SARS-CoV-2-påvisning associeres med viral RNA-forekomst hos patienter og hospitalsmiljø

Ser hvad der skete rundt omkring i verden i begyndelsen af ​​2020, University of California San Diego School of Medicine forskere vidste, at deres region sandsynligvis snart ville blive ramt af en bølge af patienter med COVID-19, infektionen forårsaget af coronavirus SARS-CoV-2. De undrede sig over, hvordan virussen vedvarer på overflader, især på hospitaler, og de vidste, at de kun havde et lille tidsvindue til at komme i gang, hvis de ville tage et øjebliksbillede af situationen "før" -; før patienter med infektionen blev indlagt.

Efter et opkald sent en søndag aften, et team samlet i hospitalslobbyen den næste dag, klar til vatpind.

I den resulterende undersøgelse, beskrevet 8. juni, 2021 i Mikrobiom , forskere tørrede patientrums overflader før, under og efter belægning, og gentagne gange indsamlet prøver fra huden, næse og afføring af COVID-19 patienter og deres sundhedspersonale over tid. I alt, de testede 972 hospitalsassocierede prøver for spor af SARS-CoV-2 over to måneder.

Selvom det føles som om vi har levet med denne virus i lang tid, undersøgelsen af ​​interaktionerne mellem SARS-CoV-2 og andre mikrober er stadig ny, og vi har stadig mange spørgsmål. Jo mere vi ved om, hvordan en virus interagerer med sit miljø, jo bedre kan vi forstå, hvordan den overføres, og hvordan vi bedst forstyrrer overførslen for at forebygge og behandle sygdommen. "

Sarah Allard, Ph.d., med senior forfatter, assisterende projektforsker ved UC San Diego School of Medicine og Scripps Institution of Oceanography

Deres fund:Virussen, eller i det mindste dens genetiske signatur, bugner. Teamet opdagede virussen på gulvene ved siden af ​​sengene til patienter med COVID-19 (39 procent af de testede prøver), gulve uden for patientrum (29 procent) og overflader inde i lokalerne (16 procent). SARS-CoV-2-detektion havde en tendens til at være højest i løbet af de første fem dage efter en patients begyndelse af symptomer.

Forskerne er hurtige til at påpege, at bare fordi de kan opdage virusets unikke genetiske signaturer på en overflade, det betyder ikke, at virussen er i stand til at inficere mennesker. Siden de startede undersøgelsen, det er veldokumenteret, at SARS-CoV-2 primært spredes gennem tætte menneskelige interaktioner, mens overfladetransmission sandsynligvis er meget sjælden. Hvad mere er, ingen af ​​sundhedspersonale, der aktivt plejede patienter i undersøgelsen, testede positivt for virussen. Undersøgelsen fokuserede på ét hospital, men forskerne forventer, at de ville finde lignende resultater på ethvert hospital, der behandler patienter med COVID-19.

"Det er enormt på så mange niveauer, "sagde co-seniorforfatter Daniel Sweeney, MD, kritisk pleje og infektionssygdomslæge ved UC San Diego Health. "Vi skal vide, om vores personlige værnemidler, PPE, er tilstrækkelig, og heldigvis ved vi nu, at ting som masker, handsker, kjoler og ansigtsskærme virker virkelig. Denne pandemi har været en global katastrofe, men det kunne have været endnu værre, hvis vores sundhedspersonale blev smittet, især hvis vi ikke vidste hvorfor. "

Vira hænger typisk ikke alene ud. Uanset om det er mennesker eller overflader, de er en del af komplekse samfund kendt som mikrobiomer, som kan omfatte en række andre vira, bakterier og yderligere mikrober. Ved at lede efter coronavirus, holdet opdagede noget andet:en bestemt type bakterier fra slægten Rothia blev fundet sammen med SARS-CoV-2 oftere end ikke, uanset indsamlingssted. Med andre ord, tilstedeværelsen af ​​Rothia forudsagde stærkt, at de også ville påvise SARS-CoV-2 i den samme prøve.

"Hvorfor det forhold?" spurgte Allard. "Hjælper bakterierne virussen med at overleve, eller omvendt? Eller er det bare, at disse bakterier er forbundet med de underliggende medicinske tilstande, der i første omgang sætter patienter i højere risiko for alvorlig COVID-19? Det er et område for fremtidig forskning. "

Undersøgelsen var en udfordring fra begyndelsen, og blev vanskeligere, da hospitalets intensivafdeling begyndte at optage flere patienter med COVID-19. Teamet designede specifikt deres tilgang til at udnytte eksisterende ressourcer for ikke at understrege forsyningskæden, der er nødvendig for klinisk pleje og test. I en separat indsats, nogle af teamet og deres kolleger udviklede alternative podepinde til forskningsformål. De indsamlede prøver så hurtigt og så effektivt som muligt for at minimere forstyrrelser i patientplejen. Prøverne blev transporteret tilbage til laboratoriet i alkohol, bevare virussen til analyse, men ikke udsætte forskere for aktive organismer.

"Mange mennesker har foretaget en masse grundlæggende og klinisk forskning i de sidste par måneder, og vi gjorde det godt, "Sagde Sweeney." Vi tilføjede vores infrastruktur. Vi fik oplevelsen. Jeg håber den samme slags fokus, driv og ånd videre i alt det næste. "

• Systemiske biomarkører viser gavnlige virkninger af aerob træning på hjernens funktion hos ældre voksne
• Næse-til-hjerne:Nasal levering af biofarmaka til hjernen