Ploche ONE: chitinasa mRNA hladiny pomocou kvantitatívnej PCR s použitím jednotného štandardu DNA: Kyslý cicavcov chitinasa je hlavný Prepis v žalúdku Mouse

Abstraktné

chitinázy hydrolyzujú β-1-4 glykozidových väzieb z chitínu, hlavné štrukturálne zložku húb, kôrovcov a hmyzu. Hoci cicavce neprodukujú chitín alebo jeho syntázu, vyjadrujú dva aktívne chitináz, chitotriosidázu (Chit1) a kyslé chitinasy cicavčie (AMCase). Tieto cicavcov chitinázy priťahujú značnú pozornosť kvôli ich zvýšenej expresie u osôb s radom patologických stavov, vrátane Gaucherovej choroby, Alzheimerovej choroby a astmy. Avšak prínos týchto enzýmov k patofyziológii týchto chorôb zostáva určiť. Kvantifikácia úrovní Chit1 a AMCase mRNA a porovnanie týchto úrovní s úrovňou známych referenčných génov môže generovať užitočné a biomedically relevantné informácie. Na začiatku sme založili kvantitatívnej real-time PCR systém, ktorý používa štandardný DNA produkovanej ligácia fragmentov cDNA cieľových génov. Tento systém nám umožnila kvantifikovať a porovnanie hladín expresie chitinas a referenčné gény v rovnakej mierke. Zistili sme, že AMCase mRNA sa syntetizuje za mimoriadne vysokých hladinách v myši žalúdku. Výška tejto mRNA v žalúdku myší bolo 7- až 10-krát vyššie ako hladiny v domácnosti a génov bola porovnateľná s úroveň mRNA pre pepsinogénu C (progastricsin), hlavná súčasť žalúdočnej sliznice. Tak, AMCase mRNA je hlavný prepis v myší žalúdku, čo naznačuje, že AMCase funkcie ako tráviaci enzým, ktorý štiepi polymérne chitín a ako súčasť obrany hostiteľa proti patogénom chitínu obsahujúce v obsahu žalúdka. Naša metodika je použiteľná pre kvantifikáciu mRNA pre viac génov naprieč rôznymi vzormi za použitia rovnakého mierky

Citácia :. Ohno M, Tsuda K, M Sakaguchi, Sugahara Y, Oyama F (2012) chitinasa mRNA úrovne kvantitatívne PCR Použitie jednotného štandardu DNA: Kyslý cicavcov chitinasa je hlavný Prepis v žalúdku Mouse. PLoS One 7 (11): e50381. doi: 10,1371 /journal.pone.0050381

Editor: Dominik Hartl, University of Tübingen, Nemecko

• Ploche ONE: Analýza žalúdka a Gut Microbiomes východného ustrice (Crassostrea virginica) od pobrežia Louisiany, USA
• Ploche ONE: rastový faktor fibroblastov 10-rastový faktor fibroblastov receptor 2b signalizácie sprostredkovanej nie je vyžadované pre dospelých žalúdočných žliaz Homeostasis