Aprovechando el poder de la tecnología de punta y el análisis de "macrodatos", Los investigadores de la recién formada Unión de Genómica COVID-19 de Arizona (ACGU) buscan comprender mejor cómo puede estar evolucionando este virus, cómo se transmite y cómo se transmite a través de la población en general. Este enfoque epidemiológico molecular combina métodos de epidemiología tradicionales con modelos evolutivos basados en análisis de alta resolución del genoma del virus.
Los científicos de ACGU secuenciarán muestras de pacientes con COVID-19 para analizar los códigos genéticos del virus, rastrear sus diferentes cepas, mostrar de dónde proviene cada muestra, dónde puede haber sido transmitido y, posiblemente, revelar detalles que podrían proporcionar información crítica para el diagnóstico, Dianas de fármacos antivirales y desarrollo de vacunas.
Solo mediante el uso de secuenciación genómica y análisis avanzados podemos comenzar a comprender completamente esta enfermedad a nivel molecular, buscando claves para desvelar sus misterios. Tenemos la capacidad de secuenciar el genoma de cada cepa de cada paciente, para eso estamos trabajando ".
David Engelthaler, Codirector y profesor asociado de la División de Patógenos y Microbiomas de TGen, la rama de enfermedades infecciosas en Flagstaff conocida como TGen North
Engelthaler es ex epidemiólogo estatal y coordinador estatal de biodefensa de Arizona. Anteriormente estuvo en los Centros para el Control de Enfermedades (CDC), y ha dirigido investigaciones de locales, brotes de enfermedades nacionales e internacionales durante más de 25 años, comenzando con el brote de hantavirus de 1993-94 en Arizona. Coordinará la secuenciación genómica del nuevo ACGU del virus SARS-CoV-2, que causa la enfermedad COVID-19.
Los otros cofundadores de la Unión son dos de los principales científicos de enfermedades infecciosas de Arizona:Paul Keim de la Universidad del Norte de Arizona y Michael Worobey de la Universidad de Arizona.
Keim es un experto mundial en patógenos como la peste y el ántrax. Trabajó con el FBI para resolver el caso de las "letras de ántrax" a raíz del 11 de septiembre. En NAU, es profesor de Biología de los Regentes, ocupa la cátedra Cowden Endowed en Microbiología y es Director Ejecutivo del Instituto de Patógenos y Microbiomas (PMI). Es profesor distinguido en TGen, Co-Director de TGen North y se desempeñará como Director de la ACGU.
"Las secuencias del genoma son ideales para los esfuerzos de investigación científica distribuida y la Unión de Arizona dependerá en gran medida de estudios nacionales y mundiales para rastrear la enfermedad. No obstante, Es fundamental que los expertos regionales participen en este proceso para maximizar los beneficios para los ciudadanos de Arizona, "dijo Keim.
Worobey es el director del Departamento de Ecología y Biología Evolutiva de la Universidad de Arizona, y es mundialmente conocido por su trabajo sobre pandemias virales. Usando epidemiología genómica, Definitivamente ha rastreado los orígenes y la propagación mundial del VIH y también ha determinado por qué la pandemia de "influenza española" de 1918 mató a millones de adultos jóvenes.
"El análisis molecular de los virus proporciona pistas cruciales sobre cómo comienzan las pandemias y cómo combatirlas, ", dijo Worobey." Aprovecharemos la riqueza de talento e infraestructura de Arizona en este esfuerzo ".
La Unión de Genómica de COVID-19 de Arizona es similar a otros grupos en todo el mundo que están trabajando para afianzarse en la lucha contra este nuevo coronavirus. El intercambio rápido de datos y análisis ha sido, y sigue siendo, crítico a científico, comprensión médica y de salud pública de la pandemia. Irónicamente, el primer epicentro estadounidense de COVID-19, Seattle, también es el hogar de NextStrain, el hogar de Internet para el seguimiento del genoma de este y otros patógenos.
El consorcio de científicos de Arizona espera que su secuencia regional les dé a los proveedores de atención médica de Arizona y a los encargados de formular políticas públicas una ventaja para responder a esta pandemia.
Como NextStrain, ACGU hará públicos sus hallazgos y estará disponible abiertamente para epidemiólogos y virólogos de todo el mundo.
Modificar genéticamente las bacterias intestinales reduce el riesgo de cáncer colorrectal en ratones, según un estudio
El microbioma intestinal y la EII:tal vez la conexión esté en la dieta, según un estudio
Diabetes tipo 1 relacionada con el microbioma intestinal y factores genéticos
La pérdida de microbioma por el uso de antibióticos afecta la respuesta a la vacuna contra la influenza
El microbioma intestinal cambia con la cocción de alimentos vegetales,
Los microbiomas de primates antiguos pueden proporcionar más información sobre el desarrollo humano
El microbioma intestinal no saludable reduce la poda sináptica del cerebro,
perjudica el aprendizaje Un nuevo estudio realizado por Weill Cornell Medicine y la Universidad de Cornell ha aportado más explicaciones sobre cómo los microbios intestinales se comunican con las neur
Los países con poblaciones de mayor edad tienen más infecciones y muertes por SARS-CoV-2,
dice estudiar Más de un año después de la pandemia de la enfermedad por coronavirus 2019 (COVID-19), causado por el síndrome respiratorio agudo severo coronavirus 2 (SARS-CoV-2), la diferencia en la g
La comida rápida puede ser uno de los principales culpables de la depresión adolescente
¿Por qué la depresión es un problema tan creciente entre los adolescentes en Estados Unidos? Una respuesta es el tipo de comida que comen, según un nuevo estudio realizado por investigadores de la Uni