Približno 9% blata E. coli izolati proizvedeni ESBL.
Druge pogosto izolirane rodove v izolatih krvnega obtoka so vključevale ST38 in ST 648, pri čemer je CTX-M-15 najpogostejša varianta encimov ESBL med temi. ST38 je bil viden tudi v vzorcih iztrebkov in odplak.
V teh človeških vzorcih so bili tudi drugi podobni sevi. Vendar pa odpornih sevov E. coli iz mesa, predvsem iz piščanca, pa tudi iz gnojevke, ki vsebuje iztrebke živali in odplake, sledila drugačni sestavi. Namesto prevladujočega ST131 v vzorcih ljudi, za njih je bil značilen ST602, ST117 in ST23, pri čemer je encim ESBL večinoma CTX-M-1. ESBL- E. coli je bil prisoten le v 2% do 3% vzorcev govejega in svinjskega mesa.
Ugotovljeno je bilo, da je okužba pri ljudeh, ki jo predstavljajo iztrebki, izolati vzorcev odplak in krvi niso bili dolžni navzkrižne kontaminacije iz živalskega mesa ali odpadkov. Večina teh je bila posledica drugih rodov, zlasti ST131. Podobno, vzorci živalskega izvora so bili redki viri ESBL-povezanih s človekom E. coli .
Večina primerov zastrupitve s krvjo je sledila okužbam genitourinarnega trakta in prizadela bolnike s povprečno starostjo 70 let. isti ESBL- E. coli sevi prevladujejo v človeški krvi, iztrebki in odplake. Ni dokazov, da človeška okužba prihaja iz piščanca ali drugega mesa, saj te pretežno prikazujejo drugo E. coli rodov.
Raziskovalci ugotavljajo, da hrana ni primarni vir hudega in širjenja E. coli okužba pri ljudeh, temveč se organizem širi med samimi človeškimi bitji. Najverjetnejša pot je feko-oralna, ali z drugimi besedami, če si ljudje po umivanju stranišča ne umivajo rok pravilno, se organizem, ki se zadržuje na rokah, prenese na naslednji predmet, ki je z njimi v stiku.
Rešitev je preprosta in očitna:zagotovite dobro higieno stranišča, poskrbite, da bodo starejši bolniki dobro hidrirani, in poskrbite za urinske katetre, kjer se uporabljajo za preprečevanje okužb sečil, ter pravočasno in ustrezno zdraviti okužbe sečil, da preprečimo zastrupitev s krvjo. To bo ustavilo prenos s človeka na človeka, ki je odgovoren za večino ESBL- E. coli okužbe pri ljudeh. Sterilizacija prehranjevalne verige ni velika prednost pri doseganju nadzora nad tem prenosom, vendar bo okužbo v živalski populaciji ohranil v mejah.