Kópiaszám profilok gyomorrák prekurzor elváltozások

DNS kópiaszám profilok gyomorrák prekurzor elváltozások
Abstract
alapon
kromoszomális instabilitás (CIN) a legelterjedtebb típusú genomikus instabilitás gyomor tumorok, de szerepe a malignus transzformáció a gyomornyálkahártya még mindig homályos . A jelen tanulmányban meghatározott megvizsgálni, hogy a két morfológiailag eltérő csoportba a gyomorrák prekurzor elváltozások, azaz bél típusú és a pylorus adenoma járna, különböző mintákat DNS kópiaszám változások, ami valószínűleg a különböző genetikai útvonalak a gyomor carcinogenesis ezekben két adenoma típusok. katalógusa Eredmények katalógusa használata 5K BAC array CGH platform, megmutattuk, hogy a leggyakoribb rendellenességek osztják a 11 intesztinális típusú és 10 pylorus adenoma volt nyereség kromoszómák 9 (29%), 11 q ( 29%) és 20 (33%), és a veszteségek a kromoszómák 13q (48%), 6 (48%), 5 (43%) és 10 (33%). A leggyakoribb aberrációk intesztinális típusú gyomor adenoma volt nyeresége 11q, 9q és 8. veszteségek kromoszómák 5q, 6, 10 és 13, míg a pylorus mirigy gyomor adenoma ezek nyeresége kromoszóma 20 és veszteség 5q és 6. Ugyanakkor nem volt szignifikáns különbség a két adenoma típusok. katalógusa Következtetés
az eredmények azt sugallják, hogy a nyereség kromoszómákon 8 9q, 11q és 20. veszteségek kromoszómák 5q, 6, 10 és 13, aligha lehet a korai események gyomor kialakulásában. A fenotípusos szervezetek, intesztinális típusú és a pylorus adenoma, azonban nem különbözött szignifikánsan (P = 0,8) szintjén kópiaszám változások. Katalógusa Háttér katalógusa gyomorrák a második leggyakoribb rosszindulatú daganat világszerte, és a prognózis ennek malignitás továbbra is nagyon rossz [1]. A gyomor rákos megbetegedések és halálozások aránya eltérő a különböző országokban az Európai Unión belül [2]. Hollandiában a ötödik helyet a daganatos halálok, mintegy 2200 új esetet évente [3]. Műtét kuratív a választandó kezelés előrehaladott esetekben a gyomorrák, mivel a helyi endoszkópos mucosectomiák lehet gyógyító korai gyomorrák. Felderítése és eltávolítása gyomor daganatok, korai vagy akár rosszindulatúvá váló állam hozzájárulhat a halál miatt gyomorrák. E cél elérése érdekében, a jobb vizsgálatok korai felismerése gyomorrák van szükség, és a javított megértéséhez biológiájának gyomorrák progresszió létfontosságú ebben a tekintetben. Katalógusa szerint Correa modell patogenezise intesztinális típusú gyomor adenokarcinóma következik egy út a krónikus aktív gastritis miatt Helicobacter pylori
fertőzés, ami a nyálkahártya atrófia, intesztinális metaplázia majd epitheliális neoplasia, és végül invazív adenocarcinoma [4]. Genetikai jellemzése szöveti minták intraepithelialis neoplasia szakaszában jelentősen hozzájárul ahhoz, hogy megértsük a molekuláris patogenezisének gyomorrák. Azonban ezek a léziók csak ritkán mutattak ki, feltehetően a gyors progressziója keresztül ebben a szakaszban felé a rák, és általában jelen csak egyes részein biopsziás minták, ami akadályozza a genomiális analízise ezen elváltozások. Elemzés alternatív prekurzor elváltozások tehát, legalábbis részben, helyettesíthetik. Gyomorrák kialakulásával keresztül adenoma