Utnytte kraften i den nyeste teknologien og analyse av "big data", forskere ved den nyopprettede Arizona COVID-19 Genomics Union (ACGU) søker å bedre forstå hvordan dette viruset kan utvikle seg, hvordan den overføres og hvordan den beveger seg gjennom befolkningen generelt. Denne molekylære epidemiologiske tilnærmingen kombinerer tradisjonelle epidemiologimetoder med evolusjonær modellering basert på høyoppløselig analyse av virusets genom.
ACGU-forskere vil sekvensere prøver fra COVID-19-pasienter for å analysere virusets genetiske koder, spore de forskjellige stammene, vise hvor hver prøve stammer fra, hvor den kan ha blitt overført og - muligens - avsløre detaljer som kan gi kritisk informasjon for diagnostikk, antivirale legemiddelmål og vaksineutvikling.
Bare ved å bruke genomisk sekvensering og avanserte analyser kan vi begynne å forstå denne sykdommen fullt ut på molekylært nivå, på jakt etter nøkler for å låse opp mysteriene. Vi har evnen til å sekvensere genomet til hver stamme fra hver pasient - det er det vi jobber mot. "
David Engelthaler, Meddirektør og førsteamanuensis i TGen's Pathogen and Microbiome Division, smittsomme grenen i Flagstaff kjent som TGen North
Engelthaler er Arizona tidligere statlige epidemiolog og statlige biologiske forsvarskoordinator. Han var tidligere hos Centers for Disease Control (CDC), og har ledet undersøkelser av lokale, nasjonale og internasjonale sykdomsutbrudd i over 25 år, starter med Arizona's hantavirusutbrudd 1993-94. Han vil koordinere den nye ACGUs genomiske sekvensering av SARS-CoV-2-viruset, som forårsaker COVID-19 sykdommen.
Unionens andre medstiftere er to av Arizona ledende forskere innen smittsom sykdom:Paul Keim fra Northern Arizona University og Michael Worobey fra University of Arizona
Keim er en verdensekspert innen patogener som pest og miltbrann. Han jobbet med FBI for å knekke saken "miltbrannbokstaver" i kjølvannet av 11. september. På NAU, han er professor i biologi, innehar Cowden Endowed Chair i mikrobiologi og er administrerende direktør for The Pathogen and Microbiome Institute (PMI). Han er en utmerket professor ved TGen, Meddirektør for TGen North og vil fungere som direktør for ACGU.
"Genomsekvenser er ideelle for distribuert vitenskapelig forskning, og Arizona Union vil stole sterkt på nasjonale og globale studier for å spore sykdommen. Likevel, det er kritisk at regionale eksperter engasjerer seg i denne prosessen for å maksimere fordelene for borgere i Arizona, "sa Keim.
Worobey er leder for Department of Ecology and Evolutionary Biology ved University of Arizona, og er verdenskjent for sitt arbeid med virale pandemier. Ved hjelp av genomisk epidemiologi, han har definitivt sporet opprinnelsen og verdensomspennende spredning av HIV og også bestemt hvorfor pandemien "spansk influensa" i 1918 drepte millioner av unge voksne.
"Molekylær analyse av virus gir viktige ledetråder om hvordan pandemier begynner og hvordan de kan bekjempes, "sa Worobey." Vi vil utnytte Arizona's rikdom av talent og infrastruktur i dette arbeidet. "
Arizona COVID-19 Genomics Union ligner andre grupper over hele verden som jobber for å få fotfeste i kampen mot dette nye koronaviruset. Rask deling av data og analyse har vært, og fortsetter å være, kritisk til vitenskapelig, medisinsk og folkehelseforståelse av pandemien. Ironisk, det første amerikanske episenteret av COVID-19, Seattle, er også hjemmet til NextStrain, internett -hjemmet for genomsporing av dette og andre patogener.
Konsortiet av forskere i Arizona håper at deres regionale sekvensering vil gi helsepersonell i Arizona og beslutningstakere i Arizona et forsprang på å svare på denne pandemien.
Som NextStrain, ACGU vil gjøre funnene offentlige og åpne for epidemiologer og virologer over hele verden.
Bestemmelse av syrenøytraliserende kapasitet for OTC-antacida
Stor studie finner at SARS-CoV-2 viral belastning er lavest hos barn
Forskere løser mystisk tilfelle av auto bryggerisyndrom
Ny superaktiverende makrofagreseptor kan forklare hyperinflammasjon ved alvorlig COVID-19
Menn som spiser yoghurt to ganger i uken er mindre sannsynlig å utvikle tarmkreft
Flått som nå bærer flere sykdommer,
Ultrafiolett B -lys er bra for tarmmikrobiomet
En liten studie publisert i tidsskriftet Grenser i immunologi 24. oktober, 2019, viser at eksponering for ultrafiolett B (UVB) lys, som vanligvis oppnås gjennom eksponering for sollys, kan utløse sp
Nytt verktøy registrerer og sporer mikrobiomvekst
I løpet av de siste årene, det menneskelige mikrobiomet har fått enorm popularitet på grunn av sin rolle i å forme ens helse. Det er avgjørende for menneskelig utvikling, ernæring, og immunitet. Derfo
Nytt verktøy for å tyde tarmmikrobiomet
De millioner av bakterier som bor i tarmen spiller en svært viktig rolle for helse og sykdom. Derimot, et konstant problem har vært mangel på forståelse av den faktiske sammensetningen av det sunne ta