Kihasználva a legmodernebb technológia és a "big data" elemzés erejét, az újonnan létrehozott Arizona COVID-19 Genomics Union (ACGU) kutatói arra törekednek, hogy jobban megértsék, hogyan fejlődhet ez a vírus, hogyan terjed, és hogyan terjed át a lakosság körében. Ez a molekuláris epidemiológiai megközelítés ötvözi a hagyományos járványügyi módszereket az evolúciós modellezéssel, amely a vírus genomjának nagy felbontású elemzésén alapul.
Az ACGU tudósai COVID-19 páciensekből származó mintákat soroznak fel, hogy elemezzék a vírus genetikai kódjait, kövesse nyomon különböző törzseit, mutassa be, hogy az egyes minták honnan származnak, ahol továbbították, és - esetleg - olyan részleteket tár fel, amelyek kritikus információkat nyújthatnak a diagnosztikához, vírusellenes gyógyszerek célpontjai és vakcinafejlesztés.
Csak a genomi szekvenálás és a fejlett elemzések segítségével kezdhetjük el teljesen megérteni ezt a betegséget molekuláris szinten, kulcsokat keres a rejtélyek feltárásához. Képesek vagyunk minden beteg minden törzsének genomját szekvenálni - erre törekszünk. "
David Engelthaler, Társigazgató és egyetemi docens a TGen Patogén és Mikrobiom osztályán, a fertőző betegség ága Flagstaffban, TGen North néven
Engelthaler Arizona korábbi állami epidemiológusa és állami biodefense koordinátora. Korábban a Centers for Disease Control (CDC) volt, és vezette a helyi vizsgálatokat, nemzeti és nemzetközi betegségkitörések több mint 25 éve, kezdve Arizona 1993-94-es hantavírus-járványával. Ő koordinálja az új ACGU SARS-CoV-2 vírus genomikus szekvenálását, ami a COVID-19 betegséget okozza.
Az Unió további társalapítói Arizona két vezető fertőző betegségekkel foglalkozó tudósa:Paul Keim az Észak-Arizonai Egyetemről és Michael Worobey az Arizonai Egyetemről
Keim világszerte szakértő az olyan kórokozókban, mint a pestis és a lépfene. Együttműködött az FBI -val, hogy feltörje a "lépfene betűk" ügyet szeptember 11 -e után. Az NAU -nál, a Regents biológia professzora, a Cowden -féle mikrobiológiai székkel rendelkezik, és a The Pathogen and Microbiome Institute (PMI) ügyvezető igazgatója. A TGen kiváló professzora, A TGen North társigazgatója, és az ACGU igazgatója lesz.
"A genomszekvenciák ideálisak az elosztott tudományos kutatási erőfeszítésekhez, és az Arizona Unió nagymértékben támaszkodik a nemzeti és globális vizsgálatokra a betegség nyomon követésére. Ennek ellenére, kulcsfontosságú, hogy a regionális szakértők vegyenek részt ebben a folyamatban, hogy maximalizálják az arizonai polgárok előnyeit, - mondta Keim.
Worobey az Arizonai Egyetem Ökológiai és Evolúciós Biológiai Tanszékének vezetője, és világhírű a vírusjárványokkal kapcsolatos munkájáról. A genomi epidemiológia segítségével véglegesen nyomon követte a HIV eredetét és világméretű terjedését, és azt is meghatározta, hogy az 1918 -as "spanyol influenza" világjárvány miért ölte meg a fiatal felnőttek millióit.
"A vírusok molekuláris elemzése kulcsfontosságú nyomokat ad arra vonatkozóan, hogyan kezdődnek a járványok, és hogyan lehet leküzdeni őket, - mondta Worobey. - Arizona tehetségének és infrastruktúrájának gazdagságát fogjuk kamatoztatni ebben a törekvésünkben.
Az Arizona COVID-19 Genomics Union hasonló a világ más csoportjaihoz, amelyek azon dolgoznak, hogy meg tudják szerezni a lábukat az új koronavírus elleni küzdelemben. Gyors adatmegosztás és elemzés történt, és továbbra is az, kritikus a tudomány számára, a járvány orvosi és közegészségügyi megértése. Ironikusan, a COVID-19 első amerikai epicentruma, Seattle, a NextStrain otthona is, az internet otthona ennek és más kórokozóknak a genomkövetésére.
Az arizonai tudósok konzorciuma reméli, hogy regionális szekvenálásuk előnyt biztosít Arizona egészségügyi szolgáltatóinak és közpolitikai döntéshozóinak a járvány kezelésében.
Mint a NextStrain, Az ACGU nyilvánosságra hozza és nyilvánosan hozzáférhetővé teszi világszerte az epidemiológusok és virológusok számára.
Allergia, amely a gyors ételfogyasztáshoz kapcsolódik,
A kutatók in vitro azonosítanak egy SARS-CoV-2 elleni aktivitással rendelkező baktériumot:Dolosigranulum pigrum
Az alacsony fermentált szénhidráttartalmú étrend javítja az IBD -ben szenvedő betegek életminőségét
A mikrobióma segíthet azonosítani a rák előtti kockázatot a HPV-ben szenvedő nőknél
Mi a helyzet a hepatitis C -vel?
A fekélyes vastagbélgyulladás biológiai terápiáira adott válasz lehetséges potenciális molekuláris előrejelzői
A tudósok megoldják az auto sörfőzde szindróma rejtélyes esetét
Kínai kutatók fontos felfedezést tettek, amely megmagyarázza egy 27 éves férfi zavaros esetét, aki korábban részeg volt anélkül, hogy ténylegesen alkoholt fogyasztott volna. Azt találták, hogy a mik
Az ételreakciókat a bél mikrobioma szabályozza,
új tanulmányra lel A héten közzétett tanulmányból kiderül, hogy a bélben lévő baktériumok (a bél mikrobiomja) és az általunk elfogyasztott élelmiszerek kölcsönhatása jelentősen eltér az egyének között
Új modell a hüvelyi mikrobiomátültetéshez
A bakteriális vaginosis olyan állapot, amely nők ezreit érinti világszerte, és nemcsak a hüvelyi tünetekkel, hanem a terhességgel kapcsolatos szövődményekkel is összefügg, beleértve a koraszülést és a