szakaszban, bár kevésbé gyakori, mint alternatív útvonalat. Ezek adenoma alkalmanként során feltárt gasztroszkópia és jelen nagy elváltozások szövettanilag mutatják belüli epiteliális daganat, amely alkalmassá teszi őket genomanalízis. Gyomor- adenoma közvetlen malignus potenciállal és kitehetik 20% -a az összes epithelialis polipok [5, 6]. Gyomor adenomák lehet egy klasszikus cső alakú, tubulovillózus, vagy villous morfológia egy túlnyomórészt bél típusú epitélium, de azt is megjelennek pylorus mirigy adenoma [6]. Pylorus mirigy adenoma adódnak mély nyálkás mirigyek a gyomorban, és erősen pozitív mucin 6 [7, 8]. Jelentős számú gyomor adenoma már mutatják progresszió adenocarcinoma. Első diagnózis 30-40% -a az összes pylorus adenoma már azt mutatják, a hangsúly a karcinóma [9, 10]. Bélrendszeri típusú adenomák ez a szám alacsonyabb, és változik 28,5% a boholy-adenoma és 29,4% a tubulovillózus típusú adenomák, hogy csak 5,4% a tubuláris adenomák [11]. Mindkét adenocarcinoma, ex intesztinális típusú adenoma és ex pylorus adenoma, mutasd mirigyekbe, ellentétben a diffúz típusú gyomorrák.
Egyik legfontosabb jellemzője a patogenezisében legtöbb gyomor rák, mint sok más daganatos betegségek, a kromoszóma instabilitás , ami a nyereség és veszteség az alkatrészek, vagy akár teljes kromoszómák [12]. Ezek a kromoszomális változások lehet elemezni összehasonlító genomiális hibridizáció (CGH). Számos korábbi vizsgálatok a genetikai változások a gyomor adenoma használja ezt a technikát, hogy nyereséget kromoszómán 7q, 8 q, 13q, 20q és veszteségek kromoszómán 4p, 5q, 9p 17p és 18q [13-16]. Bár ritka, és csak figyelték adenoma magas minőségű intraepithelialis neoplasia, magas szintű amplifikálásokban észlelt kromoszóma 7q, 8p, 13q, 17q és 20q [13-16]. A gyomor adenocarcinoma, következetesen leírt kromoszóma aberrációk nyereség kromoszómán 3q, 7p 7Q, 8 q, 13q, 17q és 20q és veszteségek kromoszómán 4q, 5q, 6q, 9p, 17p és 18q. Magas szintű amplifikálásokban már többször észlelt 7q, 8p, 8 q, 17q, 19q és 20q [14, 17-23]. Mégis, kromoszómaaberrációt vagy kópiaszám változik, nem egységes a gyomorrák. [24] Alcsoportok különböző mintákat DNS kópiaszámától lehet ismerni, amelyekről kimutatták, hogy összefüggésbe hozható klinikai eredmény is [25].
A jelen tanulmányban azt tűzte ki, hogy megvizsgáljuk, vajon a két morfológiailag eltérő csoportba a gyomorrák prekurzor elváltozások, azaz bél típusú és a pylorus adenoma járna, különböző mintákat DNS kópiaszám változást, ami valószínűleg a különböző genetikai útvonalak a gyomor carcinogenesis a két adenoma típusok. katalógusa Eredmények katalógusa kópiaszám elváltozásokat figyeltek meg 11-ből 10 intesztinális típusú adenoma és 10-ből 9 pylorus adenoma. Az átlagos száma kromoszóma események, amelyek a nyereség és veszteség, egy tumor volt 6,0 (tartomány: 0-18), beleértve 2.9 (tartomány 0-14) nyereség és 3,0 (tartomány 0-7) veszteség. A bél típusú adenomák, az átlagos száma kromoszomális események per tumor volt 6,5 (tartomány 0-18), amelyből 3,4 (tartomány 0-14) nyereség és 3,1 (tartomány 0-7) veszteségek, és a pylorus adenoma az átlagos számok 5,4 (tartomány 0-9), 2,4 (tartomány 0-7) és 3,0 (tartomány 0-7) volt.
