La bactérie commune Escherichia coli (E. coli) , fait partie du microbiome intestinal normal chez les animaux et les humains, causant rarement des problèmes, à l'exception d'un épisode occasionnel de diarrhée de courte durée. Cependant, il peut devenir nocif dans certaines conditions. Dans une telle situation, il peut provoquer une intoxication alimentaire, infections des voies urinaires, ou des infections postopératoires à la suite d'interventions chirurgicales sur l'intestin. Vers 41, 000 cas au Royaume-Uni, en 2017-18, cela s'est transformé en septicémie grave avec empoisonnement du sang (bactéries dans le sang, ou bactériémie), fabrication E. coli la cause la plus fréquente d'empoisonnement du sang en Angleterre. Dans la plupart des cas, il s'agit d'une séquelle d'une infection des voies urinaires. Environ 17 à 18 % de ces patients décèdent.
Dessin tridimensionnel de la bactérie Escherichia coli - crédit d'image :Kateryna Kon/Shutterstock De nombreux E. coli les souches causant la bactériémie sont devenues résistantes aux antibiotiques au cours des deux dernières décennies, aussi bien chez les animaux que chez les humains. Les plus préoccupantes d'entre elles sont celles qui présentent une activité de « bêta-lactamase à spectre étendu » (BLSE). Cela fait référence à la présence de certaines enzymes qui détruisent des composés comme la pénicilline et les antibiotiques céphalosporines, qui ont une structure « bêta-lactame ». La présence de BLSE est souvent liée à la résistance à d'autres médicaments importants également, rendant ces infections difficiles à traiter. Selon Livermore, « Environ 10 % des cas [d'empoisonnement du sang ou de septicémie] sont causés par des souches hautement résistantes avec des BLSE. »
Non seulement ces infections résistantes dues aux lignées BLSE deviennent plus courantes, mais ils causent presque le double de la mortalité.
Jusqu'à cette étude, la voie de propagation des résistants E. coli l'infection était inconnue - est-elle transmise par des aliments contenant les organismes, ou d'une personne infectée à une autre ?
L'étude
Pour trouver la réponse, les chercheurs ont effectué le séquençage sur les génomes de plusieurs E. coli souches obtenues à partir d'un large éventail de sources - à partir d'échantillons de sang prélevés sur des patients humains atteints de bactériémie, des excréments humains, les eaux usées des habitations humaines, le lisier ou les eaux usées des habitations animales, différents types de viande, ainsi que des fruits et légumes crus. Ils ont prélevé des échantillons entre août 2013 et décembre 2014, de divers endroits au Royaume-Uni.
Les chercheurs ont trouvé ESBL- E. coli dans 90 % des cultures reçues à partir d'échantillons sanguins. Environ 11% des échantillons fécaux humains contenaient des BLSE- E. coli , et 65 % des échantillons de poulet au détail. Pas de BLSE- E. coli a été trouvé dans des fruits ou des légumes et seulement quelques autres échantillons de viande.
A leur grande surprise, ils ont constaté qu'une souche prédominait parmi toutes les souches BLSE positives des échantillons humains - les matières fécales, les eaux usées et le sang. Il s'agissait de la souche ST131. Il représentait 64 % de E. coli isole du sang, 36% des matières fécales, et 22% à partir d'échantillons d'égouts. Environ 9 % des matières fécales E. coli les isolats ont produit des BLSE.
D'autres lignées fréquemment isolées dans les isolats sanguins comprenaient ST38 et ST 648, avec CTX-M-15 étant la variante d'enzyme BLSE la plus courante parmi celles-ci. ST38 était également important dans les échantillons de matières fécales et d'égouts.
Il y avait aussi d'autres souches similaires dans ces échantillons humains. Cependant, les souches résistantes de E. coli de la viande, surtout du poulet, ainsi que du lisier contenant des excréments d'animaux et des eaux usées, suivi une composition de type différent. Au lieu du ST131 dominant dans les échantillons humains, ceux-ci ont été caractérisés par ST602, ST117 et ST23, l'enzyme ESBL étant principalement CTX-M-1. ESBL- E. coli n'était présent que dans 2 à 3 % des échantillons de bœuf et de porc.
La conclusion était que l'infection humaine représentée par les matières fécales, les isolats d'égouts et d'échantillons de sang ne devaient pas grand-chose à la contamination croisée par la viande ou les déchets d'animaux. La plupart d'entre eux étaient dus à d'autres lignées, en particulier ST131. De la même manière, les échantillons d'origine animale étaient de rares sources de BLSE associées à l'homme. E. coli .
La plupart des cas d'empoisonnement du sang faisaient suite à des infections de l'appareil génito-urinaire et concernaient des patients âgés en moyenne de 70 ans. le même ESBL- E. coli souches prédominantes dans le sang humain, les matières fécales et les eaux usées. Il n'y a aucune preuve que l'infection humaine provienne du poulet ou d'autres viandes, car ceux-ci montrent principalement d'autres E. coli lignées.
Les chercheurs concluent que la nourriture n'est pas la principale source de maladies graves et de propagation E. coli infection chez l'homme, mais plutôt l'organisme se répand entre les êtres humains eux-mêmes. La voie la plus probable est féco-orale, ou en d'autres termes, le fait que les humains ne se lavent pas correctement les mains après avoir été aux toilettes conduit à ce que l'organisme s'attarde sur les mains pour être transmis au prochain objet mis en contact avec elles.
La solution est simple et évidente :assurer une bonne hygiène des toilettes, s'assurer que les patients âgés sont bien hydratés et prendre soin des sondes urinaires lorsqu'elles sont utilisées pour prévenir les infections urinaires, et traiter les infections urinaires rapidement et de manière adéquate pour prévenir l'empoisonnement du sang. Cela arrêtera la transmission interhumaine qui est responsable de la majorité des BLSE- E. coli infections chez l'homme. La stérilisation de la chaîne alimentaire n'est pas d'un grand intérêt pour maîtriser cette transmission, mais gardera l'infection au sein de la population animale dans les limites.
Problèmes de croissance chez les nouveau-nés prématurés associés à des bactéries intestinales altérées
Des scientifiques résolvent un mystérieux cas de syndrome de l'auto-brasserie
Les probiotiques peuvent offrir des avantages thérapeutiques pour les patients biopolaires
Diabète de type 1 lié au microbiome intestinal et à des facteurs génétiques
Une étude avec des jumeaux montre que les symptômes du COVID-19 ont une contribution génétique
Un nouveau récepteur de macrophages super-activant pourrait expliquer l'hyper-inflammation dans les cas graves de COVID-19
Des bactéries intestinales liées à des muscles plus forts chez les personnes âgées
Une nouvelle étude audacieuse suggère que la force musculaire chez les personnes âgées peut être plus élevée en raison de, en partie, mécanismes impliquant les bactéries intestinales. Les bactéries
Les régimes à base de plantes améliorent la santé cardiaque via le microbiome intestinal
Une nouvelle étude publiée en février 2020 dans le Journal de lAmerican College of Cardiology rapporte quune consommation réduite daliments dorigine animale et un régime alimentaire à base de plante
La moitié des médicaments utilisés endommagent les bactéries intestinales,
dit une nouvelle étude Une présentation saisissante à lUEG Week 2019, à Barcelone, révèle que le microbiome intestinal est à haut risque de dommages chaque fois que nous utilisons un médicament dun ou