Forskere beskriver sammensetningen av mikrobiomer hos pasienter som lider av IBD og PSC

I 2012, Professor Jeroen Raes (VIB-KU Leuven Center for Microbiology) lanserte Flemish Gut Flora Project. Sekvensering av avføringsprøver på over 3, 000 friske frivillige, Prof. Raes og hans team definerte grensene for en normal, helserelatert tarmmikrobiota. Neste, teamet henvendte seg til pasientgrupper for å identifisere mikrobiomendringer forbundet med sykdommer. Nylig, de beskrev den såkalte B2-enterotypen, mangel på noen antiinflammatoriske bakterier. I dag, deres resultater om den høye forekomsten av denne spesielle enterotypen på tvers av flere diagnoser er publisert i Naturmikrobiologi .

Sammenligning av mikrobiomer

Inflammatorisk tarmsykdom (IBD) grupperer flere tilstander preget av kronisk betennelse i tarmkanalen, inkludert ulcerøs kolitt og Crohns sykdom. Primær skleroserende kolangitt (PSC) er en kronisk leversykdom som involverer betennelse og arrdannelse i gallegangen, ofte samtidig med IBD. I deres nye studie, VIB-KU Leuven-forskerne beskriver mikrobiomsammensetning hos pasienter som lider av IBD og PSC.

Prof. Jeroen Raes, VIB-KU Leuven

I løpet av årene, mange forskergrupper over hele verden har forsøkt å beskrive mikrobiotaendringer forbundet med sykdommer. Spesielt IBD er et hett tema i mikrobiomforskning. Studien vår skiller seg fra disse tidligere forsøkene på tre fronter. Først, vi sammenlignet mikrobiota til pasienter med profiler fra friske frivillige fra vår flamske tarmflora -prosjektkatalog på over 3, 000 mikrobiomer. Sekund, i våre analyser, vi så ikke bare på prosentandelen av forskjellige bakterier i avføringsprøvene, men brukte også en ny teknikk for å tallfeste mengden. Tredje, vi korrigerte resultatene våre for faktorer som løs avføring, ofte symptomatisk ved de undersøkte sykdommene, men påvirker utfallet av mikrobiomanalyser. "

Et mikrobielt fingeravtrykk av sykdom

Ved å kombinere sin unike kompetanse innen kvantitativ mikrobiomprofilering med sin kunnskap om helserelatert mikrobiotavariasjon, forskerne i Leuven identifiserte en endret mikrobiomkonfigurasjon - også kjent som en enterotype - med høy forekomst blant pasientgrupper. Selv om denne enterotypen ble observert hos 13% av friske frivillige, det kan identifiseres hos 38 til 78% av PSC- og IBD -pasientene.

Prof. Séverine Vermeire, gastroenterolog ved UZ Leuven/KU Leuven, som deltok i forskningen, presiserer:"Denne avvikende mikrobiomkonfigurasjonen, som vi kaller B2 -enterotypen, er preget av lave bakterier og biologisk mangfold. Det er spesielt mangelfullt i noen antiinflammatoriske bakterier som Faecalibacterium. Faktisk, vi oppdager høyere nivåer av tarmbetennelse hos pasienter med B2 -enterotypen. Selv blant friske individer, bærere av denne enterotypen har litt høyere nivåer av generell lavgradig betennelse. "

Tarmbetennelse, mikrober, og depresjon

Overraskende, bare noen få måneder siden, laboratoriet til Prof. Raes beskrev en lignende mikrobiotaendring som var forbundet med lavere livskvalitet og til og med depresjon.

Prof. Jeroen Raes sier:"Det ser ut til å være en stor overlapping i mikrobiomforandringer observert på tvers av forskjellige pasientgrupper. Vi oppdaget B2 -enterotypen hos rundt 26% av deprimerte individer. Mens tarmmikrobiota har vist seg å spille en rolle i sykdomsutvikling i, for eksempel, ulcerøs kolitt og Crohns sykdom, Dette er langt mindre klart for depresjon. Derimot, Vi vil utforske sammenhengen mellom B2 -enterotypen og depresjon mer detaljert i fremtidige studier. "

Mens rundt 13% av friske individer kan klassifiseres som bærere av B2 -enterotypen, forskerne understreker at dette ikke bør være en grunn til bekymring.

Prof. Jeroen Raes:"På dette tidspunktet, vi kan ikke gi noen prediksjon om sykdomsfølsomhet eller risiko basert på en persons enterotype. Videre, enterotyper er ikke fikset og kan endres av, for eksempel, endre kostholdet ditt. De observerte sammenhengene mellom sykdommer og mikrobiotakonstellasjoner antyder ikke at tarmbakteriene faktisk forårsaker sykdommen. Mange personlige, livsstil, og miljøfaktorer er knyttet til en B2 -enterotype. Derimot, som også betennelse viser seg å være en B2-assosiert faktor hos noen individer, Vi vil helt sikkert se nærmere på potensiell årsakssammenheng. "

• Inflammatoriske markørtester er ikke følsomme nok til å utelukke alvorlige tilstander,
• Forskning fremhever potensielle mål for å bekjempe Crohns sykdom