a bél típusú gyomor-adenomák, az leggyakoribb aberrációk megfigyelt nyereség kromoszómákon 8, 9q és 11q, és veszteség kromoszómák 5q, 6, 10 és 13. a négy adenomák (36,4%), az erősítés kromoszóma 11q23.3 volt megfigyelhető egy közös régió átfedési 2,6 MB. Gain kromoszóma 9q volt megfigyelhető négy adenomák (36,4%), a 12,6 Mb közös régió átfedési kromoszómán található 9q33.1-q34.13. Gain kromoszóma 8 volt megfigyelhető három adenomák (31%), melyek közül kettő adenomák azt mutatta nyereség egész kromoszóma 8, a harmadik adenoma kimutatta nyereség kromoszóma 8p-q22.3 egy további 28.7 Mb nyereség kromoszóma 8q24.11 -qter. Ezen túlmenően, nyereséget figyeltünk kromoszómákon 1, 3, 6p, 7, 11p, 12p, 13q, 16, 17, 19, 20 és 22q. Nem amplifikációt voltak megfigyelhetők a bél típusú adenómák.
Deléciók 13. kromoszóma észleltek hét bél típusú adenomák (64%). Ezek közül öt mutatott 11,9 MB törlés kromoszóma 13q21.2-21.33 egy további 7,7 MB törlés kromoszómán 13q31.1-31.3. A másik két adenomák mutatott 16,6 Mb törlését 13q14.3-31. Egy törlés 6. kromoszómán volt megfigyelhető hat adenomák (55%), egy átfedő régió 68,9 Mb elhelyezkedik 6cen-q22.1. A törlés kromoszóma 5q volt megfigyelhető négy adenomák (36%) egy közös régió átfedési kromoszómán található 5q22.1-q23.2. Ezen túlmenően, egy deléciós egész kromoszóma 10 volt megfigyelhető négy adenomák (36%). Más veszteség figyelhető bél típusú adenomák helyezkedtek kromoszómákon 8q, 9p, 10, 12q, 20q és 21. A áttekintést az összes DNS kópiaszám aberrációk a bél típusú adenomák táblázatban mutatjuk be 1.Table 1 Áttekintés A DNS- kópiaszám változik 11 intesztinális típusú adenomák katalógusa katalógusa Kromoszóma Matton katalógusa szegélyező klónok Matton katalógusa katalógusa Tumor ID Matton nyeresége Matton veszteségek Matton szegmens mérete (Mb) hotelben
Start katalógusa
End Matton 1 katalógusa 1p-p36.11 katalógusa 26.68 katalógusa RP11-465B22 katalógusa RP1-159A19 katalógusa 5q13.2-Q23 0,2 katalógusa 55.26 katalógusa RP11-115I6 katalógusa CTB-1054G2
6p21.33-p21.1 katalógusa 13.78 katalógusa RP11-346K8 katalógusa RP11-227E22 katalógusa 6p21.1 -q16.1 katalógusa 52.05 katalógusa RP11-89I17 katalógusa RP3-393D12 katalógusa 9q33.1-34.2 katalógusa 17.32 katalógusa RP11-27I1 katalógusa RP11-417A4 katalógusa 11q23.3
4,80
RP11-4N9 katalógusa RP11-730K11 katalógusa 13q21.1-q31.3 katalógusa 39.63 katalógusa RP11-200F15 katalógusa RP11-62D23 katalógusa 2

• Downregulációját kötőszöveti növekedési faktor gátolja a növekedést és a invázió gyomorrák sejtek és csökkenti a hashártya terjesztés
• Egyrészről Helicobacter pylori genotípus és súlyosságát a krónikus gyomorhurut, gyomorfekély betegség és a gyomor nyálkahártya interleukin-8 szintek: Evidence from tanulmány a Közel Eas…