Der Nachweis von SARS-CoV-2 ist mit der Prävalenz viraler RNA in Patienten und Krankenhausumgebungen verbunden

Beobachten Sie, was Anfang 2020 auf der ganzen Welt geschah, Forscher der University of California San Diego School of Medicine wussten, dass ihre Region wahrscheinlich bald von einer Welle von Patienten mit COVID-19 betroffen sein würde. die Infektion durch das Coronavirus SARS-CoV-2. Sie fragten sich, wie das Virus auf Oberflächen persistiert, insbesondere in Krankenhäusern, und sie wussten, dass sie nur ein kleines Zeitfenster hatten, um loszulegen, wenn sie eine Momentaufnahme der "Vorher"-Situation machen wollten -; bevor Patienten mit der Infektion aufgenommen wurden.

Nach einem Anruf spät an einem Sonntagabend, ein Team versammelte sich am nächsten Tag in der Krankenhauslobby, bereit zum Abwischen.

In der resultierenden Studie, beschrieben am 8. Juni 2021 in Mikrobiom , Forscher haben zuvor die Oberflächen von Patientenzimmern abgewischt, während und nach der Belegung, und wiederholt Proben von der Haut gesammelt, Nase und Stuhlgang von COVID-19-Patienten und deren Pflegepersonal im Laufe der Zeit. In Summe, Sie testeten über zwei Monate 972 krankenhausassoziierte Proben auf Spuren von SARS-CoV-2.

Obwohl es sich anfühlt, als würden wir schon lange mit diesem Virus leben, die Untersuchung der Wechselwirkungen zwischen SARS-CoV-2 und anderen Mikroben ist noch neu, und wir haben noch viele Fragen. Je mehr wir darüber wissen, wie ein Virus mit seiner Umgebung interagiert, desto besser können wir verstehen, wie es übertragen wird und wie wir die Übertragung am besten unterbrechen können, um die Krankheit zu verhindern und zu behandeln."

Sarah Allard, Doktortitel, Co-Senior Autor, Assistant Project Scientist an der UC San Diego School of Medicine und der Scripps Institution of Oceanography

Ihre Erkenntnisse:Das Virus, oder zumindest seine genetische Signatur, im Überfluss. Das Team entdeckte das Virus auf den Böden neben den Betten von Patienten mit COVID-19 (39 Prozent der getesteten Proben). Böden außerhalb der Patientenzimmer (29 Prozent) und Flächen innerhalb der Zimmer (16 Prozent). Der Nachweis von SARS-CoV-2 war in den ersten fünf Tagen nach dem Einsetzen der Symptome eines Patienten am höchsten.

Die Forscher weisen schnell darauf hin, dass nur weil sie die einzigartigen genetischen Signaturen des Virus auf einer Oberfläche erkennen können, Es bedeutet nicht, dass das Virus Menschen infizieren kann. Seit sie das Studium begonnen haben, es ist gut dokumentiert, dass sich SARS-CoV-2 hauptsächlich durch enge menschliche Interaktionen verbreitet, während eine Oberflächenübertragung wahrscheinlich sehr selten ist. Was ist mehr, Keiner der Mitarbeiter des Gesundheitswesens, die sich in der Studie aktiv um Patienten kümmern, wurde positiv auf das Virus getestet. Die Studie konzentrierte sich auf ein Krankenhaus, Die Forscher gehen jedoch davon aus, dass sie in jedem Krankenhaus, das Patienten mit COVID-19 behandelt, ähnliche Ergebnisse finden würden.

"Das ist auf so vielen Ebenen riesig, ", sagte Co-Senior-Autor Daniel Sweeney, MD, Intensivmediziner und Arzt für Infektionskrankheiten an der UC San Diego Health. „Wir müssen wissen, ob unsere persönliche Schutzausrüstung, PSA, ist ausreichend, und zum Glück wissen wir jetzt, dass Dinge wie Masken, Handschuhe, Kleider und Gesichtsschilde funktionieren wirklich. Diese Pandemie war eine globale Katastrophe, Aber es hätte noch schlimmer kommen können, wenn sich unsere Mitarbeiter im Gesundheitswesen anstecken würden. vor allem, wenn wir nicht wussten warum."

Viren hängen normalerweise nicht alleine herum. Ob auf Menschen oder Oberflächen, Sie sind Teil komplexer Gemeinschaften, die als Mikrobiome bekannt sind. die eine Vielzahl anderer Viren umfassen kann, Bakterien und zusätzliche Mikroben. Auf der Suche nach dem Coronavirus entdeckte das Team noch etwas:eine bestimmte Bakterienart der Gattung Rothia wurde häufiger neben SARS-CoV-2 gefunden, unabhängig vom Sammelort. Mit anderen Worten, Die Anwesenheit von Rothia sagte stark voraus, dass sie auch SARS-CoV-2 in derselben Probe nachweisen würden.

"Warum diese Beziehung?" fragte Allard. "Helfen die Bakterien dem Virus zu überleben, oder umgekehrt? Oder sind diese Bakterien nur mit den zugrunde liegenden Erkrankungen verbunden, die Patienten überhaupt einem höheren Risiko für schweres COVID-19 aussetzen? Das ist ein Bereich für zukünftige Forschung."

Das Studium war von Anfang an eine Herausforderung, und wurde schwieriger, als die Intensivstation des Krankenhauses mehr Patienten mit COVID-19 aufnahm. Das Team hat seinen Ansatz speziell entwickelt, um vorhandene Ressourcen zu nutzen, um die für die klinische Versorgung und Tests erforderliche Lieferkette nicht zu belasten. In einem separaten Versuch, ein Teil des Teams und ihre Kollegen entwickelten alternative Tupfer für Forschungszwecke. Sie sammelten Proben so schnell und effizient wie möglich, um Störungen der Patientenversorgung zu minimieren. Die Proben wurden in Alkohol ins Labor zurücktransportiert, das Virus zur Analyse aufzubewahren, aber Forscher nicht aktiven Organismen auszusetzen.

"Viele Leute haben in den letzten Monaten viel Grundlagenforschung und klinische Forschung betrieben, und wir haben es gut gemacht, ", sagte Sweeney. "Wir haben unsere Infrastruktur erweitert. Wir haben die Erfahrung gesammelt. Ich hoffe, die gleiche Art von Fokus, Antrieb und Geist tragen in allem voran, was als nächstes kommt."

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