Etter en samtale sent en søndag kveld, et team samlet i sykehuslobbyen dagen etter, klar til å pusse.
I den resulterende studien, beskrevet 8. juni, 2021 tommer Mikrobiom , forskere tørket overflater på pasientrommet før, under og etter innflytting, og gjentatte ganger samlet prøver fra huden, nese og avføring av COVID-19 pasienter og deres helsearbeidere over tid. Totalt, de testet 972 sykehusassosierte prøver for spor av SARS-CoV-2 over to måneder.
Selv om det føles som om vi har levd med dette viruset lenge, studien av samspillet mellom SARS-CoV-2 og andre mikrober er fortsatt ny, og vi har fortsatt mange spørsmål. Jo mer vi vet om hvordan et virus samhandler med omgivelsene, jo bedre kan vi forstå hvordan den overføres og hvordan vi best kan forstyrre overføringen for å forebygge og behandle sykdommen. "
Sarah Allard, PhD, medforfatter, assisterende prosjektforsker ved UC San Diego School of Medicine og Scripps Institution of Oceanography
Deres funn:Viruset, eller i det minste dens genetiske signatur, florerer. Teamet oppdaget viruset på gulvene ved siden av sengene til pasienter med COVID-19 (39 prosent av prøvene testet), etasjer utenfor pasientrommene (29 prosent) og overflater inne i rommene (16 prosent). SARS-CoV-2-deteksjon hadde en tendens til å være høyest i løpet av de første fem dagene etter at en pasient begynte symptomene.
Forskerne er raske med å påpeke at bare fordi de kan oppdage virusets unike genetiske signaturer på en overflate, det betyr ikke at viruset er i stand til å infisere mennesker. Siden de startet studiet, det har blitt godt dokumentert at SARS-CoV-2 hovedsakelig sprer seg gjennom tette menneskelige interaksjoner, mens overflateoverføring sannsynligvis er svært sjelden. Hva mer, ingen av helsearbeiderne som aktivt tok vare på pasientene i studien testet positivt for viruset. Studien fokuserte på ett sykehus, men forskerne forventer at de vil finne lignende resultater på alle sykehus som behandler pasienter med COVID-19.
"Dette er stort på så mange plan, "sa med-seniorforfatter Daniel Sweeney, MD, lege for kritisk omsorg og smittsom sykdom ved UC San Diego Health. "Vi trenger å vite om vårt personlige verneutstyr, PPE, er tilstrekkelig, og heldigvis vet vi nå at ting som masker, hansker, kjoler og ansiktsskjerm fungerer virkelig. Denne pandemien har vært en global katastrofe, men det kunne vært enda verre hvis våre helsearbeidere ble smittet, spesielt hvis vi ikke visste hvorfor. "
Virus henger vanligvis ikke alene. Enten på mennesker eller overflater, de er en del av komplekse samfunn kjent som mikrobiomer, som kan omfatte en rekke andre virus, bakterier og ytterligere mikrober. På jakt etter koronaviruset, teamet oppdaget noe annet:en bestemt type bakterier fra slekten Rothia ble funnet sammen med SARS-CoV-2 oftere enn ikke, uavhengig av innsamlingssted. Med andre ord, tilstedeværelsen av Rothia spådde sterkt at de også ville oppdage SARS-CoV-2 i samme prøve.
"Hvorfor det forholdet?" spurte Allard. "Hjelper bakteriene viruset med å overleve, eller vice versa? Eller er det bare at disse bakteriene er forbundet med de underliggende medisinske tilstandene som setter pasienter i større risiko for alvorlig COVID-19 i utgangspunktet? Det er et område for fremtidig forskning. "
Studien var en utfordring fra begynnelsen, og ble vanskeligere ettersom sykehusets intensivavdeling begynte å ta imot flere pasienter med COVID-19. Teamet designet spesielt deres tilnærming for å utnytte eksisterende ressurser for ikke å understreke forsyningskjeden som trengs for klinisk behandling og testing. I en egen innsats, noen av teamet og deres kolleger utviklet alternative vattpinner for forskningsformål. De samlet prøver så raskt og så effektivt som mulig for å minimere forstyrrelser i pasientbehandlingen. Prøvene ble transportert tilbake til laboratoriet i alkohol, å bevare viruset for analyse, men ikke utsette forskere for aktive organismer.
"Mange mennesker har gjort mye grunnleggende og klinisk forskning de siste månedene, og vi gjorde det bra "Sweeney sa." Vi la til infrastrukturen vår. Vi skaffet oss erfaringen. Jeg håper det samme fokuset, driv og ånd videre i det som kommer neste. "