Vrhunski mikrobiolog NAU se pridružuje Arizonski uniji za genomiko COVID-19

Raziskovalni inštitut za translacijsko genomiko (TGen), podružnica City of Hope, Inštitut za patogene in mikrobiome na Univerzi v Severni Arizoni ter Oddelek za ekologijo in evolucijsko biologijo na Univerzi v Arizoni sta ustanovila zvezo, namenjeno sledenju koronavirusa COVID-19, je bilo objavljeno danes.

Izkoriščanje moči najsodobnejše tehnologije in analize "velikih podatkov", raziskovalci na novo ustanovljeni univerzi za genomiko COVID-19 v Arizoni (ACGU) želijo bolje razumeti, kako se lahko razvija ta virus, kako se prenaša in kako se premika po splošni populaciji. Ta molekularni epidemiološki pristop združuje tradicionalne epidemiološke metode z evolucijskim modeliranjem, ki temelji na analizi genoma virusa z visoko ločljivostjo.

Znanstveniki ACGU bodo zaporedje vzorcev bolnikov s COVID-19 analizirali genetske kode virusa, sledite različnim sevom, pokaži, od kod izvira vsak vzorec, kjer je bil morda posredovan in - po možnosti - razkrije podrobnosti, ki bi lahko zagotovile kritične informacije za diagnostiko, tarče protivirusnih zdravil in razvoj cepiva.

Šele z uporabo genomskega zaporedja in naprednih analiz lahko začnemo v celoti razumeti to bolezen na molekularni ravni, išče ključe za odklepanje njegovih skrivnosti. Imamo možnost sekvenciranja genoma vsakega seva od vsakega bolnika - to je tisto, za kar si prizadevamo. "

David Engelthaler, So-direktor in izredni profesor oddelka za patogene in mikrobiome podjetja TGen, veja nalezljivih bolezni v Flagstaffu, znana kot TGen North

Engelthaler je nekdanji državni epidemiolog v Arizoni in državni koordinator za biološko obrambo. Prej je bil v Centrih za nadzor bolezni (CDC), in je vodil lokalne preiskave, nacionalne in mednarodne izbruhe bolezni že več kot 25 let, začenši z izbruhom hantavirusa v Arizoni 1993-94. Usklajeval bo genomsko zaporedje novega virusa SARS-CoV-2 novega ACGU, ki povzroča bolezen COVID-19.

Drugi soustanovitelji Unije sta dva vodilna znanstvenika nalezljivih bolezni v Arizoni:Paul Keim z Univerze v Severni Arizoni in Michael Worobey z Univerze v Arizoni.

Keim je svetovni strokovnjak za patogene, kot sta kuga in antraks. Sodeloval je s FBI -jem, da bi razkril primer "črk antraksa" po 11. septembru. V NAU, je regentov profesor biologije, ima Cowdenov obdarjeni stol za mikrobiologijo in je izvršni direktor Inštituta za patogene in mikrobiome (PMI). Je ugledni profesor na TGen, So-direktor TGen North in bo direktor ACGU.

"Genomske sekvence so idealne za porazdeljena znanstvena raziskovalna prizadevanja, Arizona Union pa se bo pri sledenju bolezni močno zanašala na nacionalne in svetovne študije. Kljub temu, ključno je, da se regionalni strokovnjaki vključijo v ta proces, da bi kar najbolje izkoristili državljane Arizone, "je rekel Keim.

Worobey je vodja Oddelka za ekologijo in evolucijsko biologijo Univerze v Arizoni, in je svetovno znan po svojem delu o virusnih pandemijah. Z uporabo genomske epidemiologije, dokončno je sledil izvoru in širjenju virusa HIV po vsem svetu ter ugotovil, zakaj je pandemija "španske gripe" leta 1918 ubila milijone mladih odraslih.

"Molekularna analiza virusov daje ključne nasvete o tem, kako se začnejo pandemije in kako se z njimi boriti, "je dejal Worobey." V ​​tem prizadevanju bomo izkoristili bogastvo talentov in infrastrukture Arizone. "

Genomska zveza Arizone COVID-19 je podobna drugim skupinam po vsem svetu, ki si prizadevajo za oporo v boju proti novemu koronavirusu. Hitra izmenjava podatkov in analiz je bila in še naprej je, kritičnega pomena za znanost, medicinsko in javnozdravstveno razumevanje pandemije. Ironično, prvi ameriški epicenter COVID-19, Seattle, je tudi dom za NextStrain, internetni dom za sledenje genoma tega in drugih patogenov.

Konzorcij znanstvenikov iz Arizone upa, da bo njihovo regionalno zaporedje ponudnikom zdravstvenih storitev v Arizoni in oblikovalcem javne politike dalo prednost pri odzivanju na to pandemijo.

Tako kot NextStrain, ACGU bo objavil svoje ugotovitve in jih odprto dal na voljo epidemiologom in virologom po vsem svetu.

• Nepravilno čiščenje celic med nevrološkim razvojem lahko povzroči vedenjske težave vse življenje
• Raziskovalci poudarjajo, kdaj je za zdravljenje GERB po endoskopiji potrebna antirefluksna operacija