Aiemmat tutkimukset ovat paljastaneet, että CoV:t ovat alttiita lajien väliselle leviämiselle. Siksi, lisätietojen kerääminen eläinten CoV:istä on elintärkeää tulevien CoV -taudinpurkausten ennustamiseksi ja zoonoottisten tartuntatapahtumien estämiseksi.
Tutkimus:Vertaileva analyysi koronaviruksen nukleokapsidi (N) -proteiineista paljastaa, että SADS-CoV N -proteiini antagonisoi IFN-β:n tuotantoa indusoimalla RIG-I:n ubikitinaation. Kuva:Design_Cells / Shutterstock.com
Tutkijat ovat äskettäin paljastaneet sikojen akuutin ripulin oireyhtymän (SADS) -CoV, joka kuuluu Alphacoronavirus -sukuun, uusi patogeeni, joka aiheuttaa ripulia vastasyntyneillä porsailla. SADS-CoV, joka tunnetaan myös nimellä sikojen enteerinen alfacoronavirus (SeACoV), oli raportoinut yli 35%:n kuolleisuuden Etelä -Kiinassa vuoden 2017 epidemian aikana.
SADS-CoV:n lisäksi tähän mennessä on tunnistettu neljä muuta sian CoV -arvoa; nimittäin, tarttuva gastroenteriittivirus (TGEV), sian hemagglutinoiva enkefalomyeliitti -virus (PHEV), sian epidemian ripulivirus (PEDV), ja sian delta -koronavirus (PDCoV). Koska SADS-CoV liittyy läheisesti bat CoV HKU2 -kantoihin, tutkijat uskovat, että tämä kanta on syntynyt geneettisen ajautumisen tai yhdistelmätapahtumien seurauksena samanaikaisesti tarttuvien CoV:ien välillä.
Genomitutkimukset ovat osoittaneet, että SADS-CoV sisältää geneettisen sekvenssin, joka koostuu neljästä rakenneproteiinista, seitsemän itsenäistä avointa lukukehystä (ORF), jotka koodaavat kuusitoista ei-rakenteellista proteiinia, ja yksi lisäproteiini, jotka kaikki ovat samanlaisia kuin monissa CoV:issä. Neljästä rakenneproteiinista nukleokapsidi (N) -proteiini sisältää erittäin konservoituneen genomisekvenssin, joka on erittäin ekspressoitu. N -proteiinilla on rooli virusinfektiossa ja se osallistuu myös subgenomiseen ribonukleiinihapon (RNA) transkriptioon, viruksen genomin replikaatio, ja sen vuorovaikutus muiden proteiinien kanssa virion -kokoonpanon tukemiseksi.
Aiemmat tutkimukset ovat viitanneet siihen, että SADS-CoV N -proteiini on osallisena viruksen kiertämisessä isännän synnynnäisestä immuunivasteesta, joka on kehon ensimmäinen puolustuslinja haitallisia taudinaiheuttajia vastaan. Edelleen, tyypin I interferonin (IFN) signalointireitillä on tärkeä rooli isännän suojaamisessa virusinfektiota vastaan, joka sisältää patogeeniin liittyvien molekyylikuvioiden (PAMP) ensisijaisen tunnistamisen kuvion tunnistusreseptoreilla (PRR).
Kuten muutkin RNA -virukset, CoV:t tuottavat PAMP-yhdisteitä, mukaan lukien kaksijuosteinen RNA (dsRNA) ja 5'-ppp RNA-välituotteet sytoplasmassa replikaation aikana. Nämä PAMP:t tunnistetaan sitten isäntäkuvion tunnistusreseptoreilla (PRR), kuten retinoiinihapon indusoituvilla geeni I:n (RIG-I) kaltaisilla reseptoreilla (RLR). RIG-I:n ja/tai melanooman erilaistumiseen liittyvän geenin 5 (MDA5) tunnistaminen ja aktivointi johtavat niiden vuorovaikutukseen kaspaasin aktivointi- ja rekrytointialueiden (CARD) kanssa.
Myöhemmin, muodostuu prionimaisia polymeerejä, joka stimuloi alavirtaa
TANKia sitova kinaasi 1 (TBK1) ja estäjä κ B-kinaasi-ϵ (IKKϵ). TBK1:n aktivoituminen johtaa interferonin säätelytekijän 3 (IRF3) fosforylaatioon, joka vuorostaan, edistää tyypin I IFN:ien tuotantoa. Tämä johtaa lopulta satojen IFN-stimuloitujen geenien (ISG) ilmentymiseen.
ISG:t ilmentyvät autokriinisellä ja parakriinisellä tavalla pyrkien suojaamaan isäntäsolua virukselta. Näistä luontaisista puolustuksista huolimatta virukset voivat usein kehittyä kiertämään isäntäsolun puolustuskykyä. Esimerkiksi, useat CoV:t voivat estää isännän IFN -vasteita infektion aikana.
