Na een telefoontje laat op een zondagavond, een team verzamelde zich de volgende dag in de lobby van het ziekenhuis, klaar om uit te vegen.
In de resulterende studie beschreven op 8 juni 2021 in Microbioom , onderzoekers hebben eerder de oppervlakken van patiëntenkamers afgenomen, tijdens en na de bezetting, en herhaaldelijk verzamelde monsters van de huid, neuzen en ontlasting van COVID-19-patiënten en hun gezondheidswerkers in de loop van de tijd. In totaal, ze hebben gedurende twee maanden 972 ziekenhuisgerelateerde monsters getest op sporen van SARS-CoV-2.
Hoewel het voelt alsof we al heel lang met dit virus leven, de studie van de interacties tussen SARS-CoV-2 en andere microben is nog nieuw, en we hebben nog veel vragen. Hoe meer we weten over de interactie van een virus met zijn omgeving, hoe beter we kunnen begrijpen hoe het wordt overgedragen en hoe we de overdracht het beste kunnen verstoren om de ziekte te voorkomen en te behandelen."
Sara Allard, doctoraat, co-senior auteur, assistent-projectwetenschapper aan de UC San Diego School of Medicine en Scripps Institution of Oceanography
Hun bevindingen:het virus, of op zijn minst de genetische handtekening, in overvloed. Het team ontdekte het virus op de verdiepingen naast de bedden van patiënten met COVID-19 (39 procent van de geteste monsters), vloeren buiten de patiëntenkamers (29 procent) en oppervlakken binnen de kamers (16 procent). De detectie van SARS-CoV-2 was meestal het hoogst tijdens de eerste vijf dagen na het begin van de symptomen van een patiënt.
De onderzoekers wijzen er snel op dat alleen omdat ze de unieke genetische handtekeningen van het virus op een oppervlak kunnen detecteren, het betekent niet dat het virus mensen kan infecteren. Sinds ze met de studie begonnen, het is goed gedocumenteerd dat SARS-CoV-2 zich voornamelijk verspreidt door nauwe menselijke interacties, terwijl oppervlaktetransmissie waarschijnlijk zeer zeldzaam is. Bovendien, geen van de gezondheidswerkers die actief voor patiënten in de studie zorgden, testte positief op het virus. Het onderzoek richtte zich op één ziekenhuis, maar de onderzoekers verwachten dat ze vergelijkbare resultaten zouden vinden in elk ziekenhuis dat patiënten met COVID-19 behandelt.
"Dit is enorm op zoveel niveaus, " zei co-senior auteur Daniel Sweeney, MD, arts voor intensive care en infectieziekten bij UC San Diego Health. "We moeten weten of onze persoonlijke beschermingsmiddelen, PBM, voldoet, en gelukkig weten we nu dat dingen als maskers, handschoenen, toga's en gezichtsschermen werken echt. Deze pandemie is een wereldwijde ramp geweest, maar het had nog erger kunnen zijn als onze gezondheidswerkers besmet raakten, vooral als we niet wisten waarom."
Virussen hangen meestal niet alleen rond. Of het nu op mensen of oppervlakken is, ze maken deel uit van complexe gemeenschappen die bekend staan als microbiomen, die een verscheidenheid aan andere virussen kan bevatten, bacteriën en extra microben. Op zoek naar het coronavirus, het team ontdekte iets anders:een bepaald type bacterie uit het geslacht Rothia vaker wel dan niet naast SARS-CoV-2 werd gevonden, ongeacht de inzamelplaats. Met andere woorden, de aanwezigheid van Rothia voorspelde sterk dat ze ook SARS-CoV-2 in hetzelfde monster zouden detecteren.
"Waarom die relatie?" vroeg Allard. "Helpen de bacteriën het virus te overleven, of vice versa? Of is het gewoon dat deze bacteriën worden geassocieerd met de onderliggende medische aandoeningen waardoor patiënten in de eerste plaats een hoger risico lopen op ernstige COVID-19? Dat is een gebied voor toekomstig onderzoek."
De studie was vanaf het begin een uitdaging, en werd moeilijker naarmate de intensive care van het ziekenhuis meer patiënten met COVID-19 begon op te nemen. Het team heeft hun aanpak specifiek ontworpen om bestaande middelen te benutten om de toeleveringsketen die nodig is voor klinische zorg en testen niet te belasten. In een aparte poging een deel van het team en hun collega's ontwikkelden alternatieve swabs voor onderzoeksdoeleinden. Ze verzamelden zo snel en efficiënt mogelijk monsters om de verstoring van de patiëntenzorg tot een minimum te beperken. De monsters werden in alcohol terug naar het laboratorium vervoerd, het virus bewaren voor analyse, maar onderzoekers niet blootstellen aan actieve organismen.
"Veel mensen hebben de afgelopen maanden veel fundamenteel en klinisch onderzoek gedaan, en dat hebben we goed gedaan " Zei Sweeney. "We hebben onze infrastructuur uitgebreid. We hebben de ervaring opgedaan. Ik hoop dat dezelfde soort focus, drive en geest dragen voor in wat er daarna komt."
Onderzoekers gebruiken faagtherapie om alcoholische leverziekte met succes te behandelen
Bacteriën in het geboortekanaal gekoppeld aan een lager risico op eierstokkanker
Nieuwe strategie kan de darm-hersencommunicatie versterken
Langdurig gebruik van antibiotica bij prematuren bevordert resistente darmbacteriën
De helft van de gebruikte medicijnen beschadigt darmbacteriën,
Onderzoekers manipuleren bacteriesoorten in de darm met behulp van voeding
Microplastic voor het eerst ontdekt in menselijk afval
Uit een analyse van menselijke ontlastingsmonsters van deelnemers in acht landen is gebleken dat elk afzonderlijk getest monster microplastic bevatte en dat er tot negen verschillende soorten plastic
Darmmicrobioom verandert bij het koken van plantaardig voedsel,
zegt nieuwe studie Toen onderzoekers van UC San Francisco en Harvard samenwerkten om erachter te komen hoe het darmmicrobioom wordt beïnvloed door koken, ze ontdekten dat er zowel bij mensen als bij m
Onderzoek zegt bij SARS-CoV-2 hondeninfectie,
overdracht onwaarschijnlijk Een nieuwe studie gepubliceerd op de preprint-server bioRxiv* in september 2020 blijkt dat honden ziek zijn geworden en sterven aan een mysterieuze luchtweginfectie, vaak