Detekcia SARS-CoV-2 sa spája s prevalenciou vírusovej RNA u pacientov a nemocničného prostredia

Sledujúc dianie vo svete začiatkom roku 2020, Vedci Lekárskej fakulty Kalifornskej univerzity v San Diegu vedeli, že ich región pravdepodobne čoskoro postihne vlna pacientov s COVID-19, infekcia spôsobená koronavírusom SARS-CoV-2. Zaujímalo ich, ako vírus pretrváva na povrchoch, najmä v nemocniciach, a vedeli, že majú len malé časové okno, aby mohli začať, ak chceli zachytiť momentku situácie „pred“ -; pred prijatím pacientov s infekciou.

Po telefonáte v nedeľu neskoro večer, nasledujúci deň sa tím zhromaždil v nemocničnej hale, pripravený na výter.

Vo výslednej štúdii popísané 8. júna, 2021 palcov Mikrobiálna flóra , vedci predtým vymaľovali povrchy v pacientskej miestnosti, počas a po obsadení, a opakovane odoberali vzorky z kože, nosy a stolicu pacientov s COVID-19 a ich zdravotníckych pracovníkov v priebehu času. Spolu, počas dvoch mesiacov testovali 972 vzoriek spojených s hospitalizáciou na stopy SARS-CoV-2.

Aj keď sa zdá, že s týmto vírusom žijeme už nejaký čas, štúdium interakcií medzi SARS-CoV-2 a inými mikróbmi je stále nové, a stále máme veľa otázok. Čím viac vieme o tom, ako vírus interaguje so svojim prostredím, tým lepšie porozumieme tomu, ako sa prenáša a ako by sme mohli najlepšie narušiť prenos, aby sme predchádzali a liečili túto chorobu. “

Sarah Allard, PhD., spoluautor, asistent vedeckého projektu na UC San Diego School of Medicine a Scripps Institution of Oceanography

Ich zistenia:Vírus, alebo aspoň jeho genetický podpis, oplýva. Tím zistil vírus na podlahách vedľa postelí pacientov s COVID-19 (39 percent testovaných vzoriek), podlahy mimo izieb pre pacientov (29 percent) a povrchy vo vnútri miestností (16 percent). Detekcia SARS-CoV-2 bývala najvyššia počas prvých piatich dní po nástupe symptómov pacienta.

Vedci rýchlo poukazujú na to, že práve preto, že dokážu detekovať jedinečné genetické podpisy vírusu na povrchu, to neznamená, že vírus je schopný infikovať ľudí. Odkedy začali štúdium, bolo dobre zdokumentované, že SARS-CoV-2 sa šíri predovšetkým prostredníctvom blízkych ľudských interakcií, zatiaľ čo povrchový prenos je pravdepodobne veľmi zriedkavý. Čo je viac, žiadny zo zdravotníckych pracovníkov, ktorí sa aktívne starajú o pacientov v štúdii, nemal pozitívny test na vírus. Štúdia sa zamerala na jednu nemocnicu, Vedci však očakávajú, že podobné výsledky nájdu v akejkoľvek nemocnici ošetrujúcej pacientov s COVID-19.

„Je to obrovské na toľkých úrovniach, "povedal spoluautor Daniel Sweeney, MD, lekár kritickej starostlivosti a infekčných chorôb na UC San Diego Health. „Potrebujeme vedieť, či naše osobné ochranné prostriedky, OOP, je adekvátny, a našťastie teraz vieme, že veci ako masky, rukavice, šaty a štíty na tvár naozaj fungujú. Táto pandémia je globálnou katastrofou, ale mohlo to byť ešte horšie, keby sa naši zdravotnícki pracovníci nakazili, najmä ak sme nevedeli prečo. “

Vírusy sa zvyčajne nezdržiavajú samy. Či už na ľuďoch alebo povrchoch, sú súčasťou komplexných spoločenstiev známych ako mikrobiómy, ktoré môžu zahŕňať množstvo ďalších vírusov, baktérie a ďalšie mikróby. Pri pátraní po koronavíruse, tím zistil niečo iné:jeden konkrétny druh baktérií z rodu Rothia bol nájdený spolu so SARS-CoV-2 častejšie ako nie, bez ohľadu na miesto zberu. Inými slovami, prítomnosť Rothie silne predpovedala, že by tiež detegovali SARS-CoV-2 v tej istej vzorke.

„Prečo ten vzťah?“ spýtal sa Allard. „Pomáhajú baktérie vírusu prežiť, alebo naopak? Alebo je to len tým, že tieto baktérie sú spojené so základnými zdravotnými problémami, ktoré kladú na prvé miesto pacientov s vyšším rizikom závažného ochorenia COVID-19? To je oblasť pre budúci výskum. “

Štúdia bola od začiatku výzvou, a stalo sa ťažším, pretože nemocničná jednotka intenzívnej starostlivosti začala prijímať viac pacientov s COVID-19. Tím špeciálne navrhol svoj prístup s cieľom využiť existujúce zdroje tak, aby nestresovali dodávateľský reťazec potrebný na klinickú starostlivosť a testovanie. V samostatnom úsilí, niektorí z tímu a ich kolegovia vyvinuli alternatívne tampóny na výskumné účely. Zhromažďovali vzorky čo najrýchlejšie a najefektívnejšie, aby sa minimalizovalo narušenie starostlivosti o pacienta. Vzorky boli prevezené späť do laboratória v alkohole, uchovanie vírusu na analýzu, ale nevystavovanie výskumníkov aktívnym organizmom.

„Mnoho ľudí v posledných mesiacoch vykonalo veľa základného a klinického výskumu, a urobili sme to dobre, „Povedal Sweeney.“ Pridali sme do našej infraštruktúry. Získali sme skúsenosti. Dúfam, že rovnaký druh zamerania, elán a duch pokračujú v čomkoľvek, čo príde. “

• Systémové biomarkery ukazujú priaznivé účinky aeróbneho cvičenia na funkciu mozgu u starších dospelých
• Nos do mozgu:Nosová dodávka biofarmák do mozgu