Aproveitando o poder da tecnologia de ponta e da análise de "big data", pesquisadores da recém-formada Arizona COVID-19 Genomics Union (ACGU) buscam entender melhor como esse vírus pode estar evoluindo, como é transmitido e como se move pela população em geral. Esta abordagem epidemiológica molecular combina métodos tradicionais de epidemiologia com modelagem evolutiva baseada na análise de alta resolução do genoma do vírus.
Os cientistas da ACGU irão sequenciar amostras de pacientes com COVID-19 para analisar os códigos genéticos do vírus, rastrear suas diferentes linhagens, mostrar de onde cada amostra se origina, onde pode ter sido transmitido e - possivelmente - revelar detalhes que podem fornecer informações críticas para o diagnóstico, alvos de drogas antivirais e desenvolvimento de vacinas.
Somente usando o sequenciamento genômico e análises avançadas podemos começar a entender completamente esta doença a nível molecular, procurando por chaves para desvendar seus mistérios. Temos a capacidade de sequenciar o genoma de cada cepa de cada paciente - é para isso que estamos trabalhando. "
David Engelthaler, Co-Diretor e Professor Associado da Divisão de Patógenos e Microbiomas do TGen, o ramo de doenças infecciosas em Flagstaff conhecido como TGen North
Engelthaler é o ex-Epidemiologista Estadual e Coordenador Estadual de Biodefesa do Arizona. Ele trabalhou anteriormente no Centro de Controle de Doenças (CDC), e conduziu investigações de locais, surtos de doenças nacionais e internacionais por mais de 25 anos, começando com o surto de hantavírus do Arizona em 1993-94. Ele coordenará o novo sequenciamento genômico da ACGU do vírus SARS-CoV-2, que causa a doença COVID-19.
Os outros co-fundadores da Union são dois dos principais cientistas de doenças infecciosas do Arizona:Paul Keim da Northern Arizona University e Michael Worobey da University of Arizona
Keim é um especialista mundial em patógenos como a peste e o antraz. Ele trabalhou com o FBI para decifrar o caso das "cartas de antraz" após o 11 de setembro. Na NAU, ele é professor de biologia dos regentes, detém a Cátedra Cowden Endowed em Microbiologia e é Diretora Executiva do The Pathogen and Microbiome Institute (PMI). Ele é um distinto professor da TGen, Co-Diretor da TGen North e atuará como Diretor da ACGU.
“As sequências do genoma são ideais para esforços de pesquisa científica distribuídos e a União do Arizona dependerá fortemente de estudos nacionais e globais para rastrear a doença. é fundamental que os especialistas regionais se envolvam neste processo para maximizar os benefícios para os cidadãos do Arizona, "disse Keim.
Worobey é o chefe do Departamento de Ecologia e Biologia Evolutiva da Universidade do Arizona, e é mundialmente conhecido por seu trabalho sobre pandemias virais. Usando epidemiologia genômica, ele definitivamente rastreou as origens e a disseminação mundial do HIV e também determinou por que a pandemia de "influenza espanhola" de 1918 matou milhões de jovens adultos.
"A análise molecular de vírus fornece pistas cruciais sobre como as pandemias começam e como combatê-las, ", disse Worobey." Estaremos capitalizando a riqueza de talento e infraestrutura do Arizona neste empreendimento. "
A Arizona COVID-19 Genomics Union é semelhante a outros grupos em todo o mundo que estão trabalhando para ganhar uma posição na luta contra este novo coronavírus. O compartilhamento rápido de dados e análises tem sido, e continua a ser, crítico para o científico, compreensão médica e de saúde pública da pandemia. Ironicamente, o primeiro epicentro dos EUA de COVID-19, Seattle, também é o lar do NextStrain, a casa da Internet para rastreamento do genoma deste e de outros patógenos.
O consórcio de cientistas do Arizona espera que seu sequenciamento regional dê aos provedores de saúde do Arizona e aos formuladores de políticas públicas uma vantagem na resposta a esta pandemia.
Como NextStrain, A ACGU tornará suas descobertas públicas e abertamente disponíveis para epidemiologistas e virologistas em todo o mundo.
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