Primerjava mikrobiomov
Vnetna črevesna bolezen (KVČB) združuje več stanj, za katera je značilno kronično vnetje črevesnega trakta, vključno z ulceroznim kolitisom in Crohnovo boleznijo. Primarni sklerozirajoči holangitis (PSC) je kronično stanje jeter, ki vključuje vnetje in brazgotinjenje žolčnega kanala, pogosto sočasno s KVČB. V svoji novi študiji so znanstveniki VIB-KU Leuven opisujejo sestavo mikrobiomov pri bolnikih s KVČB in PSC.
Jeroen Raes, prof. VIB-KU Leuven
Skozi leta, številne raziskovalne skupine po vsem svetu so poskušale opisati spremembe mikrobiote, povezane z boleznimi. Še posebej KVČB je vroča tema v raziskavah mikrobiomov. Naša študija se od teh prejšnjih poskusov razlikuje na treh frontah. Prvič, primerjali smo mikrobioto bolnikov s profili zdravih prostovoljcev iz našega kataloga projekta flamske črevesne flore več kot 3, 000 mikrobiomov. Drugič, v naših analizah, nismo pogledali le odstotka različnih bakterij, prisotnih v vzorcih blata, uporabili pa so tudi novo tehniko za količinsko opredelitev njihove številčnosti. Tretjič, rezultate smo popravili za dejavnike, kot je ohlapno blato, pogosto simptomatsko pri preučevanih boleznih, vendar vpliva na izid mikrobiomske analize. "
Mikrobni prstni odtis bolezni
Kombinirajo svoje edinstveno znanje pri kvantitativnem profiliranju mikrobiomov s svojim znanjem o variacijah mikrobiote, povezanih z zdravjem, znanstveniki iz Leuvena so ugotovili spremenjeno konfiguracijo mikrobioma - znano tudi kot enterotip - z visoko razširjenostjo med skupinami bolnikov. Medtem ko so ta enterotip opazili pri 13% zdravih prostovoljcev, identificirali bi ga lahko pri 38 do 78% bolnikov s PSC in KVČB.
Prof. Séverine Vermeire, gastroenterolog na UZ Leuven/KU Leuven, ki je sodeloval v raziskavi, pojasnjuje:"Ta aberantna konfiguracija mikrobioma, ki mu pravimo enterotip B2, za katero je značilna nizka številčnost bakterij in biotska raznovrstnost. Zlasti ga primanjkuje pri nekaterih protivnetnih bakterijah, kot je Faecalibacterium. Pravzaprav, pri bolnikih z enterotipom B2 odkrijemo višjo stopnjo črevesnega vnetja. Tudi med zdravimi posamezniki nosilci tega enterotipa imajo nekoliko višjo stopnjo splošnega vnetja nizke stopnje. "
Vnetje črevesja, mikrobi, in depresija
Presenetljivo, šele pred nekaj meseci, laboratorij prof. Raesa je opisal podobno spremembo mikrobiote, ki je povezana z nižjo kakovostjo življenja in celo depresijo.
Jeroen Raes pravi:"Zdi se, da je pri različnih skupinah bolnikov prišlo do velikega prekrivanja sprememb mikrobiomov. Enterotip B2 smo odkrili pri približno 26% depresivnih posameznikov. Medtem ko je bilo dokazano, da ima črevesna mikrobiota vlogo pri razvoju bolezni v, na primer ulcerozni kolitis in Crohnova bolezen, za depresijo je to veliko manj jasno. Vendar pa v prihodnjih študijah bomo podrobneje raziskali povezavo med enterotipom B2 in depresijo. "
Medtem ko je približno 13% zdravih posameznikov razvrščenih kot nosilci enterotipa B2, raziskovalci poudarjajo, da to ne bi smelo biti razlog za skrb.
Prof. Jeroen Raes:"Na tej točki na podlagi enterotipa osebe ne moremo predvideti dovzetnosti za bolezen ali tveganja. Poleg tega, enterotipi niso fiksni in jih je mogoče spremeniti, na primer spreminjanje prehrane. Opažene povezave med boleznimi in ozvezdji mikrobiote ne pomenijo, da črevesne bakterije dejansko povzročajo bolezen. Veliko osebnih, življenjski slog, okoljski dejavniki pa so povezani z enterotipom B2. Vendar pa ker je tudi vnetje pri nekaterih posameznikih dejavnik, povezan z B2, zagotovo bomo podrobneje preučili potencialno vzročnost. "