Tuore tutkimus julkaistiin vuonna Rajat immunologiassa keskittyy SADS-CoV N -proteiinin rooleihin IFN:n tukahduttamisessa infektion aikana. Tässä tutkimuksessa tutkijat vertailivat aminohappojen samankaltaisuuksia eri proteiinien välillä eri CoV:ista, jotka kuuluvat neljään eri sukuun. Keskustellaan myös kunkin IFN -signalointiin liittyvän N -proteiinin tavoitteista. IFN:n estämisen mekanismi on määritetty käyttämällä SADS-CoV N -proteiinia vertailevan analyysin avulla.
Tämän tutkimuksen tutkijat paljastivat, että IFN -signaloinnin tukahduttamiseksi PAMP -tunnistusvaihe on kriittinen kohde N -proteiinille. Tätä varten vuorovaikutus SADS-CoV N -proteiinin ja RIG-I:n välillä laukaisee ubikvitinaation, joka edistää proteasomista riippuvaista hajoamista. Tämä johtaa isännän IFN -vastausten tukahduttamiseen.
Tässä tutkimuksessa on myös arvioitu useita SADS-CoV:n N-proteiineja arvioidakseen niiden kykyä estää IFN-vaste. Viime kädessä, tutkijat havaitsivat, että tämän vasteen esto ei ole riippuvainen aminohapposekvenssin samankaltaisuudesta. Esimerkiksi, aminohappojen samankaltaisuus on 91,2% SARS-CoV-2:n ja SARS-CoV:n välillä. Kuitenkin, SARS-CoV-2:n käytössä olevien mekanismien osalta, N -proteiini voisi estää IFN -promoottorin aktiivisuuden, joka muutoin on RIG-I:n aiheuttama, MAVS, TBK1, ja IKKϵ, ottaa huomioon, että SARS-CoV N -proteiini ei onnistunut siinä.
Tällainen tulos korostaa tertiäärisen rakenteen merkitystä proteiinitoiminnon määrittämisessä. Nykyisessä tutkimuksessa on edelleen aukko CoV N -proteiinin tertiäärisen rakenteen täydellisessä ymmärtämisessä. Vaikka tämä voi olla totta, tietoja eri CoV N -proteiinien N -terminaalidomeenin (NTD) ja C -terminaalidomeenin (CTD) rakenteista on tällä hetkellä saatavilla.
Tämänhetkisen tutkimuksen tulos on aiempien raporttien mukainen. Tätä varten aiemmat tutkimukset ovat osoittaneet, että PEDV:n N -proteiini aiheuttaa isännän IFN -vasteita vuorovaikutuksessa suoraan TBK1:n kanssa. Lisäksi, SARS-CoV:n N-proteiini on suoraan tai epäsuorasti vuorovaikutuksessa TRIM25:n ja proteiinikinaasi R:n (PACT) proteiiniaktivaattorin kanssa RIG-I:n aktivoimiseksi.
Esillä oleva tutkimus on myös ehdottanut, että SADS-CoV:n N-proteiini kohdistuu IFN-vasteen alkuvaiheisiin ja voi suoraan häiritä RIG-I:n aktivoitumista. Tämä vertaileva analyysi on myös osoittanut, että RIG-I:tä käyttävät häiriöt voivat olla johtava menetelmä SADS-CoV:n N-proteiinille RIG-I-kaltaisen reseptorin (RLR) signaloinnin tukahduttamiseksi. Tässä tutkimuksessa havaittiin, että SADS-CoV N -proteiini kohdistaa RIG-I:n estämään IFN-β-promoottoriaktiivisuutta.
Lyhytketjuinen rasvahappolisä parantaa aivohalvauksen palautumista,
Tutkijat kehittävät peptidejä, jotka palauttavat tasapainon suolistobakteereissa ja kääntävät ateroskleroosin
Ihmiset vastaan virukset - Voimmeko välttää sukupuuton lähitulevaisuudessa?
Suolistobakteerit liittyvät metabolisiin muutoksiin ja autismiin uudessa tutkimuksessa
Sydänkohtauksiin liittyvät mikrobit löytävät tutkimuksen
Keuhkomikrobit voivat auttaa ennustamaan vakavasti sairaiden tuloksia
Nuori veri palauttaa elinvoimaa vanhuksilla
Bram Stokerin Dracula selviytyi nuorten tyttöjen verestä. Nyt tutkijat ovat havainneet, että tässä outossa teoriassa on voinut olla totuutta! Lontoon yliopiston yliopiston geneetikon Dame Linda Part
Probiootit adjuvanttina COVID-19-potilaille
Vuonna 1892, Doderlein perusti ensin mikro -organismien hyödyllisen yhdistyksen ihmiskehoon. Siksi, COVID-19-pandemian aikana, voi olla hyödyllistä arvioida mikro-organismien roolia ihmiskehossa ja pr
Antibiootti X-206 tehokas SARS-CoV-2:ta vastaan in vitro
COVID-19-pandemia aiheuttaa edelleen monia vakavia ja kuolemaan johtavia keuhkokuumetapauksia, päättyy usein useiden elinten toimintahäiriöihin ja sydän- ja verisuonitapahtumiin. Ilman rokotetta tai t